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XLOC_045595 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_045595
Unique NameXLOC_045595
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_92:136919..157194-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045595 ID=XLOC_045595|Name=XLOC_045595|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=20276bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_92:136919..157194- (Clytia hemisphaerica)
TTCTTAAAAAGCACAAAAAAATGTTGACGCCATGCTGGAAAGCTGAGTCG GATCATGATGTAATCCAAAACAAATCGTAAACACATCATAGTGAATTTAA AACCTAACTGGCTGCGCTCGTTGAATGAGACAGATCTTAATCAGTTATGG TCTAAATAGCTCATTGACCAAATGTTTACCGAGCTCATCACTCATTCGGA AGAAGAGTTACAGTGCTTTCCCTATCACGGGAATATTTCAGTTTAATAGT CGGACCAAGGCTAGAATCTTGCTTCTTCCGAACCTTGGTGCGTTTAGCAA TGGAATCAATTTCAAATTGGCGGACAATTCTGATATTTTGTCTTTATTGT TGAATGTTTTGGAAAATCTAAAGTAAATTCCAATTTTGGATCATTTGCAA TCTCGTTCAGAATGCATCAATGAAATCAAAGAAAGATGAATAGGTATCAT CAAGCCAGGACTCTGGAAAAAAGAGTCAAATTATACAAGGCACAAGAGCA AGAATCTGGAGGAGAGCCAGCTTGGAAAGATCTTGGAGTTGGTGATATCA ATATAGTACCAAATTCTGATTCTGATTATTTTAGAAGCAACTATTATGGG GGAATGATTATGCTGATGAATTCAGAAGAAGATGGTTAGTTTTATTTTCC ACATTCTGTCGTTTTTAGCATTTTTAGGCCATATTTTTCAACTGGCTCCA GTTGTTTCAGAAGTTTGAGTAGTTTTCTTTCAGATAATATATACAGGAGA AGCAGAAAGACCAAGAAAGGTGGTGGCTATAATCTAAAATTTTGTCAGTT AATGTTCTGTCTGTTTATGAGTTGAACATTAAAATTTCTTCTAGAAGTTA TATTGATTTGATTGATTGCAACTGCATTGGGTGCAGTGTGTATTTTCAAC TACTTTTCCTTACGTAAATGTATATAAATGTTCTCTTTAAGATGTGCATT 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CGTCTCCCGTACTTGCTGTTACTGCCACGGATGAACTGGTCGGAAAAGGT ATCTTGTCTCTCACTGATTGAGGAGGAAATTTTGATGCCTACTTCGTAAT TTTTGATAGGGTATCCAGACTGAACAAACACCTCAACATACATAGTTCTA AAATAGGCCATTTCGCAGTCGAAATGGATCATCGGTGATCAGGACTGATT GAGCCTCCATAACGGCTTTCTGTTGGCTAGACGCAAAAATATTCAAAAAT TTTCAAAAAGTTGAACAAATAGTAAGTCATCATTCGTGCGCAGTTGTCCT GGTTAATCAATTTGCTTCACGACTATGAAATGGCCTATTTTAAAGTGGTG AAAAGTCTGATACAGTTTGTTTGATACTGTGTGCGAGTAAACCCTTGTTG ACAAAACCTTAAAACTTTGGAAATCCAGGTGGATGAGCAAAATATTTACA TAAAAAAATTGAAAAATTCTCATAGACTGTCAAACCTGCCTAAAACAACA ATACAAAACCAGCCACATGCAAACAACCNAGACATTTAATTTCGCATAAA AGGGTAAAATTCGCGAAAATCGGGAAAGTTTCTACTTGGGAAAGTTTGTA CGCCTAAAGATATCATCTTTAGTATGATCTTAGTATCAACGTCTGGTTTG CGGAATTACATCCGTCTCTTACATCCTTTGCCATGATTTCCAGGTCATGA TTTTTCATGTCATGTCAATGTCTAATTTCTTGCAATTTCGCAATGAAGAG