TCONS_00071457 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00071457
Unique Name	TCONS_00071457
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2885

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_60:1454946..1480227-

transcript sequence

>TCONS_00071457 ID=TCONS_00071457|Name=TCONS_00071457|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2885bp
TAAATAGgttaaataaaaatacaaaaaaaatatggCAGGAATGAAATTTG
AGTACGATGAAAAGGGAACAacattttattactttattCTTTCATTTTGT
GCTATATTCTTGATCCCAACAACCTATTATTTATTCCCCGAtgattcaaa
gaaaaagaagacagaAGATGACATAAATGAAAAGAGGAAGCCATGTTACT
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TCCACAGCAAGTCACCAATCTCAAAGTTACTGAAAAGGTGCAATTGAAAT
TCTCAGCACCAGAGAAACCAGGCATTTATCAATACATTGTGGTGGTCAAG
TCAGATTCTTATGTTGATTTCGATATGACTAAACCTCTAAAAGTGGCAGT
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gaagatgatgatgatgacgatgagGAATAATCACGCCCTCATGGTGGAAC
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GTATCGGTAGGTTTATTTTATATCTAGAAATATTTCTGTTGAATTACACT
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aaacttttgttatataaagtgctaaattaaatttc

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_60:1454946..1480227-

Legend: exon

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>TCONS_00071457 ID=TCONS_00071457|Name=TCONS_00071457|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=25282bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_60:1454946..1480227- (Clytia hemisphaerica)
TAAATAGGTTAAATAAAAATACAAAAAAAATATGGCAGGAATGAAATTTG
AGTACGATGAAAAGGGAACAACATTTTATTACTTTATTCTTTCATTTTGT
GCTATATTCTTGATCCCAACAACCTATTATTTATTCCCCGATGATTCAAA
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CTGTTTATCATTTCACTTACATTTTGATTGTAGATTTAAAGAGTAGTTAT
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TTTCAGTTGTCTATTCAATACAATCTACTATAATATACGCTTTTTTTATA
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TTTGTTAGACTTTTAAATTGAAACTGTGAGGCAGAAATATGATTTTAGCT
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GTTAAGAATTTTTTACCCTCAATTTTGGCAATTTCTTAAAAATACTTGAC
CCTCATCCAAACTACTATTCTTATAAAAAAATGTGTTTATTTGGTTTGGT
GTTCAATCCAGCTTCTTCAGGATAAAGAACATCAAAGGACATACTCTAAT
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TTTTCTAGACGAGCAGTGCTAATAATCTTGTGGGCATTATTGATCACTGG
AGTTGTCAAAGTATCACAATTTGAAAAAGAATATAGTGAATATAATCCTT
ATGACATCTTACAGATAGAAGTTGTAAGTTGATTTTGTTGTGGACCCGTT
CTTTTTTTCTTTTATTCTTGTTTGGATTCAATTGCAACTTTTTAACCAGG
TTAGAGGAAAAGAAGTGTGAACCAGAGTTGATAATGAAATGGGCTAAGTT
AAAGGTCTAAGTGGGCTTTCTACCAAGTTTGGTTCTTAAGGTGATAACCT
TTCTTTGAGTTTGATAAATATTGAAATAATTGTCATCTTTTGTTTTTATT
TTTTTCTTCTAGGGTGCTACCCAAGCAGAAATTAGGAAGAAATACAGAGA
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TGAAGATTTCGAAAGCTTATCAAGCGTAAGTAAATTCAAAATGAAAAAAA
CTAATTTTATGTTTTAAGGTTAATAATCCTAATCAATTGTTACTGATGGG
CCAACCTAGTTGTAACAGTTATTTTATTGATTCCTAAAATTTTAAGGTCA
