XLOC_044372 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044372
Unique NameXLOC_044372
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_60:1454946..1480227-

Legend: gene
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>XLOC_044372 ID=XLOC_044372|Name=XLOC_044372|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=25282bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_60:1454946..1480227- (Clytia hemisphaerica)
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TTATTTCCTGGAAGTTGTTCCAATAACATCATGCTGGGCACTGACCTTGA TTTCTTTTGCTAGATATCGCTCCATTACCTACCCAATGGCTGTCCGAATC AATAAAAAGAAATACGGACTAGCTTGTATTTTGATTTGGGTTATACCAGC TCTTATCAACATCGCTGATTTTATGCGGATTAAATTGGTGTATAATTCTG AGGAGGATAGCCATAGTTGTGACTACGACTATCCCAAAAGAGGCCAGAAA CCAGTGGTTGAATCGCAAGCAATCGTCAATAACGTGATCGACAGCTTCAT CCCTTTAGCACTAATGGTGTATTTCTACTACCGAATGTCAAAAGCGATGC ATCGAGATGAAAATGCTAATTCGTTTGCACTGAGTGACCAAAGCCGATCA AGGAATCGGGCAGCGCTGAAAACAATTAGTGGGCTTATATACGTGTTTAC TTTTAGCGTCATAATATCAAGAATGCTGGATGTTTTCCTAGGTCTTTTGG GATACTTGATCATTGAACATGAAGGATCAGTGGAGTCTAAATTGTACATT ATTTTTGATATTCACAGATTACTCTTTTTCTCAAACAATATGCTCAATAT TTTTGTCTACGCAAAAATGATACCAGGATTTCGGCGTTTTTTGTTGGCTG TTTTTACATTTGGGCTGTATCGTCGAAGAAACACAATCAATTCGTAATAT GGTTGAATATTTCAAGTTTTTAAATTTTCCACATCACAGACTAAACAAAG CAATAACTTTCTGACTATTACTCGTCAATGTTACGAGTGGGAAAACCCTC AACGAGTCATCTCAAAATAAAAGAACAAACATTTTATTCAAAACAAAATT AAAAGTAAAAGTAAAAGAATTGTAATTTTATTAGATAAAATCTGTATACA TTAGGAAATTGGATTATTATGTTATAAATTCGCACAAATTTGATCGAGAT TACAATCTTTCTCTTTACAGTCAATAAACTTACCATTCTCTAGGTAATTA AAATGAGTTTTTTTCGGACATGCTGAATAATAGGTTGGTATGAAAATATG CTTGTTATTAAATACCAGATAGTTTTGTTCCGTTTTTTTTTCGGTCATGC TGCATAATTTTCTTTTCGTTTTTCGGAACTATTACTCGTGCATAGGTAGA AAGATGTACTAAAAAGTTAAGCAACGGTCCTAAAAGGCAATAATAATACC ATAACAAAACTTTTGACTCAATTGGAATCAACCATCCTTATATTTTTTTC GGACATTGTAAATGACAAGTTCCTGTTTTTATTGAAATTCTTTTGACGGT TTTTCGCTTTTTAATTCGATTTTAGTGTGTAAAAGGCCGATATTTTTATA TCTAATTTTCATTTTTTTTTGTATTTGAATTAAATTAAATTTTGAAATTT GAATCTTAAAAAAGTATCAACACGGTAGAACTATCAACATTACCTTAAAT GTTTGATTTGCGTTCAAAGTAATCAAATCTCACTGATATTTTCCTTTCCA AGCTCTCTAATTCGATGTTAACCTTGTGTTTATCGAATTGGAGAGACTTC CCACTATTCAATATAAAAAGTCAATTCTTCTCGAAAATTGAATTACAGGG CGTCGAATTAAAAAAAGTATTAAAAGGCTCTATATAATTTTATTTTTTCT CCAATTCTCAATTTCGGTTTTTTATTAAAAGACTATTCCATGCTGGCTTC TTAAGTAGAAAGAATTAAAAAATTTAAACATGTTTAAAAGTAGAATTGTG TTTTGAAATTTACGCTGTGCGTTACTCTAAAAGATGAAATTAGAATCCAG ATTTTGTATTTATAGAAGCTATTTCCTGCTGTTAGGCAAATTGGCTGTAC CAAGAAATTGTTATTGTTTTTCTTGCTCTTATATTTTTTGTGATTCATTT GTTCAAAAATGAACATCCCGACACAATGTTTTGATTTAAAACTAAAGAAA TATCACATTGATACTCTTCACTCTTGGTACGCCCCTCGCTTATTTTTTAT TTTTGTAAAAATTTTCCGAACGGGACATTTTCATTTTAATCCTCCTGCTA ATCAATACACGCTTTTTTAAAGAATATCTTCTATAAAAATATCAGGGTGA AAATTGGCCAAATCGTAAGAACCCCTAAGAATAACCTCTAGGGTGAGTTT CACAGAATTTGATAAGAATACAGTTATTTTGTATTAGGTTAATAGAAAAA