XLOC_000965 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000965
Unique NameXLOC_000965
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000012:652657..663390+

Legend: gene
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>XLOC_000965 ID=XLOC_000965|Name=XLOC_000965|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10734bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:652657..663390+ (Clytia hemisphaerica)
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TGCCATTGTGGTGGCGCCCTTGTTTGGAATAGCTCAAATGGTTTATTTTG TTGGTTTTGCAGAGACTATTATGGAGCGTGCATCTCAACAAAGgatcaaa gatttttcttgaaatcgaaaaatatttatccccTCGAAAGAATTCCTAAA CGACTCAAATTTCTTTAACTATAGTTCTAAAAACGAGAATCTTCTGCCCC ACAATCTTCAAAGGATAACtaatttctttttagtttaTGTTACGTCTCGA CAGTTgtcaaattaaaaatgaaatgatCGGTACCTTCATGCGAGAGCATT GTTGATTTACAATCCCCTCGAAGAGAAACCCTTagttgtttttaatcaat tactttttatattttaatatGTCATATACTTTAAGTAGATAAAATCGCTC ACGACAATGTTAAAAATAATAgagtttttcataaaaatattgtTAATATA TTATAGAAAATTACAATCTATAAAGGCTTTGTATCATaagaattcaaaat atttttactttatcgTTTtacatatacagattttttacGTAAAGGTTGAT TAATggtgtgtttttttcttttttttcttttgtataatttttttagtagt gtataatatttatttggcattttattttttaaacacaCCATTAGCAACTC TCGGAAATGAtcataattagaaatttctgtAAGGATTATAataagttttg acattttctcgtaACGCTTACCAGGAAATCaaggaattttcaaaatgaga ttcAAAAATTATTCTGGTTTTCTACTAGTGAACAATTATTGCTCGTTCGT AATGCTTTAAGTGAATAGCATTACTGGTAAGCTTTTGGAGCTCACACGAT TGAAAGCTTTTACTCTGAGAATTCGCCACCCACGCCGAgagtaaaaatat tgaaaagtgaAACAGATTTATTTGGTCAGCTTAACACTGTCAAGATTCAA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001796TCONS_00001796Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001797TCONS_00001797Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001798TCONS_00001798Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001799TCONS_00001799Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001800TCONS_00001800Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001801TCONS_00001801Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001802TCONS_00001802Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001798-proteinTCONS_00001798-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000012supercontigsc0000012:652657..663390 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SLC25A22mitochondrial glutamate carrier 1 Homo Sapiens
SLC25A18PREDICTED: mitochondrial glutamate carrier 2 isoform X2 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
6.38 5.93 8.48 9.41 45.99 33.69 20.65 19.93 13.24 29.58 8.66 22.44 15.16 17.18 20.76 15.79 6.85 6.81 9.35 12.2 10.81 9.66 15.84 20.55 11.5 13.16 16.84 12.12 16.07 14.12