TCONS_00006334 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00006334
Unique Name	TCONS_00006334
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4208

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
protein sequence
transcript from alignment at sc0000066:683153..697566-
coding sequence from alignment at sc0000066:683153..697566-

transcript sequence

>TCONS_00006334 ID=TCONS_00006334|Name=TCONS_00006334|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4208bp
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ATGTGTAGATAAAAAATAGCTTCCTGGATGGAGTACCATTACGTCATGCA
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ACGAGAATCACAACGAAATTCAAGTTCAAAACTGAGGGTATCAAATCAAA
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CTGAAAGTTTGTCAACAATTTCTGAATACATTACATTGGGCAATTTGATG
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CGAGATGAGATTGAAAATCAATTGAAGAAAGATTTTCAGGATGCCATCAA
AAACAAATACAACGGAACTGACAATTCAGCAATCGACAAAACTattgatg
aatttcaaaaaaactttgaatgttGTGGTTACACCAACTATGTAGACTGG
AAGGAttccaaatattttgataaagaaaaaagcATTCCAAAATCATGCTG
CAAAGATGTAAACAATTGTAATGACTCGAATGATCCAACTCTCTTTCAAT
CAAAGGGATGCTTTAAAGAAGTTGTTGATTGGTTCAAGGATAACGCATAC
GCAGCAGCTGCTTGTGGTATTGCTTTTGCTGCCCTTCAAgttATTGGTCT
TATCTTTTCTATGTGCTTGATTTGTGCGTTGAAGAGAGCTGGTACTGTTG
CTTGAGTAAGAAAAGTTGGAGGGAAAAACCAAATGGTGAAAGTATACCGA
AGTATACAGTACTGTACAAGCATTTATGTATCACTTTGTAAAATAATTCA
TCTCAATTAAGCACAACTTTTGCACTGGTTTTTGGTGACTTCGAGTTGAT
TTGCTTTTGGTTGACAAttcctttgattttttaatgtATAAAGTATAAAA
CCATTTTATTTTATGCCTTTTTTGCTTTgtgatttttccattttcttatt
ttatctttttatagACAAACTCCTTCTATTTGTAATAGTAATATCTTACA
GTAtcttatcgttttttttttactttaactGACTCCATTATTGTAAATGT
ATGACACATTTCTAATGTATTAGAATTAATGAAAAGATTTGATTGTTTTC
TTGGTTCTTGAAATAATACTGATCTTTAATGGATGTTCAATATTATGTAA
TAGAACATATCTCTTTGTTGTAATTAACATTTGGTCATGATTTTATGAAA
TAAATGTTAACTTGTATGTGTATTTATGCCTTGCTTACCAATCATTAAGC
ATCTCATTAAATTATCCCCATGACAATGATTTAATTACTGTAGTATAATT
GCTGCTGCATAATGATGACTCTCTTTTAATAATCTACTTTTTTTTTTGAA
TTTGATACACCAACTGTTATATGTGCTCACATAAATGCTAGACAACTTAA
TTACCTGTTATCTTGTTGATATGATAAATAATATTCTTTTGGATGAAAAT
GGCTCAAAATCTTTCAAAGAAAATCAAGATTACCAAATTCCTACTTTTAT
CTTACATCATTTTATTCTTTTTACTTGGATCAGCACTGTTAGTACTAGCC
ATGGAAAGTAGATTTGGAAAGCAAGATTATATCACAGTCACTGAAAAAGT
CAGTTATATCACTGGATACATGGCAGCAAACACCTTCTGTATTATCATTG
GTGTGATCATGGTGATTGTTAGTTTCTTTGGATGTTGTGGTGTCATTGCA
GAACATTCAATAATGGTTCTTGTTCTTTTCGTTTTCATGGcaattatttt
catctttgaAATGGCCATTTGTATATATGGGTTTGCTAAAAGTGATCAGA
TAAAGGATCGTTTAGAATCTACATACCTAAAAAACATTCAAGCTCTTTAT
ACCAATGACACTTGGAGTCAACATGCGGCAGCTATCGACAATTTTCAAAG
GAATAAACAATGTTGCGGTTACCATGGTATTGAGGATTGGGACGATTCAC
ATTTCATGAAGGAAAATGGTCATTATCCAATATCATGCTGTAAAGAGTTG
AATTGTTCCACAGAAGCAGTTAGATCATATAAAAAGGCGCATTTCTACCA
AAAAGGGTGCTTTAAAGAAGTGGTTAAATGGTTGACTAGGAATATGGAGA
TTATTGGTATCGTCAATTTAACCTTTGGCATTCTTCAGATATTTGGCATG
GTGTTGACAATGATTTTATATTGTTTCGTCAAAGATATGCTTGTTATTAC
TTCCTGAGTGAAGGAGTTTTTAAACAAACTATTgctgttaaacaattttt
gAGAAGTTGACAAATGTGTATCTTGAGGCTTCAATGTTTTGAAAGAGTAT
AACTTATCACTTAATAATGGTTTAGCTGATATGTAGGTTcaaccagtgtt
tttataacagtctgtaaaatatctaatccattttcatttgtttttacaGA
TAAAATCAGTAGTAAAAAATAAACGTAATAGAAATGTCGAAATCTTGTTC
ATGTTTGAAGTACCTTCTCTTCATTTTCAACTTCTTGTTCTTTTTGATTG
GCTGTGCCATCCTTGGACTTGGAATATGGTTGAAAGTTGAGAAAGGTGAT
TACGTAGACATCTCTCAATATGATTACCTGTCAGCAGCAAATGTGGCAAT
CGCTATTGGTTCTGTTATTCTGGTCGTTTCATTTCTTGGATGTTGTGGCT
CCATCAAAGAAATTGCTCCTATGTTGATCGCATTCTTTGTGTTACTGGTG
ATCATATTTTTGCTGGAAATTGCTATCGGTATTTTCGCTTATGTCCAGAA
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ATAAATATGGTGAATCTGGTGAAGGTGGTTTGACTAAGGCTGTAGATGAT
TTTCAAAGAGATTTTCATTGTTGTGGCATTGATATATATACTGATTGGAG
GGGTTCTAAATACTATCAAAAGTTTGGTAAATTTCCGCAAACTTGTTGTA
CAGATGGACTAACAAAGGCATGTCCCACTGAGGTTGTTGCTGAATGGCAT
CGTGTTTACAAGCCTGAAgGATGTTACATCAAGCTGAAAGATTTCTTGAA
AGATAATTTCCTTTATATTGGAGTCACTGCAATCGTCTTTGCAATATTcc
aggtACTGGGAATGATATTTTCAATGATTCTTTACCGAAGCATTCGATGA
GGAAAATAATGGAGAGAGAAAATTGTCTGTATTGCATTGTTCTGGAAACA
GATGACGATGGTATTGGAAGGATAGTGATTGTATCTTGCTGCTCCTGGTG
AGGCATGCAGACTCCAGGCTATTGGTGGTCATATGTTTGGTTGACTATGT
TAAGATGGAGATATTGTATTGGCCAGAAAGTTTAACATATTAAATGCTGG
TTTGATTTGAATTACTATTGTGGAttggaaagtttttgaattcaaagtga
ataaaaatgaactatcaaaaactgttaaaaaaatgttttgggtGTTGGAA
GTGAAAATTTATTGAGAAAATAATACAATCTACTTCACTATTTCATTggt
ttttaattgtttttagttttcatatatatttttttaattttgatttatta
aacTTATTTAGATTCATACCATGTCACTATCAAAATGTGTAAAAGTATCT
ATTATTGATTTTTGTCTTTAAATACTTGTGCTGTTTTCATAAAATATGAA
CTAatcttttatatattttttatttccacTTATCTTTAAGTCGGCTACTG
TAAATAtcatttttctgctttttatcaaaaattctgtttatttttattaa
ggTAATATTTATTACATTTGATTATATaattcaaaagtatcaaaagattt
tccacctttcttcaattttgtttATAATGTAGATTTTAACTTCGATTTTA
AGCTTCCTTTATTATTTGGGATGACACTTCATGGTGCTACAATAATTCCT
GGATCCTC

Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00006334-protein

>TCONS_00006334-protein ID=TCONS_00006334-protein|Name=TCONS_00006334-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=254bp
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FYQKGCFKEVVKWLTRNMEIIGIVNLTFGILQIFGMVLTMILYCFVKDML
VITS

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000066:683153..697566-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00006334 ID=TCONS_00006334|Name=TCONS_00006334|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14414bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066:683153..697566- (Clytia hemisphaerica)
ATTTTATCTTTTCAAGCTTTTAGAACTCAAAGTTTTTTATTTTGCCAAGG
GTCAGTATTAGGGTAGTCTTTGCTGAAAGCTGGATTTGAGAGCAAAATTT
ATGTGTAGATAAAAAATAGCTTCCTGGATGGAGTACCATTACGTCATGCA
TCCATCATAAAAAGCGAAAGAGCGCTGATAAGAACATCAAAAACTCCTTC
ACGAGAATCACAACGAAATTCAAGTTCAAAACTGAGGGTATCAAATCAAA
AGGTATGAGTTTGTTTCCTAGATTTTGTTTCTGTTATTTGATTATTTGAA
TTCAGTACAATCAACTTAACATTTTCTATTCGAAGATTTAAAAGGCAGGA
GGGATGATATTCTCTCTAGACTAGAATTTTTCATACAGTCTCAAAAAAGA
TTTCCCATGTAGAGGGTCAGATAATCTATGAAGGACAAAAAACAATTATA
AAGAGATATCAATTCAAACAACCACCAGTTTCTTTTTATTATTAATTTCC
ATCCAACAAATTATATATGTATATGGAAAATAATATTCTCCTGACTCCTG
AGTTTTTTGTCAAACTATTATCCAAACCATATAAAAAGATTGCTAAGCAA
AGAAATATAGTTTCTATGAGCCATTCCGACCATCTCCTAATATTATTCCC
ATCTCTAAAAACAGTCTATGCTTAAACTTTTATATCAAGGTTACAGGATT
TGCCAGTGTGGAAACGATGTAAAATCCACGCCGAATTGTTATTTGTTTAA
ACTTGGGTCTAAGCCAAAAAAAGTTCCGAAATTGCAGGGGCGCTGTAAGC
CCTCCAAACGGGTCTTGGGCTGAGCCCTGGTCAGGTTTCAGCAGGCGAAG
CCCCCCCCCCAAAAGCCCTGAGATATTAAGTCTTCCATCCCACGCCAAAA
GTTCCTCAAAATAAGCTTTATTTATCTATATTTACACTCTACTACGTCAT
TATATGGCAATCGAGGGAGAGGCAGAGAGCGAGGTGGATGAAATCAGGTG
CTCCTCTTGTCTTGAAGAGCTTGACTTATACGTCAATATCTTACTTTATA
TCAGCTCCTTACGCCAATACGCCCAAAGTAATTACTGCCTTACCATTTCC
ACAGTGTAGGATTTGGAGTGTGGGCGGCCAATTTTACTTTCATTTTCAGG
TAAAAAATCATTGAATAAAAGAACTTAAAATCTTAAATATTTTAATTTTG
AAGAATTTGTGCAAAAAAGTGAAACATAGAAAAGTTTCATTTTTTATTGC
ATTAATTAAAATGGGGATTTTGAAATTTTTCTATGTTTGTTTTTTTGTGC
AAACCCCTGTAACTAAGGGCAAATACCCCCTTGCTAAGGCTGGACTTAAA
AAAATGTTGGTTTGCCGTCACCCGGCCGACCCTACCTCGAAACCTGCCTC
GAAACCTGCCAACCCAAAAAAATTTATTGCCATTTTGAAGAAGATTTTTT
TTCTTCAAAAACTTCAAACAATAAAAAATCAAAACTTGTATCTTGTTTGT
CTCAAGCATAAGAATCGTAAATTCCCTGCTATCACTTCTGCTTTTTATTC
AAAATTACCTAAATGTAAACAAACTGTTAACCCTTCCATGGACAAAAATT
TCATAAATCGCCAAAATAAAAAAAATTCAGACCGGCCGACCCACCTCCAA
AATCTAGGGTCAGGTGACAGCAAATCAACAATTTTTTAAGCCCAGCCTAA
GATGTTGGCTTGAAATCAAAAATGAAACCACTAAAAACGAAAATAATTCT
GTAATCTTGATATACAAGTTTAAGTCTAAACTGCTTACCACTAGAGTTGC
ATTGGGTGACACATTTTTCACCCTGGAATGCAAAATCATAAAATTTAGTT
TTTTAAAAACAAGTACGTTTGGAAAAATCCTTACTCTGTTTGAAAAAGAA
ATTGATTTTTTCCTCGTAAGTCAATCCAACAAACCAGTTATACCAGAGAA
TATTTTATTATTTTTGCTATAATTTCTTTAGTTCAAAATGTCAAGTCAAT
TAGAAGGTGGACAAACTTGCATCAAGTATTTGGTGTTTATTTTCAACTTT
CTCTTCTTTGTAAGTATTTGAATATATGTATAATTTTCATTGAAAAAAAA
TTCATTTCTACTGTTATTTCTATTTCAAATCAGGTGACAGTAAACCTTTA
AAAGGCTAGTCTTAGTATTTGCCTTTAAAATCTTTCAGATAATTGGATGT
GGCTTACTTGGTGTTGGAATCTTCTTGAAAGTTGGGGATGACAAATTTAT
CAATGTTGCTGAAAGTTTGTCAACAATTTCTGAATACATTACATTGGGCA
ATTTGATGATTGCTGTTGGTATCATCATTGTAGTTGTTGCGTTCTTTGGT
TGCTGTGGAGCCATCAAAGAAAGTCAATGCATGCTTACAGTTGTAAGTCA
