XLOC_002281 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002281
Unique NameXLOC_002281
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000039:1..22475-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_002281 ID=XLOC_002281|Name=XLOC_002281|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=22475bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000039:1..22475- (Clytia hemisphaerica)
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CGTCGCGTACGACACGTCCGAATACCATGTTAGAGTTAAGTACTTCCGCA GCAACGACCAAAGAGAGCGCCGTAACTACGTCTTCGAATAAACAGAAAGA TGTGAAAGATGTCAAGGAAGCAGCGAAGAATAACATCTCTTCCGCCAAAC GATCGCGACCAGTAAGCCTAATGATCAACAAAGAGAAAGCTTCCTCGTCA AGAAAATCTTTAACACCTTCTACTGAAGAATTCAACAGGAAACGAATGCA ATATCGCCTGAACGACCAATTACATTCCCTTGATGAAAATATTAAACAAG ATAACTCAGGACGCATGTCTCCTAAGAAAAACTCCAAATTCAATTTATCG AATTTAAGTTCGCCTCGTTGTCGCTCACCTACCAGGAAAAAAGAAACAAC ATCTGCAAAATCTACAAAAGAAAATAGACCTGATGCAAAACCTCTCCCTG TTCGACCAGCAAGCTCTTTAGCTACCACGAACAGAGATCGCTCAAGTTCA CTTTCTCGACGTACTCCTAAAAACGAAAGGTCACCTATTCGTCCGGCTAC TACCATACCGCCTTCTCCAAAGAAAACAATAAGAGAACGTTCAGCGAGTG GCAATCGCTCCACCATCACCACAAAACGAGCAACCACCATAACCACGCCG AAAAACTCAGCTACAACACCGAGCGTCGGCTCTCCCAGCACAGCCAGAAA GCCGAAAAGCACACCAACCAAAGTAGGAACATGGAACGTTGGGACAGCAG TCCAATATAAAGCCCCAAACAGTCTCCGTAAACCTTTATCCCCTAAAAAA ACAGTGAACACAAAAACAACGAATAGTCCGAAGCATGTTCGACGGAAAAC GAGTGAAGCGGGGAAAGTCCGTATTACCACTGAAGTGAATAAGAGAAAAA ATATAACCTTCCCGGACGGTAAGAAAGTAGATAAAGAGACCAATACAAAA ACAACCGTCTCTGTAGATATGAATGATTCAGAGGGAGATAAAACAGTGAA ACGAGCTTCCTTGCTAGCTAAAGTGAAAACACTTGCTCAAGAGATTGGTT CATTATCGAAACTTGAAACAGGACCTGTATCTGAGAGTTCTTCAGACTCC ATTCAAGGTGTAGGAACACCTGTTCGTAGTCATAGTGACGTCATGGAAAG TGTCATTAAAGAAGATACTGACCGTTTCAGTGAAACCGAATATTTATCTT TGTCCGAAAAACCCTAAATTTCGTCCGAAAAATGAAAGCGTATTATTGTA AATGAAGTTAGAATATATTTTTATATGGTAGTTAACTAACATTGGTAACA AAAATTCAAATCTTAATTTTCATCATTCTCTTCAGACAGACAGTCGAACC CAACCCATTTTTCCGTCTTATTTTGGAGTTTTTCCTATTTTTCAAATCTT ATCTTTTTCAATTTTTCATTTCATTTTCTCACTTCAGCAAGATGGATTTT TCTCTTTTATCTTCCCTCTGCATCATTTGCACCTTTTTTTCATTTTATTG GAAGAAAAAAATATGGGATAGATTTTGATCAAAATGAGTTTTCCTCTTGT TTTCTGTAAAACATGACCAATTTTGGATATCGAGGATGTTTTTTATTGAA AGACTCGTTTTCAGCGATTACTGAATTCTACAAGATATTAAATTTTCTCA TAATGAAAAAATATTTGAAATGAAAAAAGAAATTTCGGCAAAATGATCAC ACATGAAAGAATACAGCTGTCTTTTCTCAGACGTAAACATTGATCGTTAT CTCTCATGAAACCATTTTTTCTGATACCGTTTCTATGACGAGTTGTTAAT GCGGTTTCAATCAAAGTCTTACCGCAAAATGACGTATGAAAAACATTGTT CTCGCATAACTAACCCGTCAAATCATAATATATCATTCAGCGAGGAAGAT CACACTCAGATATTTTCATAATACCACCATATTATAGAAAATTTCACCCT TTATAAAAATCCCACTGTGAAAAGAAAAAGTCAAAAAATACGCCGCCTTC AAGATGAGAATATTACTGAACAGTCGATTGACCATTCATCGTATTTTTTC ACCGCTTGACCTTGATTTTTTCTGTTGCTTGAGTTTCATAGGCCTTTTCG CATTGTTATCGATGTCATAAAATATTTACTAGACCTAACCCCCTTTTTCG CTAATTTCAACACCCACAATATTTACGAAACACTGATACCCGACCAATAT TATTGCCTTTGAGATGTTTTCAGAAATCACAAATCTCAATGCATTTACAC CGGATGATGTCAATTAAGTCGTCATATAAATGCCACTCAAAAATATTCAA AACAAATATTTGTATCGTAAATAGCTACGTAATTTGCTTCTCATCAATCA AACTAAATATCACACTAATATACAAAATGAAGAGTGAATTTACAACAGCT TAATTGATTAAAACATGATTAATGATGGATCACCCGACTCATTGTTTTAT ACTGTACATTTCCAATATTTTTACCTTAACCTTTCAACGCTAACTTTTTT