XLOC_003036 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003036
Unique NameXLOC_003036
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000052:382486..404712-

Legend: gene
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>XLOC_003036 ID=XLOC_003036|Name=XLOC_003036|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=22227bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000052:382486..404712- (Clytia hemisphaerica)
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CATGGAGGTTAAGAATGGTTCCAGAGCTATGTTGGACCATGTTTGGCATG AAATTGGTGCGATATTGTTTGTATATGTGGCTACCTATGTACCTTAACCA AAATGTAAGTAACCTGTGNTTGTTTGTATATGTGGCTACCTATGTACCTT AACCAGAATGTAAGTAACCTGTGCAACGTCACAATAACGTCCATTTAACG TCCCTAACATCCATCTCACGTCAGATGAACGTTGTAACAACGTTGTTTCC AAGCTGGGAAATGGATTTTTCTCAAATTTTGCTTGTACTACAAAAATCTG ATTCGCAAACAACTTTTCTTCTTACAAGAAACTGTTCCGTTGGAGGATGA ATAGCAGACTTGCAATACAATCACTTTGGGCTTTTTATTGAAATTGTTAG TTCCGAAAAGTGTGGAATACTATTTCTTCAATACATTATTTGAATTTTCA AAGACTGATCGATCTGCTAAGGGATTTCATTAGAACAATCTTTTATAAGA ACAATTTTATAAGAACAGCGAGGTTCAAAACTGCCAAAAAATCAAAACAG TTTAAAAGAAATGATAGACCTCTTCAAATATATTTGTTCTTATAAAAGAG CGTATCCAGCAGAATCTTGGCTAGTTCAGATTTTTAATCGCTAATAATAT AGTTCCTTTTATAAAAACTTCAAAAACTTTTCCAGTTTTAAGATTAAAAA ATGGTCTTAAAATGTTTTCAATTTCACCATGTTGTGATAATTTTCATGTA ATTTCCTATAAGAAATAAGATGTTTTAGATTCCGCAAAGCCTTAAAATGT TCTAATATAATTAGTTCTTATATAAAAGACGGTTATATCTTGTTTATTAT GACGATTATGTTTCAGCTGAATTATTCAAAAGCAGAAGCAGGAATGTTCA GTACATTGTATGAGATTGGTGGTGTAGTGGGATCTGCATCCATTGGTCTC TTCATTGATAAGTGAGTTTCCTATTTTTTCCATTTTACTTTGTTTTTAGC ACAAGTTTTATGAACCCTGGCAGCTCGTCTCAATCCTTACCAGTCAAAAT TATTTAATCAGAGTTTATAAATGGCTAAGTTAGGGTTTCGAATAAAGGTT GTTGGGTATAACAAAGAATCACGGGAAACTCTTAACACTTAATCTTAAAA AGATTACTCTTGTCTCCCGAATAGACGGGGGGTCCGAATAAGCAGTGGGG TAGGAAAATTTTCTAAATTCTAATAAGCGGGGGGCTGTGATGGAATAAGA GGGGGGGGGGGAATTTGAAGACATCATTTTTTTTAACTGATATCAATTTC AACAACAAAAAAACTTTAACAAATGAACACGTAAAATAAAAACCAATACT GACAAAGGACAATTTTAACAAGTTTAAGATCTATCTACACTGTAATAAAA TATTGAATTATTCGAATTTAATTAGCGGAGGGGGGTGTCTTAATGAGAGC GGGGGTTGACTTACACAGTTTCTTAAACAAAAGAAAGAACAGCTTTTTTG AGAAATTCTTTTGTTGATTCTTAAGGCTTGGGGGAAGTTTTTTTGCGTTG GTGCAATGCAACATGCTCCATCCCACCAACACAAGAAAAAAAGTGTGTGT CTCATGGTTTCTTTTTTTGTTTCATGGGACAAAAGATATGCCCTCCGATG TATCGGAATGGGTCCTACCCACGGTGGAGTAGGAATCACAGCGCAAGCAG ACATTGCAACCCTGCAGATGCGAGCTGCCGAGCCATGGTGTATACTACGA CACTCGAACTACACGGGAGAACGGATGTCCTCGCAAGTGTAGAACCTCCT GAGTGTCACGGCACACCACAATGTCTGAAATATCTACCCATACTCTTGTA