XLOC_003609 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003609
Unique NameXLOC_003609
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000066:683153..697566-

Legend: gene
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>XLOC_003609 ID=XLOC_003609|Name=XLOC_003609|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=14414bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066:683153..697566- (Clytia hemisphaerica)
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TTGCTGCCCTTCAAGTAAGTTGTTTTCATGAAAGATTTTCTTAAAGTATA CCATAATGTAGCCTACAAACCTCTAAATTGTTGGACCTGTTTGACGTAAA TAAATGCACAATAAAGTCGAGCTGATCATTTTTTGAAATTTAAAAAAGTT TTGTTTGATAACCACTATTCTTATTTTGACCCCTTCAAAATTTTGAACCA TTCCTCTTCCATCTTATTAAGATGTAGGGTTTATAGTTTCCCATTATAAG AACAGAGCCAAAGTTCAGAAATGGATAGACACAGAGGAGAAATTTTTTTT GTTTCAGGTTATTGGTCTTATCTTTTCTATGTGCTTGATTTGTGCGTTGA AGAGAGCTGGTACTGTTGCTTGAGTAAGAAAAGTTGGAGGGAAAAACCAA ATGGTGAAAGTATACCGAAGTATACAGTACTGTACAAGCATTTATGTATC ACTTTGTAAAATAATTCATCTCAATTAAGCACAACTTTTGCACTGGTTTT TGGTGACTTCGAGTTGATTTGCTTTTGGTTGACAATTCCTTTGATTTTTT AATGTATAAAGTATAAAACCATTTTATTTTATGCCTTTTTTGCTTTGTGA TTTTTCCATTTTCTTATTTTATCTTTTTATAGACAAACTCCTTCTATTTG TAATAGTAATATCTTACAGTATCTTATCGTTTTTTTTTTACTTTAACTGA CTCCATTATTGTAAATGTATGACACATTTCTAATGTATTAGAATTAATGA AAAGATTTGATTGTTTTCTTGGTTCTTGAAATAATACTGATCTTTAATGG ATGTTCAATATTATGTAATAGAACATATCTCTTTGTTGTAATTAACATTT GGTCATGATTTTATGAAATAAATGTTAACTTGTATGTGTATTTATGCCTT GCTTACCAATCATTAAGCATCTCATTAAATTATCCCCATGACAATGATTT 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AGGGATGTTACATCAAGCTGAAAGATTTCTTGAAAGATAATTTCCTTTAT ATTGGAGTCACTGCAATCGTCTTTGCAATATTCCAGGTAAAAGAAAAAAT GCTGAGTTTGTCAATAGTTTGAAATTTGTTCATCATTTTGTGAAGCAATT TTTGTAGAAAAAAAGCATCATGATATAAAGTTATTTTTAAAGTTCTTTAA GATTTCTCTTGATGTACTTAAAATTTGATTCCAGATAATACATCAGTAAA TACCATTCAATAAAGCTTCATAGATTGACTTCAGATTCCGCAATTTTTTT CTTTATAGGTACTGGGAATGATATTTTCAATGATTCTTTACCGAAGCATT CGATGAGGAAAATAATGGAGAGAGAAAATTGTCTGTATTGCATTGTTCTG GAAACAGATGACGATGGTATTGGAAGGATAGTGATTGTATCTTGCTGCTC CTGGTGAGGCATGCAGACTCCAGGCTATTGGTGGTCATATGTTTGGTTGA CTATGTTAAGATGGAGATATTGTATTGGCCAGAAAGTTTAACATATTAAA TGCTGGTTTGATTTGAATTACTATTGTGGATTGGAAAGTTTTTGAATTCA AAGTGAATAAAAATGAACTATCAAAAACTGTTAAAAAAATGTTTTGGGTG TTGGAAGTGAAAATTTATTGAGAAAATAATACAATCTACTTCACTATTTC ATTGGTTTTTAATTGTTTTTAGTTTTCATATATATTTTTTTAATTTTGAT TTATTAAACTTATTTAGATTCATACCATGTCACTATCAAAATGTGTAAAA GTATCTATTATTGATTTTTGTCTTTAAATACTTGTGCTGTTTTCATAAAA TATGAACTAATCTTTTATATATTTTTTATTTCCACTTATCTTTAAGTCGG CTACTGTAAATATCATTTTTCTGCTTTTTATCAAAAATTCTGTTTATTTT 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00006334TCONS_00006334Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006333TCONS_00006333Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006332TCONS_00006332Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006331TCONS_00006331Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006330TCONS_00006330Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006329TCONS_00006329Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00006334-proteinTCONS_00006334-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000066supercontigsc0000066:683153..697566 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
TSPAN8PREDICTED: tetraspanin-8 isoform X1 Homo Sapiens
TSPAN4PREDICTED: tetraspanin-4 isoform X3 Homo Sapiens
TSPAN9tetraspanin-9 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
218.82 210.27 284.85 291.76 249.56 173.14 137.02 145.61 170.84 155.84 154.77 105.84 148.02 115.98 113.87 112.04 109.7 135.63 122.42 162.94 170.38 159.86 125.8 141.25 88.93 110.5 310.83 257.41 155.62 150.86