TTATTCTTAAGTTGAACTTTACTTGAATTGATATTTTAGGTATGAGTGTC ATCCTACTGCAGACCCTACAAACGTTGCTGGACCCTGAAAACATGTGTCA AACGGCTAATGTAAGTTCACTGTGTTTATTTTCTGATCTGGCGAAGTCAA TATAATTATCTTGAAGTTAGCGGAATTTGAGGTTTCGAACCATTCTTTTT TCTCTTTTGAGAAGCTTGGAGGGGCTCATTAAACAGCAAGTTGATCTGAT GTAAATAGCCTTATCTGTTCAGCTTTTCTTTGCTTGGTACACCCGAAGGG ATTTCAAAAAGATTTCAAAAAAGGAAAGTTATTTTAGTCTTTTTAAATCT TGTTTTCATTTTCAGAGCACGATTGAACGTTCGGAATTCTTGAGTTTCTT TTATCGTCACAACATGCACGTTCTGACGTCTCCCGTACTTGCTGTTACTG CCACGGATGAACTGGTCGGAAAAGGTATCTTGTCTCTCACTGATTGAGGA GGAAATTTTGATGCCTACTTCGTAATTTTTGATAGGGTATCCAGACTGAA CAAACACCTCAACATACATAGTTCTAAAATAGGCCATTTCACAGTCGAAA TGGATCATCGGTGATCAGGACTGATTGAGCCTCCATAACGGCTTTCTGTT GGCTAGACGCAAAAATATTCAAAAAATTTCAAAACTTTGAACAAATAGTA AGTCATCATTCGCGCGCAGTTGTCCTGATTACTCATTTTGCTTCACGACT ATGAAATGGCCTATTTTAAAGTGGTGAAAAGTCTGATACAGTTTGTTTGA TACTGTGTGTGAGTAAACCCTTGTTGACAAAACCTTAAAACTTTGGAAAT CCAGGTGGATGAGCAAAATATTTACATAAAAAAATTGAAAAATTCTCACA GACTGTCAAACCTGCCTAAAACAACAATACAAAACCAGCCACATGCAAAC AACCTTTTCTTCATTCTTCACAAAAAGTTGTTTGGATGACTCGCCAATTT GCATAAATTATTTGGGCGCTATAAGGTGGCGGGTGGGCGTATGGAAAACC CTCGAAAAAGCTATTGAGCACTTGCATCAACCAATCGCCACATGCACCCT TAGATTCGAATGCAGACGATCTATGTAAATCGGACCGTATACGATAGACG AAAATTAAAAAAAACTAGGCTGTGAAAAAGTTTATGGTCTGGATACCCAG GCTAAATTCATGAGTAAATATTACAAACACCGCCAATTGTTCGCATGGGG ATATGCATTTAAGGTTATTTTTTTAGCCTCATTTGGTTCGTGTTTTGCTA ATTTGGCTGTTAACCTCAATTTCTGACACTTTTCCTCTTAGACGACTTCC AGCGTGCGACAGTGTTTGACAACATTGTGAACTTGTTGACTTTTTGCGTG GAACATCATCAATCTTCTATCAAGAATTACATCGTCAGTAAAGATATGTT ACGCCGTGTTCTCGTTCTTTTACANN
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00073463TCONS_00073463Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00073462TCONS_00073462Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00073461TCONS_00073461Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00073460TCONS_00073460Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00073462-proteinTCONS_00073462-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_92supercontigscaffold_92:136919..157194 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SMEK2serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
10.88 10.9 11.97 10.77 105.99 79.54 50.41 56.28 27.33 35.04 26.65 22.07 19.65 21.72 22.57 29.41 31.16 30.31 17.78 17.33 29.01 29.96 29.67 33.36 27.21 33.52 20.02 15.05 24.23 30.37