XLOC_044555 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044555
Unique NameXLOC_044555
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_63:725609..728153-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_044555 ID=XLOC_044555|Name=XLOC_044555|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=2545bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_63:725609..728153- (Clytia hemisphaerica)
AACAAGTTAAGCAAGAGGTTAAAAATTAAAGATCTAGCAACTTACGGCCA
TCACATTGTTGGGGTTGTACAGGTTGTTGTTGAGGTTGCTGTGGTTGTCC
ATTACAATCAACAGTTGTTTCAACACTGCAAGGTGGTGGTGGTGTAGTGG
TCGTGGTGATTGGTTCATCTGATTCCACCACAAAAGATAATGGTGTAGTC
GTGGTTGTTGTTGGTTGATTTATCAAACTGTCGTAACTTTGTTCAGGTTT
TCCATCAGCTCCTGGGGCAGGTTTTCCATCAGCATCTGGAGCAGGCTGTC
CGTCTGCTCCTGGGGCAGGTTGTCCATCAGCTCCTGGAGCAGGTTGTCCA
TCATCTCCTGGGGCAGGAGGTTTCCCATCAGCACCTGGGGGACCATTACC
ATCTGGGTTGTCTCCTGGAGGCTTTTGTCCATCAGCATCAGATGGTTTGT
CTCCATCACTGTCACCTGGTTTAGCGTTTTCAGGAGGAGCTTGTCCGGCT
TCAGGAGGTGGCTGACCATCTTCCCCTGGAGGTCCTCCCTCGGAAGGTTT
AGCATCCTGTTTATCTTCCTCTGTTGGTTTGTCTCCTAATGGTTTATCAT
CATTTCCGGGAACTTTCAAAACATCTCCTGGTGGTGGCTGATCTAAGTTC
TCAGGAAGTTTTTGATCTGGTTTTTTATCATCTTCGGGATTCTTTCCATC
CTCGGGTTTCTTTCCATCTTCTGGTTTCGGTTTTTCTGCCCCATCCTCAG
CAGGCTTCATTTCATCCCCCAGTGGATTGGTATCATCCCCTAGTGGATTG
GTATCATCTCCTGGCTGCTGCAAAACGTCTCCTGGTTTTTTATTTTCATC
TGGTTTATCTCCAGGTTTATCTCCAGGTTTATCTCCATCAGCTGGTTTAT
CTCCATCAGCAGGTTTATCTCCATCAGCAGGTTTATCTCCATCAGCTGGT
TTATCACCGTCAACCGGTTTATCTCCATCAGCTGGCTTATCTCCATCGGC
TGGTTTATCTCCATCAGCTGGTTTATCTCCATCAGCAGGTTTATCTCCAT
CAGCTGGTTTATCACCGTCAACCGGTTTATCTCCATCAGCTGGCTTATCT
CCATCGGCTGGTTTATCTCCATCACCTGGTTTATCTCCATCACCGGGTTT
ATCTCCATCACCTGGTTTATCTCCGTCACCTGGTTTATCTCCGTCACCTG
GTTTATCTCCATCACCTGGTTTATCTCCATCAGATGGTTTATCGCCATCA
GCTGGCTTATCGCCATCGGCTGGTTTATCACCATCAGCGGGTTTATCTCC
ATCAGCTGGCTTATCTCCATCAGCTGGTTTATCTCCATCAGATGGTTTAT
CTCCATCAGCTGGCTTATCTCCATCAGCTGGTTTATCTCCATCAGCGGGT
TTATCTCCATCAGCGGGTTTATCTCCATCGCCTGGTTTATCTCCATCACC
TGGTTTATCTCCGTCAGCTGGCTTATCTCCATCAGCTGGTTTATCACCAT
CAGCTGGCTTATCGCCATCAGCTGATTTATCTCCATCAGTTGGTTTATCA
CCATCATCTTTCGTTTTGTCACCTTCTCCCCCAGCTTTATCTCCATCATT
ATCAGGGTTTTCCTCTGGGGGTTTATCTCCTGCACCTTCAGGGTTATCTT
CAGGTGGTTTATTTTGATCCTCTTCTGGAGCATTTTCTTCTTCAGGAGCT
GGTGTTGTCGTGGTGGTAGTAGTTGATGTAGTAGTTGTAGTCGGTTCCTC
AGTTGTCGTTGTTGTTGTCGGCTCTTCTGTTGTCGTGGTTGTTGTCGGCT
CCTCGGTTGTCGTGGTTGTTGTTGTCGTCGTTGGCTCCTCAGTTGTTGTT
GTCGTAGTTGTCGTAGTCGGCTCTTCGGTTGTCGTGGTGGTAGTGGTTGT
TGTTGTACTTGTCGTCGTTGTTGGAGTTGTTGTTGTCGTCGTCGTTGTTG
GAGTTGTTGTCGTCGTCGTTGTTGTTGGCGTAGTGGTCGTAGTTGTTGTG
GTCGGTGCTTCCGTGGTTGTTGTGGTTGTCGAAGTAGTTGTTGTGGGAAC
GATGTCACCAGGNTTCTTCGGTTGTCGTGGTGGTAGTGGTTGTTGTTGTA
CTTGTCGTCGTTGTTGGAGTTGTTGTCGTCGTCGTCGTTGTTGGAGTTGT
TGTCGTCGTCGTCGTTGTTGGCGTAGTGGTCGTAGTTGTTGTGGTCGGTG
CTTCCGTGGTTGTTGTGGTTGTCGAAGTAGTTGTTGTGGGAACGATGTCA
CCAGGGTTCACTTCTTGGTCTTCTGCACTAACTGGTGGTGCTTCTTTAGG
TGGTGCCTCTGGTGCTTCGATTTCAGGGACNGGTTCACTTCTTGGTCTTC
GGCACTAACTGGTGGTGCTTCTTTAGGTGGTGCCTCTGGTGCTTCGATTT
CAGGGACGGGAGCTTCTGGAGGAGGTTCATCGGCTGGTGGTGGTGCTGGT
TTTTCTGGTTCTTTTGGTGGTTTAGCATCAGGAACATCGTCTGGTTTTGG
CTTCTCAGGCTCTGGTAGTTTATCTTCTGCTTTTTCTGGGATACC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071748TCONS_00071748Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071747TCONS_00071747Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071746TCONS_00071746Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071747-proteinTCONS_00071747-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_63supercontigscaffold_63:725609..728153 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.38	0.46	0.27	0.1	0.06	0.06	0.58	0.65	0	0.1	0.94	1.68	8.09	7.66	3.62	12.19	8.38	7.62	0.04	0	4.51	6.19	4.34	4.49	10.88	11.61	0.65	0.06	0.24	0.35