TCONS_00071459 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00071459
Unique Name	TCONS_00071459
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1959

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_60:1456923..1480227-

transcript sequence

>TCONS_00071459 ID=TCONS_00071459|Name=TCONS_00071459|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1959bp
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CTTACTATC

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_60:1456923..1480227-

Legend: exon

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>TCONS_00071459 ID=TCONS_00071459|Name=TCONS_00071459|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=23305bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_60:1456923..1480227- (Clytia hemisphaerica)
TAAATAGGTTAAATAAAAATACAAAAAAAATATGGCAGGAATGAAATTTG
AGTACGATGAAAAGGGAACAACATTTTATTACTTTATTCTTTCATTTTGT
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CTGAAAATTTGTCTGAATATCTTAGATTTTAGTAGAATTAACTCAAGTGA
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GGATAGCTTTACCACAACAAACACTATTAAAAGGTAAGGTTGATGCTGGT
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GGAAAAGGCGTGAACGACTTTATAGAATGTTTGTATAATACTTTGCTACT
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CAAAACTTGAAACTATGGAGAATTTAATGAAATTGAGTCAGATGCTGATA
CAAGGAGTTTGGGAATCTAAATCGACATTTCAGATGTTACCTCACATTTC
ACANAAATTGAGTCAGATGTTGATACAAGGTGTTTGGGAATCTAAATCGA
CATTTCAGATGTTACCTCACATTTCACAAGAAAACCTACGTCATTTCAAT
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GTAGATATCCGACTGAAAAAATCCTTTTCCTGTGTCCATTTTCATAAGAG
TTTGTTATGGTTTACAGAGCGGTGGCTTAACTTTTTTTGTTTGCTTATTC
TCGGCTTTTCAACATTTACTGTTTGTGTCATATAATTCTGGGCGCTACTA
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TTGAAAAAGGCAAACAAAACTGTTTTGACCCCCCTCTTCTTGTCGTCCCC
TTTTTAAAATTTTTTATATCCTAACAACTATTTGAAGCTTTTGCAATTTC
AAACTGTCTTATCGTTATAACTGTACAATAGCTTTGAGTAAGCTTTAAAA
TAAGTGCTCAAGTTGTAGAGTGGATCATTGTAACAGTTTGAAAAATTCTT
TTTTCAGAGGAAAATAAAGACGATTCGACAGTTTGTTGGGATGAACAACA
CTGACCGACGGTAAAGGCTTTTAGTTTAACGTGAAGGAATTCAAAGATTA
CTTTTATAACAACCTGTATAAACCTGTATGAAAGAATGTATTTTGACAGA
GAATCGTTTCTACTTTTCACTTTTTCACTGATCTGTTCAGTTTTATAGAA
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ATTATATACGAAATTCCTTATAAGCATTTTCATAAAGAGCCAGATAATTC
ACACCCCTCAGGTAGAAATACAGTGTCTAGCACTGATGTTTGAGGACCCA
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TTTCTTTTTAGTCATCGATGACGAAGATATGGAAACTGTGACAGTAGGTT
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ACACCACTTCCTTTTTGTATAGTAACGGGTGTTATTTTGTTTCTGCTTTC
TCTCAAGCTAAAACGAGACTGAATAAGTTTTTCAGGTGGGCGTCAGTGTA
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AATAAGAAGATTTGCTTGAGTTAGAGACGAAGACGAAATAGAGTGGTGCT
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GAAAATAACGATGACGTAAGAATTTCGAAATTTCTACAAATTGATATTTT
GTTTAAAACGCTAAATTTGACAATCATCTAAAAGAATTGCCCGATAATTT
TACAGTCCATGTTTTCTAGAGACGCTAGAGTTTTATTCTGTTTTATCCTA
