|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00070564 ID=TCONS_00070564|Name=TCONS_00070564|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2018bp
CTAAAGATCAGCCTTATGCTCAGTGAAGCATATCAAACAAAAAGTTTGCG
TGCCGAATATTCGCCTCTTTCTACGACAAAAATTTGCGTCTTTTATTAAA
TACTATGAACAAATGAAAACgtaaaaaagttgaagaaatttgAATCTCTG
TGTCctatttttattgatttcttcAGTATCATCGACACttatttgttttt
gttattttgattgaCAAGTTGTTTGGTCACCCCTGGCAACCATGATGCGT
TGTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTCAAAGGTGACAATGCCAA
CACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCATGTCCAGAAGCTCCC
CACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAACGTCCTGCTTCACAA
CAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTTGATCCTTTCATTTA
CAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGGTCAACCACCATGTC
CCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTCAACAAAGTCAGATG
ATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTCTGTCCATCAATGTG
TCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAACAACTGGTATCACTG
TGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTCTACCACCATCATGC
CCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAAATGTGCCCACAGCC
CTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTTCACCATGTCTGCTT
TACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCAACTGTCCAACCGGA
TGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCATCAGCTAATCCTCC
ACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTGCCCCAACCCTTGCC
CTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAACAGACAGTGAACATT
ATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGCCCAGCTCAATGTCA
AAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTGCCCTATGGGATGTC
CACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCACAACCATGTCAACCA
CCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATGATGGCTCCACCACC
AATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCCAATGGGATGTCCAG
CAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAACCCTGCCAACCACCT
TCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTTTACTTTTCACCTCA
AAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCGA
TGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAATGTGCCCACAGCCC
TGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAAGCTGCACCGATGAT
GGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAA
TGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCA
TGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGAT
GATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGTC
AAGCACCCTCCTGTCCAATGGGTTGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCA
TCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGC
CCAGGGTGCCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGA
TGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAG
ACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATC
GTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTATGATGATGCCACCTCCCA
TGATGGCTGCTCCACAGA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_56:861491..863932- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00070564 ID=TCONS_00070564|Name=TCONS_00070564|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2442bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_56:861491..863932- (Clytia hemisphaerica)
CTAAAGATCAGCCTTATGCTCAGTGAAGCATATCAAACAAAAAGTTTGCG
TGCCGAATATTCGCCTCTTTCTACGACAAAAATTTGCGTCTTTTATTAAA
TACTATGAACAAATGAAAACGTAAAAAAGTTGAAGAAATTTGAATCTCTG
TGTCCTATTTTTATTGATTTCTTCAGTATCATCGACACTTATTTGTTTTT
GTTATTTTGATTGACAAGTTGTTTGGTCACCCCTGGCAACCATGATGCGT
TGTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTCAAAGGTAATTATTGATT
TTTCATTATTTTAATCCAAAAAGTTGTCAAATGGGAGGATTATCATAATT
TTGATTTATAACAAGACATACAGTCTCCATAAGGCAATATATTTTTACTT
TACTACAATTTTCTGGTTTCCAGTCGGTCTACTTGGAAATCCGTCATCAT
ATTTTCTCTCACTTGTTTTTTTCCTCCATCTTGAACAAATGAAAATGATA
AAATATGATGTGTAATGTCTCGTCAAACTAACAACGTTCGTATTACGTTG
GTATTAGCACCCCAGTTAGAAATGCATTTGTTGCTCATATCAAAGTCAAC
CTGTCTATTGACTTTGCTTACATCTTGGCAACTTCAAAGGAAATTTTCCC
CTCATGTAAAAGCACAGCTTTATGACTTATTTGATTTTTGTATCTATTTT
TTACTTCCTAGGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCT
TAGGCTCCATGTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAAC
TCCTACCAACGTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCC
AAAAGGTGTTGATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATC
CAGTTATGGGTCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCA
TATCCATGTCAACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCA
ACCTCCTTTCTGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTT
GCCCACAAACAACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCT
AACCCATGTCTACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCG
ACCACAACAAATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTG
GTTGCCCCTTCACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGT
CCATCCAGCAACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGT
ATACGGACCATCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTC
TTGGTGGCTGCCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATC
GCCACACAACAGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCC
AAGCTCATGCCCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGG
GAGCCTCTTGCCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCA
ATGTGCCCACAACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCA
AACTCAAATGATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCAC
CAGCTTGTCCAATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATG
TGTCCACAACCCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAAC
ACCAAGACTTTACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAAC
CTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCC
ATGCCTTCAATGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGG
CTGTTTGCAAGCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAAC
CTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCC
GCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGG
ATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTC
CACAGATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGTTGC
CCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCC
ACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTATGATGATGCCAC
CTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCA
GGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTG
TCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTG
CCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1575043694:863646..863932 | TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1575043694:863646..863932 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1575043694:861491..863221 | TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1575043694:861491..863221 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1510915933:863646..863932 | TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1510915933:863646..863932 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1510915933:861491..863221 | TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1510915933:861491..863221 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1491911889:863646..863932 | TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1491911889:863646..863932 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1491911889:861491..863221 | TCONS_00070564-exon-scaffold_56-1491911889:861491..863221 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_56 | supercontig | scaffold_56:861491..863932 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
