TCONS_00071448 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00071448
Unique Name	TCONS_00071448
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	2884

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_60:1454946..1480226-

transcript sequence

>TCONS_00071448 ID=TCONS_00071448|Name=TCONS_00071448|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2884bp
AAATAGgttaaataaaaatacaaaaaaaatatggCAGGAATGAAATTTGA
GTACGATGAAAAGGGAACAacattttattactttattCTTTCATTTTGTG
CTATATTCTTGATCCCAACAACCTATTATTTATTCCCCGAtgattcaaag
aaaaagaagacagaAGATGACATAAATGAAAAGAGGAAGCCATGTTACTG
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aaaaaatatacctTATACGAGCAGTGCTAATAATCTTGTGGGCATTATTG
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ATGATTAATATCGTTGGCCAGTTGATGTATTTAGCCAAAATGGGAAGAGt
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AGATGCTGATACAAGGAGTTTGGGAATCTAAATCGACATTTCAGATGTTA
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ATCTAAATCGACATTTCAGATGTTACCTCACATTTCACAAGAAAACCTAC
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TTGAGGCTACAACTAGAGtCATCGATGACGAAGATATGGAAACTGTGACA
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ATAACGATGACGCTACAGCGTCACCGAAGCCAGTCAAAGGTTGGCAACGT
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CCACAGCAAGTCACCAATCTCAAAGTTACTGAAAAGGTGCAATTGAAATT
CTCAGCACCAGAGAAACCAGGCATTTATCAATACATTGTGGTGGTCAAGT
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aagatgatgatgatgacgatgagGAATAATCACGCCCTCATGGTGGAACG
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CATGTCTGATAGAATCTGTTTAGAATATTGCCCATTCGGTCTAATAATTa
aacttttgttatataaagtgctaaattaaatttc

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_60:1454946..1480226-

Legend: exon

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>TCONS_00071448 ID=TCONS_00071448|Name=TCONS_00071448|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=25281bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_60:1454946..1480226- (Clytia hemisphaerica)
AAATAGGTTAAATAAAAATACAAAAAAAATATGGCAGGAATGAAATTTGA
GTACGATGAAAAGGGAACAACATTTTATTACTTTATTCTTTCATTTTGTG
CTATATTCTTGATCCCAACAACCTATTATTTATTCCCCGATGATTCAAAG
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AATTATTATAAGTCTAATGAACTGCCAGTATTCAGTATTATATTGATTCT
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AGAAAAAAATATACCTTATGTATGTGTTATTACTTCTACTTTAATTGTTT
TTCAGTTGTCTATTCAATACAATCTACTATAATATACGCTTTTTTTATAA
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TTGTTAGACTTTTAAATTGAAACTGTGAGGCAGAAATATGATTTTAGCTC
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TTTCTCATGATGTTTGTTGAAAAGTCACTAGTCTAAGAAGTAAGAATGGG
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CTCATCCAAACTACTATTCTTATAAAAAAATGTGTTTATTTGGTTTGGTG
TTCAATCCAGCTTCTTCAGGATAAAGAACATCAAAGGACATACTCTAATA
ACATTAAAAATTCTTTGAACTTTTCAGATCTTATCAATTTCTCATGCTTT
TTTCTAGACGAGCAGTGCTAATAATCTTGTGGGCATTATTGATCACTGGA
GTTGTCAAAGTATCACAATTTGAAAAAGAATATAGTGAATATAATCCTTA
TGACATCTTACAGATAGAAGTTGTAAGTTGATTTTGTTGTGGACCCGTTC
TTTTTTTCTTTTATTCTTGTTTGGATTCAATTGCAACTTTTTAACCAGGT
TAGAGGAAAAGAAGTGTGAACCAGAGTTGATAATGAAATGGGCTAAGTTA
