XLOC_041445 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_041445
Unique NameXLOC_041445
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_451:338198..349677-

Legend: gene
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>XLOC_041445 ID=XLOC_041445|Name=XLOC_041445|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11480bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_451:338198..349677- (Clytia hemisphaerica)
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GCTCGAGGTATGTATTACATGCTACAGTTAGGCTAGGTTGGATGCTAACA TAAGAATGTATAATAAAAACATTCTAAAATGATTATCCCCAAAAAGTTAA GAATATTCATCATGAATTGAAAAAACAAAAGTCTTATAAAAAAAGAGTGT ATAAACAAAGGATTGTAAGTGATTCTATGCTTTATCACGATCCATAACAC TGACCAGCCTGAAAATAAATAAAACTATTTGGAAAAAGTTAAATTACCAA TGATTGATTTTGTCTTGCGAATTCGAATTGAAAAAGTCTCCCACTTTAGT AGAATTTTGCTCATAGTATCCTTATTTACCCAAAATTTAGAAGATAGACA ATTTACTCTAAGGTCCTGAAGAAACGTCTCCATCCAGTTATTAATTTTCG AAAGATTTTCGGACCACCTCTCCTGTTCTTAATAGGATCCCCCGTTTATT TATTTTTCAAAATATTTTCAGCTATTTATTACAAGCTGAATTGGGCTTTT CCAGAAAAAAAACGTATACCCCCTGTTGAGGAGGTCCATCGTTTTGTGGC TGGAAATGCTGAAACCCCCTGGAATTCCAGGCAATTTCAGGTTTACTCTG GAATTCTGAATTTTAGTAGGATCTAAAAGGCTACCCCCATGAAATTCCAG TTATTTTTGACAGATTCCCTATGGAATTCCGGCACATATCAAACCTTACC CCCTTGGAACGGAAATGGACCTCCTCAACAGGGGCTATGCGGTTTTTTCT GAAAAAGCCCATTGCTTTAAAGAGCCTGTTTTTAGCTTATAATTACCTTC TTTTGGGGGTGTTTGGAGGTACAATAGCGGACCCCTTTTTATTCAGACTC TCCCCCGTTAATTAGATTTTGAATAAATTTCGGAACCTTCTTAAAATTCG GACCCACTACTATTCGGTACCATAGAGTAGAAGAAAAGCGATTCACAACC TAATCGTGGCTACAGAATGTAAAGCTAATTGGCTATCCTCGACATTTATA AAACATTCCTGATACCATTTGTTGAGAGCACTTTAGCGGGTGAGAGAAAA AGGAGGAGTCGCTTGAAAAACTGTAAACAAAAAATGACGTATAGAGTCCT TGAGCAAATATCATCACGCAAAATTGCAGATATGATGATGTAAATGAAAT CAGAGGCGCAGCCCGGCTGTAATCTAGAAAAAAAATCTTACACTGTGACA CTTGCGGTAAAAGTAAACCACTTCAGAATAATGCAATGTTGAATCAAAGT TAAAGTGAAACCTCTTTCACTTTTCAGAAAACCAAGTACAATGTTTTACA AACCCAAAACACCATCCCGATGAAGAAGATCCTTCAATACAACACTCCAG CATGGTATTCAATGATCACTTTCTCCATCGATGCAGCGTTTACACATATT GATGGATATACTTACCTATTTCAACAGTCTTTTGTGTATAGGTGAGTACA TACTTTGAGGGGGGCGTTGGGAGTTTTGCGTATACCAAAATACCGACGCA TTCTTCCTAGGTCACCGTCAACATCGACAGCAAAAATATGCATATTTTGC CATTGCATAGCATGTTATGACATCAAAATCCCGTCATTTTTTATGGTTAC CCTTTAAACTATAACCTGGCTGTTTCAAGATGCAATACTCTGCAAGGTTT TTCTTATTCGTTTCTTCCTTTCCCTTTTTCAAGGTGGAATTCAACTGGGC CACCGTACGACAGATTGCCAAATGGTAAGGTGGCCGATGGTTGGCCAAAG AAAATATCAGCCGTATTTCCTGGACTACCAAACAGTATTGATACAGCTTT CAGATGGCCATTAGATGGAAGAACATATTTCTTCAAAGGGCCTCATTTTT ACATATGGGATCCAGTTTCCAACAAAGCTGATGGATTATATAGTATTGCT CAATGGAGAAATGTGTGTGATGTTTTTGTTTGTCGTAAACATTCGAATCC GTTTTGCATTAATAGTGATTCATAGAAGATTTAAATGGCGGTTGAAAAAT TCTGTAACCTCCACCATTCATGAAAGGAAACATTAGATATGGGTTCATAG GCCATTTCACAGTCGCAAAGTGTAATGGGTAATCAGGACCACTGCGAGCT AATGAAGACTTACAATTGGTCCAAAGTTTTGAAATTTTTTAAAGTTTTTT GCGTCTAGCCAACGGGAAGCCGTTATGGAGGCGCAATTAGTCCTGATTAC CCATGATCCATTTCAACTGTGAAATGGCCTATATCGTATCTTTAGCATTT AAACGTTTTTCTTACAAAATGTCGGATTTAACAAAACGTAACATTTTGGT AACACTTGGGAAACTTCCATACAACAATCAATAACAATGATGTTATGATG GATGACTGGGCCCTCATATTTCTGACTTAGATTGAAATGTCTTGAACCAG TGTTACGTCAAGATTTAGTTTTTTTTGCAAAAGGGGTATTGTCCCTTAAC