XLOC_000336 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000336
Unique NameXLOC_000336
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000002:736495..748372-

Legend: gene
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>XLOC_000336 ID=XLOC_000336|Name=XLOC_000336|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11878bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002:736495..748372- (Clytia hemisphaerica)
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TGGTCTTACGGTATCGTATGCTGGGAAATCTTCTCTTATGGTGAAAGACC TTACTGGGAATGGAGCAATTACGAGGTAGGTTTCAAGGACAGGGCAGAAT AGTACCATTAAAGATTCCACTGTCTCTTTCGAAATCCTAATGGAGATGGA AATTATATTGTTTCAAGAATTTTTTATCCAGTTGAGATCTTTATGGAGTG AAATATTTTCCATGCACTTTTGAATGGGGATAAAATCAACTGTCCAGTGG GGCTAAAATTGTAGCGGATTTCTTCCACCGGAAATGAAATTTCGGACAAA TTTTACGAGGGTGTCTAAAGATTAATGCCTCATAGGATGACCCTAATCAA ATTTAAATGTATTTGATATATTGGCTGGGTCAAAGGCCATCTGAAGGCAA ACATTTGAAGGAAAAAAAGTCCGGTGTCCACTTTCGCGCGAAGCGCGCGA AACTTTTCACGTTATTTGTAACGTCATTGGTTGATTGGTTGATTAAAAAA AGAAGCAATTCCATTGGTCAAAATTGACGTAACGGTTGAAAAAAGTTGAA CTTCCTTCAACTTTTTTTTTATTCGCGCGAAACTTTTTTATGACGTAATC TTTTCTTCAGGCAAAAACGGCTAAGAAAAAATCTTTCGCGCGCTTCGCAC GAAAGTGGACACCGGCCTTGAAAAACCATAAATCCCTTTAAAAACCCATT AGAAAAGTGAAGTAGAAATCATCTTCTAAAGAAAAAATTCAATGAGCTAA TAATTTATTTTTATTTTTTTGAAGGTTATGGAAAGACTTTCGACTGGCTA TCGGTTACCTCCACCAATGGTAAGAAAAGAAATTTTAAATCTTTGTAATT TTGTAGAACTTATTAAACTATTGATATTAAGAAAGAAATAAGAAAGTTAA AAGATTAACCGTGATATTTTAGGAGAAAAGCTACGATCTTTGAATAATAA 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CCTTTTGTGCCAAATATTATCGCCATAGTTGCCATTAATGGTCTCTAGCT AAATTTTCAAAGGGAATTGAGTTTCTTATTGACGGTGACGTTCGATCTCT ACCTGAAGACTCCGATGACTAGCTACCATGGAAACTATTTTAACTTGACA AATAATCAGCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCCAATCGAGAAATTCA CTTCAATCTCTGTATACTCCTCAGTTAAACGAACGATTTTTTACCCATAT CCAAAGTACATTCATCTTACCAGCGAGACTAAAATGACTCTAGAAACGTT TCTGAAATTACAAAAAGAATTATATCAATATCTCTCTTTTCTATCATTTT AATAGGGACGAAAATTTGGATTATTCAGTACTGGATGATTTAGCAAGCTG GTTAGAAGCAATAAATATGAAACAATATTTGAAAATGTTTACCGAGAGTG GTTATATGACACCCAAAGATATTCTCTATTTGACCAATGAAGATCTAGAA TCGCTTGGTGTTGGTTTGATTGGACATCGCAAGAAACTGTTGAAAGCAAT TAAAAACACCAAAAACCAGGTAAGGTCTTAAAATTATAACATTACCTTGT ATCAGTGAAAGGGTTGCCTAGGATATCTCCTTGTGACCAAAAACAAACCA ATCACTATAAAGGATGAAAATTAAAAACTTTTTTGATGAATCTAGCAAAG CTTAAATCTCTTCACCTTCAATGTTAAACATTTTCTTGAAATAATCGAAA TCAATATTCTTCCAATCATGATCTATCTTTTCAGAATTCTGAATTCAGAA TTTTTTGAGCAATCACCAATTATCAATTCCATTTTCTTTTCCTTCTTCAG ACTGAAAGCACCAACAAATCAGATACTGACAGCAAAGCATCCAAAGTGAG TCGAACCAGTAGTTTCGCAGGATTCGGGAGCTCTCTGAGCAAAAAAGTCT CATTTCTGGCAAGTCCTAATTCATCAATATCCTTTAAGAAGACAGTCGGA AAACGAACGTCACTCGGATATCAATTGCAATGATTCTGATTGGCTAGATA TTAAGCAGTAGTGAATCTGATTGGATGAATAACGAGAAGTAGCGAATCTG ATTGGATGAATATCAAGAAGTAGTGAATCTGATTGGATGATTATCAAGAA GTAGTGAATCTGATTGGATGAATATCAAGAAGTAGCGAATCTGATTGGAT GAATATCAAGAAGTAGTGAATCTGATTGGATGAGTATCAAGAAGTAGTGA ATCTGATTGAATGAATATCAAGAAGTAGCGAATCTGATTAGACGATTATC AAGAAGTAGTGAATCTGATTGGTTGGATAAAGAGCAGTGGATCTGATTGG ATAAATATCAAGCAGTAGTGAATCTGATTGGTTGGATACAAAGCAGTGCA GTGGAAATCTGATTGGTTAAAAATCGACAATAAGCTATGAATCTGATGGT TGAATGTTAAAAAAAATGCAGGAATAATGAAGATAACTAATCTGGATGAA TGAATATAAACAAAAAGTCACGACTCTGATAGGGAGATAATTTACAAAAG ATATGAATGAATGAACAATGGATAATCAACAGATATTGGGTGAACAATAA ACTTCGAGAATGATTGGTTGATAACAAACAATGGACAGTGTTAATTGATG ACGTTCACGAAAGAACCAAAGTCTCATGATGAACTAATGAAATTTTTTAG CTAAAATGCATGCATGTATGAATAACAATTAACCTAATCATAGAAAGCGT ATAACATATATGAGAACGATGTTGCATGTGATCAAAGTCATTTCGTAATC GAATTCTTTTTTTGGCGATTGACAACTGTTGGTAGATCCTGAATCAAAAT AGATAAAAATGCAGATAGTTGTTCCTATCAACAAAACAAAAAAGCTAGAA 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Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000567TCONS_00000567Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00000566TCONS_00000566Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00000565TCONS_00000565Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00000567-proteinTCONS_00000567-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000002supercontigsc0000002:736495..748372 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.52 0.44 0.45 0.3 7.44 4.91 1.85 2.43 14.05 13.38 6.81 13.55 10.64 10.99 10.46 10.23 9.77 8.63 0.98 1.01 0.26 0.34 0.35 0.37 0.28 0.48 2.49 1.45 0.13 0.15