XLOC_039309 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039309
Unique NameXLOC_039309
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_371:551935..560437-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039309 ID=XLOC_039309|Name=XLOC_039309|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8503bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_371:551935..560437- (Clytia hemisphaerica)
GGCTAATCAACTTAGTGGATGAAAGTGAGTGGCTGAGCAGGTTGTGGGTA AATTTAAATTCTTTTTTATGATTTCTCGGAAATAATAAACAAGCACATGT TAAACACATGTTTACTTCATTGCCTAACCCTGAACAAGTTCACCCCATTA GTTCAATCCATCTCTGACATGTCTTTCTCATGACTGATGACCTGCAGAAA TCCAAACCTCTTCTCCCCAAAACAGCAGAGACTGCTATAAGACTGCTAAG GTCTATTCAGGGTGTTCAGCACTTACATACTTTTTCACCCAACGTTAATT TGGTGGTGGGAAACTGAAACCCAATTTCAAATTGATGGTACAAAATTTTG AAGAAAAATCAACTCAAGTAGATGTTTTGGGCTATTCCAAAATGATATAT ATACAAGAGTATTGGCAAACTTTTTTCACCTGCCCTCCCCCTGAAATTTT GAATGACAAATTATCCCGCCTTGAAATCTAGGATATACCATGAAGTCGGG TAACTTGCATCAGTGGAGGCTAACATGCATAGCCCTCAAATGAATGACCT GTCTGGTCCTTAAAATACAAAGTTAAATCTAAAGAAAAATGGTAGAGTAA AGCTGGAAGCGAAACTGCGTAGTTCTTGTTGTTTTGAAATTTTGCTGCTT TGATTGGTTAGTCATTTGAGGGCTATGCATCATGTGAACCTCCACTGATG CAAGTTACCCAACTTCATGGTAGTATCCTGTCAGTCCTGTGGAAGTTGAA ATTTTGTGAAAAAGGGGCTGGAAAACAACTATTGATGTCATTTTATGAAG AGGGCTCTCTAGAGAGAAAGCCCTGAGAAATTGCTGAGATATCATATTAT TTCCATGAATTATACACACATAGAAAAATATTGAACCCCCCTCCCCCTTA AAAAAAAAAAAAGGAAAAAAGTTTTGATTAGTAACTGGGCATAAAATGAC 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TAAACCTCATTAATATTAGATCAATTTTTCAAAGATATTTATCAAAATGG AAGAGAAACCTAAAATGAAAACATTGGGAGACGAGGCACCTTCTAAAGTG ACACCAATGTCAGTCCTTGGACAAGATAAAGCATCTACATCATCTTTAAG GAATCCTGGCATGTCATCAAATCAATCTTTGGTTATGCAACTTCAGCACG CAACACAAATGTCCAATATCACTGGAACTGCAACAACAGCGACTTGTATG TTTTTTAATTTTCTTTTTTTTTATCTTACTTGACAACCAAAATTAAAAAT TAAATTAAATTTAAGTTAAGTTTTCTAACCTATAATTTCAAAATGATATA TACAATCTATCTCTTTTTACTTTGAATTTCTAAAGAAAGAAATTTGGATA AAACTCAATTTTGTGCCTGTAATATTTCTCATTTTTGACCAGCATCATCA ACACAACCAGGGGCCACTGATACACAACAACAGCAACAACAACAGCAAAC AAATACTGCCACACCTTTGACAGAGTACACTATGTACCACCATTTACCAT CTACAGTCATGAACCAACAAAATAATACAGGTATATATTGCAAAGGTTAT ACAGAGCTTTTTTTCCTGTGTTTTGTTAGTTCTTTGGTAAATATTCTGTT TTTTTTCTATTAGGAGAAATGAAGAAAGTTTTAACTCAGAATGTTTTAGT AATTCAAAGTTATTCAGCTTATTAATAATTAAGTTTAACAGCTATTCTCA CTGTCAGAGTTTTGGCAGTGATTTATTTACTTTTGATTTTAAAAAGGCTC TTTCTATAGTCTATGTTTAAAAAAAATGTTCCAAAATAAGAAGTTTAGAC AGATTTGTCATGTTCAAAAGAGTAATTTTTTTTCCACCTGTAGATGATGG AGATGGTGCTGGTTCATACGATGACAGCCCACGTGAAATGAGAGAACAAG 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TCCTTAAAAGAGCATATTTTCAAAAAATTAAAAAAAAAGAAATTTTGGCG GGAACTTAATTTGGCGGATTCTTGCCAAATCCGCCAAATTTTCTTTCCGC CAAAATTTCTTCCTTTAAGGTAGATCGGTGCCAAAATAGGCTGCTACATC GGGAACAATAATCTTTCAAAGGTCTATTGAGACCCATTATCTACACATTT GGCTATGAAATAAATTTTTACAAAAAATAAAAAGATACTAAATCTTCAAA AAGTCCTCAAAATAATTCCTTAATTTTTTTGACTTTTCACAACCTAGAGC AAGCGAACGATGTCAACAAGAAAAACGAAAAACAATTAATGGAGAAGACA TCTTGTTTGCAATGACAACCCTAGGTTTCGATAATTACGTTGAGCCTTTG AAAGTTTACTTGACCAAATATCGAGAGGTTTGTCTTTTTAATTTTTAAAG