TTTCTCAGGTTTGTTAAACGGAAAAAAGTTTTCGTCTTCATTTTGTTATC
TAAGTAATTGTATTATCCCAGTTATTGATTTTCAATGTTCATATTCAACA
GGCTACAGCGTCACCGAAGCCGGTCAAAGGTTGGCAACGTAAAGTAAAGA
AAGGGAAAGGAGCTAAGAAGCCAGTCAAAAAGCAACCTGTCAAAAAGAAG
AAAAAAGAGGATGANCGCCCTGGTCACACTCACCAGAAAAACTATGGAAG
TATGTACACCACTTCCTTTTTGTATAGTAACGGGTGTTATTTTGTTTCTG
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GTGTAGCCTTAGCTTTCTCTTATAAATAAGTTGCATTATGGTTAATGTTT
CTTTTAATAAGAAGATTTGCTTGAGTTAGAGACGAAGACGAAATAGAGTG
GTGCTTGTCACAAAAGACTACCTTGTTCAAATATTACGCTTTCTTTTTTG
GACGGAAAAATCCATCGAATAACACTGTTTTTATAAAAAAAAATTATTTT
TACATTTTAGGAGTTCTTTGGTGATGAAAGTGAAGAAGTGTCTTTGAATA
ATATCGAAAATAACGATGACGTAAGAATTTCGAAATTTCTACAAATTGAT
ATTTTGTTTAAAACGCTAAATTTGACAATCATCTAAAAGAATTGCCCGAT
AATTTTACAGTCCATGTTTTCTAGAGACGCTAGAGTTTTATTCTGTTTTA
TCCTATTTCTCAGGTTTGTTAAACGGAAAAAAGTTTTCGTCTTCATTTTG
TTATCTAAGTAATTGTATTATCCCAGTCATTGATTTTCAATGTTCATATT
CAACAGGCTACAGCGTCACCGAAGCCAGTCAAAGGTTGGCAACGTAAAGT
AAAGAAAGGGAAAGGAGCTAAGAAGCCAGTCAAAAAGCAACCTGTCAAAA
AGAAGAAAAAAGAGGATGAGGTAAGGTGCTAAGCTATAACGAAGTTTAAA
GTAAATAATAAGTAATTGCATTAAACTTATTAAGGAATCGTTTAAAATAC
CGACCTATTCTAAACAATTGTGGAGTTTTCTCAGGTTTTTTTATTTATCC
TTGAGTTATGCTACGACTATATAGAATTATTACAATCCCTTTATGAATTG
AGCAAATATTTAAGCCATTTGACTAAATACAAAATAATTATACTTAAATT
TATTTTTGATAAATTACGAACAATTCTGAAGATCCAAAAATTGATAACAA
TCACTAATCTTGGTACCGATGTACTAGTCACGATGTCTGAGATTTTAGTA
CTGACCCCTGGGGTGGCTTGATGGTGCTTGTCAGAATACTTTGCATTCGG
ACTAATGGTGTTTTCTTTTCCTTTACATCGAAAGAAACAAGAAGACAAAA
CAGAAAACAAAGAAGAAAAAGATGAGGAAGCTGATGAAGAATCTTATGAC
GGGTAACATTTTTTTATTTAACTGAATGCACTTCAAACGATAGATTTGTT
TCTATGTGAGACCCGGATCATCAGATTATTAGCGACCAGAAGGTGTGACC
ACGCTATAGTGCTTTATTCATGTGGANGGATTATTTGCGACCAGAAGGTG
TGACCACGCTATAGTGCTTTATTCATGTGGAGTTCAAGCTCAACCCACTC
TTTTTTAGAGTGCCTAAATATTTCATTGACTGTCTTGTGTTGATCTGAGT
TTTTCTGACATTTATTTTTATTCAAAGTACTCATTTCATGGGCGGGGTCT
GGAAGCTTTCAAATCCCTCTTCGACATACTGAACTGGATTCATTAAAATT
CATTAAAATGAAAAGGCTGGTGCGTGAAAATTTCACTACAGTGAAGTCTG
TTATAACTCAACACGCGCGGGGAGCTGCGGGGAGCGCAAATTTGTTCGAT
TTTGACAAAACTTATTTTATTTAACATATCTAATATTTGGCGTGCCGGGA
CTGCCTCCGTGCAAAAATTGTGTAGTATATATTTAATATTTGGCGTGTCG
GGATTGCCACCGTGCGATAATACTTAATATGCGGAAAAAAAATTTGTTCG
ATTTAAGAAAGTTTTGCGATGTAAAGAAAGGCTTTTACGACATTTTTAAC
TGAAGGGACTAGAAAATTTGTTCGAATTAAGGAGACGGAGTTATAGAGGC
TGGAGTTAAGACGAGATTAGAGTTGATTTAGGATTTGAGTTAAAGAGACT
TCAGTGTTTTTAGTCAAACTGGCTATTTTCCGTTGATAAGTCTACGGAGT
TAATAATTTTAAATAAGATGAATTCTTTTCTCATTCAGCGTGGAAAATAT
GGATAGCGAAGATGAGAATGCAGCCGATGATGAGGCGGACGAACAAGCAG
ACGAAGCGGATGACAAAAAGGATGAAGAAGATGATGATGAGGATGAAGGT
AAGAAAGATTTTCTCAGGGTATGCATAGAAGTTGGGAAATATTTTCCTTT
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TTTCACCTTTTTTCACCTTTTTTAGTTTTTTTACATATGCATGTTTTTCT
TCCACAAATTACATGGCAGATGTTCTTTCTTGGATAAATAGTTATCTTTT
GTAGAATGTGTGAATTATAATTGATAGAAAACATAATAATTTTTTTATTA
TCGATACCATCTTGTCTCCAAAATATTTGGTTCTTCTTACAAGAAGTTAG
GATATAATAATATATGTGCTATGAGGCGAGACCAATTTAATTTGTTGTTC