ATCATACCCGTGAAAACAACTAGTTGAATTGGTTTTGCTTTCAAAGCTTT
TGTCTTAGGAAACTATTCACGTCTTTGTAATTTAGACCTTGCCTTTAGAC
CATCTACAAACTCTGATTTTGAATGGTCCTGGCCGCTCGTTTGATCAGTC
ATGGTCGCTTGTTAGTAACAATTACATCAAAAAAATTGTTATGAAATTTC
TCTAAATTAACTGGTCATTTACCAGCCCTTAAAAGACTGTCTAAGGGCCG
GTTCAATTTTCAGGTACTTAAAATCCCTTTGGGAGTCTTATTATACCTGG
CTAGAGTAAGATTAATGAAATTCATCATTCTTTTGATTCAAGTCTAACAG
ATGAAGAAACTAAAAAGAATTGGGAAGACTATGGCAATCCTGATGGGCCA
GGAGGTTTGCTAAAATTTTTAGATTCATTTCTTAATAAACATAAGTAAAC
TTTCTAAATGAAAGACTAAAGCGCTGATATGACAACATTTCTCCTAGCAG
GCATCCATAGAAAATATCAGTCGTGCTTGCAGGCCCTATGTCTGATTGAA
CTGTCTTTTCTATTGGTGGTATCAAATGGTGAACGGTTCTTAGCGCTCCT
ATAGTAGGAATTAGTTACACCCAGTCAAGAAAAGAACAAGATGTAATGCA
CCTTCCCCCCTGCCTGGAATGGTAACAAAGCTATATTCACAAAATTTCTT
TTGGATTAGAATTTTTTTTTGAATTAATTTCTTCAATAACAAATCTTTAC
ACTTTCAGCAACACAGTTTGGCATTGCTCTACCATCTTGGATTGTCGATA
AGAAGAACTCAATGTGGGTTCTTGGGGCATACATGCTTGCTTTCATCATT
ATACTGCCAATAGTTGTGGTATGTTTTCACAAAATTCATTTTTTCAAAAA
ACCTCTAAATTGTTTAAACTGAAATGAATAAAAAAAGTGGCCTGATTGGA
CTGAAAATTTGTCTGAATATCTTAGATTTTAGTAGAATTAACTCAAGTGA
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AAATTAATGGCTTATTAGATTGTAATATTTAACTTATAAAAGAAACTGAA
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AGAAGTTTTACTTGATACAGAACAATTATTTTGGTATTTTCTTCATCGGA
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GTTAATTTTTGCGCATAGAGTGTTTTTCTATCACTGCTACACTCTATATT
CGAATATTAACATTGCATAATCTTGATACCAAATTTTGTGCGTTTTTGGT
CCTCTCTGTAAAATATTGCATGAGAAACCGGTACTTTTTCTCAGTGCATT
ATGAATGAAGCAGAATGTGAAGTTCATCGCATGTGGGCAATATCATATTC
TAAGGAGGAAGCAAGTAGTTGGGCTTAGCATTGATTATCGAATATACCCT
GATTTTCATTTGCATTGATTTTCTTTCATCTCAGGTGCAATAATGATACT
CGCTGGTGCATTAGAATTTGATAAAAGTCACAATGCAGAAGTACAGGAAA
GACCAAGTGACAATGTTGAACTTCCACAGGTAAGTTACTGGTCCTCTAAT
TCCAATTAATTTATTATTATTCATTATTAAGTTATTATGTAATTTTCTTG
TCACAGCTGACTCAATTTTCCTAGTATTCACACTAATATATACTTAAAAA
ACAGGTCGCATTTTGAGTGACAAAGTTTTCCATGGACACGTTCTAATGTT
CTGTCAATCGCTAAATCAAGTCAATCAATTTTGTATAAAGCCTGCCTCTA
TTTTGAGTTAATGTTTGAAATGACAAAATGGTTCCCTTCTATTTTAGCTA
ATGAGAGAGTTACCGCAGCTGAACGAGAAGAATAAAGAACGACCTCTATG
TTTTGCATACAGTATCAAAGCACGAGCGCTTATGCATGCTCATTTCTCTA
GGATAGCTTTACCACAACAAACACTATTAAAAGGTAAGGTTGATGCTGGT
CGTGGTAGATCATTCTGATAGTTAAACGATTTAGTATCAATTACCTATTG
TTTATATTCTTATTATCTTGGTATTTTTTGAGAGAATTGATGATATATTC
TTAGTTGCCAGAAAGGCACTGGGACTATTGATATTTTCATTAAAGTACCC
TTATCTTTTCTTCTTCACAGATTTAGAATTAATTTTGAAGAAATCACCAA
CGTTAGTACGTGAGATGATTAATATCGTTGGCCAGTTGATGTATTTAGCC
AAAATGGGAAGAGGTATGAAAAATGTTTCTTGTTTGTTGCAGATATTGAT
TTTCAATAACCATGGTAGTCTGGAGGCTTACTAACTTTTCCTCGATTTTA
CAAAGCTCACATGAGTGATTCAAATTTGAATGTTTACAAAAATCAGCTAA
GGAAAAGGCGTGAACGACTTTATAGAATGTTTGTATAATACTTTGCTACT
ATTGATTAAATTCATTCTGTCTTCTTTATTTTTTTCAGTATCTCAACCTC
CAAAACTTGAAACTATGGAGAATTTAATGAAATTGAGTCAGATGCTGATA
CAAGGAGTTTGGGAATCTAAATCGACATTTCAGATGTTACCTCACATTTC
ACANAAATTGAGTCAGATGTTGATACAAGGTGTTTGGGAATCTAAATCGA