AAGGTCTAAGTGGGCTTTCTACCAAGTTTGGTTCTTAAGGTGATAACCTT
TCTTTGAGTTTGATAAATATTGAAATAATTGTCATCTTTTGTTTTTATTT
TTTTCTTCTAGGGTGCTACCCAAGCAGAAATTAGGAAGAAATACAGAGAT
CTTAGTAAGCTGAACCATCCTGACAAAGGAGGAGATGCTGTTGTTTTCAT
GAAGATTTCGAAAGCTTATCAAGCGTAAGTAAATTCAAAATGAAAAAAAC
TAATTTTATGTTTTAAGGTTAATAATCCTAATCAATTGTTACTGATGGGC
CAACCTAGTTGTAACAGTTATTTTATTGATTCCTAAAATTTTAAGGTCAA
TCATACCCGTGAAAACAACTAGTTGAATTGGTTTTGCTTTCAAAGCTTTT
GTCTTAGGAAACTATTCACGTCTTTGTAATTTAGACCTTGCCTTTAGACC
ATCTACAAACTCTGATTTTGAATGGTCCTGGCCGCTCGTTTGATCAGTCA
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CTAAATTAACTGGTCATTTACCAGCCCTTAAAAGACTGTCTAAGGGCCGG
TTCAATTTTCAGGTACTTAAAATCCCTTTGGGAGTCTTATTATACCTGGC
TAGAGTAAGATTAATGAAATTCATCATTCTTTTGATTCAAGTCTAACAGA
TGAAGAAACTAAAAAGAATTGGGAAGACTATGGCAATCCTGATGGGCCAG
GAGGTTTGCTAAAATTTTTAGATTCATTTCTTAATAAACATAAGTAAACT
TTCTAAATGAAAGACTAAAGCGCTGATATGACAACATTTCTCCTAGCAGG
CATCCATAGAAAATATCAGTCGTGCTTGCAGGCCCTATGTCTGATTGAAC
TGTCTTTTCTATTGGTGGTATCAAATGGTGAACGGTTCTTAGCGCTCCTA
TAGTAGGAATTAGTTACACCCAGTCAAGAAAAGAACAAGATGTAATGCAC
CTTCCCCCCTGCCTGGAATGGTAACAAAGCTATATTCACAAAATTTCTTT
TGGATTAGAATTTTTTTTTGAATTAATTTCTTCAATAACAAATCTTTACA
CTTTCAGCAACACAGTTTGGCATTGCTCTACCATCTTGGATTGTCGATAA
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TACTGCCAATAGTTGTGGTATGTTTTCACAAAATTCATTTTTTCAAAAAA
CCTCTAAATTGTTTAAACTGAAATGAATAAAAAAAGTGGCCTGATTGGAC
TGAAAATTTGTCTGAATATCTTAGATTTTAGTAGAATTAACTCAAGTGAT
AAACTCTTGGATGAAAACAAAAATTCTCCCCTCCAACAAAGATTGTGCTA
AATTAATGGCTTATTAGATTGTAATATTTAACTTATAAAAGAAACTGAAT
GTTGTTTTTAGGGCTCATGGTGGTATCGTTCTATACAATACAGTGCAGAA
GAAGTTTTACTTGATACAGAACAATTATTTTGGTATTTTCTTCATCGGAC
ACCTAACATGTCACTAAAACGTGAGCAGATGTTTGAACTGAAACATTTTG
TTAATTTTTGCGCATAGAGTGTTTTTCTATCACTGCTACACTCTATATTC
GAATATTAACATTGCATAATCTTGATACCAAATTTTGTGCGTTTTTGGTC
CTCTCTGTAAAATATTGCATGAGAAACCGGTACTTTTTCTCAGTGCATTA
TGAATGAAGCAGAATGTGAAGTTCATCGCATGTGGGCAATATCATATTCT
AAGGAGGAAGCAAGTAGTTGGGCTTAGCATTGATTATCGAATATACCCTG
ATTTTCATTTGCATTGATTTTCTTTCATCTCAGGTGCAATAATGATACTC
GCTGGTGCATTAGAATTTGATAAAAGTCACAATGCAGAAGTACAGGAAAG
ACCAAGTGACAATGTTGAACTTCCACAGGTAAGTTACTGGTCCTCTAATT
CCAATTAATTTATTATTATTCATTATTAAGTTATTATGTAATTTTCTTGT
CACAGCTGACTCAATTTTCCTAGTATTCACACTAATATATACTTAAAAAA
CAGGTCGCATTTTGAGTGACAAAGTTTTCCATGGACACGTTCTAATGTTC
TGTCAATCGCTAAATCAAGTCAATCAATTTTGTATAAAGCCTGCCTCTAT
TTTGAGTTAATGTTTGAAATGACAAAATGGTTCCCTTCTATTTTAGCTAA
TGAGAGAGTTACCGCAGCTGAACGAGAAGAATAAAGAACGACCTCTATGT
TTTGCATACAGTATCAAAGCACGAGCGCTTATGCATGCTCATTTCTCTAG
GATAGCTTTACCACAACAAACACTATTAAAAGGTAAGGTTGATGCTGGTC
GTGGTAGATCATTCTGATAGTTAAACGATTTAGTATCAATTACCTATTGT
TTATATTCTTATTATCTTGGTATTTTTTGAGAGAATTGATGATATATTCT
TAGTTGCCAGAAAGGCACTGGGACTATTGATATTTTCATTAAAGTACCCT
TATCTTTTCTTCTTCACAGATTTAGAATTAATTTTGAAGAAATCACCAAC
GTTAGTACGTGAGATGATTAATATCGTTGGCCAGTTGATGTATTTAGCCA
AAATGGGAAGAGGTATGAAAAATGTTTCTTGTTTGTTGCAGATATTGATT
TTCAATAACCATGGTAGTCTGGAGGCTTACTAACTTTTCCTCGATTTTAC
AAAGCTCACATGAGTGATTCAAATTTGAATGTTTACAAAAATCAGCTAAG
GAAAAGGCGTGAACGACTTTATAGAATGTTTGTATAATACTTTGCTACTA
TTGATTAAATTCATTCTGTCTTCTTTATTTTTTTCAGTATCTCAACCTCC
AAAACTTGAAACTATGGAGAATTTAATGAAATTGAGTCAGATGCTGATAC