TACGGGCAGATTGTTAGCAAAATATGGGTCGGTTGGTCGGTAAAATAAAA
ATAAAATTTTCATTTATCAGGGTTGTTAAAGTACCGAAAATGTTTTCCAA
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AAAATCTTAATGTATGGAAATAATGCGTGATTTTCTAACTTTTTCAATTT
TTTTAATTAATTTTCAGCTTTATTCAAATCTGATTCTTACAAATAACTAG
TGTGTAAAATATATTGTAGTGGAAATTCAATATTATTATTTTTTTGATTT
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TCGCCTGAATAAAAATAAAATCGAAAATTTTTAACATATAAACAGAATAC
AGTAGGCCAGAGATGAGATTGGCAGTTATTATTATTAAATGCATATGAGT
AGATTGTATCATCGATAAGAAGCCATCGATAATGACTCAATCTGGGGTTG
GTCTAAGTATCAATCAGATTCATGCTCCCTGGTCAGTAAAATCTGGTTCT
ATGCATTCATTTTCGGTATTTCTATTCTGGTCTGTAAAATATTTAGGTAC
TCCACAACCTAGCCCAATTGGCTACCCCAATTGGCTACCCTGCTCTTTAG
ACCAACCCCTCAATCTGGATAATTGGAGCTGAGTGGATGAAGAACGGAAA
TATACCTTGGTATCTAGACTTTAGATTCCCTTTTAAAATTGAATAATTGA
ATAATAAATAAATAATATTAGTAATAAATAAGTATAAATGGTAATTAGAG
GCAAAGCAAAAATGAAGCAGGACTAAAGAGCAAGCTTAATGTTGACGAAC
TATTCGTTATAATAGTATTGAGATTTTACTGCTTGCTGTTTTGATTTATT
GACTTGAAGTGAAGTTACAAGATAGCGACTAAAGGATGAGAGGCTTTTGC
ATTATCTAGGTAGGTTCAGAGATTGTACCATTAGTCCAGGGAAAGTGTGT
CAATTGTGAGTTTTTGGCTAGAAAGCATGAAATTTGATACAGTGGTACCT
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TTGTGTATCATATAATAGTTAAGAAATTTAACACTTCTATACACCTTTTC
GACCGTAGTCACGCGGTCAGGCGCGTGCCACTTATATTTAATTTACCACC
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ACCGCGCGGCAATTTGCGGCTAGGGTCGAAAAGGTATATTGAAAAGGACA
CGTGTAAAAAAGGCACAAATGAATAAATGTAGATTAGATATTGGTTTAAT
TGGTTCTCCATGTAGAGTTTAGCCAATGATGAAACATAAACTTATAAACT
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AGAATTTAGAAATTCAAAAATAGGAGAATTCTAAAAAAAAGAAGCTAAAT
CTAATAAAAACATTTATTACATTTTTTATTAAAATTTTCCTTTTTCATAA
TATTTTTCACATTTGCATAATGCATTATGTCAGGAATATCTAGAGAACTT
TTATTTCATGAGTCTTGCAGAGAAGTGCGACTTATTTTTAAATTGGTTTT
CCACCGTCATATAGTAATTTATTGCTGTAATTTCGAAAGCAATAGAGAAA
ATGAATGCAAATGGTAGCCACGATTTCACTATGAAAAATGGTAATATCAC
TATCGATAGCGATAATCTCAGCGGTGAAATTCATCCAGAAGTTCTAGTGA
ATATTCGTGAAGTAGCCGAAGAAACTTTTTATTACTACGTTCTTAATATT
TTGCCTGGTTTGGTTGCGATTGGTGGTTTCTGGAATCTGCTTATCATCGT
TTACTTCGTCAAAATCAATTTGAAGAAAGGATTAAAACGAATGAGCTCGT
ATCATCTTCTGATCATTAATCTTGCTTTGGCCGATCTAGCCNGAAGGCTC
TATATGATTTTATTTTTACTCCAATTCTCAATTTCGGTTTTTTATTAAAA
GACTATTCCATGCTGGCTTCTTAAGTAGAAAGAATTAAAAAATTTAAACA
CGTTTAACAATTGTGTTTTGAAATTTACGCTGTGCGGTACTCTAAAAGAT
GAAATTAGAATCCAGATTTTGTATTTATAGAAGCTATTTCCTGCTGTTGG
GCAAATTGGCTGTACCAAGAAATTGTTATTGTTTTTCTTGCTCTTATATT
TTTTGTGATTCATTTGTTCAAAAATAAACATCCCGACACAATGTNCACCT
CTCATTTCCTTTTCAAACACACATGGGAACTCCCGGCATTTGCATGTCTT
ATATTCCGTGTTTATTTCCCGAACGTTGTTCCAATGACAGCATCTTGGGC
ACTGACCTTAATTTCTTTTGCTAGATATCGCTCCATTACCTACCCAATGG
CTGTGCGAATCAATAANTTTGATTTAAAACTAAAGAAATATCACCTTGAT
ACTCTTCACTCTTGGTACGCCCCTCGCTTTTTTTTTTATTTTTGTAAAAA
TTTTCCGAACGGGACATTTTCATTTTAATCCTCCTGCTAATCAATACACG
CTTTTTTAAAGAATATCTTCTATAAAAATATCAGGGTGAAAATTGGCCAA
ATCGTAAGAACCCCTAAGAAAAACCTCTAGGGTGAGTTTCACAGAATTTG
ATAAGAATACAGTTATTTTGTATTAGGTTAATAGAAAAAAACTGCTTCCT