AACTGCTACTTTTGTTAGACTTGAATTTACACTTTGAGGCAGAAATGTAA ATTTAGCTCCAAATGTTCATTCAAAATTGATCATTTCTCATGTTTGTAAA AAAGTCTGAAAAAGGAAGAATATGCTAAGAATATTTCACCCTCAATTTTG ACAATTTCTTAAGAATGCTTGACCCTCATCCAAAGTAAAGATTGATTATG TTTACAGTTGGTTATTGTGTAATTTCACAAAACACTCTGCCTGTCATTTT AGCAGAATACCTATATCCATTTTATAAGAACAATAAAAACCTTGAATGTA AAAATTTAATAATTGAATTAGTAAAAATGGCATACCTCAACTCAAAATAG AAACAGTTTGAACATTTTGATGTTTGAGCTGCTGAAAAATAAGAATACCC GAGCTTCAATTCATCGCGTTGAGAATAATGAAAAGTGAAATTTTTCTTTC AGGAAATGTGGTCGAAAGAGACGATGGGGCGGATGATGAATGGTCCAGTA TAAAAGATGATATGATGCAACCTGATCGTCTCTTAGATGCCAAATCCAAA GAAAGTCATATCGTTCATTGTCCTTACTATCCAATGGTTGGTATAATACT TGTTTTCTTTATAAGCATTCCGCTTATAAGCATATCTTGGCTCTTATATG GCAAAAATTTAAGCATAAGCTAAGCATTACCTTGAGCCTATGAAAAATTT ATTTTCCTGATTTTGGCTGTTTTNAAAATCAAACTGGTCTCGCCATATTT AAAAACTTCAGATGAGAAACTTACGTGTTCATTTCGATTCTTTGAACTGA ATTTAACTGAATCATTTTGGTTGGATAGGAAAAACACGAATATTGGTGGG TATACTTGATCAATAAGAAGAACAATCAATTAGTCACAGCTCCACAGCAA GTCACCAATCTCAAAGTTACTGAAAAGGTTTGTCTACTCTTGCAATACTA AGTGCTTAATTTTTTAGTTCGATTGTTTTCCAAACCCGTTTATTAAATAT TTTCATTAGTCAAGAGAAGATCTATAGTTACCTTAATTTTGGGGTACTTA GATTTTAAAACTTTGACTACTTTTGACTACCCACTGACCAGAGCTCTCCT TCTCACCCTTCTTAGGTGCAATTGAAATTCTCAGCACCAGAGAAACCAGG CATTTATCAATACATTGTGGTGGTCAAGTCAGATTCTTATGTTGATTTCG ATATGACTAAACCTCTAAAAGTAAGTACTGTTGAGTCTCTTTAATTTGAC TCTCTATTATAACTGGAATGTCTCCTTAACTCAAACAAGTTTTCTCATCC CTTCGGATAACAACCTGACTGCATAATTCCATAAACAATTTGCGTTCCCC GTGCTTGTTCGAGTTATGGAGACTCCACTTTAGCTCGTTTCTCAAATTTC TTATGTGATTCGGTAATAAATGCGTTCAACACGAAGACTAATGGTGAACT AATATTTTTAACCTTTGAATATGGAATACGTGCATCGCGTGTATAATACA TCTTACAAGTGTTTTGTGTATCTATTTTTATATAATCAAGCCCCCTTCAT CATTTTTTAAGATGTCTTTGAAATGACTGTTGCTTTTGTCACTAGGCTTG TTCTAAAAATGATTTCTTCTACGGACGCTGTTTNAATATTCGCTTACCTT GAGTTAATAAATCGCAATATCTACTGAAACCCGAAATCAAATTTGGATTA TTCCCCAGCTAAATTCCCACTGAGAGTTATTGTGTAATTTAACAAAACAC TCTGCCTGTCATTTTAGCAGAATACCTATATCCATTTTATAAGAACAATA AAAACCTTGAATGTAAAAATTTAAGAATCGAATTAGTAAAAATGGCATAC CTCAACTTTAAATAGAAACAGTTTGAACATTTTGATGTTTGAGCTGCTGA AAAATAAGAATATCCGAGCTTCAACAAGAAGAATTCATCGCGTTGAGAAT AATGAAAAGTGAAATTTTTCTTTCAGGAAATGTGGTCGAAAGAGACGATG GGGCGGATGATGAATGGTCCAGTATAAAAGATGATATGATGCAACCTGAT CGTCTCTTAGATGCCAAATCCAAAGAAAGTCATATCGTTCATTGTCCTTA CTATCCAATGGTTGGTATAATACTTGTTTTCTTTATAAGCATTCCGCTTA TAAGCATATCTTGGCTCTTATATGGGAAAAATTTAAGCATAAACTAAGCA TCACTTTGAGCCTATGAAAAATTTATTTTCCTGATTTTGGCTGTTTTTAG CTGGGATTTTACGGATTTTTAGAATTTCCCTCAAATTTTGATTGATGTGA TATAAGCATCCTTATAAGTATTTTTCAGTCTTGTCAAGTCATCGATCTAA GCATCTTCGAGCCTGTTTTCGAATTTTTGTATGCTTAGGCGATGCCAATT TAATTGATAATCTAATGGTTAAAATGAAAAATTGAACATAAAATTCTTAA AGCCTTGGAAAAACTAGCAAAATTTTTAAAATTTGGGAGTCTGTGAAGCA ATGCAAATAAAAATGTACTATCAAGATGAATTAGATTTTTATTTCGATTT TTGGAATTTCAGGGTCGGTTGGGCTTGTAAAACAATTAATAGTAGGGGGA ATTTTGTTCGATTTTTTGGAATCGCTTGACTGTTTTGTTAGAAGCACTTG TTATACATTTTTGGAAAGCTAAGGGGTAGGGGANAGGCATTTATCAATAC