AAGGAGTTTGGGAATCTAAATCGACATTTCAGATGTTACCTCACATTTCA
CANAAATTGAGTCAGATGTTGATACAAGGTGTTTGGGAATCTAAATCGAC
ATTTCAGATGTTACCTCACATTTCACAAGAAAACCTACGTCATTTCAATA
CTAAAAAGGTATCACTTGCCATTCTTAAAGAAACAAATGTTGAAATTCAG
TAGATATCCGACTGAAAAAATCCTTTTCCTGTGTCCATTTTCATAAGAGT
TTGTTATGGTTTACAGAGCGGTGGCTTAACTTTTTTTGTTTGCTTATTCT
CGGCTTTTCAACATTTACTGTTTGTGTCATATAATTCTGGGCGCTACTAG
AAATGTTATAAAGATGAGGTATAGTGTCTTAGTGGGTTCGTTACCACCTT
TGAAAAAGGCAAACAAAACTGTTTTGACCCCCCTCTTCTTGTCGTCCCCT
TTTTAAAATTTTTTATATCCTAACAACTATTTGAAGCTTTTGCAATTTCA
AACTGTCTTATCGTTATAACTGTACAATAGCTTTGAGTAAGCTTTAAAAT
AAGTGCTCAAGTTGTAGAGTGGATCATTGTAACAGTTTGAAAAATTCTTT
TTTCAGAGGAAAATAAAGACGATTCGACAGTTTGTTGGGATGAACAACAC
TGACCGACGGTAAAGGCTTTTAGTTTAACGTGAAGGAATTCAAAGATTAC
TTTTATAACAACCTGTATAAACCTGTATGAAAGAATGTATTTTGACAGAG
AATCGTTTCTACTTTTCACTTTTTCACTGATCTGTTCAGTTTTATAGAAA
CCTTTGTTAAATGCTTTCAGGATGCTTTTGCGGACGTTATCGGATGAACA
ATATCAAGATGTATTAAATGTGTGTTCTTCTTTCCCTCATCTTGAAATTG
AGGCTACAACTAGAGGTACTGTTCATTATCAAATTCCAATCTTAACCTCT
CTACACGCTTATGGTTTGAAGAATTTTCGTTGATGCTTTTCTGGGAAAAA
ACATAAATCTCCTATGAGGTATAAAGTCGAAATTTCCAGACAGGAGATAA
TTATATACGAAATTCCTTATAAGCATTTTCATAAAGAGCCAGATAATTCA
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TTTAAAAGTCTTTCGGCGTTAGAAATTTTGGATTTTCTTATTGTTTCCTT
TTCTTTTTAGTCATCGATGACGAAGATATGGAAACTGTGACAGTAGGTTC
CACTGTCACCGCCCTGGTCACACTCACCAGAAAAACTATGGAAGTATGTA
CACCACTTCCTTTTTGTATAGTAACGGGTGTTATTTTGTTTCTGCTTTCT
CTCAAGCTAAAACGAGACTGAATAAGTTTTTCAGGTGGGCGTCAGTGTAG
CCTTAGCTTTCTCTTATAAATAAGTTGCATTATGGTTAATGTTTCTTTTA
ATAAGAAGATTTGCTTGAGTTAGAGACGAAGACGAAATAGAGTGGTGCTT
GTCACAAAAGACTACCTTGTTCAAATATTACGCTTTCTTTTTTGGACGGA
AAAATCCATCGAATAACACTGTTTTTATAAAAAAAAATTATTTTTACATT
TTAGGAGTTCTTTGGTGATGAAAGTGAAGAAGTATCTTTGAATAATATCG
AAAATAACGATGACGTAAGAATTTCGAAATTTCTACAAATTGATATTTTG
TTTAAAACGCTAAATTTGACAATCATCTAAAAGAATTGCCCGATAATTTT
ACAGTCCATGTTTTCTAGAGACGCTAGAGTTTTATTCTGTTTTATCCTAT
TTCTCAGGTTTGTTAAACGGAAAAAAGTTTTCGTCTTCATTTTGTTATCT
AAGTAATTGTATTATCCCAGTTATTGATTTTCAATGTTCATATTCAACAG
GCTACAGCGTCACCGAAGCCGGTCAAAGGTTGGCAACGTAAAGTAAAGAA
AGGGAAAGGAGCTAAGAAGCCAGTCAAAAAGCAACCTGTCAAAAAGAAGA
AAAAAGAGGATGANCGCCCTGGTCACACTCACCAGAAAAACTATGGAAGT
ATGTACACCACTTCCTTTTTGTATAGTAACGGGTGTTATTTTGTTTCTGC
TTTCTCTCAAGCTAAAACGAGACTGAATAAGTTTTTCAGGTGGGCGTCAG
TGTAGCCTTAGCTTTCTCTTATAAATAAGTTGCATTATGGTTAATGTTTC
TTTTAATAAGAAGATTTGCTTGAGTTAGAGACGAAGACGAAATAGAGTGG
TGCTTGTCACAAAAGACTACCTTGTTCAAATATTACGCTTTCTTTTTTGG
ACGGAAAAATCCATCGAATAACACTGTTTTTATAAAAAAAAATTATTTTT
ACATTTTAGGAGTTCTTTGGTGATGAAAGTGAAGAAGTGTCTTTGAATAA
TATCGAAAATAACGATGACGTAAGAATTTCGAAATTTCTACAAATTGATA
TTTTGTTTAAAACGCTAAATTTGACAATCATCTAAAAGAATTGCCCGATA
ATTTTACAGTCCATGTTTTCTAGAGACGCTAGAGTTTTATTCTGTTTTAT
CCTATTTCTCAGGTTTGTTAAACGGAAAAAAGTTTTCGTCTTCATTTTGT
TATCTAAGTAATTGTATTATCCCAGTCATTGATTTTCAATGTTCATATTC
AACAGGCTACAGCGTCACCGAAGCCAGTCAAAGGTTGGCAACGTAAAGTA
AAGAAAGGGAAAGGAGCTAAGAAGCCAGTCAAAAAGCAACCTGTCAAAAA
GAAGAAAAAAGAGGATGAGGTAAGGTGCTAAGCTATAACGAAGTTTAAAG
TAAATAATAAGTAATTGCATTAAACTTATTAAGGAATCGTTTAAAATACC
GACCTATTCTAAACAATTGTGGAGTTTTCTCAGGTTTTTTTATTTATCCT
TGAGTTATGCTACGACTATATAGAATTATTACAATCCCTTTATGAATTGA