TTGTTAGACTTGAATTTACACTTTGAGGCAGAAATGTAATTTTAGCTCCA
AATGTTCATTCAAAATTGATCATTTCTCATGTTTGTAAAAAAGTCAAGTC
TGAAAAAGGAAGAATATGCTAAGAATATTTCACCCTCAATTTTTGCAATT
TCTTAAGAATGCTTGACCCTCATCCAAAGTAAAGATTGGTTATGTTTACA
GTTTGTTGTTGTGTAATTTCACAAAACACTCTGCCTGTCATTTTAGCAGA
ATACCTAGATCCATTTTATAAGAACAATAAAAACCTTGAATGTAAAAATT
TAAACAGTTTGAACATTTTGATGTTTGAGCTGCTGAAAAATAAGAATACC
CGAACAAGAAGAATTCATCGCGTTGAGAATAATGAAAAGTGAAATTATTC
TTTCAGGAAATATGGTCGAAAGAGACGATGGGGCGGATGATGAATGGTCC
AGTATAAAAGATGATATGATGCAACCTGATCGTCTCTTAGATGCCAAATC
CAAAGAAAGTCATATCGTTCATTGTCCTTACTATCCAATGGTTGGTATAA
TACTTGTTTTCTTTATAAGCATTCCGCTTATAAGCATATCTTGGCTCTTA
TATGGCAAAAATTTAAGCATAAGCTAAGCATTACCTTGAGCCTATGAAAA
ATTTATTTTCCTGATTTTGGCTGTTTTCAGCTCGGATTTTACGGATTTTT
AGAATTTCCCTCAAATTTTGCTTGATGTGATAAGCATCCTTATAAGTATT
TTTCAGTCTTGTCAAGTCATCGATCTAAGCATCTTCGAGCCTGTTTTCGA
ATTATTGTATGCTTAAGCGAGGTCAATTTAATTGATAATCTAATGGTTAA
AATGAAAAATTGAACATAAAATTCTTAAAGCCTTGCAAAAACTAGCAAAA
TTTTGAAAATTTGGGAGTCTGTGAAGGAATGCAAATAAAAATGTACTATC
AAGATGAATTAGATTTTTATTTCGATTTTTGGAATTTCAGAGTCGGTCGG
GCTTAGCCCGAGCCCCCTTTACAAGTTGTAAAACAATTAATCAAACTGGT
CTCGCCTTATTTAAAAACTTCAGATGAGAAACTTACGTGTTCATTTCGAT
TTTTTAAACTGAATTTAACTGAATCTTTTTCGTTGGATAGGAAAAACACG
AATATTGGTGGGTATACTTGATCAATAAGAAGAATAATCAATTAGTCACA
GCTCCACAGCAAGTCACCAATCTCAAAGTTACTGAAAAGGTTTGTCTACA
CCTTGCAATACTAAGTGCTTCAAATTTATTTTTCGATTGTTTTCCAAACC
CGTTTATTAAATATTTTCATCAGTCAAGAGAAGATCTATAGTTACCTTAT
TTTGGGGGTACTTAGATTTCCTACCCCCTCAACTCCGAACCCCCCGGGAA
GTAGTTAGCACTGGCCTTAAAATACATTATTTAAAGTATCTCCCAAAAGC
AAGGACATGCTAAACGTTGATTTGGTGACTTCGATTTTAAAACTTTGACT
ACTTTTGACTACCCACTGACCAGAACTCGTTTTCTCACCCTTCCTAGGTG
CAATTGAAATTCTCAGCGCCAGAGAAACCAGGCATTTATCAATACATTGT
GGTGGTCAAGTCAGATTCTTATGTTGATTTCGATATGACTAAACCTCTAA
AAGTAAGTACTGTTGAGTCTCTTTAATTTGACTCTCTATTATAACTGGAA
TGTCTCCTTAACTCAAACAAGTTTTCTCATCCCTTCGGATAACAACCTGA
CTGCATAAGTCCATAAAAAAATTGCGTTCCCCGTGCTTGTTCGAGTTATG
GAGACTCCACTTTAGCTCGTTTCTCAAATTTCTTATGTGATTCGGTAATA
AATGCGTTCAACACGAAGACTAATGATATGAACTAATATTTTTAACATTT
GAATATGGAATACGTGCATCGCGTGTATAATACATCTTACAAGTATTTTG
TGTATCTATTTTCATATATTCAAGCCCCTTTCATCATTTTTTAAGATGTC
TTTGAAATGACTGTTGCTTTTGTCACTAGACTTGTTCTAAAAATGATTTC
TTCTACGGACGCTGTTTGGATTGGAACGGGACAGCGTAGATTATTCTATT
CACGATATGTACCATTGTAATGTTTTCTGATATTACATCACGGACCCAAT
TCATGATATGCACCACTGCAATGACTTCATGAAATTATGCAACATTTCTG
TTTTTGTTCCACCTAATACGTCACTTTTTCTATTGTTTGAGTGACGTATT
GGGTGGAAAATTTTAAAAGTTCTCAGAAGACTCTCCAGTGGTGCATATCA
TGAATAGCTGATTGGTTCTAAGTGACGTAAAATCAGTCAATACGTCACTT
TCAACCAGTCAGATGTTTGCTCCGTGAAGACATTGCAATGGTGCATATCA
TGAATATACATTTTGTTCCTTTGCAATTTCCTCAAATGATCCTCACTCCA
TGTCCTGCAAATTGATATGGTGTTTTTCTGTTATTCCCAGGTGGCAGTAT
CAGAAGCGAAAGATTTCGATCCTGGAGAGCATTGGAATTATTCGAGTGAA
GATGACGATAAAGATGATTCCGGTGAAAGCGTTTACGAAACTGAAGAAGA
AGATGATGATGATGACGATGAGGATTAATCACGCCATCAGGGTGGAACGC
CCGTCAAACAACCGCCCGAATAGTCAAAAGTGTCAAGGGCGTCCGAACTT
CAGATCATGGTCTCTCAGACAGATCTTTTTAGACTTGTCCAAGGAAAACT
CGTTCCAAAACAACTTTTCGAAAAAGGTTACCACATGTTTGATTTTTAAA