TTTTTTTTCATTCCAAAAGACACCAAAATCAGATTCTTACGTTTTACTTC TTATTTCTACGTTACGTTACTAACTTCACTTATCATCCGGTCTAAAAACA TGTTGTCTAAAGTATTCGTAGCTTTTTACTAAGTTGATGAAATACAAGAT TTAACTAATATTTCTTTTCTCAAAAAGTGCTATCATTTCAGATTGTGCTA TATACTCGAATTTACAGTTTCCCTCTTCCTCTGTAAGGTTAGCGAGCTCT CAAATTAAGGGTATTCTCAGCAATCTTAGCTAAATTCTTATGTTTTTTTT ATGTTCTTATTTTAAATTTTACCAGAGTTTGAAAGGCGAGAAAGTTTTGA ACGTTGCGGAATATGCTCACCATGTAGATAGCGAAGAACAAGCCAGTGGA TTATCGGCTATACAATATCAAATCGCTGGTAGCAACCTTCATCCGAGCAT GGTTTCTGCTGATGGAACACCGTACGCTGCGTACACTCAAGCTCAAATTA ATCAAGTCAATTCACAGGTAAGAATCCCGGATGATTTGATGTTTCATTTC AACTTACTCTTGTGTGCTTANCCCCCCTGCTTATTCCCCCCCCCCCCCCC CCCTACAATTAAGCACACAAGAGTAGTATTTCTAACACTCAAGGTTTGAA AATTATAAAATAATCCTCTTTTGCCTATGCCATAAAGTTAAAGATAAAAA AACCCCGATCCATACAAGGAACATACGTGAGTAGATTTAGCCAAACCCAA CCTTTTTCGACAAGCTGAGAATTGCAGGTTGAAGTAATGAAACTGCTGTT GTACTTTTCAGGAAAATTTTGGAAAAATGAAAGAAACCGTTGATATATTA TTTTGTAACAAAACGTGTACGAAATTCTTATATAAATTTTGTTTCCAGAT TCAATTCAACACGTGACAAGAAAAATCTATGAACATGTAAATTTGGATCA ATCACAGAGAAGCTACCAGTTTGGGGATATTTGCAGTGAAGTTGCCACAA GGGGGTTGTTGTGTTTGATATGGATGGAGGATGGGATGGTTAACGTGTCA AAGCTTTACAACAAAAGCTAGTTTTAAGCAAGACTCGATTATCATCATAA CAACTTTAATGTCTTCAGGCCCAAAAACAATCTGTTGTGTGTCCAATTGT CAACTTGACGTATGTCGGACATTTTTAGAAGGAAGTTAGTCCACCTAAAA TATAGTATAGATCTTTGCGTCGCCTGGCAGAATCGCCCAAGTAACAAATA TTTATGCCCCCATAGATATTTCTAGGTTTTTCTCGGACGCTCCGGATTTT TTAAACATCTCAAGATCCATATAGAATACAAATCAAAAGGTTCAAGCTGT CCGCAGTAATTTACATGCCCACCTATTTTGCGTTATTATTTTGCCACGTA AATGTGAGCAAATTTATTTATTTTTAAACTTATTCATCGTTTTTAGATGT TTTTTTTTTGTAAATAATCAAACTACAACGTACCTTACTTTAATAGTTAG AAGTGAAATACAGTTTATCAGTTAAATTCTAAGTGACTAACGTTTCTAAC GTCGTTTTGCATAATATTCCACTTCCCGCTCTAAGATTCTCCTGACTTTC CGGGATTTTTCCGCTATTTTACCCACGAGAACCGACGTGAGATTGGAAAC GGTTTTTTAAAAATCTTTTGTTCACTTTTGAAACTGTCTAACTTTCCGAA GCTCATTTTTCAACTACCCAGAGTCCTGGTCTTTTTCCGCTAGAAAAGTT GAATCTTATGCCAAATGACGGTAATAATATGATCTGTTATATTTTGTTTG GCTCAATTACTGTACTAGTTCAGGCATTTCACAACTTTAGAACAATCACA ATGATCAAAATTTCGAAAGAAAGAGAACAAAGCCAAAGGTTTCTTACAGT GTAAAAATATATATATTGCAAATAATTTCAAAAAAATAACTATTATAATT CAATATAATTAAAAAAAAAACTATTTTACATGTTACATTTAGATTTTCTC ACAATCGTTGTTTTTGAAATTGGCTAGGTCAACTGAAATATTTTAAAGCT TTAGCGGTCTTGTCTAAAATAAAGTCGGTACGATCTCAACAATTGTAATT TTCGGGTACTACTTTTGTCGGGTTGCACGAAAGCGACGTTTATGTAAGTT TCCATTTGGGATCCCTGTTTAACATCTTCCAAATCCTTGCTTCTTCAAAC AAAAGAAAAGAGGCCTTGTTCTTCCCCTCCAAATTCTTCGTCCTGCAAAA CTGTTTGAATACGCATTCGCTGTTCCACTTTTTGATAGAGTTCAAATGAT ATTTCTTCTTCGGAAAGAAAGCTCAAAATTCCTTTGGCGCCCTGTAAATG GCA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062759TCONS_00062759Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00062758TCONS_00062758Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00062758-proteinTCONS_00062758-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_371supercontigscaffold_371:551935..560437 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
15.89 16.72 12.8 12.74 31.72 28.76 25.89 25.49 15.54 16.2 11.76 8.65 8.99 8.64 8.19 6.26 18.12 15.01 7.74 10.49 13.13 12.87 11.23 12.4 15.82 15.11 4.54 3.42 5.41 6.35