GCAAATATTTAAGCCATTTGACTAAATACAAAATAATTATACTTAAATTT
ATTTTTGATAAATTACGAACAATTCTGAAGATCCAAAAATTGATAACAAT
CACTAATCTTGGTACCGATGTACTAGTCACGATGTCTGAGATTTTAGTAC
TGACCCCTGGGGTGGCTTGATGGTGCTTGTCAGAATACTTTGCATTCGGA
CTAATGGTGTTTTCTTTTCCTTTACATCGAAAGAAACAAGAAGACAAAAC
AGAAAACAAAGAAGAAAAAGATGAGGAAGCTGATGAAGAATCTTATGACG
GGTAACATTTTTTTATTTAACTGAATGCACTTCAAACGATAGATTTGTTT
CTATGTGAGACCCGGATCATCAGATTATTAGCGACCAGAAGGTGTGACCA
CGCTATAGTGCTTTATTCATGTGGANGGATTATTTGCGACCAGAAGGTGT
GACCACGCTATAGTGCTTTATTCATGTGGAGTTCAAGCTCAACCCACTCT
TTTTTAGAGTGCCTAAATATTTCATTGACTGTCTTGTGTTGATCTGAGTT
TTTCTGACATTTATTTTTATTCAAAGTACTCATTTCATGGGCGGGGTCTG
GAAGCTTTCAAATCCCTCTTCGACATACTGAACTGGATTCATTAAAATTC
ATTAAAATGAAAAGGCTGGTGCGTGAAAATTTCACTACAGTGAAGTCTGT
TATAACTCAACACGCGCGGGGAGCTGCGGGGAGCGCAAATTTGTTCGATT
TTGACAAAACTTATTTTATTTAACATATCTAATATTTGGCGTGCCGGGAC
TGCCTCCGTGCAAAAATTGTGTAGTATATATTTAATATTTGGCGTGTCGG
GATTGCCACCGTGCGATAATACTTAATATGCGGAAAAAAAATTTGTTCGA
TTTAAGAAAGTTTTGCGATGTAAAGAAAGGCTTTTACGACATTTTTAACT
GAAGGGACTAGAAAATTTGTTCGAATTAAGGAGACGGAGTTATAGAGGCT
GGAGTTAAGACGAGATTAGAGTTGATTTAGGATTTGAGTTAAAGAGACTT
CAGTGTTTTTAGTCAAACTGGCTATTTTCCGTTGATAAGTCTACGGAGTT
AATAATTTTAAATAAGATGAATTCTTTTCTCATTCAGCGTGGAAAATATG
GATAGCGAAGATGAGAATGCAGCCGATGATGAGGCGGACGAACAAGCAGA
CGAAGCGGATGACAAAAAGGATGAAGAAGATGATGATGAGGATGAAGGTA
AGAAAGATTTTCTCAGGGTATGCATAGAAGTTGGGAAATATTTTCCTTTA
GCATTAATAATGACATTTTCATCGCGTGACTTTTGTCGTAGTTTCTCTAG
TCACTTAGTCTTACTCAGCTATTGAGTCTCGGTTTTCTTATGCCTTTCTA
TTATTTCTGCTCGGGGGGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGGGGGAGTTTCAAAAGAT
TTTCCAAAGGGGGGAAAAGGAAAAATGGAAATCCAGGGGGGATTTCAAAA
ATGTGCAACAAAGTTTTTTTCGGGGGGTGGGGAAGAACTTTTCACCTTTT
TTCACCTTTTTTCACCTTTTTTAGTTTTTTTACATATGCATGTTTTTCTT
CCACAAATTACATGGCAGATGTTCTTTCTTGGATAAATAGTTATCTTTTG
TAGAATGTGTGAATTATAATTGATAGAAAACATAATAATTTTTTTATTAT
CGATACCATCTTGTCTCCAAAATATTTGGTTCTTCTTACAAGAAGTTAGG
ATATAATAATATATGTGCTATGAGGCGAGACCAATTTAATTTGTTGTTCT
ACGGGCAGATTGTTAGCAAAATATGGGTCGGTTGGTCGGTAAAATAAAAA
TAAAATTTTCATTTATCAGGGTTGTTAAAGTACCGAAAATGTTTTCCAAA
AAATATCTGGTTCAAAAATTCACTTTTTTTTGTCTTCGATGAAGATGATA
AAATCTTAATGTATGGAAATAATGCGTGATTTTCTAACTTTTTCAATTTT
TTTAATTAATTTTCAGCTTTATTCAAATCTGATTCTTACAAATAACTAGT
GTGTAAAATATATTGTAGTGGAAATTCAATATTATTATTTTTTTGATTTT
AGCAAAAATAGGGTCGGTCGGGCCCGTAGAACAACAAATTAAATTGGTCT
CGCCTGAATAAAAATAAAATCGAAAATTTTTAACATATAAACAGAATACA
GTAGGCCAGAGATGAGATTGGCAGTTATTATTATTAAATGCATATGAGTA
GATTGTATCATCGATAAGAAGCCATCGATAATGACTCAATCTGGGGTTGG
TCTAAGTATCAATCAGATTCATGCTCCCTGGTCAGTAAAATCTGGTTCTA
TGCATTCATTTTCGGTATTTCTATTCTGGTCTGTAAAATATTTAGGTACT
CCACAACCTAGCCCAATTGGCTACCCCAATTGGCTACCCTGCTCTTTAGA
CCAACCCCTCAATCTGGATAATTGGAGCTGAGTGGATGAAGAACGGAAAT
ATACCTTGGTATCTAGACTTTAGATTCCCTTTTAAAATTGAATAATTGAA
TAATAAATAAATAATATTAGTAATAAATAAGTATAAATGGTAATTAGAGG
CAAAGCAAAAATGAAGCAGGACTAAAGAGCAAGCTTAATGTTGACGAACT
ATTCGTTATAATAGTATTGAGATTTTACTGCTTGCTGTTTTGATTTATTG
ACTTGAAGTGAAGTTACAAGATAGCGACTAAAGGATGAGAGGCTTTTGCA
TTATCTAGGTAGGTTCAGAGATTGTACCATTAGTCCAGGGAAAGTGTGTC
AATTGTGAGTTTTTGGCTAGAAAGCATGAAATTTGATACAGTGGTACCTT
AGGGGGTAAGAAACATTTTGAACTTCTGATTCACTTCCGGAACACCTGTT
TGTGTATCATATAATAGTTAAGAAATTTAACACTTCTATACACCTTTTCG
