XLOC_006871 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006871
Unique NameXLOC_006871
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000141:471055..493989-

Legend: gene
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ACTGGTTTCAGCAGATTGTGGGGTATTTTTACAGTTCGTCTTGCTCTCTT TGTGCANAGTGAAGTATTTTTACAGTTCGTCTTGCTCTCTGTGTGCAAGA GACAGTCTTACAGTTGTGAAGCTGCGTTTAAAAACGTTCTTTCGAAGCGA ATGAACTCTCACAGTTCTTAACTGTGTTTCTATACTCATTCTTTTTCGCA ATAAAAACTAACTTTTATTTATTTTTCAAGCATCGCGACCTCTTTTCTGA TTGTCTTTAATAACACAAAATGACAGCATGTCACTCTTTTTATCATCATA TCACTATAAACCGGTAATTTTTTTGTCCGGGAATTAATACAGGATATTAC CGGGGTTCTGCACTTTGCATATCTATGAGAAAGCTGTTCCTTTGATCATT TAGTATACTAGTGAATATCTTTTTCTCATCAAAAACTCGTTAAAAAGTGA AAACGGCGCCCCGATCAAGTCTTGCGAACTTTCTCATAGAATTTCGAAAC AGAAATCTCGCATGAATAAATTTTAGAACATTCGCTTATGGTTTATTTTG GACAGTTTACTTTCATTTAAACCTTACTAAAGAGAGTTTGAAACTTTCTT ATAAAACGATCATGTTTTTTTTTAGTATATGAGTTCTAATATTGATTTTC TCATTCCGTTTTAAGCGATCAGTTCTCGCATTCTGGTCACGAATTTCGAA GGTCTTCTTTTTAACATTGTACTAACAAATCAGTGCCGATTCAATTAGAA TTCAATTTTGATAAAAATGGCACCTCATTGGAATCATATATCTTTATTTA TTTGAAGTGAAAAGAACGTTTTGATTGTAAAGCACTTTTCTAACATCTTC ATAAGAGGTTTCGAGGCTGCTTTTTTCTCATGATTCTGTGATTTTACGGA TAACTTTTTATTAAACCGGGGGTATTGTGGTTTTTGATCTCCTACATCTC CTACTTTGTTTTAAGGATAACTATTTTAAGATTAAGTCAATTTTCCTATC GGGACCACCAAAAATAAAAGCAAATTTGCAATTTCTTCGGGCTCCAATAT TGTCAGCAATTATCGGTAGAAGTAATAGCTACCCAACTCTATATTGGATG AGTTCCAACGATTTGACTTCAAGTATTTGATTATTCTAAGTAAAACTAGA TATAAAGAATTCTCAATTGGTTTTCCAGAAAGCATTTAGGATGTGAAATT TGACCCCAAAATCTCGATGTAATGAAAAATCAACAGTTTCTTTTTTAATT GAACTGTTTACAAATCCATTTTATCCCCACCTGATATTTCTATCAAAATT TGAAACAGTTCAAACAAAGGATAAGTAAGTTTAATTTCATATCATAGTAA ATTTTGATAAAGTAGAAAACTTGTCAATTTTATAGTGCTTATAAGATATG TTATGCTTTCCCGATTTTACCTTTTTTACATCTCTCTTTTTTAAGAATGT TTAGACGCAAGTACATTCAAACTTCGNTTCCCGATTTTACCTTTTTTACA TCTCTCTTTTTTAAGAATGTTATAGACGCAAGTACATTCAAACTTCTTAT AATTCATAATGAATTTCGATTATTATTTTAAGCGGTGCTGAAATGCGTTG TCTTTTAAAATATTGAAAGTACCGAAGATGGGTGGTTTAAGAGATCTGTC ATCTTGAATATTATTCACAATTTTGTGTCTTTTCATTATGTTCTTAGATG TTTTTAAACCTCTATGTGTGTGTATTTTANGTACCAAAGATGGGTGGTTT AAGAGATCTGTCATTTTGAATATTATTCACAATTTTGTGTCTTTTCATTA TGTTCTTAGATGTTTTTAAACCTCTATGTGTGTGTATTTTGTCAAACAGA AATAATTGTACAAAACTCTTAAGAGAAAGGGAAAGTTGGGAGAGATAATA TTATCATTCCCCGCCTTCTTTCTCATTACGATTTCCCCTCCTCGTAAAAG GATATCCCTTTCAAATAGTAGAAAAATTATCATCAAATCAAAAAATTGAT TTATCTTCCCCTAAACTCTCTCCTCAATTTAAAATTGGATCGTTCCGGTG AATGTTTATATCTTTCCGTTTTAACCCTTTCTTTTATAAGTATTCCGAGA CTTATGGTTTGGTCTTGTAACAATATGATTTGTTTTTTTTTTTAAGACAA ATACACCCCTGTTTCAGGGATTGACAAGAATCGTTTAGCCAGTAGATAAA GAATAAGGAAGATCAAAAAGAAAATGTCCTGTTTAAGATTCTAGTGTCGT CTGTTCAAAAACCATGTAATGGTTTTCACATTTTGTAGTGTCTTTCCCAG TGAGAATAACTTTATTTCTCATGGGGATATTTCACGGGTAATTTTTGCAA TGGTAGTCTTTCACTTGGCCTGATACAGGGGTGTAGCAACAGAAGTCCTA GATCTTATTAAGAGGCAGTACTTGTTTGAAAAAATACAGGGAGAAACGAA AGGTCAAAGTAACTTCATCTTCATTATCATCCTTCGAAACAAACAATAAC CCTCCCTCCACAGCTCTCGATCAGTCATTGCAGTGCCCAGTTCCTCAATC TCTAGCCCTGTTTCTCGTTACAAAATATCAAGAAAAGTGCGCTTTCTCGA