CATTTCAGATGTTACCTCACATTTCACAAGAAAACCTACGTCATTTCAAT
ACTAAAAAGGTATCACTTGCCATTCTTAAAGAAACAAATGTTGAAATTCA
GTAGATATCCGACTGAAAAAATCCTTTTCCTGTGTCCATTTTCATAAGAG
TTTGTTATGGTTTACAGAGCGGTGGCTTAACTTTTTTTGTTTGCTTATTC
TCGGCTTTTCAACATTTACTGTTTGTGTCATATAATTCTGGGCGCTACTA
GAAATGTTATAAAGATGAGGTATAGTGTCTTAGTGGGTTCGTTACCACCT
TTGAAAAAGGCAAACAAAACTGTTTTGACCCCCCTCTTCTTGTCGTCCCC
TTTTTAAAATTTTTTATATCCTAACAACTATTTGAAGCTTTTGCAATTTC
AAACTGTCTTATCGTTATAACTGTACAATAGCTTTGAGTAAGCTTTAAAA
TAAGTGCTCAAGTTGTAGAGTGGATCATTGTAACAGTTTGAAAAATTCTT
TTTTCAGAGGAAAATAAAGACGATTCGACAGTTTGTTGGGATGAACAACA
CTGACCGACGGTAAAGGCTTTTAGTTTAACGTGAAGGAATTCAAAGATTA
CTTTTATAACAACCTGTATAAACCTGTATGAAAGAATGTATTTTGACAGA
GAATCGTTTCTACTTTTCACTTTTTCACTGATCTGTTCAGTTTTATAGAA
ACCTTTGTTAAATGCTTTCAGGATGCTTTTGCGGACGTTATCGGATGAAC
AATATCAAGATGTATTAAATGTGTGTTCTTCTTTCCCTCATCTTGAAATT
GAGGCTACAACTAGAGGTACTGTTCATTATCAAATTCCAATCTTAACCTC
TCTACACGCTTATGGTTTGAAGAATTTTCGTTGATGCTTTTCTGGGAAAA
AACATAAATCTCCTATGAGGTATAAAGTCGAAATTTCCAGACAGGAGATA
ATTATATACGAAATTCCTTATAAGCATTTTCATAAAGAGCCAGATAATTC
ACACCCCTCAGGTAGAAATACAGTGTCTAGCACTGATGTTTGAGGACCCA
TTTTAAAAGTCTTTCGGCGTTAGAAATTTTGGATTTTCTTATTGTTTCCT
TTTCTTTTTAGTCATCGATGACGAAGATATGGAAACTGTGACAGTAGGTT
CCACTGTCACCGCCCTGGTCACACTCACCAGAAAAACTATGGAAGTATGT
ACACCACTTCCTTTTTGTATAGTAACGGGTGTTATTTTGTTTCTGCTTTC
TCTCAAGCTAAAACGAGACTGAATAAGTTTTTCAGGTGGGCGTCAGTGTA
GCCTTAGCTTTCTCTTATAAATAAGTTGCATTATGGTTAATGTTTCTTTT
AATAAGAAGATTTGCTTGAGTTAGAGACGAAGACGAAATAGAGTGGTGCT
TGTCACAAAAGACTACCTTGTTCAAATATTACGCTTTCTTTTTTGGACGG
AAAAATCCATCGAATAACACTGTTTTTATAAAAAAAAATTATTTTTACAT
TTTAGGAGTTCTTTGGTGATGAAAGTGAAGAAGTATCTTTGAATAATATC
GAAAATAACGATGACGTAAGAATTTCGAAATTTCTACAAATTGATATTTT
GTTTAAAACGCTAAATTTGACAATCATCTAAAAGAATTGCCCGATAATTT
TACAGTCCATGTTTTCTAGAGACGCTAGAGTTTTATTCTGTTTTATCCTA
TTTCTCAGGTTTGTTAAACGGAAAAAAGTTTTCGTCTTCATTTTGTTATC
TAAGTAATTGTATTATCCCAGTTATTGATTTTCAATGTTCATATTCAACA
GGCTACAGCGTCACCGAAGCCGGTCAAAGGTTGGCAACGTAAAGTAAAGA
AAGGGAAAGGAGCTAAGAAGCCAGTCAAAAAGCAACCTGTCAAAAAGAAG
AAAAAAGAGGATGANCGCCCTGGTCACACTCACCAGAAAAACTATGGAAG
TATGTACACCACTTCCTTTTTGTATAGTAACGGGTGTTATTTTGTTTCTG
CTTTCTCTCAAGCTAAAACGAGACTGAATAAGTTTTTCAGGTGGGCGTCA
GTGTAGCCTTAGCTTTCTCTTATAAATAAGTTGCATTATGGTTAATGTTT
CTTTTAATAAGAAGATTTGCTTGAGTTAGAGACGAAGACGAAATAGAGTG
GTGCTTGTCACAAAAGACTACCTTGTTCAAATATTACGCTTTCTTTTTTG
GACGGAAAAATCCATCGAATAACACTGTTTTTATAAAAAAAAATTATTTT
TACATTTTAGGAGTTCTTTGGTGATGAAAGTGAAGAAGTGTCTTTGAATA
ATATCGAAAATAACGATGACGTAAGAATTTCGAAATTTCTACAAATTGAT
ATTTTGTTTAAAACGCTAAATTTGACAATCATCTAAAAGAATTGCCCGAT
AATTTTACAGTCCATGTTTTCTAGAGACGCTAGAGTTTTATTCTGTTTTA
TCCTATTTCTCAGGTTTGTTAAACGGAAAAAAGTTTTCGTCTTCATTTTG
TTATCTAAGTAATTGTATTATCCCAGTCATTGATTTTCAATGTTCATATT
CAACAGGCTACAGCGTCACCGAAGCCAGTCAAAGGTTGGCAACGTAAAGT
AAAGAAAGGGAAAGGAGCTAAGAAGCCAGTCAAAAAGCAACCTGTCAAAA
AGAAGAAAAAAGAGGATGAGGTAAGGTGCTAAGCTATAACGAAGTTTAAA
