TCONS_00070562 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00070562
Unique NameTCONS_00070562
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4010

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00070562 ID=TCONS_00070562|Name=TCONS_00070562|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4010bp
AAATACTATGAACAAATGAAAACgtaaaaaagttgaagaaatttgAATCT
CTGTGTCctatttttattgatttcttcAGTATCATCGACACttatttgtt
tttgttattttgattgaCAAGTTGTTTGGTCACCCCTGGCAACCATGATG
CGTTGTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTCAAAGGTGACAATGC
CAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCATGTCCAGAAGCT
CCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAACGTCCTGCTTCA
CAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTTGATCCTTTCAT
TTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGGTCAACCACCAT
GTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTCAACAAAGTCAG
ATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTCTGTCCATCAAT
GTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAACAACTGGTATCA
CTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTCTACCACCATCA
TGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAAATGTGCCCACA
GCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTTCACCATGTCTG
CTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCAACTGTCCAACC
GGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCATCAGCTAATCC
TCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTGCCCCAACCCTT
GCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAACAGACAGTGAAC
ATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGCCCAGCTCAATG
TCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTGCCCTATGGGAT
GTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCACAACCATGTCAA
CCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATGATGGCTCCACC
ACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCCAATGGGATGTC
CAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAACCCTGCCAACCA
CCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTTTACTTTTCACC
TCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCC
CGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAATGTGCCCACAG
CCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAAGCTGCACCGAT
GATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTC
CAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGA
CCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTAT
GATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCTT
GTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGTTGCCCACAAACCATGGCTTCCGCA
CCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATG
TGCCCAGGGTGCCACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCC
CAGGGTGCCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGAT
GTGCCCACAACCTTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAAA
CCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAACCAGGC
TGTCCTTCTGGATGTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAA
GCTCCTTCAGCAAATGTCACCACCTCAACCGATGATGTGTCCACAACCTT
GTCAAGCTCCAGGTTGCCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCTATG
CCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTG
TATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCTCAACCTT
GTCAGGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCGGCA
CCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCCACGGGATG
TGCACAGGGCGCGGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCCTGCACCTC
AAATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCA
CAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCACGCCACC
ATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTC
CCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCGCAACCCTGCCAAGCTCCAGGG
TGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCC
ACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGG
CTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCC
TCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGC
TGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGG
GTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGT
CAACCACCAGGCTGTCCATCTGGCTGTCAAGAATCTCCAAGGTTTTATTT
TTCTCCAAGTAAACTTCAACAGCAGATGCCAGCACCTCAAGCACCGGCCT