CCCTTTTGTTGGTTTACAATTGTTTTTCATTCATAAAATTTGAAAATAAA
GGCTTTGGGACAGGAGAAGTTTCCATTGTCCCAGGGACAAAATCAGTGTA
TCTTTAGGGTATTTTTCTCACTTTTTGTCCCATGAAACAAAAAAGAAACC
ATAGGCCCCCTTTTTTTCTGTATTGGTGGGATGGAGCATGTTGCATTACA
CCAACAAGAAAAAAAATTCTCATGTCCCCAAGCCTTAAGTTGGATTGTTA
CTTTTTTTAAGTACAAACATTAATAGTTTTATAGCCAGTCAGCTCTGTAT
CTTTCATTTTCGATAATCTTCTGGTTGACCTGGGTTGANCTTAGTCAGCT
CTGTATCTTTCATTTTCGATAATCTTCTGGTTGACCTGGGTTGACAATGA
TTATCGCCTTATTAAAGAACTGCTTTTAATAAGTTTAGAAATTGTTTTTG
AAAATTATCCATGTGTTTCCTTTGTGGTTGAATAATTCCAGCTTTGACAA
AAATCATTTTTAACCTGTTTTACTTGATTGATCTAATATTTCTCTATAGT
TTTTCACATTTCTGATGTTGATCTTCATCCTTGAATTGGCTGGTGGGATT
TACGGATTCATCAACCGAGATGAGGTGAGAAGAGGTTTCTTAGCTTCAGT
TGAATCTGAGAATGTCTGTCTGTCTGTCACCCTTTGGGGCAGGCTACAGA
CTTCAAAAATGGTCAGATTTGGCTGAAATTTTGCACACTTATTCCCTGTT
GTTCCTTGGGTGAATATCACAATTATCTGTTTTTTTTTCTACAAAATTTT
GATTTTTAGGGGTGTGGTCACAAGTTTTTTAGCCAAAACAAGGCTAAAAC
TTTTTCGTTTATCAAAAAATTTTGCTGATTTTTTTATTTTTATTTTTATG
TTTACAATTGCACAGGCACATTCAATAATTTATTATGATTTAAGTTGCAT
AATGGCATTATATACAAATATATATTTTTGTATTTATAAGAAACTGATGA
ATCAGAGCATTTTTGTTTTTGCTTATGTCATAGATTGAAAATCAATTGAA
GAAAGATTTTCAGGATGCCATCAAAAACAAATACAACGGAACTGACAATT
CAGCAATCGACAAAACTATTGATGAATTTCAAAAAAACTTTGAATGTTGT
GGTTACACCAACTATGTAGACTGGAAGGATTCCAAATATTTTGATAAAGA
AAAAAGCATTCCAAAATCATGCTGCAAAGATGTAAACAATTGTAATGACT
CGAATGATCCAACTCTCTTTCAATCAAAGGTCAGTGATATTTTAAACATT
TGTGCAATGGATGTTTCTTTTGACTTTCATTTTTTAATAAATCTCTTTCT
TTTTGAAACTTGATATCCACTGGTAAAAAATTTGTTGACTCCAAAAAAAT
AAATCAAGATGTATGTCTGGAATTAAAAATCTCTTGTTTTATTTGTGATA
GAGCCATTGCTACTATATTTTCTTCCGTTCAGACTTTGTCTTGGATGCTA
ATCAAAAATTAACCCCTGTTTTGTGACATTTTTACAGTCAGCCACAACTT
TGCTCATACAGTGAAACCATTTTGTGGCTTACATTTGTAAATGCATCTGT
TGTTAAGCTGAATAGTTCAGCTTTCCGTTGCAAAAAGAATGAAATTTTGT
GNTTTTTTTCTACAAAATTTTGATTTTTAGGGGTGTGGTCACAAGTTTTT
TAGCCAAAACAAGGCTAAAACTTTTTCGTTTATCAAAAAATTTTGCTGAT
TTTTTTATTTTTATTTTTATGTTTACAATTGCACAGGCACATTCAATAAT
TTATTATGATTTAAGTTGCATAATGGCATTATATACAAATATATATTTTT
GTATTTATAAGAAACTGATGAATCAGAGCATTTTTGTTTTTGCTTATGTC
ATAGATTGAAAATCAATTGAAGAAAGATTTTCAGGATGCCATCAAAAACA
AATACAACGGAACTGACAATTCAGCAATCGACAAAACTATTGATGAATTT
CAAAAAAACTTTGAATGTTGTGGTTACACCAACTATGTAGACTGGAAGGA
TTCCAAATATTTTGATAAAGAAAAAAGCATTCCAAAATCATGCTGCAAAG
ATGTAAACAATTGTAATGACTCGAATGATCCAACTCTCTTTCAATCAAAG
GTCAGTGATATTTTAAACATTTGTGCAATGGATGTTTCTTTTGACTTTCA
TTTTTTAATAAATCTCTTTCTTTTTGAAACTTGATATCCACTGGTAAAAA
ATTTGTTGACTCCAAAAAAATAAATCAAGATGTATGTCTGGAATTAAAAA
TCTCTTGTTTTATTTGTGATAGAGCCATTGCTACTATATTTTCTTCCGTT
CAGACTTTGTCTTGATTTATTTTTTGTCGCCAAGTATTTGCAATTTNTTG
TGAGTAAAAAATGTGGCTTACAGCGGGGGAGATAATCAGAAATTATACAG
GCTGGTGTCCATGTCCATTGACTATCAAGCCTTAAACTATTTCTTTGATT
ATTTATCAAATATAAAGAGAATAGCCTTATAAAATGCACATTATTGTGGC
TTACAGATCCAAAAACATGACTGTAAAGCATGTATCAAACAATGTGATTC
AAATCGATTTCAGTGGTGGTTTATGAAGCTAGAACAGTACCTAGTGTAAC
TTAATTTTGTCTGTCAGCCACAAAAATTGCTCATCTAATCATGAAAAGAC
TACTATTGATGGTTTCCTTTCAAATTTTATATAAAATACCAACCCTGCAT
TCTTAATGGATCAATTATCTGTATTGTCATGTTAACGGTATTATCTTGCA
TTTACCTCCAAGTAAGCCACATTTTGTGCTCAAATTACGACTTCACAAAA
TTTTGAAAGTATTCTGGTGATTTTAAATTGAATTTTAGATCATTTTGAGT
AGCTACAAATGTTTTAGAAGCGTATGGAGCAGGTTAAACGCTTAATTTCT
GACAAAAATATCCCTTTAATGTAAGCCACAAAATAGANGTATTTATAAGA