ACCGTAGTCACGCGGTCAGGCGCGTGCCACTTATATTTAATTTACCACCC
TAAACTCGATCCAATCCTTTTTTGTTACATTTTTTCTATTGTCTTCAGGT
GCGAAAAAAGACTGGAACGGTTTTAGGGTGGTAAAATGGACAAAAAATGA
CCGCGCGGCAATTTGCGGCTAGGGTCGAAAAGGTATATTGAAAAGGACAC
GTGTAAAAAAGGCACAAATGAATAAATGTAGATTAGATATTGGTTTAATT
GGTTCTCCATGTAGAGTTTAGCCAATGATGAAACATAAACTTATAAACTT
ATAGGATCAGAAGTATCGAGACTAATATATCGAGTTTCAAAACGAAGATA
GAATTTAGAAATTCAAAAATAGGAGAATTCTAAAAAAAAGAAGCTAAATC
TAATAAAAACATTTATTACATTTTTTATTAAAATTTTCCTTTTTCATAAT
ATTTTTCACATTTGCATAATGCATTATGTCAGGAATATCTAGAGAACTTT
TATTTCATGAGTCTTGCAGAGAAGTGCGACTTATTTTTAAATTGGTTTTC
CACCGTCATATAGTAATTTATTGCTGTAATTTCGAAAGCAATAGAGAAAA
TGAATGCAAATGGTAGCCACGATTTCACTATGAAAAATGGTAATATCACT
ATCGATAGCGATAATCTCAGCGGTGAAATTCATCCAGAAGTTCTAGTGAA
TATTCGTGAAGTAGCCGAAGAAACTTTTTATTACTACGTTCTTAATATTT
TGCCTGGTTTGGTTGCGATTGGTGGTTTCTGGAATCTGCTTATCATCGTT
TACTTCGTCAAAATCAATTTGAAGAAAGGATTAAAACGAATGAGCTCGTA
TCATCTTCTGATCATTAATCTTGCTTTGGCCGATCTAGCCNGAAGGCTCT
ATATGATTTTATTTTTACTCCAATTCTCAATTTCGGTTTTTTATTAAAAG
ACTATTCCATGCTGGCTTCTTAAGTAGAAAGAATTAAAAAATTTAAACAC
GTTTAACAATTGTGTTTTGAAATTTACGCTGTGCGGTACTCTAAAAGATG
AAATTAGAATCCAGATTTTGTATTTATAGAAGCTATTTCCTGCTGTTGGG
CAAATTGGCTGTACCAAGAAATTGTTATTGTTTTTCTTGCTCTTATATTT
TTTGTGATTCATTTGTTCAAAAATAAACATCCCGACACAATGTNCACCTC
TCATTTCCTTTTCAAACACACATGGGAACTCCCGGCATTTGCATGTCTTA
TATTCCGTGTTTATTTCCCGAACGTTGTTCCAATGACAGCATCTTGGGCA
CTGACCTTAATTTCTTTTGCTAGATATCGCTCCATTACCTACCCAATGGC
TGTGCGAATCAATAANTTTGATTTAAAACTAAAGAAATATCACCTTGATA
CTCTTCACTCTTGGTACGCCCCTCGCTTTTTTTTTTATTTTTGTAAAAAT
TTTCCGAACGGGACATTTTCATTTTAATCCTCCTGCTAATCAATACACGC
TTTTTTAAAGAATATCTTCTATAAAAATATCAGGGTGAAAATTGGCCAAA
TCGTAAGAACCCCTAAGAAAAACCTCTAGGGTGAGTTTCACAGAATTTGA
TAAGAATACAGTTATTTTGTATTAGGTTAATAGAAAAAAACTGCTTCCTT
TGTTAGACTTGAATTTACACTTTGAGGCAGAAATGTAATTTTAGCTCCAA
ATGTTCATTCAAAATTGATCATTTCTCATGTTTGTAAAAAAGTCAAGTCT
GAAAAAGGAAGAATATGCTAAGAATATTTCACCCTCAATTTTTGCAATTT
CTTAAGAATGCTTGACCCTCATCCAAAGTAAAGATTGGTTATGTTTACAG
TTTGTTGTTGTGTAATTTCACAAAACACTCTGCCTGTCATTTTAGCAGAA
TACCTAGATCCATTTTATAAGAACAATAAAAACCTTGAATGTAAAAATTT
AAACAGTTTGAACATTTTGATGTTTGAGCTGCTGAAAAATAAGAATACCC
GAACAAGAAGAATTCATCGCGTTGAGAATAATGAAAAGTGAAATTATTCT
TTCAGGAAATATGGTCGAAAGAGACGATGGGGCGGATGATGAATGGTCCA
GTATAAAAGATGATATGATGCAACCTGATCGTCTCTTAGATGCCAAATCC
AAAGAAAGTCATATCGTTCATTGTCCTTACTATCCAATGGTTGGTATAAT
ACTTGTTTTCTTTATAAGCATTCCGCTTATAAGCATATCTTGGCTCTTAT
ATGGCAAAAATTTAAGCATAAGCTAAGCATTACCTTGAGCCTATGAAAAA
TTTATTTTCCTGATTTTGGCTGTTTTCAGCTCGGATTTTACGGATTTTTA
GAATTTCCCTCAAATTTTGCTTGATGTGATAAGCATCCTTATAAGTATTT
TTCAGTCTTGTCAAGTCATCGATCTAAGCATCTTCGAGCCTGTTTTCGAA
TTATTGTATGCTTAAGCGAGGTCAATTTAATTGATAATCTAATGGTTAAA
ATGAAAAATTGAACATAAAATTCTTAAAGCCTTGCAAAAACTAGCAAAAT
TTTGAAAATTTGGGAGTCTGTGAAGGAATGCAAATAAAAATGTACTATCA
AGATGAATTAGATTTTTATTTCGATTTTTGGAATTTCAGAGTCGGTCGGG
CTTAGCCCGAGCCCCCTTTACAAGTTGTAAAACAATTAATCAAACTGGTC
TCGCCTTATTTAAAAACTTCAGATGAGAAACTTACGTGTTCATTTCGATT
TTTTAAACTGAATTTAACTGAATCTTTTTCGTTGGATAGGAAAAACACGA
ATATTGGTGGGTATACTTGATCAATAAGAAGAATAATCAATTAGTCACAG
CTCCACAGCAAGTCACCAATCTCAAAGTTACTGAAAAGGTTTGTCTACAC
CTTGCAATACTAAGTGCTTCAAATTTATTTTTCGATTGTTTTCCAAACCC