GTCCGTCTCCTTGTATCCCGCCATTTTGCCCTGCAAACTGTCTTATCCCA
TCATGTCCACAGCCATGTCAACCACCAAGTTGTCCAGCATACTGTCCTAC
CACAACTGCAATGACGCCATCCAGCTGTCCAACGCCTTGCCCGCCTCACA
TCTGTCCACAGGGGTGCACCGTAGTACAATCGACCGTTAACATGTGTCCA
CAGCCTTGCATGCCGCCATCTTGTCCAGGTGGCTGCCCTCAAACAACGAA
CATTTATCCTCCAATGTGTCCACAGCCTTGCCAGGGTAATATTTGCCCAA
GTGGATGTGCTGCACGTCAGAAGAAAGATATAATTGAACGACAGAGAGGT
TAAATTCGAAATTCGAtggaaaatgagaaataaaaactttacagaCAATC
ATTCGATTATGTTTTTGGTAACACAAAAGTGCTTTGTGAGTGGGATTTTT
AGAGAGAACgaattttattttgtaataTAGGGAAATTTACCAGCCTGGTC
ATTTGCTGATTTTTGAACACCTTTGATGATCTTTTCATAAGATGTTTGAC
CCCCTACTAAAGTGTTTTTGTATCTCGTAATGAATTGAAGAATGTGGCCT
ACCTTATTCCTTGCAACCACTCTGTTTTATACCTCTACTACCAATAAAGT
AAAAACTCAAGTTGCTAGTGACCTTTTCTCAAGTAAGAAAAAGCGAGATT
CTAATGCCACACCGTGTAACTTATAacggaaataatttttaagccatttt
cTACATATTTACCTCATGCACTTTTGCTATTTGTGAGGGTTTTTTTTACA
GCCATCTCGCTTTCTCGATTCACaaacttgaaagtttttgacgaCTACCC
TTTAGTAAGTTTAAGTGCGTAGATTAAGAATTTTACATAAATGGTTTGGT
TGTTTAGCATGTATTAGGGATCGATTAGTTTACGATCTATTATATTTTAG
GCTCAATTTTAAATTAATGTTTAGATAACTATTTATTTTTAGATGTCtct
aaatgttttttgaatatgTTATAGTATTATTTtattcgtggaatttttta
taaaaagtattacagttgaatttttgataaaagaaattctttataaaagt
tgaaattttc
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00070562-protein

>TCONS_00070562-protein ID=TCONS_00070562-protein|Name=TCONS_00070562-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=905bp
MMRCLVLVLVISLVKGDNANTTAEKRNRLGSMSRSSPLTSASSSNSYQRP
ASQQSGQQQQPPKGVDPFIYNMLAQSWDPVMGQPPCPFQCPSPCPYPCQQ
SQMMAPMPMPMQPPFCPSMCPPSGCPMGCPQTTGITVIPPTPICSNPCLP
PSCPSSCLGAARPQQMCPQPCQPPACPSGCPFTMSALPAMCPRPCPSSNC
PTGCPITLDIPVYGPSANPPPSAASAPPLGGCPNPCPHPCPPGCIATQQT
VNIMACPTPCPPSSCPAQCQKQCPQPCQGASCPMGCPQTMASAPSMCPQP
CQPPACPSGCMQTQMMAPPPMCPQPCQPPACPMGCPATSMAAPSMCPQPC
QPPSCPIGCQQTPRLYFSPQKMMQTCPQPCQAPGCPMGCPMTMASMPSMC
PQPCMPPSCPNGCLQAAPMMGAPQMCPQPCQAPSCPMGCPQTMASAPSMC
PRPCMPPSCPSGCAQGAAMMMPPPMMAAPQMCPQPCQAPSCPMGCPQTMA
SAPSMCPRPCMPPSCPSGCAQGATMHATIVPLRMCPGCRYDDATSHDGCS
TDVPTTLPSSRVPYGMPANHGFSSNNVSTALSTTRLSFWMSRVATILFLA
REAPSANVTTSTDDVSTTLSSSRLPNGLPHDHGFYAFDVSTALYASILSN
WLYASRSNDGCSTDVPSTLSGTFLSNGMPTNHGFGTINVSKTMHASLMPH
GMCTGRGYDDASSHDACTSNVPTTLSSTLLSNGMPTDHGFSSIDVSKTMH
ATIVPLRMCTRCRYDDATSHDGCSTDVPATLPSSRVPYGLPANHGFRSNN
VSTTLSSTLLSNGMPTDHGFSSIDVSKTMHATIVPLRMCTRCRYDDATSH
DGCSTDVPTTLPSSRVPYGLPANHGFRSNNVSTTLSTTRLSIWLSRISKV
LFFSK
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_56:858684..863835-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00070562 ID=TCONS_00070562|Name=TCONS_00070562|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5152bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_56:858684..863835- (Clytia hemisphaerica)
AAATACTATGAACAAATGAAAACGTAAAAAAGTTGAAGAAATTTGAATCT CTGTGTCCTATTTTTATTGATTTCTTCAGTATCATCGACACTTATTTGTT TTTGTTATTTTGATTGACAAGTTGTTTGGTCACCCCTGGCAACCATGATG CGTTGTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTCAAAGGTAATTATTG ATTTTTCATTATTTTAATCCAAAAAGTTGTCAAATGGGAGGATTATCATA ATTTTGATTTATAACAAGACATACAGTCTCCATAAGGCAATATATTTTTA CTTTACTACAATTTTCTGGTTTCCAGTCGGTCTACTTGGAAATCCGTCAT CATATTTTCTCTCACTTGTTTTTTTCCTCCATCTTGAACAAATGAAAATG ATAAAATATGATGTGTAATGTCTCGTCAAACTAACAACGTTCGTATTACG TTGGTATTAGCACCCCAGTTAGAAATGCATTTGTTGCTCATATCAAAGTC AACCTGTCTATTGACTTTGCTTACATCTTGGCAACTTCAAAGGAAATTTT CCCCTCATGTAAAAGCACAGCTTTATGACTTATTTGATTTTTGTATCTAT TTTTTACTTCCTAGGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATC GCTTAGGCTCCATGTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCG AACTCCTACCAACGTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACC TCCAAAAGGTGTTGATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGG ATCCAGTTATGGGTCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGT CCATATCCATGTCAACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTAT GCAACCTCCTTTCTGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGG GTTGCCCACAAACAACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGC TCTAACCCATGTCTACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGC CCGACCACAACAAATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAA GTGGTTGCCCCTTCACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCC TGTCCATCCAGCAACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCC AGTATACGGACCATCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTC CTCTTGGTGGCTGCCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGC ATCGCCACACAACAGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCC TCCAAGCTCATGCCCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCC AGGGAGCCTCTTGCCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCT TCAATGTGCCCACAACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCAT GCAAACTCAAATGATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAAC CACCAGCTTGTCCAATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCT ATGTGTCCACAACCCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACA AACACCAAGACTTTACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCAC AACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCT TCCATGCCTTCAATGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAA TGGCTGTTTGCAAGCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTC AACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCT TCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTC AGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTG CTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGT TGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCAT GCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTATGATGATGC CACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCT CCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAGACCATGGCTTCAGCTCCAACAAT GTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGG GTGCCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGAACGNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGC CGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCAC AACCTTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAAACCATGGCT TCAGCTCCAACAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCTTC TGGATGTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTC AGCAAATGTCACCACCTCAACCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCT CCAGGTTGCCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGAT GTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAG CCGCTCCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCTCAACCTTGTCAGGCA CCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCGGCACCATCAAT GTGTCCAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCCACGGGATGTGCACAGG GCGCGGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCCTGCACCTCAAATGTGC CCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCAT GGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCACGCCACCATCGTGCC CCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATG GCTGCTCCACAGATGTGCCCGCAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTAT GGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTT GTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAGCT CCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATG TGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGCTGCTCCAC AGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCG CAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGTCAACCACC AGGCTGTCCATCTGGCTGTCAAGAATCTCCAAGGTTTTATTTTTCTCCAA GTAAACTTCAACAGCAGATGCCAGCACCTCAAGCACCGGCCTGTCCGTCT CCTTGTATCCCGCCATTTTGCCCTGCAAACTGTCTTATCCCATCATGTCC ACAGCCATGTCAACCACCAAGTTGTCCAGCATACTGTCCTACCACAACTG CAATGACGCCATCCAGCTGTCCAACGCCTTGCCCGCCTCACATCTGTCCA CAGGGGTGCACCGTAGTACAATCGACCGTTAACATGTGTCCACAGCCTTG CATGCCGCCATCTTGTCCAGGTGGCTGCCCTCAAACAACGAACATTTATC CTCCAATGTGTCCACAGCCTTGCCAGGGTAATATTTGCCCAAGTGGATGT GCTGCACGTCAGAAGAAAGATATAATTGAACGACAGAGAGGTTAAATTCG AAATTCGATGGAAAATGAGAAATAAAAACTTTACAGACAATCATTCGATT ATGTTTTTGGTAACACAAAAGTGCTTTGTGAGTGGGATTTTTAGAGAGAA CGAATTTTATTTTGTAATATAGGGAAATTTACCAGCCTGGTCATTTGCTG ATTTTTGAACACCTTTGATGATCTTTTCATAAGATGTTTGACCCCCTACT AAAGTGTTTTTGTATCTCGTAATGAATTGAAGAATGTGGCCTACCTTATT CCTTGCAACCACTCTGTTTTATACCTCTACTACCAATAAAGTAAAAACTC AAGTTGCTAGTGACCTTTTCTCAAGTAAGAAAAAGCGAGATTCTAATGCC ACACCGTGTAACTTATAACGGAAATAATTTTTAAGCCATTTTCTACATAT TTACCTCATGCACTTTTGCTATTTGTGAGGGTTTTTTTTACAGCCATCTC GCTTTCTCGATTCACAAACTTGAAAGTTTTTGACGACTACCCTTTAGTAA GTTTAAGTGCGTAGATTAAGAATTTTACATAAATGGTTTGGTTGTTTAGC ATGTATTAGGGATCGATTAGTTTACGATCTATTATATTTTAGGCTCAATT TTAAATTAATGTTTAGATAACTATTTATTTTTAGATGTCTCTAAATGTTT TTTGAATATGTTATAGTATTATTTTATTCGTGGAATTTTTTATAAAAAGT ATTACAGTTGAATTTTTGATAAAAGAAATTCTTTATAAAAGTTGAAATTT TC