GCGCCTAGGGCCCGCAGGACACCAAAGTAAGATCTCAGACACCATTTCGT TTTTCGCACGGAAACAGTGACCTGAGAAAGAGGAAATTCTTGGAAGTCCA TGATATATCTCTTGAAGGGTTGGGTGGTTGCGCCAATCAAGATTCTGGAC TCTTTTCAAAAGATTTGTATCGCAGCCATCAAGGCTCTTCAGCATGGTTT TTGTCATGGTCCAAGTCTCCGAGCCATAGGAACTTCACTGAGATCTTGTC TTTCGTATATTTTTAGCACTTATCTAATGACTGTTCATTTTTTCCTCAAT AGATCGCTATCCAATTCAAAGAACGTGACTTAGTTTGTTCTCAAGAGAAA AATTACGTTGCCACATCTCAATACCTACCCGAAGCTTTCTCCGATGGTTC ACGTACGAACGGCCCGCCTGGTTGCTTGACGACCATTTCCAAATATGACC AAGATTCAGTAAAACTAAAAGCTTGTCGCTCCAACACTACCATTTTGATT CGTCGCGTTGGTAGATATCTAACGTTCAATATCTTATCACCCTTCGAGAT TGTAAACAAATCCAGTGGACTTTGTCATGGTGGATGTCCAACCAGTGAAC TTTTCGATTATCTCTCTTTCTTTGCAAACCTCATCAACCAAAATGACGTC ACCAATGACATAAGAACGGCACCGCGCTCCAATGACGTCAGTGTTACGTC ACAACTTTCGTATCACGAAGCAATGCACTTGTGCTCAGTGAGAAATGTAA CAGACTTTTATTACGACTCTTGTGTCTTCGATCTTTTGATGACTGGAGAA AGACAATTTTCACTAGCAGCTAAGCTGGCAATGCTTGATGCACAGAGCAT GGACCCTAAGTTACGACTGCGCCGCTCTAATAGCGTTGTATTACAAGTCG CCAGTCAACAGCAGCAGAGAGTACAAAATTATTCATCATCAAGGACTTTA ACTCACTCTTCTGTACTGGTAGTATTACTGACCTTATGGTGTGTACTAGC CCTAAGGTGACGGCATTAAAGCCCTGGTCAGACTGTAGATGATTTTAAAT TATGTTCACATTATGAGTTATTTTTTGTTTTTATTCAGAGTGTTTGTTGG GTACACCGAACTCTAAAATTATGGATTTCCACTCAACAGCTGAAACTGAA CAAGCAAAATTATTAGAAAAAGGAGACTTCCATTTCAATCCTTATTTTAG AGTTCGGTGGTTGGGTACCTGTTTTGGATGGGTCTCGCAATACCACTATA GTATTTTTTATCACAAATAAATTAAAAAGGGTGGTTGGGAATATTTTATG GTTCCCATACCTCCTTTTTAGAAATTTTATGCATTGTTATAAATTTATAG AAGAGAGAGAAAAATGAATGATATATATTTTTGAGAGTGATAATTTCAAA AAGAGATTTTTTTTTCCTTTTTTTATGTTAGTTTGTATTGAGCGTGCGAG CGTGCGAGTGTGCGAAGTGCGAGCGTGCGAGCGTGAAAAATGGAGAGATT TAAGTTATATTTGAAAAAAGTTAAAATTGTTTATGTTTTTTTCGCCGCGT TTTTGACGTCCTTGTACATATTTGAATGTGAATATAAAAAAACAATATTA ATATTATTATTATTTACTGCGCTATTTTTTTGTGTTCAATTTATTATTTT TAACACTTAAAATTTTCATACAACTGTTCAAGACTGGCTCACTACTGCAC TCTAAAAGTTGAGCCTGAAAAACAATCAAACTTGAACTTCTTAGTAGCAG AAGAAAGTTTGTCTTAACAGTTTTAATATTTTTTTTGTTTCTTTTGTTTT TATTTTTTTGCTTACTTGATTTTTGTTCCCATTTTGCAGAGTTCTGAAAA TGATAAAATTGCACGAATTTTTGAAAAACAAGAGCTGAAAATCTTTAATA CAGTGAAAATTCTACATATTGAAAGTTTTACCATCGTAAATTACAGGTTC TTTCATTTTATATTTTTTTGAGTTAAAATTTATTTTTCAATCATCCAGCC CCTAAGTTTTATTTATTTTATATTTTTTGCTCACTCACTGTTTTTATTTT ATAGTGATTTCACACCTATTAATTTTACCCCTCTTTTTCATCATTATTTT TTTTTGAAAAAAAAGGAGGAGTTTTATTCNTCACTGTTTTTATTTTATAG TGATTTCACACCTATTAATTTTACCCCTCTTTTTCATCATTATTTTTTTT CGAAAAAAAGGAGGAGTTTTATTCCGTTGGAAATTAGAAAGACAGAAGCA AAAATGAAAAAAAAGAAAGCAAAAGAAATGACACG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012218TCONS_00012218Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012217TCONS_00012217Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012218-proteinTCONS_00012218-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000141supercontigsc0000141:471055..493989 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.32 0.26 0.39 0.58 2.95 2.27 1.53 2.04 2.28 2 1.83 2.52 19.13 16.47 1.52 2.03 14.09 16.11 30.61 25.55 22.8 24.96 5.62 6.92 12.93 22.45 1.03 0.69 0.87 1.07