GTAAATAATAAGTAATTGCATTAAACTTATTAAGGAATCGTTTAAAATAC
CGACCTATTCTAAACAATTGTGGAGTTTTCTCAGGTTTTTTTATTTATCC
TTGAGTTATGCTACGACTATATAGAATTATTACAATCCCTTTATGAATTG
AGCAAATATTTAAGCCATTTGACTAAATACAAAATAATTATACTTAAATT
TATTTTTGATAAATTACGAACAATTCTGAAGATCCAAAAATTGATAACAA
TCACTAATCTTGGTACCGATGTACTAGTCACGATGTCTGAGATTTTAGTA
CTGACCCCTGGGGTGGCTTGATGGTGCTTGTCAGAATACTTTGCATTCGG
ACTAATGGTGTTTTCTTTTCCTTTACATCGAAAGAAACAAGAAGACAAAA
CAGAAAACAAAGAAGAAAAAGATGAGGAAGCTGATGAAGAATCTTATGAC
GGGTAACATTTTTTTATTTAACTGAATGCACTTCAAACGATAGATTTGTT
TCTATGTGAGACCCGGATCATCAGATTATTAGCGACCAGAAGGTGTGACC
ACGCTATAGTGCTTTATTCATGTGGANGGATTATTTGCGACCAGAAGGTG
TGACCACGCTATAGTGCTTTATTCATGTGGAGTTCAAGCTCAACCCACTC
TTTTTTAGAGTGCCTAAATATTTCATTGACTGTCTTGTGTTGATCTGAGT
TTTTCTGACATTTATTTTTATTCAAAGTACTCATTTCATGGGCGGGGTCT
GGAAGCTTTCAAATCCCTCTTCGACATACTGAACTGGATTCATTAAAATT
CATTAAAATGAAAAGGCTGGTGCGTGAAAATTTCACTACAGTGAAGTCTG
TTATAACTCAACACGCGCGGGGAGCTGCGGGGAGCGCAAATTTGTTCGAT
TTTGACAAAACTTATTTTATTTAACATATCTAATATTTGGCGTGCCGGGA
CTGCCTCCGTGCAAAAATTGTGTAGTATATATTTAATATTTGGCGTGTCG
GGATTGCCACCGTGCGATAATACTTAATATGCGGAAAAAAAATTTGTTCG
ATTTAAGAAAGTTTTGCGATGTAAAGAAAGGCTTTTACGACATTTTTAAC
TGAAGGGACTAGAAAATTTGTTCGAATTAAGGAGACGGAGTTATAGAGGC
TGGAGTTAAGACGAGATTAGAGTTGATTTAGGATTTGAGTTAAAGAGACT
TCAGTGTTTTTAGTCAAACTGGCTATTTTCCGTTGATAAGTCTACGGAGT
TAATAATTTTAAATAAGATGAATTCTTTTCTCATTCAGCGTGGAAAATAT
GGATAGCGAAGATGAGAATGCAGCCGATGATGAGGCGGACGAACAAGCAG
ACGAAGCGGATGACAAAAAGGATGAAGAAGATGATGATGAGGATGAAGGT
AAGAAAGATTTTCTCAGGGTATGCATAGAAGTTGGGAAATATTTTCCTTT
AGCATTAATAATGACATTTTCATCGCGTGACTTTTGTCGTAGTTTCTCTA
GTCACTTAGTCTTACTCAGCTATTGAGTCTCGGTTTTCTTATGCCTTTCT
ATTATTTCTGCTCGGGGGGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGGGGGAGTTTCAAAAGA
TTTTCCAAAGGGGGGAAAAGGAAAAATGGAAATCCAGGGGGGATTTCAAA
AATGTGCAACAAAGTTTTTTTCGGGGGGTGGGGAAGAACTTTTCACCTTT
TTTCACCTTTTTTCACCTTTTTTAGTTTTTTTACATATGCATGTTTTTCT
TCCACAAATTACATGGCAGATGTTCTTTCTTGGATAAATAGTTATCTTTT
GTAGAATGTGTGAATTATAATTGATAGAAAACATAATAATTTTTTTATTA
TCGATACCATCTTGTCTCCAAAATATTTGGTTCTTCTTACAAGAAGTTAG
GATATAATAATATATGTGCTATGAGGCGAGACCAATTTAATTTGTTGTTC
TACGGGCAGATTGTTAGCAAAATATGGGTCGGTTGGTCGGTAAAATAAAA
ATAAAATTTTCATTTATCAGGGTTGTTAAAGTACCGAAAATGTTTTCCAA
AAAATATCTGGTTCAAAAATTCACTTTTTTTTGTCTTCGATGAAGATGAT
AAAATCTTAATGTATGGAAATAATGCGTGATTTTCTAACTTTTTCAATTT
TTTTAATTAATTTTCAGCTTTATTCAAATCTGATTCTTACAAATAACTAG
TGTGTAAAATATATTGTAGTGGAAATTCAATATTATTATTTTTTTGATTT
TAGCAAAAATAGGGTCGGTCGGGCCCGTAGAACAACAAATTAAATTGGTC
TCGCCTGAATAAAAATAAAATCGAAAATTTTTAACATATAAACAGAATAC
AGTAGGCCAGAGATGAGATTGGCAGTTATTATTATTAAATGCATATGAGT
AGATTGTATCATCGATAAGAAGCCATCGATAATGACTCAATCTGGGGTTG
GTCTAAGTATCAATCAGATTCATGCTCCCTGGTCAGTAAAATCTGGTTCT
ATGCATTCATTTTCGGTATTTCTATTCTGGTCTGTAAAATATTTAGGTAC
TCCACAACCTAGCCCAATTGGCTACCCCAATTGGCTACCCTGCTCTTTAG
ACCAACCCCTCAATCTGGATAATTGGAGCTGAGTGGATGAAGAACGGAAA
TATACCTTGGTATCTAGACTTTAGATTCCCTTTTAAAATTGAATAATTGA