ACAAATTTCAGACAATTCTAGCTTCTCTTTTATATTGACCACGCCCAAGG
GTTTTTAGTACTTTACTTTCGCACCTCTTAAGCTAAAGTGCCGCTCGTAT
ATTTCCCTCTTTTTAATTATTCAGTACTGAATACAAATAATAAAAATAAG
GGAAGGTTTTTTATCAATATTAGAAATTATTATTATTATAAGAAATATGT
ATCGGTAGGTTTATTTTATATCTAGAAATATTTCTGTTGAATTACACTTC
ATGTCTGATAGAATCTGTTTAGAATATTGCCCATTCGGTCTAATAATTAA
ACTTTTGTTATATAAAGTGCTAAATTAAATTTCTTTTGGCATGTAATATA
ATTTGATTAAAATAAAAAAGATCAATCGGTTAAAAAATAAATTATCAGTG
AAAAATTACAAAAATAACTTGAAANCTAGAATATTACCCATTCGGTCTAA
TCATTAAACGTTTGTTATATAAAGTTCTAAATTAAATTTCTTTTGGCATG
TAATATAATTTGATTAAAATAAAAAAAGATCAATCGGTCAAAAAAAAATT
ATCAGTGAAAAAATTACAAAAATAACTTGAAAGTGACGTAATGTCAGAAG
ACAGAAATTCATATTCCAGCTTCATCGAAAAAAGTATCAAAAGTTAAAAC
TAGGTGTCATACCCCCAAAAGAACACCCCTTATTGGAAAATTGCGGACAA
ATCACCATCTGTTGGGTGAAGCCTGAAATTCTTCCATCCCCATTTTTCCA
TAAACCCATACTCCCGATTATAAACGAAATGGATTGCCTTTCGGAGCTAT
TCCTAAGGACTATATTGAGCTGCTGACTATAGAAAAGAAAAACTTTCTTA
CTAGGCCATCAAAATATCGAAAAAATTGAGATTATTTCCTACACCGTAGA
TAATTACTATTAATCATTACTGTCGAACGTGCTAACCGCTCTGGCTCAAC
TTCAGTATTATTTAAATTACTCAAAAATCAACATTTTCAAAAAATGAAAA
AAATAAAAATCCCCCAAATATTCACCCAAGGAACAAGTGTACAAAACTTC
AATCAAAGCGGACCATTTTTGAAGTCTCCAGCCTGCCCCAAAATTTTGAG
GTGACATACAGACATGCATACAGGCAAACAAACATTCTCAGATTCTAGGT
AGCTCAACTGAAGTTGCAAAAAAACCTTTGATAAAATTTTAAAATTACAA
ACCTTGCCCTGGTTCCTCAGCTTGATCTTCTTTCAGAAGTTTTTTATATT
TGTTTTCCTTAGAGCTTTTGCTTTCAAACGCCATCACTTCAATCATTCTT
TCTAAGAAATGGGCCCACAAAAGGTAGAAACGTTTCAATCAGAAAATTCA
AGTTTTTCATTCTCAATATATCGTACTGAACTAAACAAAAAGCATACCCG
GCGGAACAACCGTAAAAGTGGGGGAGGCTGAAGGCTCAAATGGGATAAAA
TTCACTAGGAATTTGAGAANGTTGAGTTTCTTTGCTTGTTCTTGCATCTC
CTTGATCTTTTTCCGTTCGTTGAGTGTGAAATCTTCCGTTATACTTACCT
GAATGAAACAAGTTTCTTTCAGCATGTGTAAATTCTTCACGATGAGATCT
TTGTCATGTTGACTTTGTAGGGTGACTTTCAAAGGACGGCCATTCTTAGT
TTTTCTGTCTCCTAATCTGTGGTGAGTAACATTGATTTCTGGAACATTGA
TGTCATCTAGGAGTTCTCGGAACNTTTGAAATTGTCTGTTTACGAATTTA
TATAGCTTAAATTTTTTTTTAAACCTAAACGTCATATGCAACCACAGCTC
TTTTAAAAGTGTATAAATGGGCTCTTCTAGAAAAAAAATTGTATATGGGG
GATGGAAGGTATAACAATTTTCAGTGATTTATCCCCTAAAGTCAAAAAAT
GTGTACAAATCTGTACTAGCTTTAAAGCTAATAGAGTTCGANNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTCCTTCCGTTTTTGTTCTTCGGCAGA
TTTTATATCTTCTTTTTGCTTCTTGGTAATCTCGGCGTATGTTTTCTTTG
ATGTTTCAGTCATTATATCTGCTGTGTGCTTTATTTCCTCCTTTATCATG
CTTCTTGTCTTTTCCTCCATCTCTTGTAGTTTTCCTGCCAGAAAGGTTTT
GAGGTCATTTTTGATGGAATCACGGGTTTTTGTGTTGGTGTTGACCTCAT
TGTTCAGTTTTTGTATGACGTCGTCTTTCTTTTTAAGTTCATTTTGAATC
ATATGTTGAGTGTTTTTTCCCACTTTATTTCTTAGGTCTTTCGTTATTCG
CACGCAGTTTGAACATAAGTAATGATCGTTGTAGGATGTCACAAATATTT
GTAGTTGATACTCCATAATGAACTAATCTTTTACATTTTTTGCATGTTAA
GCGATCCAGGTCTTCGTTTTCAGTACATCTTGACGACGTGTAAGCTTGAG
GTGGTGAGGCTGCTTCGAAAGGCTGATCTTTATCCATTTTGATGTTATTT
TCATGAATTTTGATGTTTTTATTTATTTTCAGCCATTTTTTCGAAAAGCG
TTGCAAAAGCGTCTGATCTAGTTGACGTCAAATAAAAACCATTATATTCC
TTCACTCTCCAAAAGTTCAAGCGAATGTGAACATTTATGTTCTATTTGAA
TTTATTGAATATAAGATATAACGAATTTTGTTAGGTGACAACAATCAAAT
ATCTTTAAAATTTGTCCAAAACTATTGTGAAATTTAACAGTATATCCTAC