TCAGAGAGTTATGGTACCCAATTCCCCTCACATGGCATGGGTTGACCCGG GCGAAGGAACATTCACTTGCCAAGTGAATCGTAGCGCCACAGTGGGTATC GAACTCGAGCCTCCTGGACAGAAGTCACCAAATATCCAAAAGACACGCTG ATTTTGTCCCAGGGACAAAAGTGAGAGAAAGCCTTTATCAAGAGATGCAC AAACTCGAAAAACAATGTTGTTTTAGTTAAAAGTCATCTGTAAGAAATAA TTTGGATCCCCCCCGCTCCTTCGCCCTCCTTTGCTGCTCCACCCTCTCAA ATATTGTTACTGTAATACCGTATTATAAATCATCATTACATATTCCTTTT TTTAACTAGGGTCATGCGAGGAAATACATATATGGGTGTATTCGTATTAC TGACTCTCTCCACATCCGCCCTTTGTTTGTTTCAACTTACAAGTCAGTGT GGAATGGTTATGAATGCTATATTTTTATTTCTGGCGGGAGCCGGAAGTTC CGGTCCGGATGCAGTCATTTCTGGATCACTGGCAGTAGAAATTGGTACAC GGGAAAATGCGCAATCAGCAGTTTCAGGATTAATAAATGGTAAGTAGTAA CTTTTTCTTTACCCCAGTAAAGTGATTTTGGCTAAGATAGAACAATCACA TCAAAATTAAGCGTCGATCAAAAAACATTGCTTTCGTTTTCAAGCAAAAG GCCATATACATTCATGGTGCAATATATTCTACGAAGACAAGCAAGTTTTT GCCAGTAGTGGCAAATTTAACCTAGAGAAAAACCGTTCAAAAATTGCGCG TCTGTGAGAAGGGGGTGTAGATATGAATAGTAGTTAATAATTGCCTTAAA TTTTATATAATTTTGTTGTGTGTTTTATTTGATTTTTCTCCATTTCTATT TTTCCCTTTAGGATTTGGAAGTCTTGGTGCTATACTTGAAGGCCCTTTCA TTGCAATGGTCTTAACATATTTTGGATGGAGTGGGACTTTTTATGTCATG GTTCTGTTGACTTTCTTAAGCGCAATCTCCATTGCAAGACCGGCATTCCA AAAATGATAGCATTTTGACTGATTTGGTTTAAAAAAAGAATATATTTATT TATTTATTTACTTTATTTGTTTTAAAGGTACGTTAGAAATTATGTAGAAG CATTATCCAATATAGAGCTAGAAAATGATAAATTAAAAAAATTGCAAAGA TTGTTTTAAACGTTCAGGAGGTTTGAACCCTTTTAACACCCCCTGGAACA ATAAGGCTAGAAACACCAAAAAATGAGAATACCTTATCGGGGAAAACTTC GTCGGGGAAAAGTGACGAAATTTCGGCCAAGTGACGAATATTTTTCCCCG ACGAGAATTTTCCCCGACGAAAATTTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00005343TCONS_00005343Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005342TCONS_00005342Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005341TCONS_00005341Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005340TCONS_00005340Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005339TCONS_00005339Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005338TCONS_00005338Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005337TCONS_00005337Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00005336TCONS_00005336Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00005341-proteinTCONS_00005341-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000052supercontigsc0000052:382486..404712 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7.21 6.38 2.52 2.4 1.69 2.06 14.24 16.52 23.02 18.4 19.25 21.02 18.96 14.69 24.33 29.85 14.12 15.38 2.14 2.19 3.48 3.41 5.17 4.24 4.74 4.66 1.15 1.83 1.61 2.61