ATAATAAATAAATAATATTAGTAATAAATAAGTATAAATGGTAATTAGAG
GCAAAGCAAAAATGAAGCAGGACTAAAGAGCAAGCTTAATGTTGACGAAC
TATTCGTTATAATAGTATTGAGATTTTACTGCTTGCTGTTTTGATTTATT
GACTTGAAGTGAAGTTACAAGATAGCGACTAAAGGATGAGAGGCTTTTGC
ATTATCTAGGTAGGTTCAGAGATTGTACCATTAGTCCAGGGAAAGTGTGT
CAATTGTGAGTTTTTGGCTAGAAAGCATGAAATTTGATACAGTGGTACCT
TAGGGGGTAAGAAACATTTTGAACTTCTGATTCACTTCCGGAACACCTGT
TTGTGTATCATATAATAGTTAAGAAATTTAACACTTCTATACACCTTTTC
GACCGTAGTCACGCGGTCAGGCGCGTGCCACTTATATTTAATTTACCACC
CTAAACTCGATCCAATCCTTTTTTGTTACATTTTTTCTATTGTCTTCAGG
TGCGAAAAAAGACTGGAACGGTTTTAGGGTGGTAAAATGGACAAAAAATG
ACCGCGCGGCAATTTGCGGCTAGGGTCGAAAAGGTATATTGAAAAGGACA
CGTGTAAAAAAGGCACAAATGAATAAATGTAGATTAGATATTGGTTTAAT
TGGTTCTCCATGTAGAGTTTAGCCAATGATGAAACATAAACTTATAAACT
TATAGGATCAGAAGTATCGAGACTAATATATCGAGTTTCAAAACGAAGAT
AGAATTTAGAAATTCAAAAATAGGAGAATTCTAAAAAAAAGAAGCTAAAT
CTAATAAAAACATTTATTACATTTTTTATTAAAATTTTCCTTTTTCATAA
TATTTTTCACATTTGCATAATGCATTATGTCAGGAATATCTAGAGAACTT
TTATTTCATGAGTCTTGCAGAGAAGTGCGACTTATTTTTAAATTGGTTTT
CCACCGTCATATAGTAATTTATTGCTGTAATTTCGAAAGCAATAGAGAAA
ATGAATGCAAATGGTAGCCACGATTTCACTATGAAAAATGGTAATATCAC
TATCGATAGCGATAATCTCAGCGGTGAAATTCATCCAGAAGTTCTAGTGA
ATATTCGTGAAGTAGCCGAAGAAACTTTTTATTACTACGTTCTTAATATT
TTGCCTGGTTTGGTTGCGATTGGTGGTTTCTGGAATCTGCTTATCATCGT
TTACTTCGTCAAAATCAATTTGAAGAAAGGATTAAAACGAATGAGCTCGT
ATCATCTTCTGATCATTAATCTTGCTTTGGCCGATCTAGCCNGAAGGCTC
TATATGATTTTATTTTTACTCCAATTCTCAATTTCGGTTTTTTATTAAAA
GACTATTCCATGCTGGCTTCTTAAGTAGAAAGAATTAAAAAATTTAAACA
CGTTTAACAATTGTGTTTTGAAATTTACGCTGTGCGGTACTCTAAAAGAT
GAAATTAGAATCCAGATTTTGTATTTATAGAAGCTATTTCCTGCTGTTGG
GCAAATTGGCTGTACCAAGAAATTGTTATTGTTTTTCTTGCTCTTATATT
TTTTGTGATTCATTTGTTCAAAAATAAACATCCCGACACAATGTNCACCT
CTCATTTCCTTTTCAAACACACATGGGAACTCCCGGCATTTGCATGTCTT
ATATTCCGTGTTTATTTCCCGAACGTTGTTCCAATGACAGCATCTTGGGC
ACTGACCTTAATTTCTTTTGCTAGATATCGCTCCATTACCTACCCAATGG
CTGTGCGAATCAATAANTTTGATTTAAAACTAAAGAAATATCACCTTGAT
ACTCTTCACTCTTGGTACGCCCCTCGCTTTTTTTTTTATTTTTGTAAAAA
TTTTCCGAACGGGACATTTTCATTTTAATCCTCCTGCTAATCAATACACG
CTTTTTTAAAGAATATCTTCTATAAAAATATCAGGGTGAAAATTGGCCAA
ATCGTAAGAACCCCTAAGAAAAACCTCTAGGGTGAGTTTCACAGAATTTG
ATAAGAATACAGTTATTTTGTATTAGGTTAATAGAAAAAAACTGCTTCCT
TTGTTAGACTTGAATTTACACTTTGAGGCAGAAATGTAATTTTAGCTCCA
AATGTTCATTCAAAATTGATCATTTCTCATGTTTGTAAAAAAGTCAAGTC
TGAAAAAGGAAGAATATGCTAAGAATATTTCACCCTCAATTTTTGCAATT
TCTTAAGAATGCTTGACCCTCATCCAAAGTAAAGATTGGTTATGTTTACA
GTTTGTTGTTGTGTAATTTCACAAAACACTCTGCCTGTCATTTTAGCAGA
ATACCTAGATCCATTTTATAAGAACAATAAAAACCTTGAATGTAAAAATT
TAAACAGTTTGAACATTTTGATGTTTGAGCTGCTGAAAAATAAGAATACC
CGAACAAGAAGAATTCATCGCGTTGAGAATAATGAAAAGTGAAATTATTC
TTTCAGGAAATATGGTCGAAAGAGACGATGGGGCGGATGATGAATGGTCC
AGTATAAAAGATGATATGATGCAACCTGATCGTCTCTTAGATGCCAAATC
CAAAGAAAGTCATATCGTTCATTGTCCTTACTATCCAATGGTTGGTATAA
TACTTGTTTTCTTTATAAGCATTCCGCTTATAAGCATATCTTGGCTCTTA
TATGGCAAAAATTTAAGCATAAGCTAAGCATTACCTTGAGCCTATGAAAA