GTTTATTAAATATTTTCATCAGTCAAGAGAAGATCTATAGTTACCTTATT
TTGGGGGTACTTAGATTTCCTACCCCCTCAACTCCGAACCCCCCGGGAAG
TAGTTAGCACTGGCCTTAAAATACATTATTTAAAGTATCTCCCAAAAGCA
AGGACATGCTAAACGTTGATTTGGTGACTTCGATTTTAAAACTTTGACTA
CTTTTGACTACCCACTGACCAGAACTCGTTTTCTCACCCTTCCTAGGTGC
AATTGAAATTCTCAGCGCCAGAGAAACCAGGCATTTATCAATACATTGTG
GTGGTCAAGTCAGATTCTTATGTTGATTTCGATATGACTAAACCTCTAAA
AGTAAGTACTGTTGAGTCTCTTTAATTTGACTCTCTATTATAACTGGAAT
GTCTCCTTAACTCAAACAAGTTTTCTCATCCCTTCGGATAACAACCTGAC
TGCATAAGTCCATAAAAAAATTGCGTTCCCCGTGCTTGTTCGAGTTATGG
AGACTCCACTTTAGCTCGTTTCTCAAATTTCTTATGTGATTCGGTAATAA
ATGCGTTCAACACGAAGACTAATGATATGAACTAATATTTTTAACATTTG
AATATGGAATACGTGCATCGCGTGTATAATACATCTTACAAGTATTTTGT
GTATCTATTTTCATATATTCAAGCCCCTTTCATCATTTTTTAAGATGTCT
TTGAAATGACTGTTGCTTTTGTCACTAGACTTGTTCTAAAAATGATTTCT
TCTACGGACGCTGTTTGGATTGGAACGGGACAGCGTAGATTATTCTATTC
ACGATATGTACCATTGTAATGTTTTCTGATATTACATCACGGACCCAATT
CATGATATGCACCACTGCAATGACTTCATGAAATTATGCAACATTTCTGT
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AGAAGCGAAAGATTTCGATCCTGGAGAGCATTGGAATTATTCGAGTGAAG
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CTTTTGTTATATAAAGTGCTAAATTAAATTTCTTTTGGCATGTAATATAA
TTTGATTAAAATAAAAAAGATCAATCGGTTAAAAAATAAATTATCAGTGA
AAAATTACAAAAATAACTTGAAANCTAGAATATTACCCATTCGGTCTAAT
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AATATAATTTGATTAAAATAAAAAAAGATCAATCGGTCAAAAAAAAATTA
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TCACCATCTGTTGGGTGAAGCCTGAAATTCTTCCATCCCCATTTTTCCAT
AAACCCATACTCCCGATTATAAACGAAATGGATTGCCTTTCGGAGCTATT
CCTAAGGACTATATTGAGCTGCTGACTATAGAAAAGAAAAACTTTCTTAC
TAGGCCATCAAAATATCGAAAAAATTGAGATTATTTCCTACACCGTAGAT
AATTACTATTAATCATTACTGTCGAACGTGCTAACCGCTCTGGCTCAACT
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ATCAAAGCGGACCATTTTTGAAGTCTCCAGCCTGCCCCAAAATTTTGAGG
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GTTTTTCATTCTCAATATATCGTACTGAACTAAACAAAAAGCATACCCGG
CGGAACAACCGTAAAAGTGGGGGAGGCTGAAGGCTCAAATGGGATAAAAT
TCACTAGGAATTTGAGAANGTTGAGTTTCTTTGCTTGTTCTTGCATCTCC
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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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TTCTTGTCTTTTCCTCCATCTCTTGTAGTTTTCCTGCCAGAAAGGTTTTG
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GTTCAGTTTTTGTATGACGTCGTCTTTCTTTTTAAGTTCATTTTGAATCA
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TGGTGAGGCTGCTTCGAAAGGCTGATCTTTATCCATTTTGATGTTATTTT
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TTTTTGGCTAGAAAGCATGAAATTTGATACAGTGGTACCTTAGGGGGTAA
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TATCATATAATAGTTAAGAAATTTAACACTTCTATACACCTTTTCGACCG
TACTCGCGTGGTCAGACGCGTGCCACTTATATTTAATTTACCACTCTAAA
ACCGATCCAATCCTTTATTTTTTTACACTTTTTTCTATTGTCCTTAGGTG
TGAAAAAAGACTGGAACGGTTTTAGGGTGGTAAAATGGACAAAAAATGCC
CGCGCGGCAATTGGTAGCGAGCACCTCACTAAAAACCGGGATTTTTCATC
TCGTTTCTTAATTAATTGCGTAAAAAAAACGCGGGTGACGTCTAGTATAG
GCTAGGCAATTGGCGGCTAGGGTCGAAAAGGTGTATTGAAAAGGACACGT
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TTTCATGAGTCTTGAATAGAAGTGCGACTTTATTTTTAAATTGGTTTTCC
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GAATGCCAATGGTAGCCACAATTTCACTATGAACAATGGTAATATCACTA
