XLOC_006972 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006972
Unique NameXLOC_006972
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000144:294574..306117+

Legend: gene
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>XLOC_006972 ID=XLOC_006972|Name=XLOC_006972|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11544bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000144:294574..306117+ (Clytia hemisphaerica)
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CCTCCTAGTCAAACAAACAGTTTTCATTTTGATGTGTCTGGTTTAAGGTC TAGTTTACCTATAGATCATCCACGTCGCAAATTAAGGATGTAGCTCATGC ACACTCCGTCGACTTAGTTATTGTACGTGATTAAAAATTAGCAGTAAGTT TGGTTCAGTGCGTTATAGTTGCACCAAAAGTTTCAGAACTTTTATGTCTC ATGGTCTAATAAAAACTTGAGCGAGAATTCATATTTCTTCAAATGTCAAA GAGAGTCGAAATTTAAGAAGTATGACTGTTTCTTCACTAGTTTGAATTAC CTTATTAACTCGAAACTGGAATTATAGCGTCCACTGTGTCTTGTAGAAAT TAGTTGATTGCCCTAAATGACCAGAGTTGCAATCAAATTATGTTTTCCAT TCAGGTTCTTCGTATCAAACCACCAATGAACGTCACTAAAGAAGACATTG ATTTCGGACTTGCTGTTCTCAGACAATCTATCGAAGAACATCTCGCTCAA TAGAAGGCGATGTTGTGAAACATACCAACGTTGAACATACAATATCAATG CAGGGTTCACAAGAAGACGAGACTATTGTGTATTCTGGTTAGATATACAT CGTCCCAGTAATTTTCGATGGAGCCTTGTCCTTATTGAAGAGCGTCATTG AAAATTCATGGACCGTACTGCTGTTCCACAGTggcaaaaaataaacaaag ggAAGCATTATTCAGCACAGTTAAgtttataattttaaatcacCACGCCA TTCCAAAAAtactcatttaaaaaaatatacgcTCAAGGAACTAATTTGAT ATTCACACCTTACGTCATTAATGAGTTTTAGCAAAGATTGACAAAAGGGG TTCTCTAAGATGTCTATAGAATTAATTCTTCCCTCGCTATTTCTTCACTT GAGAATAAATTTCACATAAGGgtaattttcatcaattttctaTATAATGC 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012414TCONS_00012414Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012415TCONS_00012415Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012416TCONS_00012416Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012417TCONS_00012417Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012418TCONS_00012418Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012419TCONS_00012419Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012420TCONS_00012420Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00012421TCONS_00012421Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012414-proteinTCONS_00012414-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000144supercontigsc0000144:294574..306117 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
AGXT2alanine--glyoxylate aminotransferase 2, mitochondrial precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.42 1.23 1.66 1.62 301.27 238.79 331.45 314.75 224.29 256.68 229.05 212.33 442.98 412.59 275.58 364.02 290.23 232.62 250.67 259.45 264.08 284.47 140.32 153.24 94.92 64.11 51.86 66.92 367.96 289.26