ATTTATTTTCCTGATTTTGGCTGTTTTCAGCTCGGATTTTACGGATTTTT
AGAATTTCCCTCAAATTTTGCTTGATGTGATAAGCATCCTTATAAGTATT
TTTCAGTCTTGTCAAGTCATCGATCTAAGCATCTTCGAGCCTGTTTTCGA
ATTATTGTATGCTTAAGCGAGGTCAATTTAATTGATAATCTAATGGTTAA
AATGAAAAATTGAACATAAAATTCTTAAAGCCTTGCAAAAACTAGCAAAA
TTTTGAAAATTTGGGAGTCTGTGAAGGAATGCAAATAAAAATGTACTATC
AAGATGAATTAGATTTTTATTTCGATTTTTGGAATTTCAGAGTCGGTCGG
GCTTAGCCCGAGCCCCCTTTACAAGTTGTAAAACAATTAATCAAACTGGT
CTCGCCTTATTTAAAAACTTCAGATGAGAAACTTACGTGTTCATTTCGAT
TTTTTAAACTGAATTTAACTGAATCTTTTTCGTTGGATAGGAAAAACACG
AATATTGGTGGGTATACTTGATCAATAAGAAGAATAATCAATTAGTCACA
GCTCCACAGCAAGTCACCAATCTCAAAGTTACTGAAAAGGTTTGTCTACA
CCTTGCAATACTAAGTGCTTCAAATTTATTTTTCGATTGTTTTCCAAACC
CGTTTATTAAATATTTTCATCAGTCAAGAGAAGATCTATAGTTACCTTAT
TTTGGGGGTACTTAGATTTCCTACCCCCTCAACTCCGAACCCCCCGGGAA
GTAGTTAGCACTGGCCTTAAAATACATTATTTAAAGTATCTCCCAAAAGC
AAGGACATGCTAAACGTTGATTTGGTGACTTCGATTTTAAAACTTTGACT
ACTTTTGACTACCCACTGACCAGAACTCGTTTTCTCACCCTTCCTAGGTG
CAATTGAAATTCTCAGCGCCAGAGAAACCAGGCATTTATCAATACATTGT
GGTGGTCAAGTCAGATTCTTATGTTGATTTCGATATGACTAAACCTCTAA
AAGTAAGTACTGTTGAGTCTCTTTAATTTGACTCTCTATTATAACTGGAA
TGTCTCCTTAACTCAAACAAGTTTTCTCATCCCTTCGGATAACAACCTGA
CTGCATAAGTCCATAAAAAAATTGCGTTCCCCGTGCTTGTTCGAGTTATG
GAGACTCCACTTTAGCTCGTTTCTCAAATTTCTTATGTGATTCGGTAATA
AATGCGTTCAACACGAAGACTAATGATATGAACTAATATTTTTAACATTT
GAATATGGAATACGTGCATCGCGTGTATAATACATCTTACAAGTATTTTG
TGTATCTATTTTCATATATTCAAGCCCCTTTCATCATTTTTTAAGATGTC
TTTGAAATGACTGTTGCTTTTGTCACTAGACTTGTTCTAAAAATGATTTC
TTCTACGGACGCTGTTTGGATTGGAACGGGACAGCGTAGATTATTCTATT
CACGATATGTACCATTGTAATGTTTTCTGATATTACATCACGGACCCAAT
TCATGATATGCACCACTGCAATGACTTCATGAAATTATGCAACATTTCTG
TTTTTGTTCCACCTAATACGTCACTTTTTCTATTGTTTGAGTGACGTATT
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GCGGAACAACCGTAAAAGTGGGGGAGGCTGAAGGCTCAAATGGGATAAAA
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GAATGAAACAAGTTTCTTTCAGCATGTGTAAATTCTTCACGATGAGATCT
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GATGGAAGGTATAACAATTTTCAGTGATTTATCCCCTAAAGTCAAAAAAT
GTGTACAAATCTGTACTAGCTTTAAAGCTAATAGAGTTCGANNNNNNNNN
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TTTTATATCTTCTTTTTGCTTCTTGGTAATCTCGGCGTATGTTTTCTTTG
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GAGGTCATTTTTGATGGAATCACGGGTTTTTGTGTTGGTGTTGACCTCAT
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GGTAGGTCAGAGATTGTACCATTAGTTCAGGGAAAGTGTGTCAATTGTGC
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GTATCATATAATAGTTAAGAAATTTAACACTTCTATACACCTTTTCGACC
GTACTCGCGTGGTCAGACGCGTGCCACTTATATTTAATTTACCACTCTAA
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GTGAAAAAAGACTGGAACGGTTTTAGGGTGGTAAAATGGACAAAAAATGC
CCGCGCGGCAATTGGTAGCGAGCACCTCACTAAAAACCGGGATTTTTCAT
CTCGTTTCTTAATTAATTGCGTAAAAAAAACGCGGGTGACGTCTAGTATA
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ATTTCATGAGTCTTGAATAGAAGTGCGACTTTATTTTTAAATTGGTTTTC
