XLOC_003049 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003049
Unique NameXLOC_003049
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000052:755467..765606-

Legend: gene
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>XLOC_003049 ID=XLOC_003049|Name=XLOC_003049|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10140bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000052:755467..765606- (Clytia hemisphaerica)
GAGAAATCAACACTAATGTCACAAAAATTTGTGAAAAACCTTCTTATAAC AGGTGCCAACCGTGGTTTAGGTTTGGAATTTGTGAAGAAGTTGGCGAGCA GAGTTGATATTTTATTTGCTGGATGTCGTAAACCTTCTGAAGCTTAAGTA TACTCTTATATTGATTACATTTTTCTCCGAAGATATTTTTGAAGCAATTT CTTTTTCCATGGTTCTCTACTTAGGATAGTTTGTAGAAGACAATTTGGTT GGCAAACAATATTATCCTCTAGAGGATGCATGATCTCTCATTTTCGCTGC TATTTTCTACTTTCCTGTCTTCTATTCTGATTTTCTGACTTTCTCAAGTG TTCTTAACTGTTTTTACATATTTTTTCTAAAGTTCGCTTGAACCACCAAA TGCAACCAAAGCAACCTTTGGTTTGCAAACCCAATGCCTAACCTCTTACG TTACTGAGACACAGCAGAATACTGTCATTCATAAATACTGTCAACTGCTC TAACTTGGGACGGTTGGTCGACTGGGACATGGGACTGTTTGATATCTGGC CTGTATTTTTTCACTTACTATTAAATCTCTTTGACCACAAATTTGTTTTG ATAATTCCACCAAGTTTATCAATCATACTTTCTGTCATACTGTAACATGT CACAATATCTTCCACTACGGAATAACTTTCATATTTCGATTTAAAAGCCT ACTCGCTGCGAAAGAGAAATTGTGTATTTTTTAATATGCCTTTCATTAAC TCAAATCAAATGACTTTGGAGGTTTGGTGAAATGGTGGCCAAATTGTCGT CCCATGTTTTGTCAGATAGTCCCAAGTTAGAGCAGTTGACGGTACTTATA GCGTTAAATTACATACCTTAATTGAAATAGCTCCCAACCCTACTTGTGCC CCTACAAGGATCTCTACAGCACCCTAACTTAATTCAGAGTGTATGAGTGC 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GAAAATCCGAATGGCCGAGTGGGGAAAACATTAATTTCGATTAGTCAATT TGTAACTGGGGAGGGAAAACAGTAAACTCGATTAGTCAATTTGTAACTGG GAAGGGTAAACTCAGCTTGAAAATATAACATACGTTATTGTATATATGCC TCAAAAAAGATTGAAATATCTCTTTCGTAGATGGGATTGATGCCAGCAGG TGCCAATACTATACAATTTCAAACTAGTCCTGTACTATCCTGTAGCACAA TTTAGTTCTATAGCCATTCGTGAAAATGAACCACCACGGTTTCTTTATCT ACCATTCACGCTGAATCTGTTGGTAGCATCGGATATTTGATTTCCAGACC TCGAAAAAAACCGTTAGTAAAGGGTCCCCTTGATAAGTTCAATCGATTCA CTAAAAATCGATTTACTCGAAAACTGCAGGAGATTCAAAGGGCATTTTCT TTTTGTCAATTCTACACCCTATTAGAAGCATAATATCAAAAATTGACTAA CTGATCTAAGGGGTGGCCTACGAAGTGACACAATTCACTACCTCGGCCGA TAGTCTAGTGTTCTGGATCAACTGCTTGACCCCCCCCCCTGACATTTTGA TACATACTTTCAAAATGTTTATTCAATCAAATAATGTAACGCCAGAACAG TGGGCTGGGGACTAACAACACTTTATTTTTTTCCATTCATTTCAGATGTC ACTTGCGAAAAAAACATCCAAGCTTGCATTGAAGAAGTCTCTAAAGTTTG CGGTGAAGCCGGATTGAGTTGTTTGATTAACAATGCAGGAGCTAACAAGA AGCCGGATAACAAAGTTACCGAACTATCATTGGATGACCTCAAACGTATT TTTAGTGTCAACACTTTTGGTCCTCCCATAGTGTGTAAGGTAAAAAAGAT GTTTGCGATTCTCCAAGGTTTCTTGTCTCGCCCTCTAATTTGAGCCTCTA TGATTCCTCTATTTGTTACTCAAACTAACACATTTTTTTCTGCTCAGCTT GGAAAGTCATACTAAACGATTCCCTATAATTGTTTTATATTTAATTCCTT TAAAAATGTCGAATTACAGAGAGAGTTAATAGCGAGATTATGTATCGGAG ATATTCTACGGCTACGGTTGCGGGGCTGCCCATGCGGGTCGTCACCAAAG GCGACATGTCGTTGTCTACTTTGCTCTGTACGGGAAATACACCAAAACAC CGTATAAGCAAAGTCGACATAATGCCGTACGTCAAATATCGGACTTGCTT TCACCCGCCATTACTTGCCTTACTCGCCATTTCCCTCGCCCTTCAGCCGT AGCCGTAGAGAATTCCAGATACATAATCTCGCTAATGAAAGCTGTGTACA CGAGCTTCATCGCCTGAGCTTCCTCTCTAATCTTGATTTACTTCATGGAC CTTTCAGCATTCCCTATCATTGCTTCAACAAGCTGCCAAAACACATTCAG