AGTATATATATTAAAGAATAAATTATATAAACAATAAAAACCATTAACCA
TGTTAACCATGTTTATCGAATTGAAGAGACTCCCCACTTTGTATTATCTA
GGTAGGTCAGAGATTGTACCATTAGTTCAGGGAAAGTGTGTCAATTGTGC
ATTTTTGGCTAGAAAGCATGAAATTTGATACAGTGGTACCTTAGGGGGTA
AGAAACATTTTAGAAACAGCTTCTGACCCACTTCCGGAACACCTGTTTGT
GTATCATATAATAGTTAAGAAATTTAACACTTCTATACACCTTTTCGACC
GTACTCGCGTGGTCAGACGCGTGCCACTTATATTTAATTTACCACTCTAA
AACCGATCCAATCCTTTATTTTTTTACACTTTTTTCTATTGTCCTTAGGT
GTGAAAAAAGACTGGAACGGTTTTAGGGTGGTAAAATGGACAAAAAATGC
CCGCGCGGCAATTGGTAGCGAGCACCTCACTAAAAACCGGGATTTTTCAT
CTCGTTTCTTAATTAATTGCGTAAAAAAAACGCGGGTGACGTCTAGTATA
GGCTAGGCAATTGGCGGCTAGGGTCGAAAAGGTGTATTGAAAAGGACACG
TGTAAAAAAGGCACAAATGAATAAATGTAGATTAGATATTGGTTTAATTG
GTTTTCCATTTAGAGTTTAGCCAATGATGAAACATAAACTTATAAACTTA
TAGGATCAGAAGTATCGAGACTAATATATCGAGTCTCAAAATGAAGATAG
AATTTAGAAATTCAAAAATAGGAGAATTCTAAAAAAAAGAAGCTAAATCT
AATAAAATCATTTATTACATTTTTTATTAAAATTTTCCTTTTTCATAATA
TTTTTCACATTTGCATAGTGCATTATGTCAGGGATATCTCGAGAACTTTT
ATTTCATGAGTCTTGAATAGAAGTGCGACTTTATTTTTAAATTGGTTTTC
CACCGTCGGGTAGTAATTTATTGCTTTAATTTCGAAAGCAATAAAGAAAA
TGAATGCCAATGGTAGCCACAATTTCACTATGAACAATGGTAATATCACT
ATCGATAGCGATAATTTCACCACTGATGGTAGCGCCAGCGGTAGCGGTGA
AATTCATCCAGAAGCTCTGGAGAGTATTGGCGAAGTAGCAGAAAAAATTC
ACTATTACTTCTTTCTTAATATTTTCCCTGGTTTAGTTGCGATTGGTGGT
CTCTGGAATCTGCTTATCATCGTTTACTTCGTCAAAATCAATTTGAAGAA
CGGATTAAAGCGAATGAGCTCGTATCATCTTCTGATCATTAATCTTGCTT
TGGCCGATCTAGCCATCTGCATTGGTGTACCAATTGCCTTTCATTTCTAT
ACAAAACACACATGGGAACTCCCGGCATTTGCATGTCTTATATTCCGTGT
TTATTTCCTGGAAGTTGTTCCAATAACATCATGCTGGGCACTGACCTTGA
TTTCTTTTGCTAGATATCGCTCCATTACCTACCCAATGGCTGTCCGAATC
AATAAAAAGAAATACGGACTAGCTTGTATTTTGATTTGGGTTATACCAGC
TCTTATCAACATCGCTGATTTTATGCGGATTAAATTGGTGTATAATTCTG
AGGAGGATAGCCATAGTTGTGACTACGACTATCCCAAAAGAGGCCAGAAA
CCAGTGGTTGAATCGCAAGCAATCGTCAATAACGTGATCGACAGCTTCAT
CCCTTTAGCACTAATGGTGTATTTCTACTACCGAATGTCAAAAGCGATGC
ATCGAGATGAAAATGCTAATTCGTTTGCACTGAGTGACCAAAGCCGATCA
AGGAATCGGGCAGCGCTGAAAACAATTAGTGGGCTTATATACGTGTTTAC
TTTTAGCGTCATAATATCAAGAATGCTGGATGTTTTCCTAGGTCTTTTGG
GATACTTGATCATTGAACATGAAGGATCAGTGGAGTCTAAATTGTACATT
ATTTTTGATATTCACAGATTACTCTTTTTCTCAAACAATATGCTCAATAT
TTTTGTCTACGCAAAAATGATACCAGGATTTCGGCGTTTTTTGTTGGCTG
TTTTTACATTTGGGCTGTATCGTCGAAGAAACACAATCAATTCGTAATAT
GGTTGAATATTTCAAGTTTTTAAATTTTCCACATCACAGACTAAACAAAG
CAATAACTTTCTGACTATTACTCGTCAATGTTACGAGTGGGAAAACCCTC
AACGAGTCATCTCAAAATAAAAGAACAAACATTTTATTCAAAACAAAATT
AAAAGTAAAAGTAAAAGAATTGTAATTTTATTAGATAAAATCTGTATACA
TTAGGAAATTGGATTATTATGTTATAAATTCGCACAAATTTGATCGAGAT
TACAATCTTTCTCTTTACAGTCAATAAACTTACCATTCTCTAGGTAATTA
AAATGAGTTTTTTTCGGACATGCTGAATAATAGGTTGGTATGAAAATATG
CTTGTTATTAAATACCAGATAGTTTTGTTCCGTTTTTTTTTCGGTCATGC
TGCATAATTTTCTTTTCGTTTTTCGGAACTATTACTCGTGCATAGGTAGA
AAGATGTACTAAAAAGTTAAGCAACGGTCCTAAAAGGCAATAATAATACC
ATAACAAAACTTTTGACTCAATTGGAATCAACCATCCTTATATTTTTTTC
GGACATTGTAAATGACAAGTTCCTGTTTTTATTGAAATTCTTTTGACGGT
TTTTCGCTTTTTAATTCGATTTTAGTGTGTAAAAGGCCGATATTTTTATA