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ATCGATAGCGATAATTTCACCACTGATGGTAGCGCCAGCGGTAGCGGTGA
AATTCATCCAGAAGCTCTGGAGAGTATTGGCGAAGTAGCAGAAAAAATTC
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TGGCCGATCTAGCCATCTGCATTGGTGTACCAATTGCCTTTCATTTCTAT
ACAAAACACACATGGGAACTCCCGGCATTTGCATGTCTTATATTCCGTGT
TTATTTCCTGGAAGTTGTTCCAATAACATCATGCTGGGCACTGACCTTGA
TTTCTTTTGCTAGATATCGCTCCATTACCTACCCAATGGCTGTCCGAATC
AATAAAAAGAAATACGGACTAGCTTGTATTTTGATTTGGGTTATACCAGC
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CCCTTTAGCACTAATGGTGTATTTCTACTACCGAATGTCAAAAGCGATGC
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AGGAATCGGGCAGCGCTGAAAACAATTAGTGGGCTTATATACGTGTTTAC
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GATACTTGATCATTGAACATGAAGGATCAGTGGAGTCTAAATTGTACATT
ATTTTTGATATTCACAGATTACTCTTTTTCTCAAACAATATGCTCAATAT
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TTTTTACATTTGGGCTGTATCGTCGAAGAAACACAATCAATTCGTAATAT
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TACAATCTTTCTCTTTACAGTCAATAAACTTACCATTCTCTAGGTAATTA
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ATAACAAAACTTTTGACTCAATTGGAATCAACCATCCTTATATTTTTTTC
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TCTAATTTTCATTTTTTTTTGTATTTGAATTAAATTAAATTTTGAAATTT
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ATTTAGCTCCAAATGTTCATTCAAAATTGATCATTTCTCATGTTTGTAAA
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AAAATTTAATAATTGAATTAGTAAAAATGGCATACCTCAACTCAAAATAG
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GAAAGTCATATCGTTCATTGTCCTTACTATCCAATGGTTGGTATAATACT
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GTGCTTGTTCGAGTTATGGAGACTCCACTTTAGCTCGTTTCTCAAATTTC
TTATGTGATTCGGTAATAAATGCGTTCAACACGAAGACTAATGGTGAACT
AATATTTTTAACCTTTGAATATGGAATACGTGCATCGCGTGTATAATACA
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TTATGGAGACTCCACTTTAGCTCGTTTCTCAAATTTCTTATGTGATTCGG
TAATAAATGCGTTCAACACGAAGACTAATGGTGAACTAATATTTTTAACC
TTTGAATATGGAATACGTGCATCGCGTGTATAATACATCTTACAAGTGTT
TTGTGTATCTATTTTTATATAATCAAGCCCCCTTCATCATTTTTTAAGAT
GTCTTTGAAATGACTGTTGCTTTTGTCACTAGGCTTGTTCTAAAAATGAT
TTCTTCTACGGACGCTGTTTGGGTTGGAACGGGACAGCGTGGAGATTATT
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TGAATATACATTTTGTTCCTTTGCAATTTCCTCAAATAATCCTCAATCAT
GTCCTGCAAATTGATATGGTGTTTTTCTGTTATTCCCAGGTGGCAGTATC
AGAAGCGAAAGATTTCGATCCTGGAGAGCATTGGAATTATTCGAGTGAAG
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CGTCAAACAACCGCCCAAATAGTCAAAAGTGTCAAGGGCGTCTGAACATC
AGATCATGGTCTCTCAGACAGATCTTTTTAGACTTGGCCAAGGAATACTT
GTTCCAAAACAACTTTTCGGAAAAGGTTACCACATGTTTGATTTTTAAAA
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_044372	XLOC_044372	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_60	supercontig	scaffold_60:1454946..1480227 -

Expression

No biomaterial libraries express this feature.

