XLOC_044338 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_044338
Unique NameXLOC_044338
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_60:418778..431569-

Legend: gene
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>XLOC_044338 ID=XLOC_044338|Name=XLOC_044338|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12792bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_60:418778..431569- (Clytia hemisphaerica)
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ATTATATATTAAAGTCATTTCAAGCAGCATTATTCTCTCTCAAATTTATT CATTCTGAATCAAACCTTTATTCTTGATTGAGCTTGATTCTTTACCTATC ATCATCAGGACAAATAAACATTGAGAACAATGATAAAACAATGAAAATGC TTGATAACTTTTGATAATTCTAAAGTTTTGAGAAAAACTATTCTCCTACA AAAAACATAAGAAATTTTTCTTGTTACGTACTCTGCAGATTACCTGACCA CGTGTCATGTGAAGAAGGTGCATTGTTGGAACCTCTATNAATTTTTGTTT ACATTTTTTTGCTGATGAAGCATTTTTAAAAGCGCGGGATATTTCCGACC ATCAAATTTTCAAATTTTTAGAGCTTTGGATATTTCCGACCATCAAATGA TAATTCCGACCATCAAAAGATATTTCCGACCATCAAATTTTCAAATTTTC AGAGTTTTGGATATTTCCGACCATCAAATGATATTTCCGACCATTACGCT ATGATATTTCCGACCATTAAAGATATCTCCGCCCGTCTACGGAAAAAAAT TTGCCTCGTCAACATACGTACATAATGACATCAAAGTCAACAGTTGAGAG TTTAAAACCAAAGAACTGCGAATGAAGATTTTTAGTTTAAAATCTACTAA ATTTCTTGACTTAATTAATCTATCTGTTCGATTGTGATCATAATGTAGGA GATCGCGTAGCAATTGAACCTGGAGTACCATGCAGAATGTGTGATTGTTG TAAAACTGGTTCATACAATTTATGTCCAAAGATGGAATTTTGTGCAACGC CACCTATCGATGGGAGTCTTTGTCGTTATTATGTTCATGCTGCTGATTTC TGCTACAAGTACGTTGCTTATTTTCCTTATTATGTAAAATGAATAGGAAT TAAGGAAGGGAGATTTTTTTTTTGAAAACGCAAAGTAAAGATTCATATTG 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ACATGACATTCAAAATAACGTCACGTGATGGACGAGAAGTAGCTGAACAA GTGAAGAAAAAATTCGGTCGAATCGATAAAACAATCGAATGTAGTGGAGC TGAATCGAGTGTCCATACTGCTATCTATGTGAGTAAAAATCTTTTGTACA CTACTATCTAATATCAAAACGTCAAGATTTTTATCATTTTGAAATGTTTA TTGAAAAACTAAACGTGAAAAACTCTAAAAAGACGTAAAGAATATTTCTT TTTGGCGATTAACTTTTTTTGTGTTTGCGACAGAGACGGAAAGTTTCTGA TTTGTCTAGATCATGATTGACTGAGGACGACGGTAAATCAGCACTTTTAT CGTCCTTGATTTGCAGATTAAAACTGTGGGTTATTTTAAATCGCTTCACT CCGCCTAAAAAGTGAAAATACATAAGATTGCTATTGATTCCCCAATCGAA ACTACCAGCAGCCGAGAAGACCGTTCTTCACTATGCGAAGTTATGTTTTT CGTTAGTCCCTTCACTTCAATTCAAAAACTTTTTTCTTGAAATTTACAGG CTACAGCATCCGGAGGGATTGCAATGTTGGTTGGCATGGGCAAAGCAGAA ATTAATTTCCCAATTTTCGAAGCATTAGCGCGGGAAATTGACGTCAGAGG GAATTTCAGATACGTCAATTGGTAAGAAAAGATATTTATTTGACGGAAAA CTGTTACTACCAGGTTTTTTTCCAATTTAAATTGTCTTTTTGACGTGTTT TTTCGATGTATTTTATAACGTCAAAATTAGTTTTTGGCCGATATCTTGAG