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_56:858684..863835-

>TCONS_00070562 ID=TCONS_00070562|Name=TCONS_00070562|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=8154bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_56:858684..863835- (Clytia hemisphaerica)
ACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTA
TGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCT
TGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCCGCAAACCATGGCTTCAGC
TCCAACAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCTTCTGGAT
GTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAA
ATGTCACCACCTCAACCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGG
TTGCCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTC
CACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCT
CCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCTCAACCTTGTCAGGCACCTTC
TTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCGGCACCATCAATGTGTC
CAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCCACGGGATGTGCACAGGGCGCG
GCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCCTGCACCTCAAATGTGCCCACA
ACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTT
CAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCACGCCACCATCGTGCCCCTCA
GGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGCTGC
TCCACAGATGTGCCCGCAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTT
GCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGTCAA
GCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATC
GATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCAC
AAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATG
TGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAAC
CATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGTCAACCACCAGGCT
GTCCATCTGGCTGTCAAGAATCTCCAAGGTTTTATTTTTCTCCAAGTAAG
TGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCATGT
CCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAACGT
CCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTTGA
TCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGGTC
AACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTCAA
CAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTCTG
TCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAACAA
CTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTCTA
CCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAAAT
GTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTTCA
CCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCAAC
TGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCATC
AGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTGCC
CCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAACAG
ACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGCCC
AGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTGCC
CTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCACAA
CCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATGAT
GGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCCAA
TGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAACCC
TGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTTTA
CTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTC
CAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAATG
TGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAAGC
TGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCAC
CCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATG
TGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGG
TGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCC
CACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGTTGCCCACAAACCATG
GCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCC
CTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCATGATGCGTTGTCTAGTGCTGGTTTTGG
TAATCAGCCTCGTCAAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGAT
GTGCCCAGGGTGCCGCTATGATGATGCCACCTCCCATGATGGCTGCTCCA
CAGATGTGCCCACAACCTTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGATGCCC
GCAAACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTCCACAGCCCTGTCAACAAC
CAGGCTGTCCTTCTGGATGTCAAGAGTCGCCACGATTTTATTTCTCGCCA
GAGAAGCTCCTTCAGCAAATGTCACCACCTCAACCGATGATGTGTCCACA
ACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCAATGGGTTGCCCCATGACCATGGCTT
CTATGCCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCCAACT
GGCTGTATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCTCA
ACCTTGTCAGGCACCTTCTTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATGGCTT
CGGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCTCCCTCATGCCCCACG
GGATGTGCACAGGGCGCGGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGCCTGC
ACCTCAAATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGAT
GCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCACG
CCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCA
ACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCGCAACCCTGCCAAGCTC
CAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATG
TGTCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGAC
CATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGT
GCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATG
ATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCC
TATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAAC
CTTGTCAACCACCAGGCTGTCCATCTGGCTGTCAAGAATCTCCAAGGTTT
TATTTTTCTCCAAGTAAGTGACAATGCCAACACTACCGCTGAAAAACGGA
ATCGCTTAGGCTCCATGTCCAGAAGCTCCCCACTTACCTCAGCCTCATCA
TCGAACTCCTACCAACGTCCTGCTTCACAACAATCAGGACAACAGCAGCA
ACCTCCAAAAGGTGTTGATCCTTTCATTTACAACATGTTGGCACAAAGCT
GGGATCCAGTTATGGGTCAACCACCATGTCCCTTCCAATGCCCCTCTCCA
TGTCCATATCCATGTCAACAAAGTCAGATGATGGCTCCCATGCCAATGCC
TATGCAACCTCCTTTCTGTCCATCAATGTGTCCACCTTCTGGTTGTCCCA
TGGGTTGCCCACAAACAACTGGTATCACTGTGATCCCACCAACACCAATC
TGCTCTAACCCATGTCTACCACCATCATGCCCATCCTCTTGCTTGGGAGC
TGCCCGACCACAACAAATGTGCCCACAGCCCTGCCAACCTCCAGCCTGCC
CAAGTGGTTGCCCCTTCACCATGTCTGCTTTACCAGCCATGTGTCCAAGA
CCCTGTCCATCCAGCAACTGTCCAACCGGATGCCCCATCACTTTAGACAT
TCCAGTATACGGACCATCAGCTAATCCTCCACCCTCAGCTGCATCTGCCC
CTCCTCTTGGTGGCTGCCCCAACCCTTGCCCTCACCCATGTCCACCAGGA
TGCATCGCCACACAACAGACAGTGAACATTATGGCTTGCCCAACACCATG
TCCTCCAAGCTCATGCCCAGCTCAATGTCAAAAACAATGTCCTCAACCAT
GCCAGGGAGCCTCTTGCCCTATGGGATGTCCACAGACAATGGCTTCAGCT
CCTTCAATGTGCCCACAACCATGTCAACCACCTGCTTGTCCTTCTGGGTG
CATGCAAACTCAAATGATGGCTCCACCACCAATGTGTCCACAACCCTGTC
AACCACCAGCTTGTCCAATGGGATGTCCAGCAACTTCAATGGCTGCTCCA
TCTATGTGTCCACAACCCTGCCAACCACCTTCTTGTCCTATCGGGTGTCA
ACAAACACCAAGACTTTACTTTTCACCTCAAAAAATGATGCAGACGTGTC
CACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCGATGGGTTGCCCCATGACCATG
GCTTCCATGCCTTCAATGTGCCCACAGCCCTGTATGCCTCCATCTTGTCC
AAATGGCTGTTTGCAAGCTGCACCGATGATGGGTGCTCCTCAAATGTGTC
CTCAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAAACCATG
GCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCC
CTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGATGCCTCCTCCCATGATGG
CTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATG
GGTTGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATG
CATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCATGATGCGTT
GTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTCAAAGACCATGCATGCCAC
CATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCCAGGGTGCCGCTATGATGATGCCACCT
CCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGCCAAGCTCCAGG
GTGCCCTATGGGATGCCCGCAAACCATGGCTTCAGCTCCAACAATGTGTC
CACAGCCCTGTCAACAACCAGGCTGTCCTTCTGGATGTCAAGAGTCGCCA
CGATTTTATTTCTCGCCAGAGAAGCTCCTTCAGCAAATGTCACCACCTCA
ACCGATGATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCAATGGGTT
GCCCCATGACCATGGCTTCTATGCCTTCGATGTGTCCACAGCCCTGTATG
CCTCCATCTTGTCCAACTGGCTGTATGCAAGCCGCTCCAATGATGGCTGC
TCCACAGATGTGCCCTCAACCTTGTCAGGCACCTTCTTGTCCAATGGGAT
GCCCACAAACCATGGCTTCGGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATGCATG
CCTCCCTCATGCCCCACGGGATGTGCACAGGGCGCGGCTATGATGATGCC
TCCTCCCATGATGCCTGCACCTCAAATGTGCCCACAACCTTGTCAAGCAC
CCTCCTGTCCAATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATG
TGTCCAAGACCATGCACGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGG
TGCCGCTATGATGATGCAACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCC
CGCAACCCTGCCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATG
GCTTCCGCTCCAACAATGTGTCCACAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCC
AATGGGATGCCCACAGACCATGGCTTCAGCTCCATCGATGTGTCCAAGAC
CATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATG
ATGATGCAACCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCCTG
CCAAGCTCCAGGGTGCCCTATGGGTTGCCCGCAAACCATGGCTTCCGCTC
CAACAATGTGTCCACAACCTTGTCAACCACCAGGCTGTCCATCTGGCTGT
CAAGAATCTCCAAGGTTTTATTTTTCTCCAAGTAAGTGACAATGCCAACA
CTACCGCTGAAAAACGGAATCGCTTAGGCTCCATGTCCAGAAGCTCCCCA
CTTACCTCAGCCTCATCATCGAACTCCTACCAACGTCCTGCTTCACAACA
ATCAGGACAACAGCAGCAACCTCCAAAAGGTGTTGATCCTTTCATTTACA
ACATGTTGGCACAAAGCTGGGATCCAGTTATGGGTCAACCACCATGTCCC
TTCCAATGCCCCTCTCCATGTCCATATCCATGTCAACAAAGTCAGATGAT
GGCTCCCATGCCAATGCCTATGCAACCTCCTTTCTGTCCATCAATGTGTC
CACCTTCTGGTTGTCCCATGGGTTGCCCACAAACAACTGGTATCACTGTG
ATCCCACCAACACCAATCTGCTCTAACCCATGTCTACCACCATCATGCCC
ATCCTCTTGCTTGGGAGCTGCCCGACCACAACAAATGTGCCCACAGCCCT
GCCAACCTCCAGCCTGCCCAAGTGGTTGCCCCTTCACCATGTCTGCTTTA
CCAGCCATGTGTCCAAGACCCTGTCCATCCAGCAACTGTCCAACCGGATG
CCCCATCACTTTAGACATTCCAGTATACGGACCATCAGCTAATCCTCCAC
CCTCAGCTGCATCTGCCCCTCCTCTTGGTGGCTGCCCCAACCCTTGCCCT
CACCCATGTCCACCAGGATGCATCGCCACACAACAGACAGTGAACATTAT
GGCTTGCCCAACACCATGTCCTCCAAGCTCATGCCCAGCTCAATGTCAAA
AACAATGTCCTCAACCATGCCAGGGAGCCTCTTGCCCTATGGGATGTCCA
CAGACAATGGCTTCAGCTCCTTCAATGTGCCCACAACCATGTCAACCACC
TGCTTGTCCTTCTGGGTGCATGCAAACTCAAATGATGGCTCCACCACCAA
TGTGTCCACAACCCTGTCAACCACCAGCTTGTCCAATGGGATGTCCAGCA
ACTTCAATGGCTGCTCCATCTATGTGTCCACAACCCTGCCAACCACCTTC
TTGTCCTATCGGGTGTCAACAAACACCAAGACTTTACTTTTCACCTCAAA
AAATGATGCAGACGTGTCCACAACCTTGTCAAGCTCCAGGTTGCCCGATG
GGTTGCCCCATGACCATGGCTTCCATGCCTTCAATGTGCCCACAGCCCTG
TATGCCTCCATCTTGTCCAAATGGCTGTTTGCAAGCTGCACCGATGATGG
GTGCTCCTCAAATGTGTCCTCAACCTTGTCAAGCACCCTCCTGTCCAATG
GGATGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATCAATGTGTCCAAGACCATG
CATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCACAAGGTGCCGCTATGATGA
TGCCTCCTCCCATGATGGCTGCTCCACAGATGTGCCCACAACCTTGTCAA
GCACCCTCCTGTCCAATGGGTTGCCCACAAACCATGGCTTCCGCACCATC
AATGTGTCCAAGACCATGCATGCCACCATCGTGCCCCTCAGGATGTGCCC
AGGGTGCCATGATGCGTTGTCTAGTGCTGGTTTTGGTAATCAGCCTCGTC
AAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_043912XLOC_043912Clytia hemisphaericagene
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070562-proteinTCONS_00070562-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1575043694:863646..863835TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1575043694:863646..863835Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1575043694:861699..863221TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1575043694:861699..863221Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1575043694:858684..860980TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1575043694:858684..860980Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1510915933:863646..863835TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1510915933:863646..863835Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1510915933:861699..863221TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1510915933:861699..863221Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1510915933:858684..860980TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1510915933:858684..860980Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1491911889:863646..863835TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1491911889:863646..863835Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1491911889:861699..863221TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1491911889:861699..863221Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1491911889:858684..860980TCONS_00070562-exon-scaffold_56-1491911889:858684..860980Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_56supercontigscaffold_56:858684..863835 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0621326 0 0 0 1.80384 1.98754 14.4109 15.7248 0.743963 1.92585 12.9128 4.99332 10.0823 7.74218 6.70842 26.0434 16.1631 13.4356 0 0 8.5991 9.26268 3.43069 5.00278 7.68358 7.60589 1.44688 0.384216 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00070562 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top