XLOC_006165 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_006165
Unique NameXLOC_006165
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000119:302368..322763+

Legend: gene
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GGTAAATGGTGTAAAGAATATTGCAGAATATGTGACCGCAAATCACCACC GCCTTTAACACTTCCAACTGGTAAAAATGATCAATGGGTAATTGCTTAAA TTATACTGGAGGTCCTattttaacctgtgttcgttcgttcgtccgtccgt ccgtccgtccgtccttccgttcgtctgttaccaacttttctcaggagggc accatcataggtaaaagatggctcaagcagattgttccaaaaaaattttt gtggctcaaacgcatttttatctataagaatcactatttataagcataca tcaatgttcttagccaaattactcaattattATTATGAGATAAATGTTTT TTGCTCATGAaggtttacttttgaagaatatttgtgttgagtcatgaaat tttggttagacgtgttttttaagaaaaaaatggaccaaatttgatttttt tttataagcaaacaTATTACCAATTACTTAGTTATTAGATTCTCTCAAGA TAGGCTCTttcgttttttatgaatttttcacTTAGgagcataactataaa cccttgaatgtgacaggcTAAGTAGTAGGCGAAAAGAAAGTGAACCAGGC TGGCCGGTATTTTCATAACATAATTTACTTGCCGGAACCAACATATATCT GTATAAACAATCTGAAAATCTTAAAACTTTATAAGTGGGGTGAATAAAAA TTTCCTGggtggaatatttttgaaaaggagtCTCCAACAGAATTATTTTA AGAAACTGACCCTCACTCTACAGactgtttcattgtttcaatgttcatat GTTCGTattgattagttttgataatCAGGTACAAAGTGTCACTTGTTTTT AAATAGAATAAATTTAATGACTAATCTTTCACCAAATCCAAAGGTTctaa atttttacatatttgtgTTGGATATAATGAAGATGTTATTGCGATCCAAT TTTGTTAAATACTATTATTTTATTCAACGCTAGGTCGTCTGCGATCAATG TTCACCGGAAATGTGGTACCACGCAGGATGTCTTGGTATCAAAGAGACAT CGCAGTTAAAAGATGTTTCGTACGTCTGCAATAAAGTGAGTGCTCAGAAT AACCAACCACCTTTTAATTTAGTCTATTTTATTAATAATAACACTATGAC CAAGCTTTCGAGGACATTCTAGTAGAGTCTACACTTATACATAATATACA CAAAAAATGTATTTAGAAACATTAGGGAGAGGGGTGTATGCGAGTTAGCT GGCTGAAAAACCTTTAAATGGGCCAACAAGTGGTGCCACGGGTAAAACTG TAAAGACTCAGGGGCTAGAAAAAAGGTGGATTTTGCAAAGTTATAACTAA CGATCTGATGGAGCTACAAACTCTGAGGAAGAAAATCTATTAAGACAAGT CCCTTTCTCAAACACATAAGAGTTGAGTCCCTACTATTACATGACAGTGG TCCACTTTACAGCTTTTTTAGGTTTGTGAATCGCAATTTTTTACCTGAAT GAAAtaagaagtcattgcagttTTTATTACAGACGCTGGCCCTCTCGCTC GGGTAATTAGAGCTaacaaatttgataaaaattattataagttttttttt tttttttgctttaaccAAACAGTATATTTTATTCTCTTATGTAGCCCATT GTTAAAGACGAGAAAttatcccttgcaatggatgaAACCCTGATCAGAAA GAGAGCAAATAAGCAAATTCGAAAATGTGGTGGCTGCTCTGTTCCAATCA GCGAAGCTTCACTGGACCCCCCGCATGATATGGTCTTGCTCAAGAAAATG TTAAGACCGAAACGTAATTGTTCATGGCAGTCGAAAAAAGAGGACGACTT CGTCGTGGCGTCCGTTCATTACCATGTTCAACCTGGTTGTATAAAAGACA TTGATCTGGGAAAAGTTATTTTATCAAGAGACATGCACTTGTTAGCGTCG CATCGAGAAAGATTGAGTGATATTGGTGTTAACGTAGATTCTCTAATTTA GAACGTCCTCTAATTAGATCAAAAGAACCTAAATTTAAACGATATGTCAC ATGGGATTTATCAGTCTCAATTTTTAGATATCATTATAATGCAACAGACA ACTGAAGTAACTTTTTCTGACATCAAGAAGACACTCCTGGTGTTTAAATC AAACGTTTATTATGTTATTAGCGACGTTACCCTTTAACTCTTAGGCATAC acgtttgttttgttttttatttttcatttttagaaacacGTTTTGCTCAG CAggctcaatgtttcttaagaaatcattTATTTGAgtctaaaatattctt agatgTTTCTCATATAAAAACCagaaaacatatttttaaaccTGGC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00010985TCONS_00010985Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010986TCONS_00010986Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00010988TCONS_00010988Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010989TCONS_00010989Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010990TCONS_00010990Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010991TCONS_00010991Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010992TCONS_00010992Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010993TCONS_00010993Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010994TCONS_00010994Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010995TCONS_00010995Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00010996TCONS_00010996Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00010996-proteinTCONS_00010996-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000119supercontigsc0000119:302368..322763 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
23.19 24.39 34.51 39.89 19.23 17.54 11.09 15.53 102.49 63.57 119.18 48.89 88.55 59.22 15.18 24.01 15.28 22.76 84.84 159.1 69.3 71.45 37.03 58.58 38.58 30.42 128.17 155.96 13.01 11.36