XLOC_043912 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043912
Unique NameXLOC_043912
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_56:858684..863932-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_043912 ID=XLOC_043912|Name=XLOC_043912|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=5249bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_56:858684..863932- (Clytia hemisphaerica)
CTAAAGATCAGCCTTATGCTCAGTGAAGCATATCAAACAAAAAGTTTGCG TGCCGAATATTCGCCTCTTTCTACGACAAAAATTTGCGTCTTTTATTAAA TACTATGAACAAATGAAAACGTAAAAAAGTTGAAGAAATTTGAATCTCTG TGTCCTATTTTTATTGATTTCTTCAGTATCATCGACACTTATTTGTTTTT GTTATTTTGATTGACAAGTTGTTTGGTCACCCCTGGCAACCATGATGCGT TGTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTCAAAGGTAATTATTGATT TTTCATTATTTTAATCCAAAAAGTTGTCAAATGGGAGGATTATCATAATT TTGATTTATAACAAGACATACAGTCTCCATAAGGCAATATATTTTTACTT TACTACAATTTTCTGGTTTCCAGTCGGTCTACTTGGAAATCCGTCATCAT ATTTTCTCTCACTTGTTTTTTTCCTCCATCTTGAACAAATGAAAATGATA AAATATGATGTGTAATGTCTCGTCAAACTAACAACGTTCGTATTACGTTG GTATTAGCACCCCAGTTAGAAATGCATTTGTTGCTCATATCAAAGTCAAC CTGTCTATTGACTTTGCTTACATCTTGGCAACTTCAAAGGAAATTTTCCC CTCATGTAAAAGCACAGCTTTATGACTTATTTGATTTTTGTATCTATTTT TTACTTCCTAGGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCT TAGGCTCCATGTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAAC TCCTACCAACGTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCC AAAAGGTGTTGATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATC CAGTTATGGGTCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCA TATCCATGTCAACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCA ACCTCCTTTCTGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTT GCCCACAAACAACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCT AACCCATGTCTACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCG ACCACAACAAATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTG GTTGCCCCTTCACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGT CCATCCAGCAACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGT ATACGGACCATCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTC TTGGTGGCTGCCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATC GCCACACAACAGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCC AAGCTCATGCCCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGG GAGCCTCTTGCCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCA ATGTGCCCACAACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCA AACTCAAATGATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCAC CAGCTTGTCCAATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATG TGTCCACAACCCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAAC ACCAAGACTTTACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAAC CTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCC ATGCCTTCAATGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGG CTGTTTGCAAGCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAAC CTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCC GCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGG ATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTC CACAGATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGTTGC CCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCC ACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTATGATGATGCCAC CTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCA GGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTG TCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTG CCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGAACGNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCA AGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGC TATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAAC CTTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAAACCATGGCTTCA GCTCCAACAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCTTCTGG ATGTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGC AAATGTCACCACCTCAACCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCA GGTTGCCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTG TCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCG CTCCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCTCAACCTTGTCAGGCACCT TCTTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCGGCACCATCAATGTG TCCAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCCACGGGATGTGCACAGGGCG CGGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCCTGCACCTCAAATGTGCCCA CAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGC TTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCACGCCACCATCGTGCCCCT CAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGCT GCTCCACAGATGTGCCCGCAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGG TTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGTC AAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCA TCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGC ACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGA TGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAA ACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGTCAACCACCAGG CTGTCCATCTGGCTGTCAAGAATCTCCAAGGTTTTATTTTTCTCCAAGTA AACTTCAACAGCAGATGCCAGCACCTCAAGCACCGGCCTGTCCGTCTCCT TGTATCCCGCCATTTTGCCCTGCAAACTGTCTTATCCCATCATGTCCACA GCCATGTCAACCACCAAGTTGTCCAGCATACTGTCCTACCACAACTGCAA TGACGCCATCCAGCTGTCCAACGCCTTGCCCGCCTCACATCTGTCCACAG GGGTGCACCGTAGTACAATCGACCGTTAACATGTGTCCACAGCCTTGCAT GCCGCCATCTTGTCCAGGTGGCTGCCCTCAAACAACGAACATTTATCCTC CAATGTGTCCACAGCCTTGCCAGGGTAATATTTGCCCAAGTGGATGTGCT GCACGTCAGAAGAAAGATATAATTGAACGACAGAGAGGTTAAATTCGAAA TTCGATGGAAAATGAGAAATAAAAACTTTACAGACAATCATTCGATTATG TTTTTGGTAACACAAAAGTGCTTTGTGAGTGGGATTTTTAGAGAGAACGA ATTTTATTTTGTAATATAGGGAAATTTACCAGCCTGGTCATTTGCTGATT TTTGAACACCTTTGATGATCTTTTCATAAGATGTTTGACCCCCTACTAAA GTGTTTTTGTATCTCGTAATGAATTGAAGAATGTGGCCTACCTTATTCCT TGCAACCACTCTGTTTTATACCTCTACTACCAATAAAGTAAAAACTCAAG TTGCTAGTGACCTTTTCTCAAGTAAGAAAAAGCGAGATTCTAATGCCACA CCGTGTAACTTATAACGGAAATAATTTTTAAGCCATTTTCTACATATTTA CCTCATGCACTTTTGCTATTTGTGAGGGTTTTTTTTACAGCCATCTCGCT TTCTCGATTCACAAACTTGAAAGTTTTTGACGACTACCCTTTAGTAAGTT TAAGTGCGTAGATTAAGAATTTTACATAAATGGTTTGGTTGTTTAGCATG TATTAGGGATCGATTAGTTTACGATCTATTATATTTTAGGCTCAATTTTA AATTAATGTTTAGATAACTATTTATTTTTAGATGTCTCTAAATGTTTTTT GAATATGTTATAGTATTATTTTATTCGTGGAATTTTTTATAAAAAGTATT ACAGTTGAATTTTTGATAAAAGAAATTCTTTATAAAAGTTGAAATTTTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070564TCONS_00070564Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070563TCONS_00070563Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00070562TCONS_00070562Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070562-proteinTCONS_00070562-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_56supercontigscaffold_56:858684..863932 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.06 0.04 0 0 5.93 5.04 35.52 40.19 3.39 4.97 37.22 16.19 24.71 26.02 14.67 60.34 39.26 32.22 0.01 0 27.05 26.07 12.65 15.65 21.45 23.04 3.5 0.85 0.05 0.22