ATCAAATCATCACAAAGCCTCTTATCGTTAACATTGGGACTGGTTTATCG TCTGTCAGCAGAATGAATCGCGATATGAGTTGCTATTATTCCTATAATAT GTCCAAGGTAAAGATTTCTTGTTACATTAGCAATTATTTCTCGACTTGCC TATAGTTGTGCCATTGTTATAGTTTGAAAGAGTTTAAAAGAATGTCTAAG CTTTCTTTAAAATTTCAGAAAAATCTTGTAGCGTAACAATAAAAATGGAG TCTTTGGAAAATCTAACTTGACGATCTTCTGTTTGTTATTTGTCTCTTGA CTTTTTAGAGCCCTTTGAACATGTTTACCAAAATGTTATCGCTGGAAATC GAAGAAGACGGTATTGATGTCATTGCTATCCACCCTGGGTGGGTACAAAC AGATATGGGCGGTTCAAATGCCACCCTCACTGTTCAACAATCAATTGACA TGATGTTAGAGACGTTATCCAATCTCAGACAAGAACAAAATGGAACCTTA ATCAATTTCAAAGGAGAAACAATCCCATATTGAGAGAGACTTGGTTAAAT GGATTATTTTATTGGGATGAGAGGAGAGAGACTCCAGAGACGAGAGGTCA AAATTGCAAAAAAATTTGTATCTTATTTAAAATAGAATGAAGTTTAGAGT GACTTCGTCTATTAGAGTAACAAGTGAAATAATATCAAGCTGATCAGGGT AGAGACATGTAAGCTGTCAGTTAGGTAAACCACTAGAACGTTCATTATAA TAAATCTTCCTAATATATTTTTAATTTGAGATAAATTTTTGTATGATAAT GTAAAGAAGAATGTTTTTGAAAGTTTTACGAGTTTTTATGGATTCTACCA ACCGAAATTGTGTGAAAGAGCAGATTTTAATGATTTTAAGGCGATTATTT TAACATGACCTAAAGATGATGGTTAAGATGACCTTTTGGTTCGATTCTCC ATGTTTATAATGTTTGTATGTATTTTTCAGGTAACAGTAAAAATATCAAA GAAATAAAAACATCAATGAACATGACGGCCAATGAATTTTCATTTTCTTG TGATCCAAACTTCTGCAGTGTTTGTGGTTCAATCCTCCCTCTCCCCGTCA CTGGTTCAGATGTCCTCTCCTGCAAGTTATGCTCAACTTCCATCAGTGTA GATTCTCTTGAAGGTATCGTCATCCATTCGTTCAAGAAGTTTAATCAACA CAAACTCAAATCATCTGATGAGATGGAACGAATGAAAGAAATGGAAGAGA GTGCGACCAACCATGGACCTGTGGTCAAACGAGAATGTTCGAAATGTCAT CATAAGAAAATGACATATACGACGCGTCAAACGAGGTCGGCCGATGAGGG CCAGACAGTCTTTTTCACATGCTTGAAATGCAATTTCACCGAGACCGAAT ATTCATAATGATTCTAATCGATATTTTTCTGCTGGAAATTTGATAATAAT TTTAGCTGGAGAAGGTAACAGTTTCTTGTACTTTTTGGAAATTGGTTGTA CTTGCGTGAGTTATTGATATGCTGAAATTGTATCTTACATTGGTATTATT AGATCGATGGAAGACAAAATACTTAGTTCCATTGTCATTGCATCATAGCT AGATGGTTATGCACTACGAATATCTTTTTGGAACAAGATGTTTATAATTC AATGTCAATTGATTTTAAAAGCTCTTAAGCTTCTTACATCTCATTCAAAC ACACTGATGATAACTGTATCATACAGCTATATAATCTATTTCCGATTACG TAATTACAATGATTTTTCCTCACAGTTTTTTATTCCGTATGATTATTTAT GGTCTTTGGAAGAGATGATATCTACACATTTGTAATATATATTTGAGCAA CTCTTGTTATGACTTGTTGTATGTCGTTAAGAAGGTCTTAGTTCTATACA TTATTATCTATATATGCAAGATTTGAAATGAATTGGTATTCACAATATCT AAACATTTCCAATCATATATATTTAGTCTTATACTTCTCTTTCAATACCA ATTTGTTATGTCGTTGGAAAGGTCTTAATTCTATACATTA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00005374TCONS_00005374Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005373TCONS_00005373Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005372TCONS_00005372Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005371TCONS_00005371Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005370TCONS_00005370Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005369TCONS_00005369Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00005371-proteinTCONS_00005371-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000052supercontigsc0000052:755467..765606 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
80.06 78.97 89.63 88.28 41.48 31.42 41.04 43.33 33.4 32.36 26.94 25.82 19.69 21.29 24.14 28.44 31.86 31.45 11.82 12.1 22.21 18.72 44.25 39.84 23.81 23.98 22.42 16.66 28.16 28.01