TCTAATTTTCATTTTTTTTTGTATTTGAATTAAATTAAATTTTGAAATTT
GAATCTTAAAAAAGTATCAACACGGTAGAACTATCAACATTACCTTAAAT
GTTTGATTTGCGTTCAAAGTAATCAAATCTCACTGATATTTTCCTTTCCA
AGCTCTCTAATTCGATGTTAACCTTGTGTTTATCGAATTGGAGAGACTTC
CCACTATTCAATATAAAAAGTCAATTCTTCTCGAAAATTGAATTACAGGG
CGTCGAATTAAAAAAAGTATTAAAAGGCTCTATATAATTTTATTTTTTCT
CCAATTCTCAATTTCGGTTTTTTATTAAAAGACTATTCCATGCTGGCTTC
TTAAGTAGAAAGAATTAAAAAATTTAAACATGTTTAAAAGTAGAATTGTG
TTTTGAAATTTACGCTGTGCGTTACTCTAAAAGATGAAATTAGAATCCAG
ATTTTGTATTTATAGAAGCTATTTCCTGCTGTTAGGCAAATTGGCTGTAC
CAAGAAATTGTTATTGTTTTTCTTGCTCTTATATTTTTTGTGATTCATTT
GTTCAAAAATGAACATCCCGACACAATGTTTTGATTTAAAACTAAAGAAA
TATCACATTGATACTCTTCACTCTTGGTACGCCCCTCGCTTATTTTTTAT
TTTTGTAAAAATTTTCCGAACGGGACATTTTCATTTTAATCCTCCTGCTA
ATCAATACACGCTTTTTTAAAGAATATCTTCTATAAAAATATCAGGGTGA
AAATTGGCCAAATCGTAAGAACCCCTAAGAATAACCTCTAGGGTGAGTTT
CACAGAATTTGATAAGAATACAGTTATTTTGTATTAGGTTAATAGAAAAA
AACTGCTACTTTTGTTAGACTTGAATTTACACTTTGAGGCAGAAATGTAA
ATTTAGCTCCAAATGTTCATTCAAAATTGATCATTTCTCATGTTTGTAAA
AAAGTCTGAAAAAGGAAGAATATGCTAAGAATATTTCACCCTCAATTTTG
ACAATTTCTTAAGAATGCTTGACCCTCATCCAAAGTAAAGATTGATTATG
TTTACAGTTGGTTATTGTGTAATTTCACAAAACACTCTGCCTGTCATTTT
AGCAGAATACCTATATCCATTTTATAAGAACAATAAAAACCTTGAATGTA
AAAATTTAATAATTGAATTAGTAAAAATGGCATACCTCAACTCAAAATAG
AAACAGTTTGAACATTTTGATGTTTGAGCTGCTGAAAAATAAGAATACCC
GAGCTTCAATTCATCGCGTTGAGAATAATGAAAAGTGAAATTTTTCTTTC
AGGAAATGTGGTCGAAAGAGACGATGGGGCGGATGATGAATGGTCCAGTA
TAAAAGATGATATGATGCAACCTGATCGTCTCTTAGATGCCAAATCCAAA
GAAAGTCATATCGTTCATTGTCCTTACTATCCAATGGTTGGTATAATACT
TGTTTTCTTTATAAGCATTCCGCTTATAAGCATATCTTGGCTCTTATATG
GCAAAAATTTAAGCATAAGCTAAGCATTACCTTGAGCCTATGAAAAATTT
ATTTTCCTGATTTTGGCTGTTTTNAAAATCAAACTGGTCTCGCCATATTT
AAAAACTTCAGATGAGAAACTTACGTGTTCATTTCGATTCTTTGAACTGA
ATTTAACTGAATCATTTTGGTTGGATAGGAAAAACACGAATATTGGTGGG
TATACTTGATCAATAAGAAGAACAATCAATTAGTCACAGCTCCACAGCAA
GTCACCAATCTCAAAGTTACTGAAAAGGTTTGTCTACTCTTGCAATACTA
AGTGCTTAATTTTTTAGTTCGATTGTTTTCCAAACCCGTTTATTAAATAT
TTTCATTAGTCAAGAGAAGATCTATAGTTACCTTAATTTTGGGGTACTTA
GATTTTAAAACTTTGACTACTTTTGACTACCCACTGACCAGAGCTCTCCT
TCTCACCCTTCTTAGGTGCAATTGAAATTCTCAGCACCAGAGAAACCAGG
CATTTATCAATACATTGTGGTGGTCAAGTCAGATTCTTATGTTGATTTCG
ATATGACTAAACCTCTAAAAGTAAGTACTGTTGAGTCTCTTTAATTTGAC
TCTCTATTATAACTGGAATGTCTCCTTAACTCAAACAAGTTTTCTCATCC
CTTCGGATAACAACCTGACTGCATAATTCCATAAACAATTTGCGTTCCCC
GTGCTTGTTCGAGTTATGGAGACTCCACTTTAGCTCGTTTCTCAAATTTC
TTATGTGATTCGGTAATAAATGCGTTCAACACGAAGACTAATGGTGAACT
AATATTTTTAACCTTTGAATATGGAATACGTGCATCGCGTGTATAATACA
TCTTACAAGTGTTTTGTGTATCTATTTTTATATAATCAAGCCCCCTTCAT
CATTTTTTAAGATGTCTTTGAAATGACTGTTGCTTTTGTCACTAGGCTTG
TTCTAAAAATGATTTCTTCTACGGACGCTGTTTNAATATTCGCTTACCTT
GAGTTAATAAATCGCAATATCTACTGAAACCCGAAATCAAATTTGGATTA
TTCCCCAGCTAAATTCCCACTGAGAGTTATTGTGTAATTTAACAAAACAC
TCTGCCTGTCATTTTAGCAGAATACCTATATCCATTTTATAAGAACAATA
AAAACCTTGAATGTAAAAATTTAAGAATCGAATTAGTAAAAATGGCATAC
CTCAACTTTAAATAGAAACAGTTTGAACATTTTGATGTTTGAGCTGCTGA
AAAATAAGAATATCCGAGCTTCAACAAGAAGAATTCATCGCGTTGAGAAT