AACTGATGAATCAGAGCATTTTTGTTTTTGCTTATGTCATAGATTGAAAA
TCAATTGAAGAAAGATTTTCAGGATGCCATCAAAAACAAATACAACGGAA
CTGACAATTCAGCAATCGACAAAACTATTGATGAATTTCAAAAAAACTTT
GAATGTTGTGGTTACACCAACTATGTAGACTGGAAGGATTCCAAATATTT
TGATAAAGAAAAAAGCATTCCAAAATCATGCTGCAAAGATGTAAACAATT
GTAATGACTCGAATGATCCAACTCTCTTTCAATCAAAGGTCAGTGATATT
TTAAACATTTGTGCAATGGATGTTTCTTTTGACTTTCATTTTTTAATAAA
TCTCTTTCTTTTTGAAACTTGATATCCACTGGTAAAAAATTTGTTGACTC
CAAAAAAATAAATCAAGATGTATGTCTGGAATTAAAAATCTCTTGTTTTA
TTTGTGATAGAGCCATTGCTACTATATTTTCTTCCGTTCAGACTTTGTCT
TGATTTATTTTTTGTCGCCAAGTATTTGCAATTTTTTTGGGGGGGGCAGC
ATTCTAAAGACATTTGCTTAAAGGGCTCTTCCATAAATTTTCATATACAG
GATATATTGGATATTTTGTGCAAGGGTAGTGAAAAATCTACAAAATTTGC
CTTGTTTTGGGGGCAAAACTGCTCTGTTTAGGGGTAATTATTAATGTCTG
GGGGTCAACTGATACTTGCAGGGGGTTAGATCTGTTTTCTGGGGGTCATA
AGTCACAATGTCTGAGGGGTAAATTTCCAAAAAAAAATTTATTTTCCACC
CCCAAACTTTTTCTGGAAGAGACCAAACTATGAGTGTAATCATTGTATTG
GAAGTATCACCAATTGCCAACTAGGAATGGGCTCTTCCAGAAAAAAATTG
CACATGGGGGTGGAGGATATAACAATTTTTAGTGATTTATCCCCCGAACA
GGGTGACTTTATGCCCCCGGACAATAGGTTTTACCCCCTGGACAAGCATC
TGCTGACCCCCCGGGCACCCCAAATTACACCCGGACACCCCAAATTACAC
CCAAACAGAGCAAATTTACACCCCGGACAAAATATCCTCCACCCCCCATG
TACAATTTTTTTCTGGAAGAGCCCAATATACTCATGTTTGAACCAAAAAC
TGCCAACTACAAGTAGAACCATAGTAGTGTAGGAACTTTACATTAATTTT
AATTTAACGTAGCTTAGTGAGTTCTGTTTATTTTATCCTGCTGGGTAAAG
TATTAAATTAGAAAAAGTATTCTATTCAAATTATTGTTTTGGTTTACAGC
TGTCAGGCTGTTGAAATGACATTAATAAAAATTAATATGCTACGCAGTAC
TACCAGTTGTTTGTTCTGCAAATTTTAACAAGCAATGAAAGCCCTTTGAC
GGTGAACAGTTAATTGGAGCTAGGGATTCTTTCTCTGGAGTTTGTGTCAC
AGGGGGGATCTTTTTGCATAGGTGTTAAATCTTTGAAAAATAGAATTGAA
CTTTTATTGGGCTTAAGGCAATTACTTTTTTATTTTCTGGTTTACGGAAT
CGCCGACGTTTTTTTTGCAAAAATAAAATAAAAATAAAATTGGATTTTAC
AAATATTTCATTTATTTATGCTCTTCCGACCTTGTACTGAAAAGCCATAA
AAAGGAAACTTTATAGAAAATTACATTTTATAANCATTTATTTATGCTCT
TCCGACCTTGTACTGAAAAGCCATAAAAAGGAAACTTTATAGAAAATTAC
ATTTTATAAAAGCAAGAAGGGCAAGCAAAATGGTCAGTGTCCAGGTCTTT
AATAAATTAAACACAATTTCCCTACTAAAAACGTTCTTTAATGTATGTAA
GTTTTCTCTAAACATAATTTTTAAATTTTCTCCAACATTAAAGTTTGAAA
AGAGCAATTTTATTTTTATTTTTTTCCATCCTCCGGTCCAAAAGATCATC
TTTGAATGTCCGTAAACCAGAAAATAAAAAAGTAATTACCTAATAGATTC
AGACTAAGAGACTAACTAAAGGGTTTCCTTGTTCCAATATTAAATACTTT
GCTTGATGTACACTTCTGAATTTGGTGAAAAGTAAAGTTATCACTGAACT
GTAATCATTTCTGATCATTTTGTTTTAAAGGGATGCTTTAAAGAAGTTGT
TGATTGGTTCAAGGATAACGCATACGCAGCAGCTGCTTGTGGTATTGCTT
TTGCTGCCCTTCAAGTAAGTTGTTTTCATGAAAGATTTTCTTAAAGTATA
CCATAATGTAGCCTACAAACCTCTAAATTGTTGGACCTGTTTGACGTAAA
TAAATGCACAATAAAGTCGAGCTGATCATTTTTTGAAATTTAAAAAAGTT
TTGTTTGATAACCACTATTCTTATTTTGACCCCTTCAAAATTTTGAACCA
TTCCTCTTCCATCTTATTAAGATGTAGGGTTTATAGTTTCCCATTATAAG
AACAGAGCCAAAGTTCAGAAATGGATAGACACAGAGGAGAAATTTTTTTT
GTTTCAGGTTATTGGTCTTATCTTTTCTATGTGCTTGATTTGTGCGTTGA
AGAGAGCTGGTACTGTTGCTTGAGTAAGAAAAGTTGGAGGGAAAAACCAA
ATGGTGAAAGTATACCGAAGTATACAGTACTGTACAAGCATTTATGTATC
ACTTTGTAAAATAATTCATCTCAATTAAGCACAACTTTTGCACTGGTTTT
TGGTGACTTCGAGTTGATTTGCTTTTGGTTGACAATTCCTTTGATTTTTT
AATGTATAAAGTATAAAACCATTTTATTTTATGCCTTTTTTGCTTTGTGA
TTTTTCCATTTTCTTATTTTATCTTTTTATAGACAAACTCCTTCTATTTG
TAATAGTAATATCTTACAGTATCTTATCGTTTTTTTTTTACTTTAACTGA
CTCCATTATTGTAAATGTATGACACATTTCTAATGTATTAGAATTAATGA
AAAGATTTGATTGTTTTCTTGGTTCTTGAAATAATACTGATCTTTAATGG