ATTGTGGTGGTCAAGTCAGATTCTTATGTTGATTTCGATATGACTAAACC TCTAAAAGTAAGTACTGTTGAGTCTCTTTAATTTGACTCTCTATTATAAC TGGAATGTCTCCTTAACTCAAACAAGTTTTCTCATCCCTTCGGATAACAA CCTGACTGCATAACTCCATAAACAATTTGCGTTCCCCGTGCTTGTTCGAG TTATGGAGACTCCACTTTAGCTCGTTTCTCAAATTTCTTATGTGATTCGG TAATAAATGCGTTCAACACGAAGACTAATGGTGAACTAATATTTTTAACC TTTGAATATGGAATACGTGCATCGCGTGTATAATACATCTTACAAGTGTT TTGTGTATCTATTTTTATATAATCAAGCCCCCTTCATCATTTTTTAAGAT GTCTTTGAAATGACTGTTGCTTTTGTCACTAGGCTTGTTCTAAAAATGAT TTCTTCTACGGACGCTGTTTGGGTTGGAACGGGACAGCGTGGAGATTATT CTGTTCACGATATGTACCATTGCAATGTTTTCTGATATTACATCATGGAC CCAATAGCTGATTGATTGTAAGTGACGTAAAATCAGTCAATACGTCACTT TCAACCAGTCAGATGTTCGGTCAGTGAAGACATTGCAATGGTGCATATCA TGAATATACATTTTGTTCCTTTGCAATTTCCTCAAATAATCCTCAATCAT GTCCTGCAAATTGATATGGTGTTTTTCTGTTATTCCCAGGTGGCAGTATC AGAAGCGAAAGATTTCGATCCTGGAGAGCATTGGAATTATTCGAGTGAAG ATGACGATAAAGATGATTCCGGTGAAAGCGTTTACGAAACTGAAGAAGAA GATGATGATGATGACGATGAGGAATAATCACGCCCTCATGGTGGAACGCC CGTCAAACAACCGCCCAAATAGTCAAAAGTGTCAAGGGCGTCTGAACATC AGATCATGGTCTCTCAGACAGATCTTTTTAGACTTGGCCAAGGAATACTT GTTCCAAAACAACTTTTCGGAAAAGGTTACCACATGTTTGATTTTTAAAA CAAATTTCAGACAATTCTAGCTTCTCTTTTATATTGACCACGCCCAAGGG TTTTTAGTACTTTACTTTCGCACCTCTTAAGCTAAAGTGCCGCTCGTATA TTTCCCTCTTTTTAATTATTCAGTACTGAATACAAATAATAAAAATAAGG GAAGGTTTTTTATCAATATTAGAAATTATTATTATTATAAGAAATATGTA TCGGTAGGTTTATTTTATATCTAGAAATATTTCTGTTGAATTACACTTCA TGTCTGATAGAATCTGTTTAGAATATTGCCCATTCGGTCTAATAATTAAA CTTTTGTTATATAAAGTGCTAAATTAAATTTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071462TCONS_00071462Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071461TCONS_00071461Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00071458TCONS_00071458Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00071456TCONS_00071456Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00071453TCONS_00071453Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00071450TCONS_00071450Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071449TCONS_00071449Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00071447TCONS_00071447Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071446TCONS_00071446Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071445TCONS_00071445Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071444TCONS_00071444Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071444-proteinTCONS_00071444-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_60supercontigscaffold_60:1454946..1480227 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SEC63translocation protein SEC63 homolog Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
123.55 126.96 63.56 50.45 70.18 55.83 155.53 161.83 79.01 78.29 80.84 79.61 68.88 65.78 95.21 110.08 75.37 91.12 23.13 31.14 56.68 54.31 72.47 74.67 59.68 67.44 46.81 37.78 77.79 60.18