AATGAAAAGTGAAATTTTTCTTTCAGGAAATGTGGTCGAAAGAGACGATG
GGGCGGATGATGAATGGTCCAGTATAAAAGATGATATGATGCAACCTGAT
CGTCTCTTAGATGCCAAATCCAAAGAAAGTCATATCGTTCATTGTCCTTA
CTATC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_044372	XLOC_044372	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_60	supercontig	scaffold_60:1456923..1480227 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00071459 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SEC63 (Translocation protein SEC63 homolog OS=Homo sapiens GN=SEC63 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 399.438 bits (1025), Expect = 2.997e-131
Identity = 196/395 (49.62%), Postives = 279/395 (70.63%), Query Frame = 2

Query:   32 MAGMKFEYDEKGTTFYYFILSFCAIFLIPTTYYLFPDDSKKKKTEDDINEKRKPCYCPPCMAKQDLIVKKIPKKKIYLIRAVLIILWALLITGVVKVSQFEKEYSEYNPYDILQIEVGATQAEIRKKYRDLSKLNHPDKGGDAVVFMKISKAYQALTDEETKKNWEDYGNPDGPGATQFGIALPSWIVDKKNSMWVLGAYMLAFIIILPIVVGSWWYRSIQYSAEEVLLDTEQLFWYFLHRTPNMSLKRAIMILAGALEFDKSHNAEVQERPSDNVELPQLMRELPQLNEKNKERPLCFAYSIKARALMHAHFSRIALPQQTLLKDLELILKKSPTLVREMINIVGQLMYLAKM--GRVSQPPKLETMENLMKLSQMLIQGVWESKSTFQMLPHI 1210
            MAG +F+YD+ G TF+YF+ SF  + +IP TYYL+P D    +  + I  K        CM  +  ++K  P     + + VL+  WAL +    KVS+ ++EY EYNPY++L ++ GAT AEI+K+YR LS   HPDKGGD V+FM+I+KAY ALTDEE++KNWE++GNPDGP AT FGIALP+WIVD+KNS+ VL  Y LAF++ILP+VVGSWWYRSI+YS +++L+ T Q++ YF+++T NM +KR IM+LAGA EFD  +N +   RP+DN+ +PQL+RE+  +N K  E PL   YS+KAR L+ +H +R+ +P +TL +D + +LKK P L++EM+N++ QL+ +A+    R  + P L ++EN MKLSQM +QG+ + KS    LPHI
Sbjct:    1 MAGQQFQYDDSGNTFFYFLTSFVGLIVIPATYYLWPRD----QNAEQIRLKNIRKVYGRCMWYRLRLLKPQPNIIPTVKKIVLLAGWALFLFLAYKVSKTDREYQEYNPYEVLNLDPGATVAEIKKQYRLLSLKYHPDKGGDEVMFMRIAKAYAALTDEESRKNWEEFGNPDGPQATSFGIALPAWIVDQKNSILVLLVYGLAFMVILPVVVGSWWYRSIRYSGDQILIRTTQIYTYFVYKTRNMDMKRLIMVLAGASEFDPQYNKDATSRPTDNILIPQLIREIGSINLKKNEPPLTCPYSLKARVLLLSHLARMKIP-ETLEEDQQFMLKKCPALLQEMVNVICQLIVMARNREEREFRAPTLASLENCMKLSQMAVQGLQQFKSPLLQLPHI 390

HSP 2 Score: 89.7373 bits (221), Expect = 2.997e-131
Identity = 51/124 (41.13%), Postives = 73/124 (58.87%), Query Frame = 3

Query: 1215 QENLRHF-NTKKRKIKTIRQFVGMNNTDRRMLLRTLSDEQYQDVLNVCSSFPHLEIEATTRVIDDEDMETVTVGSTVTALVTLTRKTMEEFFGDESEEVSL--NNIENNDDATASPKPVKGWQR 1577
            ++NLR   N KK KIKTI+  V +  +DR  LL  L DE+Y++V+ V  SFP++ ++  ++V+DDED   +TVGS VT LV LTR+TM E F  E    +      E+    T   +   GWQ+
Sbjct:  392 EDNLRRVSNHKKYKIKTIQDLVSLKESDRHTLLHFLEDEKYEEVMAVLGSFPYVTMDIKSQVLDDEDSNNITVGSLVTVLVKLTRQTMAEVFEKEQSICAAEEQPAEDGQGETNKNRTKGGWQQ 515

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00071459 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00071459 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
SEC63	2.997e-131	49.62	Translocation protein SEC63 homolog OS=Homo sapien...	[more]

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TCONS_00071459 (transcript) - C. hemisphaerica