ATGTTCAATATTATGTAATAGAACATATCTCTTTGTTGTAATTAACATTT
GGTCATGATTTTATGAAATAAATGTTAACTTGTATGTGTATTTATGCCTT
GCTTACCAATCATTAAGCATCTCATTAAATTATCCCCATGACAATGATTT
AATTACTGTAGTATAATTGCTGCTGCATAATGATGACTCTCTTTTAATAA
TCTACTTTTTTTTTTGAATTTGATACACCAACTGTTATATGTGCTCACAT
AAATGCTAGACAACTTAATTACCTGTTATCTTGTTGATATGATAAATAAT
ATTCTTTTGGATGAAAATGGCTCAAAATCTTTCAAAGAAAATCAAGATTA
CCAAATTCCTACTTTTATCTTACATCATTTTATTCTTTGTAAGTTTTGTT
TATTGTCCCTTTCACTTTCATATTTTCCAAAAAAAAATTACTGAAACCCA
CAGTAAATAACTTAAAATTTCATAAAAAAGAGTAAGAAACATGAGTGCTT
GTTACATTTTATCTGAAAATTACTCTATCGGTTCAATATTTTAGTTACTT
GGATCAGCACTGTTAGTACTAGCCATGGAAAGTAGATTTGGAAAGCAAGA
TTATATCACAGTCACTGAAAAAGTCAGTTATATCACTGGATACATGGCAG
CAAACACCTTCTGTATTATCATTGGTGTGATCATGGTGATTGTTAGTTTC
TTTGGATGTTGTGGTGTCATTGCAGAACATTCAATAATGGTTCTTGTTGT
AAGTTCAACTGATTTTTTGTTCATACACAGCTATTTGGTCTTAAATGATT
TTATCAAATAACTAAACGCTCACCCTATTTTCACTTTTGCCCTTCTGGAT
TTGACTGGTTTAAAAATCAGATGGAATAAAATTGAACATCGAGTATTTTG
TCTGTAGTGGCTTTGTATTTAAAAACTCAAGATGTTTGTAATGAAAGGGA
GAGATGAAATCTGTTAAGTAATCAAAGTTCTTTCACAGAATTTTTTTTCT
CTCATCTTATCAGGCAAAATGATCTTATGTTAGCTTTTAACCAAAGAACT
ATTTTATATGTGAGTTGAATCAGTAATGAATCACTCTTCATCGCAGGGGC
TCCATTCAAATCAAAACCTTATCAATTCCTGCTAAGTTGTTTGAATATTT
CTTGACAATATTTTTCTAATCCTCTTTGAAGGGTCTACTTGTTATGTTTT
CCCTCACGTTACATTTTATATCATCCTCTCTCCATCTTAGTGTGGTTTTA
TGAAAATGATGAATTAAAAATAGTCCTCTTTCTTATGTGAATGTATATTG
TAAGTTCTAGTACTGTTTTCAAAGATGTTCTGGTCTAGTACTTTTGTCTA
ATTTTCTTTCTTTACAGCTTTTCGNCAAAGATGTTCTGGTCTAGTACTTT
TGTCTAATTTTCTTTCTTTACAGCTTTTCGTTTTCATGGCAATTATTTTC
ATCTTTGAAATGGCCATTTGTATATATGGGTTTGCTAAAAGTGATCAGAT
AAAGCTTGTCAAGAATGTGATATATCAAACAATAACAAATCTTATAATCA
CATTTTATGTCTACTCTATGTTAACATTTAATGTCAACTAACTTAATGCT
CTAAACTGATTTACCAAAAGGACATGATTTCTCTCTAATCAACTGAAAAC
TATCAGTTGTTTAGGATTTTGTGTTTTCTCTGGTATATTACTGTCTCGGT
GTTTATTAGATATTTTTTGCATTTTACTTAGTTAAGGGATCGTTTAGAAT
CTACATACCTAAAAAACATTCAAGCTCTTTATACCAATGACACTTGGAGT
CAACATGCGGCAGCTATCGACAATTTTCAAAGGAATAAACAATGTTGCGG
TTACCATGGTATTGAGGATTGGGACGATTCACATTTCATGAAGGAAAATG
GTCATTATCCAATATCATGCTGTAAAGAGTTGAATTGTTCCACAGAAGCA
GTTAGATCATATAAAAAGGCGCATTTCTACCAAAAAGTAAAGTTGATTTT
GATCCTCACTACCTTTAGATTTTAAAACAATGAACAGCATTTTTACTATC
CAGATATTTGATGTGTAAATCTCAAAAGGAAGTTTTCTTTTGATTACTGT
CTTTGTCATGCCTTCTCACTCCATCAATTTTCATATTTTTTGCTTTAGGG
GTGCTTTAAAGAAGTGGTTAAATGGTTGACTAGGAATATGGAGATTATTG
GTATCGTCAATTTAACCTTTGGCATTCTTCAGGTAACATCCATTAGATTC
AATTTCCAAAAAGGTTTGAAAACTAAGACTTCCATTTCAGTGTCCTGAAA
ATATTTGGTTTTCTTGATGATTGATTATTTTGCTGGATTTTTCTACTGAT
ATTTTAGCAAAACCTGTTTTTCACGCTAAGGCTAAAATGACAAAGAGGTG
AAAAGTAAACACATACATTTGGCAGATTTTGTGGGGTTAAGTTGAAGCCA
CAAAGTTGAATATCGACCAAATTTTTAAAATCTAATACCAGATTCTCTCT
GCCATTTGTTCTTTGAAATCATGAGTTATATTCAGGTTATATTTTAGTGA
AACAGTTCTGTGTATATTAAATCCTTGTGGAGAATTACAATAACTTCCTG
ATAACAATCACATCATCTTAGCNTAAATCCCTGTGGAGAATTATAATAAC
TTCCTGATAACAATCACATCATCTTAGCATCACATTCAGAAATCTCTTGA
AGAAATTGATCAATTAACTATTTTTCTTTTGCTTTCTTAGATATTTGGCA
TGGTGTTGACAATGATTTTATATTGTTTCGTCAAAGATATGCTTGTTATT
ACTTCCTGAGTGAAGGAGTTTTTAAACAAACTATTGCTGTTAAACAATTT
TTGAGAAGTTGACAAATGTGTATCTTGAGGCTTCAATGTTTTGAAAGAGT
ATAACTTATCACTTAATAATGGTTTAGCTGATATGTAGGTTCAACCAGTG
TTTTTATAACAGTCTGTAAAATATCTAATCCATTTTCATTTGTTTTTACA