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00071457 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SEC63 (Translocation protein SEC63 homolog OS=Homo sapiens GN=SEC63 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 478.404 bits (1230), Expect = 2.320e-154
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Query:   32 MAGMKFEYDEKGTTFYYFILSFCAIFLIPTTYYLFPDDSKKKKTEDDINEKRKPCYCPPCMAKQDLIVKKIPKKKIYLIRAVLIILWALLITGVVKVSQFEKEYSEYNPYDILQIEVGATQAEIRKKYRDLSKLNHPDKGGDAVVFMKISKAYQALTDEETKKNWEDYGNPDGPGATQFGIALPSWIVDKKNSMWVLGAYMLAFIIILPIVVGSWWYRSIQYSAEEVLLDTEQLFWYFLHRTPNMSLKRAIMILAGALEFDKSHNAEVQERPSDNVELPQLMRELPQLNEKNKERPLCFAYSIKARALMHAHFSRIALPQQTLLKDLELILKKSPTLVREMINIVGQLMYLAKMG--RVSQPPKLETMENLMKLSQMLIQGVWESKSTFQMLPHISXKLSQMLIQGVWESKSTFQMLPHISQENLRHF-NTKKRKIKTIRQFVGMNNTDRRMLLRTLSDEQYQDVLNVCSSFPHLEIEATTRVIDDEDMETVTVGSTVTALVTLTRKTMEEFFGDESEEVSLNN--IENNDDATASPKPVKGWQR 1651
            MAG +F+YD+ G TF+YF+ SF  + +IP TYYL+P D    +  + I  K        CM  +  ++K  P     + + VL+  WAL +    KVS+ ++EY EYNPY++L ++ GAT AEI+K+YR LS   HPDKGGD V+FM+I+KAY ALTDEE++KNWE++GNPDGP AT FGIALP+WIVD+KNS+ VL  Y LAF++ILP+VVGSWWYRSI+YS +++L+ T Q++ YF+++T NM +KR IM+LAGA EFD  +N +   RP+DN+ +PQL+RE+  +N K  E PL   YS+KAR L+ +H +R+ +P +TL +D + +LKK P L++EM+N++ QL+ +A+    R  + P L ++EN MKLSQM +QG+ + KS               L+Q           LPHI ++NLR   N KK KIKTI+  V +  +DR  LL  L DE+Y++V+ V  SFP++ ++  ++V+DDED   +TVGS VT LV LTR+TM E F  E    +      E+    T   +   GWQ+
Sbjct:    1 MAGQQFQYDDSGNTFFYFLTSFVGLIVIPATYYLWPRD----QNAEQIRLKNIRKVYGRCMWYRLRLLKPQPNIIPTVKKIVLLAGWALFLFLAYKVSKTDREYQEYNPYEVLNLDPGATVAEIKKQYRLLSLKYHPDKGGDEVMFMRIAKAYAALTDEESRKNWEEFGNPDGPQATSFGIALPAWIVDQKNSILVLLVYGLAFMVILPVVVGSWWYRSIRYSGDQILIRTTQIYTYFVYKTRNMDMKRLIMVLAGASEFDPQYNKDATSRPTDNILIPQLIREIGSINLKKNEPPLTCPYSLKARVLLLSHLARMKIP-ETLEEDQQFMLKKCPALLQEMVNVICQLIVMARNREEREFRAPTLASLENCMKLSQMAVQGLQQFKSP--------------LLQ-----------LPHIEEDNLRRVSNHKKYKIKTIQDLVSLKESDRHTLLHFLEDEKYEEVMAVLGSFPYVTMDIKSQVLDDEDSNNITVGSLVTVLVKLTRQTMAEVFEKEQSICAAEEQPAEDGQGETNKNRTKGGWQQ 515

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Identity = 55/116 (47.41%), Postives = 78/116 (67.24%), Query Frame = 2

Query: 1919 RDDGADDEWSSIKDDMMQPDR-LLDAKSKESHIVHCPYYPMEKHEYWWVYLINKKNNQLVTAPQQVTNLKVTEKVQLKFSAPEKPGIYQYIVVVKSDSYVDFDMTKPLKVAVSEAK 2263
            +DD A  EW  ++  + + +R LL+ KSK +H V+  Y+P EK E+WW+Y+ ++K   L++ P  V  LK TE+V+LKF AP KPG YQY V ++SDSY+  D  KPLK+ V EAK
Sbjct:  607 KDDEA--EWQELQQSIQRKERALLETKSKITHPVYSLYFPEEKQEWWWLYIADRKEQTLISMPYHVCTLKDTEEVELKFPAPGKPGNYQYTVFLRSDSYMGLDQIKPLKLEVHEAK 720

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00071457 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00071457 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
SEC63	2.320e-154	45.69	Translocation protein SEC63 homolog OS=Homo sapien...	[more]

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TCONS_00071457 (transcript) - C. hemisphaerica