TCGATAGCGATAATTTCACCACTGATGGTAGCGCCAGCGGTAGCGGTGAA
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CTATTACTTCTTTCTTAATATTTTCCCTGGTTTAGTTGCGATTGGTGGTC
TCTGGAATCTGCTTATCATCGTTTACTTCGTCAAAATCAATTTGAAGAAC
GGATTAAAGCGAATGAGCTCGTATCATCTTCTGATCATTAATCTTGCTTT
GGCCGATCTAGCCATCTGCATTGGTGTACCAATTGCCTTTCATTTCTATA
CAAAACACACATGGGAACTCCCGGCATTTGCATGTCTTATATTCCGTGTT
TATTTCCTGGAAGTTGTTCCAATAACATCATGCTGGGCACTGACCTTGAT
TTCTTTTGCTAGATATCGCTCCATTACCTACCCAATGGCTGTCCGAATCA
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CTTATCAACATCGCTGATTTTATGCGGATTAAATTGGTGTATAATTCTGA
GGAGGATAGCCATAGTTGTGACTACGACTATCCCAAAAGAGGCCAGAAAC
CAGTGGTTGAATCGCAAGCAATCGTCAATAACGTGATCGACAGCTTCATC
CCTTTAGCACTAATGGTGTATTTCTACTACCGAATGTCAAAAGCGATGCA
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GGAATCGGGCAGCGCTGAAAACAATTAGTGGGCTTATATACGTGTTTACT
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ATACTTGATCATTGAACATGAAGGATCAGTGGAGTCTAAATTGTACATTA
TTTTTGATATTCACAGATTACTCTTTTTCTCAAACAATATGCTCAATATT
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GTTGAATATTTCAAGTTTTTAAATTTTCCACATCACAGACTAAACAAAGC
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ACGAGTCATCTCAAAATAAAAGAACAAACATTTTATTCAAAACAAAATTA
AAAGTAAAAGTAAAAGAATTGTAATTTTATTAGATAAAATCTGTATACAT
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AATGAGTTTTTTTCGGACATGCTGAATAATAGGTTGGTATGAAAATATGC
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GCATAATTTTCTTTTCGTTTTTCGGAACTATTACTCGTGCATAGGTAGAA
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GTCGAATTAAAAAAAGTATTAAAAGGCTCTATATAATTTTATTTTTTCTC
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CAATTTCTTAAGAATGCTTGACCCTCATCCAAAGTAAAGATTGATTATGT
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AAAGTCATATCGTTCATTGTCCTTACTATCCAATGGTTGGTATAATACTT
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TTCATTAGTCAAGAGAAGATCTATAGTTACCTTAATTTTGGGGTACTTAG
ATTTTAAAACTTTGACTACTTTTGACTACCCACTGACCAGAGCTCTCCTT
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CTGACTGCATAACTCCATAAACAATTTGCGTTCCCCGTGCTTGTTCGAGT
TATGGAGACTCCACTTTAGCTCGTTTCTCAAATTTCTTATGTGATTCGGT
AATAAATGCGTTCAACACGAAGACTAATGGTGAACTAATATTTTTAACCT
TTGAATATGGAATACGTGCATCGCGTGTATAATACATCTTACAAGTGTTT
TGTGTATCTATTTTTATATAATCAAGCCCCCTTCATCATTTTTTAAGATG
TCTTTGAAATGACTGTTGCTTTTGTCACTAGGCTTGTTCTAAAAATGATT
TCTTCTACGGACGCTGTTTGGGTTGGAACGGGACAGCGTGGAGATTATTC
TGTTCACGATATGTACCATTGCAATGTTTTCTGATATTACATCATGGACC
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GAAGCGAAAGATTTCGATCCTGGAGAGCATTGGAATTATTCGAGTGAAGA
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ATGATGATGATGACGATGAGGAATAATCACGCCCTCATGGTGGAACGCCC
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GATCATGGTCTCTCAGACAGATCTTTTTAGACTTGGCCAAGGAATACTTG
TTCCAAAACAACTTTTCGGAAAAGGTTACCACATGTTTGATTTTTAAAAC
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_044372	XLOC_044372	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
scaffold_60	supercontig	scaffold_60:1454946..1480226 -

Expression

No biomaterial libraries express this feature.