TAAACAAAAGCAAGTNTTGACAAGATTTAGTTTTTTTTTGCAAAAGGGGT ATTGTCCTTTAATTCTAAACACTAAACAAAAGCAAGCAAGTCGGAAAAAC TGATATATTGTATTGATTTTATCTTATCAAACTAAGTTAACTTGATTAAG CCAAAACATTTTTTTTTATAAGAACAAACTATATAAGAAAAAGACTTCGG TGGCCAAAATCTCAAGAACATGTTAAGAACATTTAAGGCTTTGTTGGCTC TAAAACACCTGTTTTCTTAGGAAAATGGACAAAAATACTCAAAAAATGCT GAAAAGAAGAACATATGTTAAGAACATTTTTAGGCTTGAAACCCAAAAAG CTAAGACCGTCTGAAGACTTCAAAGATTTTGGATGAGAAGTTCATTATCT TTTCGCTGATCACCCCAACTGGCACACAACGTTGTTTCAACGTTTATCTA ACGTTCACAACGTCCATATAACGTTAGATGAACGTTAAAATAACGTTGTG TGCCAGCTGGGATTGTTGAAAACAGAAGTGTACCCAAACCCGAAGGGGGG GGTACTTAGGCAAATGGAGGGAACGGTATGTACCGCCCTTAAGGGTACCT TTTTTAGATTTCCAAAGTCCCGCTAAGGGTCAGAAAAATCAGAAAATCAA ATTTCAGCCCCACTAAGGGTAGGAGAAATAGGAAAATTCGAAATTTGGTC AAAATTGGTCAAATTTGTCCTGGTAAGGGTCGTAAAATTCACAAAATTTT CCTTTGCTTTCTCCTTTTTAGTCCCAGTAAGTCCAAGGGTCGAAAGTCAG CTCGCAACCCTAGTACCCCCGGGCCCGGGGGACCCAAACAGAGTTATTAT CAACTTCCATAAGCTTTCTTTAATTTCTTTCATTGTAAATAGGTAAAAAT AATTACCATTAGTTTTGTAAGTGACATTGTATATAATGAAACAGTTAAAA AAAATAAAACATTTAAAGATATAAAGCTGCTCAAATTTTAGGAGATTGAT GACGCTGATTTTCGTATCAAGAATATGACAAAAGGAAGAACCATCTATTC ATAATGTCTTTTGAAACACTTATTCTCCGTTTACGATGAAGATTCATTTG TTTCGGAATCTGAATCTTTCATTTGGACATCTCACAGCCCCGGTGGAACT TTTCTCCTCAATGATGATAAAAATTCGTATTAAAATCCCGATGGGGATAG AGATTCTATTGTTCCAAGGTTAAAAAATCCAATGGGGATGGTTGTGGAGT GTAATTTTTAAACATTGAATTTCGAGGGGGATGAAGTCAAAGTCAATTTC CCAGTGGGGCTGAAATACCAGGGTATTTTCCCACAGGAGACGAATTTTTT TGCCAGATTTTCCAGTGGGTCAGTGACAGTCAGTGACAATTAATGAATGG AACCAAATGCAAAAAAAAAAAACAAATCCAGCAAAACAAAAACATTAAAA TTGAAATCCTCTATTTTTAGTTTCCTCATTGGCAACTAAGAAAATAAGAT CTTGTTGCTTAATTAGATCCCCATGCATTTTATTTTCAGTGTCTTTTAAG CCATTCAAACCATCTGAATCTTTCCTGACTCCTTGTTTCAATATTTGCCA GTAGCCTACTGTATTAACTGTGTCTTTTTCATATAAATTGGTAGTTGGCA TGGAATTCACATCATCCAGAACTGAAATATCAGCTTCTCTCTTGGTCTTG GCCGATTTTAGGAATTCCTGAGACTTGTGCTGTGGGCTGTTCATCTTTTT GGGCACCATCGAGTTCCCGATCTCACCTGAATCAAAGTTTTCAGCCTTTC CCCTGCTGATTCTTTTCGGCAAGAACGATTTTTCAAACTTGGAAAAAGGA CTCGTCATGTCATCGGGCGCCAATGAATTTCCGTTATCTGAAGCTGAACT TTCAATATTCTTGACAAGATTCTTTAGCAAGACCAATTTCTCGAGCTTGG GGAAATCGATTTTCTTTCCAGGAGCTGCTTCTTGGCTTTGTTCTGCAGCC AAGTTGATATATTCATTTTTCAATATGACAGGCTCTTTTGCATCATGTGG AGTATCTAAATGCTCAAATTTAGCGAAAGGAAGATTCTCCATTAAAGGAC TGACATCTCCATATGGCAGATCTAGATCTTCTCGATCATTGAATAGGGAG TCTTGCTCATTTTTCAGGAAAGCAAAGTTTCGAATTTGAAACAACTTGCG CCTTAAATCTCCATAAGTTTTTGTTGATCTTGGAACGCCTCTAAATTTTT CTTGCTCCTTTTTGGCTCGTGTTGGTAGGAAGGAACCTGGGGCAAGTGAA CCATCCGCCATTAATCTTTCAATGACGTCATCTTTGACGTCTACTTGTTG TTTGTTGGAATTTTCGCCATGAATGCTGAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00066227TCONS_00066227Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00066226TCONS_00066226Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00066225TCONS_00066225Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00066227-proteinTCONS_00066227-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_451supercontigscaffold_451:338198..349677 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.03 0.03 0.1 0.23 0.04 0.21 0.16 0.15 0.06 0.19 0.12 0.12 3.54 3.41 3.48 6.43 0.07 0.07 0.17 0.1 0.1 0.07 0.08 0.18 0.25 0.13 0.3 0.11 0.1 0.2