GAAAAAGGCCAGAAAATTCATAATTTTTTTTTGGAAATTTATTCTTTTAA AGGCCATTTCTTGACCAGGACAAATGATTCAGGTATCAACTTTGGTATCG TTGGAAAGCTCCTGCTCTCAGCTACAAAAAATAGCTGATTTTATTTTTCT GAATCTCAGGTGGTCAGGAGTTATGACCAAAAGACTGTGTATCGGTAAAA TGACCTTTTCAAAACGTATATATACGACTTTCGCCGTCTAAGGGTTAAAG AACTATATACTTTCTATCGAAATTTTATGTTATATCTCTTTAGCCTCAAA ACCGGCCATGCCTCGCTAGGTTAAAAGAACTATATCTTGGATATTCAGCA AATGAGAACTTAAATATCCGTAACCATGGAAACAAATTTTGTTAAAAATA TTTGATTTTTTTCAAATTTTTTCAAAAATTCAGTTGTTTTAATAAAAAAC TTTTTGAGTAAGATTTTCAAATCTTTCTTCCGATATTTGAAAATGTATTT CATAGTTTACTAAAACGATTTTCGCGATACCCTTTTACCTGAGTTTTATC GGTTCCTCAAAGATAAAAAGGATAAAAACGTCTTTCTTCAGACCTACATG GCTGGATTTAGTTAAAGTAAGCCTAGGGGAGGAGCGTATAACTATAAGCA GTTCTATTTTGCTATAATTAACCTTCCTTTCCCATATCCAAGGAAGGATA TGGACCTCATTGGCTACCTGGCATCAGAGAAAAATCATAGAGCGAAGTTG TACGTCGTACACATGTATGGTTGAAATATTCTTCCCGTCAATCCTAATGA TTTTATCACACTCTATGTTAGAGGCTGTGTTGTACTCCTGCTAAATCTGC ATTAAAATAAAACTTAAGTGACAAGCTTTTAGCAGTTGACCTCGAAATCA CAACACACACTGTTCACGGTTTAAAAATCTCAGACCTTTTATAAAGGCAC ACATTCATTGTCAATTTTTATTTTTCTCCGAAAAGCAGTCTAGATCAAAA ACAGGGGGGGGGGCTTATGAATACCTTTTCCAAGATTTTTGTTTTTTTGT CTGCATTGATCATCTCTTTTCATACATTCTAATAGTTCTAATTTCGGTCA CATTTTCCGGACGATATGAAATTTGTAAACTAATTTTTATCTTAACATTA TTTTCATTGATTTTATTATTAATTTAATTCCTATTATTTGATACTCTCAA GTTTGACCATTAACATGCATTAATAATTTTTTGGGGAAACCTGTTTTCCA ATAAGCGGACAAGGGCGCACCTTTTTAAAATGATCTTAATATTTGAAGTT CCTACCAAGTGTTGAAAGAATAGCTGTTTATATTCTCAACCTACTTTTGT TAGATCAAAACAATTTTTCCCCAAAAAGGAGTTTTTTTTATCCAGCCTCT CTATAGAAGCTTGAAATTCTTCTTTTTTCACTCACATTTAGGATTTGAAG AAGAACGAATCATACATCACCAACAACAATTGTCCAACGTCACCAAGTAC CAAATATGGTTTCGTATCTGCCACGCCCAATACCAAAAAGACAGTCAGGC GTGTTCGTTCAACGAGCTCTTCAAGTTCACAAAAACAATTTTATTACTCT GACGGTGAAGATGAGGACGAAGAACACATCACCGAGAATGAAAGACCTTC TTCTGATAAAGAGGACCATTTAAATGATATGGAATTCTCGAACTTANAAA GACCTTCTTCTGATAAAGAGGACCATTTAAATGATATGGAATTCTCGAAC TTATTAAGGAGACCAAGACCGATGTCTTTTCCTTACGCCTTGAACGAACC ACCAGATGAATTCGCCAATTTCCGTTGAAGTGTTTGTTTTGATGTTGTAT TGCCAGAGATATTCCGTTGTCCTGTCCCCTGGATGAATGAGATGTGTTGG TGTTTTTTGAAAAATAGGATGACAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004093TCONS_00004093Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004092TCONS_00004092Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004091TCONS_00004091Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004090TCONS_00004090Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004089TCONS_00004089Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004088TCONS_00004088Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004089-proteinTCONS_00004089-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000039supercontigsc0000039:1..22475 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
DCLK1serine/threonine-protein kinase DCLK1 isoform 1 Homo Sapiens
DCLK2serine/threonine-protein kinase DCLK2 isoform b Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.39 10.34 8.31 8.73 49.38 41.5 101.31 110.02 35.39 51.84 56.89 59.71 67.93 53.33 60.55 96.18 72.84 73.02 31.43 37.11 57.38 57.36 36.44 43.86 62.16 66.12 55.08 45.09 32.23 33.36