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00071448 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SEC63 (Translocation protein SEC63 homolog OS=Homo sapiens GN=SEC63 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 478.404 bits (1230), Expect = 2.131e-154
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Query:   31 MAGMKFEYDEKGTTFYYFILSFCAIFLIPTTYYLFPDDSKKKKTEDDINEKRKPCYCPPCMAKQDLIVKKIPKKKIYLIRAVLIILWALLITGVVKVSQFEKEYSEYNPYDILQIEVGATQAEIRKKYRDLSKLNHPDKGGDAVVFMKISKAYQALTDEETKKNWEDYGNPDGPGATQFGIALPSWIVDKKNSMWVLGAYMLAFIIILPIVVGSWWYRSIQYSAEEVLLDTEQLFWYFLHRTPNMSLKRAIMILAGALEFDKSHNAEVQERPSDNVELPQLMRELPQLNEKNKERPLCFAYSIKARALMHAHFSRIALPQQTLLKDLELILKKSPTLVREMINIVGQLMYLAKMG--RVSQPPKLETMENLMKLSQMLIQGVWESKSTFQMLPHISXKLSQMLIQGVWESKSTFQMLPHISQENLRHF-NTKKRKIKTIRQFVGMNNTDRRMLLRTLSDEQYQDVLNVCSSFPHLEIEATTRVIDDEDMETVTVGSTVTALVTLTRKTMEEFFGDESEEVSLNN--IENNDDATASPKPVKGWQR 1650
            MAG +F+YD+ G TF+YF+ SF  + +IP TYYL+P D    +  + I  K        CM  +  ++K  P     + + VL+  WAL +    KVS+ ++EY EYNPY++L ++ GAT AEI+K+YR LS   HPDKGGD V+FM+I+KAY ALTDEE++KNWE++GNPDGP AT FGIALP+WIVD+KNS+ VL  Y LAF++ILP+VVGSWWYRSI+YS +++L+ T Q++ YF+++T NM +KR IM+LAGA EFD  +N +   RP+DN+ +PQL+RE+  +N K  E PL   YS+KAR L+ +H +R+ +P +TL +D + +LKK P L++EM+N++ QL+ +A+    R  + P L ++EN MKLSQM +QG+ + KS               L+Q           LPHI ++NLR   N KK KIKTI+  V +  +DR  LL  L DE+Y++V+ V  SFP++ ++  ++V+DDED   +TVGS VT LV LTR+TM E F  E    +      E+    T   +   GWQ+
Sbjct:    1 MAGQQFQYDDSGNTFFYFLTSFVGLIVIPATYYLWPRD----QNAEQIRLKNIRKVYGRCMWYRLRLLKPQPNIIPTVKKIVLLAGWALFLFLAYKVSKTDREYQEYNPYEVLNLDPGATVAEIKKQYRLLSLKYHPDKGGDEVMFMRIAKAYAALTDEESRKNWEEFGNPDGPQATSFGIALPAWIVDQKNSILVLLVYGLAFMVILPVVVGSWWYRSIRYSGDQILIRTTQIYTYFVYKTRNMDMKRLIMVLAGASEFDPQYNKDATSRPTDNILIPQLIREIGSINLKKNEPPLTCPYSLKARVLLLSHLARMKIP-ETLEEDQQFMLKKCPALLQEMVNVICQLIVMARNREEREFRAPTLASLENCMKLSQMAVQGLQQFKSP--------------LLQ-----------LPHIEEDNLRRVSNHKKYKIKTIQDLVSLKESDRHTLLHFLEDEKYEEVMAVLGSFPYVTMDIKSQVLDDEDSNNITVGSLVTVLVKLTRQTMAEVFEKEQSICAAEEQPAEDGQGETNKNRTKGGWQQ 515

HSP 2 Score: 110.538 bits (275), Expect = 1.095e-24
Identity = 55/116 (47.41%), Postives = 78/116 (67.24%), Query Frame = 1

Query: 1918 RDDGADDEWSSIKDDMMQPDR-LLDAKSKESHIVHCPYYPMEKHEYWWVYLINKKNNQLVTAPQQVTNLKVTEKVQLKFSAPEKPGIYQYIVVVKSDSYVDFDMTKPLKVAVSEAK 2262
            +DD A  EW  ++  + + +R LL+ KSK +H V+  Y+P EK E+WW+Y+ ++K   L++ P  V  LK TE+V+LKF AP KPG YQY V ++SDSY+  D  KPLK+ V EAK
Sbjct:  607 KDDEA--EWQELQQSIQRKERALLETKSKITHPVYSLYFPEEKQEWWWLYIADRKEQTLISMPYHVCTLKDTEEVELKFPAPGKPGNYQYTVFLRSDSYMGLDQIKPLKLEVHEAK 720

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00071448 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00071448 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
SEC63	2.131e-154	45.69	Translocation protein SEC63 homolog OS=Homo sapien...	[more]

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TCONS_00071448 (transcript) - C. hemisphaerica