ATTGGCTTGATGTAAATTTTTGAGATNTTTTTCGATGTATTTTATAACGT CAAAATTAGTTTTTGGCCGATATCTTGAGATTGGCTTGATGTAAATTTTT GACCCAGCATTTTTCGAAATCCTCTCGTTGATACAATTCTTTTGAGCTAT ATATGAAAGTTAATGAATAATGGGAAGCGGTGTGCGTCAGGCAAAATATA TTTGGGACATGCCTTGTTTCACCCAAGCAAATGAGAGAAGTAATAATCAT GACGTTTGCACGACGAAGCGCTATTGAGAAATTAAATGTTGAGAAATCTT TGTTTGATTTAATTTGAGATGCTTAAAATTCCACACTAGAGGGTGTAAAA TTTTTAAAGAAACTATTTGTAAAGGGGGCGTCCGGGAGTCGCAGACACCG AAATGCCGACGTATTTTCCTTGGGTCACCGTCGACACCGACATCAAGAAC TGCTAAAGTCCTTATTTTGTTACCACGTGGTATCTTTGACACGAAAACAC CGTCACTTTTTTCTTCAAACACTAAAACACCGACGGAAAAGGACTAATAC CGTCACCCCGTCAAACCCGTGCGCTCCCTCCCATTTGTAAATTAATTGTA TTGGTTCTGGTTTCAATGATTTTTAGATATCGGAATTTGATTCGATGTTA TACAGTTGACGCTCTCTAATTCGATCTTCAAGGGGAATTGGATTTTCATC GAATAAGGGAGCTTATCAAATAAGGGAGCGTCGTTTATGAGAGTTTCTTG TTGACGGGGACTTTAAATTTCATCGGATAAGGGAGCCTATCGAATAGTAG AACGTCGAATTAAAGAGCGTCAACTGTATGTATTTATTTTTACAATCTCT AGCTATCCAACAGCTTTGGATCTTGTAGCTTCTGGTAAAGTCAACGTCAA ACCACTAATCACTCATCGTTTCAAACTTGAAGAATCTCATAAAGCATTCA CCACCAGTAGCTCTCCTGGATGTAATACAATCAAAGTCATGATTTCTTGT CATGAAGAGTAACTGGAGAAAGAGAGACTAGGAAACTAGCCTACCCCGTC TGGTATGTTCTGTTTTGTTTTTTATCCATCGACGAAAATCTACTATTGCC GTTTTTGTAGCACTTCTCTTTTTTATAAAATTTTGATTGATGTAAATCAT CTTTTCACCCCCTTCTCTTTTATAACTTTTTCGATAATCTTCAAATTAGG TGATTGTAAATTTTTTTGCATCTTTTTTTATTTAAAATTTGCTTTCGATA TTTATTATTTATTTTGTCATAATTATATTTTATTTCTGATGATGTCAAAT AATACTGTATTTTCTTTTTCTTCTAATAATCTTCAAGTAGAAAAGAGAAA ACTATTCTAACATACAACTTTCTTTACATCTACTGTAAATCGAATAGTGG TGAAGATTCCATTCGATGCCTGAAAAATGTGGTTTGATTTCATGTAAGGC AAAAATAAAAAATGTAGTGTTTCGGAATGCGGGTGAAGGAAAAAGCTCTC ATGCGGGCGGCCGGAAATTTTTTTTTACTACCTTAAGGGAAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071347TCONS_00071347Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071346TCONS_00071346Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00071345TCONS_00071345Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00071347-proteinTCONS_00071347-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_60supercontigscaffold_60:418778..431569 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SORDsorbitol dehydrogenase Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
147.61 157.5 108.65 106.8 4.29 3.24 6.42 6.64 17.47 14.91 26.56 40.03 50.06 60.85 44.15 34.66 45.1 43.27 49.3 44.59 32.72 34.51 56.51 58.95 53.62 55.56 63.07 73.06 22.56 25.2