GATAAAATCAGTAGTAAAAAATAAACGTAATAGAAATGTCGAAATCTTGT
TCATGTTTGAAGTACCTTCTCTTCATTTTCAACTTCTTGTTCTTTGTAAG
TAAATTGTAATAACCAAATGAGACAGATATCTATCCGTATCTTCTTATAT
TTTCTTGTAATTTTATACTACCATGTAGTCAAGGTGTATTCAATACCTTC
TTTTGATAAAGGTGGTTGTGCTTTCTTGTTCTTGTTGAATTATCTGGTTT
TTCTTTCCTAACAGTTGATTGGCTGTGCCATCCTTGGACTTGGAATATGG
TTGAAAGTTGAGAAAGGTGATTACGTAGACATCTCTCAATATGATTACCT
GTCAGCAGCAAATGTGGCAATCGCTATTGGTTCTGTTATTCTGGTCGTTT
CATTTCTTGGATGTTGTGGCTCCATCAAAGAAATTGCTCCTATGTTGATC
GCAGTAGGTTCAAATTCCCACTTAGTGATATTTTGCTGTCTTTTTTATTT
TACATTAATGATGATGAAATATTTATTAGTCATTTATTTTTCTGCTTTTT
ACTGTCCCATTATTCATCAGATATTACACACAAGTATCTTTTTGACAATT
TATTCTCTCTTTTACGACTAGAAATACTAATGTTGTTAAACAGCATTACA
TGGAAATCGTTGTTCTCATTGTTAACAATTGCAGGCATATGATCAACGAC
TAGAGGCAACCCAATTAAGTCATCTTCAAATCTTTGCAACCTTCAATTGA
AAGAAAGAATGAAACACTCCCGATTCATAAAGCTTTACTTTTATTTAGTT
CTTTGTGTTACTGGTGATCATATTTTTGCTGGAAATTGCTATCGGTATTT
TCGCTTATGTCCAGAAAGACGATGTAAGTAAAGACTATTACTGTTTGACT
GTCTTTGAACTGTTCTTGTTGTACGACTTCAATCCTTCATAATGGGCTCT
TCCAGGAAAAATCGGGTAAGGGGGTGGAGGATAAGTTGTCCAGGGGTCCG
AAAAAATGTTCTAAAAATTGCTTTGTCCAGGGGGTAAATCTGCGATGCTA
GTAAATTTTTATGTCCAGGAGATTAAATTGATGATTGTTCATGGGTATAA
TCCATGTCCATGGGTTTAAAAATGAAAATGCCCAGGGGTAATTCCCACCC
CCAATGAACGGATTTTTTCTGGAAGACCTCATATTTATGTTGATTCACAA
TACCACAAACTACCTAGTGAATATGTCTTCTAAAGTTAATTCTTTTGCCC
TGATTATTTGGAATTAGTTTGCAACTAGGACATTCTCATTCCAACCCCAT
CGTTTATAGATTTGGTTTGATTTGATTTCGTTTGATAGATTACTTATTCC
AATCCTCCTGCGTTTTCAAAAGTTTTACAATCTGGAAATCTTGCTGAAAA
TCTGGATTCAAAGTGTACTGTGTTTGGACAAAGACATAACAGTAGCTATA
TAAACATTAACTTGATTTCATTTTTTAGTTGGAAACAGAACTGCAGAAGG
ATTTGACTCAAGCAATGCTGAATAAATATGGTGAATCTGGTGAAGGTGGT
TTGACTAAGGCTGTAGATGATTTTCAAAGAGATTTTCATTGTTGTGGCAT
TGATATATATACTGATTGGAGGGGTTCTAAATACTATCAAAAGTTTGGTA
AATTTCCGCAAACTTGTTGTACAGATGGACTAACAAAGGCATGTCCCACT
GAGGTTGTTGCTGAATGGCATCGTGTTTACAAGCCTGAAGTAAGTGTTTT
TAATGGGATAGTTTTACTCTACTTCCTGTTAGCATAGCTTTAGATTTTTT
TTCTTTTAAAAATAATTACTATCTTATTGAAACTTAACCTATTGCAAATT
GGTTCAGACTTTTGCATTTCATTTAATATTCAACATTTTATTATTTTTGT
AGGGATGTTACATCAAGCTGAAAGATTTCTTGAAAGATAATTTCCTTTAT
ATTGGAGTCACTGCAATCGTCTTTGCAATATTCCAGGTAAAAGAAAAAAT
GCTGAGTTTGTCAATAGTTTGAAATTTGTTCATCATTTTGTGAAGCAATT
TTTGTAGAAAAAAAGCATCATGATATAAAGTTATTTTTAAAGTTCTTTAA
GATTTCTCTTGATGTACTTAAAATTTGATTCCAGATAATACATCAGTAAA
TACCATTCAATAAAGCTTCATAGATTGACTTCAGATTCCGCAATTTTTTT
CTTTATAGGTACTGGGAATGATATTTTCAATGATTCTTTACCGAAGCATT
CGATGAGGAAAATAATGGAGAGAGAAAATTGTCTGTATTGCATTGTTCTG
GAAACAGATGACGATGGTATTGGAAGGATAGTGATTGTATCTTGCTGCTC
CTGGTGAGGCATGCAGACTCCAGGCTATTGGTGGTCATATGTTTGGTTGA
CTATGTTAAGATGGAGATATTGTATTGGCCAGAAAGTTTAACATATTAAA
TGCTGGTTTGATTTGAATTACTATTGTGGATTGGAAAGTTTTTGAATTCA
AAGTGAATAAAAATGAACTATCAAAAACTGTTAAAAAAATGTTTTGGGTG
TTGGAAGTGAAAATTTATTGAGAAAATAATACAATCTACTTCACTATTTC
ATTGGTTTTTAATTGTTTTTAGTTTTCATATATATTTTTTTAATTTTGAT
TTATTAAACTTATTTAGATTCATACCATGTCACTATCAAAATGTGTAAAA
GTATCTATTATTGATTTTTGTCTTTAAATACTTGTGCTGTTTTCATAAAA
TATGAACTAATCTTTTATATATTTTTTATTTCCACTTATCTTTAAGTCGG
CTACTGTAAATATCATTTTTCTGCTTTTTATCAAAAATTCTGTTTATTTT
TATTAAGGTAATATTTATTACATTTGATTATATAATTCAAAAGTATCAAA
AGATTTTCCACCTTTCTTCAATTTTGTTTATAATGTAGATTTTAACTTCG
ATTTTAAGCTTCCTTTATTATTTGGGATGACACTTCATGGTGCTACAATA
ATTCCTGGATCCTC

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000066:683153..697566-

>TCONS_00006334 ID=TCONS_00006334|Name=TCONS_00006334|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=4590bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000066:683153..697566- (Clytia hemisphaerica)
ATATTTGGCATGGTGTTGACAATGATTTTATATTGTTTCGTCAAAGATAT
GCTTGTTATTACTTCCTGAGGGTGCTTTAAAGAAGTGGTTAAATGGTTGA
CTAGGAATATGGAGATTATTGGTATCGTCAATTTAACCTTTGGCATTCTT
CAGGGATCGTTTAGAATCTACATACCTAAAAAACATTCAAGCTCTTTATA
CCAATGACACTTGGAGTCAACATGCGGCAGCTATCGACAATTTTCAAAGG
AATAAACAATGTTGCGGTTACCATGGTATTGAGGATTGGGACGATTCACA
TTTCATGAAGGAAAATGGTCATTATCCAATATCATGCTGTAAAGAGTTGA
ATTGTTCCACAGAAGCAGTTAGATCATATAAAAAGGCGCATTTCTACCAA
AAACTTTTCGTTTTCATGGCAATTATTTTCATCTTTGAAATGGCCATTTG
TATATATGGGTTTGCTAAAAGTGATCAGATAAATTACTTGGATCAGCACT
GTTAGTACTAGCCATGGAAAGTAGATTTGGAAAGCAAGATTATATCACAG
TCACTGAAAAAGTCAGTTATATCACTGGATACATGGCAGCAAACACCTTC
TGTATTATCATTGGTGTGATCATGGTGATTGTTAGTTTCTTTGGATGTTG
TGGTGTCATTGCAGAACATTCAATAATGGTTCTTGTTATGAAAATGGCTC
AAAATCTTTCAAAGAAAATCAAGATTACCAAATTCCTACTTTTATCTTAC
ATCATTTTATTCTTTATATTTGGCATGGTGTTGACAATGATTTTATATTG
TTTCGTCAAAGATATGCTTGTTATTACTTCCTGAGGGTGCTTTAAAGAAG
TGGTTAAATGGTTGACTAGGAATATGGAGATTATTGGTATCGTCAATTTA
ACCTTTGGCATTCTTCAGGGATCGTTTAGAATCTACATACCTAAAAAACA
TTCAAGCTCTTTATACCAATGACACTTGGAGTCAACATGCGGCAGCTATC
GACAATTTTCAAAGGAATAAACAATGTTGCGGTTACCATGGTATTGAGGA
TTGGGACGATTCACATTTCATGAAGGAAAATGGTCATTATCCAATATCAT
GCTGTAAAGAGTTGAATTGTTCCACAGAAGCAGTTAGATCATATAAAAAG
GCGCATTTCTACCAAAAACTTTTCGTTTTCATGGCAATTATTTTCATCTT
TGAAATGGCCATTTGTATATATGGGTTTGCTAAAAGTGATCAGATAAATT
ACTTGGATCAGCACTGTTAGTACTAGCCATGGAAAGTAGATTTGGAAAGC
AAGATTATATCACAGTCACTGAAAAAGTCAGTTATATCACTGGATACATG
GCAGCAAACACCTTCTGTATTATCATTGGTGTGATCATGGTGATTGTTAG
TTTCTTTGGATGTTGTGGTGTCATTGCAGAACATTCAATAATGGTTCTTG
TTATGAAAATGGCTCAAAATCTTTCAAAGAAAATCAAGATTACCAAATTC
CTACTTTTATCTTACATCATTTTATTCTTTATATTTGGCATGGTGTTGAC
AATGATTTTATATTGTTTCGTCAAAGATATGCTTGTTATTACTTCCTGAG
GGTGCTTTAAAGAAGTGGTTAAATGGTTGACTAGGAATATGGAGATTATT
GGTATCGTCAATTTAACCTTTGGCATTCTTCAGGGATCGTTTAGAATCTA
CATACCTAAAAAACATTCAAGCTCTTTATACCAATGACACTTGGAGTCAA
CATGCGGCAGCTATCGACAATTTTCAAAGGAATAAACAATGTTGCGGTTA
CCATGGTATTGAGGATTGGGACGATTCACATTTCATGAAGGAAAATGGTC
ATTATCCAATATCATGCTGTAAAGAGTTGAATTGTTCCACAGAAGCAGTT
AGATCATATAAAAAGGCGCATTTCTACCAAAAACTTTTCGTTTTCATGGC
AATTATTTTCATCTTTGAAATGGCCATTTGTATATATGGGTTTGCTAAAA
GTGATCAGATAAATTACTTGGATCAGCACTGTTAGTACTAGCCATGGAAA
GTAGATTTGGAAAGCAAGATTATATCACAGTCACTGAAAAAGTCAGTTAT
ATCACTGGATACATGGCAGCAAACACCTTCTGTATTATCATTGGTGTGAT
CATGGTGATTGTTAGTTTCTTTGGATGTTGTGGTGTCATTGCAGAACATT
CAATAATGGTTCTTGTTATGAAAATGGCTCAAAATCTTTCAAAGAAAATC
AAGATTACCAAATTCCTACTTTTATCTTACATCATTTTATTCTTTATATT
TGGCATGGTGTTGACAATGATTTTATATTGTTTCGTCAAAGATATGCTTG
TTATTACTTCCTGAGGGTGCTTTAAAGAAGTGGTTAAATGGTTGACTAGG
AATATGGAGATTATTGGTATCGTCAATTTAACCTTTGGCATTCTTCAGGG
ATCGTTTAGAATCTACATACCTAAAAAACATTCAAGCTCTTTATACCAAT
GACACTTGGAGTCAACATGCGGCAGCTATCGACAATTTTCAAAGGAATAA
ACAATGTTGCGGTTACCATGGTATTGAGGATTGGGACGATTCACATTTCA
TGAAGGAAAATGGTCATTATCCAATATCATGCTGTAAAGAGTTGAATTGT
TCCACAGAAGCAGTTAGATCATATAAAAAGGCGCATTTCTACCAAAAACT
TTTCGTTTTCATGGCAATTATTTTCATCTTTGAAATGGCCATTTGTATAT
ATGGGTTTGCTAAAAGTGATCAGATAAATTACTTGGATCAGCACTGTTAG
TACTAGCCATGGAAAGTAGATTTGGAAAGCAAGATTATATCACAGTCACT
GAAAAAGTCAGTTATATCACTGGATACATGGCAGCAAACACCTTCTGTAT
TATCATTGGTGTGATCATGGTGATTGTTAGTTTCTTTGGATGTTGTGGTG
TCATTGCAGAACATTCAATAATGGTTCTTGTTATGAAAATGGCTCAAAAT
CTTTCAAAGAAAATCAAGATTACCAAATTCCTACTTTTATCTTACATCAT
TTTATTCTTTATATTTGGCATGGTGTTGACAATGATTTTATATTGTTTCG
TCAAAGATATGCTTGTTATTACTTCCTGAGGGTGCTTTAAAGAAGTGGTT
AAATGGTTGACTAGGAATATGGAGATTATTGGTATCGTCAATTTAACCTT
TGGCATTCTTCAGGGATCGTTTAGAATCTACATACCTAAAAAACATTCAA
GCTCTTTATACCAATGACACTTGGAGTCAACATGCGGCAGCTATCGACAA
TTTTCAAAGGAATAAACAATGTTGCGGTTACCATGGTATTGAGGATTGGG
ACGATTCACATTTCATGAAGGAAAATGGTCATTATCCAATATCATGCTGT
AAAGAGTTGAATTGTTCCACAGAAGCAGTTAGATCATATAAAAAGGCGCA
TTTCTACCAAAAACTTTTCGTTTTCATGGCAATTATTTTCATCTTTGAAA
TGGCCATTTGTATATATGGGTTTGCTAAAAGTGATCAGATAAATTACTTG
GATCAGCACTGTTAGTACTAGCCATGGAAAGTAGATTTGGAAAGCAAGAT
TATATCACAGTCACTGAAAAAGTCAGTTATATCACTGGATACATGGCAGC
AAACACCTTCTGTATTATCATTGGTGTGATCATGGTGATTGTTAGTTTCT
TTGGATGTTGTGGTGTCATTGCAGAACATTCAATAATGGTTCTTGTTATG
AAAATGGCTCAAAATCTTTCAAAGAAAATCAAGATTACCAAATTCCTACT
TTTATCTTACATCATTTTATTCTTTATATTTGGCATGGTGTTGACAATGA
TTTTATATTGTTTCGTCAAAGATATGCTTGTTATTACTTCCTGAGGGTGC
TTTAAAGAAGTGGTTAAATGGTTGACTAGGAATATGGAGATTATTGGTAT
CGTCAATTTAACCTTTGGCATTCTTCAGGGATCGTTTAGAATCTACATAC
CTAAAAAACATTCAAGCTCTTTATACCAATGACACTTGGAGTCAACATGC
GGCAGCTATCGACAATTTTCAAAGGAATAAACAATGTTGCGGTTACCATG
GTATTGAGGATTGGGACGATTCACATTTCATGAAGGAAAATGGTCATTAT
CCAATATCATGCTGTAAAGAGTTGAATTGTTCCACAGAAGCAGTTAGATC
ATATAAAAAGGCGCATTTCTACCAAAAACTTTTCGTTTTCATGGCAATTA
TTTTCATCTTTGAAATGGCCATTTGTATATATGGGTTTGCTAAAAGTGAT
CAGATAAATTACTTGGATCAGCACTGTTAGTACTAGCCATGGAAAGTAGA
TTTGGAAAGCAAGATTATATCACAGTCACTGAAAAAGTCAGTTATATCAC
TGGATACATGGCAGCAAACACCTTCTGTATTATCATTGGTGTGATCATGG
TGATTGTTAGTTTCTTTGGATGTTGTGGTGTCATTGCAGAACATTCAATA
ATGGTTCTTGTTATGAAAATGGCTCAAAATCTTTCAAAGAAAATCAAGAT
TACCAAATTCCTACTTTTATCTTACATCATTTTATTCTTT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_003609	XLOC_003609	Clytia hemisphaerica	gene

The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:


Feature Name	Unique Name	Species	Type
TCONS_00006334-protein	TCONS_00006334-protein	Clytia hemisphaerica	polypeptide

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000066	supercontig	sc0000066:683153..697566 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
72.9368	70.0809	94.9448	97.252	83.1684	57.6907	45.5906	48.4459	56.7488	51.7765	51.4924	35.1065	49.216	38.5276	37.8602	37.2919	36.546	45.178	40.7531	54.2895	56.7598	53.225	41.915	47.0616	29.6388	36.8287	103.489	85.7303	51.8665	50.2856

Annotated Terms

The following terms have been associated with this transcript:

Vocabulary: **INTERPRO**
Term	Definition
IPR000301	Tetraspanin
IPR018499	Tetraspanin/Peripherin
IPR008952	Tetraspanin_EC2

Vocabulary: **Cellular Component**
Term	Definition
GO:0016021	integral component of membrane

GO Annotation

GO Assignments

This transcript is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
cellular_component	GO:0016021	integral component of membrane

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00006334 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: CD151 (CD151 antigen OS=Homo sapiens GN=CD151 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 126.331 bits (316), Expect = 2.702e-31
Identity = 86/222 (38.74%), Postives = 126/222 (56.76%), Query Frame = 1

Query: 2800 GCAILGLGIWLKVEKGDYVDI-SQYDYLSAANVAIAIGSVILVVSFLGCCGSIKEIAPMXXXXXXXXXXXXXXXXXXGIFAYVQKDDLETELQKDLTQAMLNKYGESGEGGLTKAVDDFQRDFHCCGIDIYTDWRGSKY--YQKFGK--FPQTCCTDGLTKACPTEVVAEWHRVYKPE-GCYIKLKDFLKDNFLYIGVTAIVFAIFQVLGMIFSMILYRSIR 3447
            G A++ +GIW    K DY+ + +   YL+ A + +  G+V++V   LGCC + KE   +L  +F+LL+IIFLLEI  GI AY     L TEL+++L   M  +Y + G   +T AVD  Q++FHCCG +   DWR S++   Q+ G    P +CC   +   C     A    +YK E GC  KL+ F++++   IG   I  A  QV GMIF+  LYRS++
Sbjct:   31 GLAVMAVGIWTLALKSDYISLLASGTYLATAYILVVAGTVVMVTGVLGCCATFKERRNLLRLYFILLLIIFLLEIIAGILAYAYYQQLNTELKENLKDTMTKRYHQPGHEAVTSAVDQLQQEFHCCGSNNSQDWRDSEWIRSQEAGGRVVPDSCCKT-VVALCGQRDHAS--NIYKVEGGCITKLETFIQEHLRVIGAVGIGIACVQVFGMIFTCCLYRSLK 249

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00006334 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00006334 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
CD151	2.702e-31	38.74	CD151 antigen OS=Homo sapiens GN=CD151 PE=1 SV=3	[more]

You are here

TCONS_00006334 (transcript) - C. hemisphaerica