XLOC_042295 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_042295
Unique NameXLOC_042295
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_473:135588..146475-

Legend: gene
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>XLOC_042295 ID=XLOC_042295|Name=XLOC_042295|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10888bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_473:135588..146475- (Clytia hemisphaerica)
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TTCGTCATTTTTTAAAAGAGTTCATGAAAAGTGCAAAAATTAATTTTGGA TTTCTTGTACGTTTTATTTTTGTTGAGTAAGATTAGAGATTGCTGTCAAA TCAGTGGGGCTCTGAGAAAGGAATCCTAAAATCCTCAAAAGCTCTAACAT TGAAAGTTTCGTATTTGCTTGCCTTTATTAAAGCAATCATTCTGATGTAT TGGGTTTATTGTTCTTTTATATTTTTGGCTTTAAACTTTCTCCTCAAGAT TCTAATTGTATAGCCTTCCCTCCTTATTTCTTATGTTAACATCTTAATAT TAATTTCATCTTCTTCAGATAAAATTTTGTATTGCACCTATCGATCGCTC AAAGATGGACATTGAGGTTGAGCAAAACGAAAAAGAAAATGATGAAGAAC AAACAATAAACAGTAGTAGTGAATCCAGCGATTCCGAATCGGATTCTACC TTACCAAGAACACTGACAGCTCCAACGAAGCTTGATCGCCATGGATTCAT TGTCGGGCACCGTTTACATGATAAAGTATCTTCATTGCCTAACCCAGGGT ACACAACAACCATCGGCAAACGTCGGGAACGAAAATGGCTTTCTATGTTC GTAAACTGGGACTCGTATATACGTCGGAATCCTAAACAGTTACGACGCCG ATGTCGCAAAGGGATTCCACAGGCCGTCCGCTCACTAGCCTGGCAACATT TGTGTGGTGCACACAAATTACATGAACAAAATCCAAAACTTTTTGACAAA CTATTAGAATCAGAAGAAGGTTCTAAATGGAGTAACATTATTAAAAGAGA CATCCCTCGCACATTTCGTCATCACACCATGTTTAAAGAAGACAAAGGGT TAGGTGCAGGTCAACTTTATCAAGTTTTATTAGCGTTCAGTGCGCATGTA CCTACTATAGGATATAACCAAGCGTTAGCTCCTCTTGCAGCTGTGATGTT AATGCATATGCCTCCAGATGAATGCTTTTGGGTTCTCGTCTCCGTCTGCA GGTATTACGTACCTGGATATTACGGAGATAAAATGGAAGCTATGAGACTT GACGGTCTCATTTTCGAGCGCTTATTACGTAAATATTTACCGTACATTTA CAGACACATGAAATCGTATAATATTGATCCTTTGATGTATATTGTCGAAT GGTTTGTATGTGTTTTTGCAAGGTGTCTACCTTTCCAGACAGTTCTACGT GTATGGGATGTGTTCTTTTGTGAAGGTGTGAAAGTACTGTTCAAAGTTGG GCTAGCTATACTAAAGCTAGTGTTCCCTAGCGCCAGTTCACTATCTGATA AAGACGATTTCCAAACGACGCAGATTTTATTAGATTTACCTAAAGACGTG ACAATAGACACCATTTTGATTCCAGAGGTTTTGAAATATAATATTGAGGA AAGAGAATTTCAAAAGTTTCATCAAGACGTTTATCGGGAAAATCCAGAAT TGAGTTTGAGTCGATATTTTTCCTTAAATGTCAAATTGGATGAACAGGAC GAAGAATCGGATTGATTTTTCGGATTTTATTGGAATTTTCGGATTTTATC GGAAACTGAGGATATGGTGATGATGATTTCTTAATAAGATTTTTTAAATG ATTTTTATTACCTTATTATAATTACAATGCAAGATTTTAGTATTTTACCT TAAAGCTGGGTGTCCACTAAAGAAAAAGTTCATTGGAAATGATGAATCTA AACAAAAAAAAATTCAGACATATATCTAGAATTAAAAGTCTATTGTCCTT ATTTTGACAGAAGAAAAATGATAAGCGATGAAGAACAGTTTATTGTTGAT TTATTTCCGCCATAGCGCAAATAAAACAAAGTATTTTTAATTTCAGTACT TCAGACATATGTATGTCTGGATTATTTTTTGCGACAAACAAATTTGCCTA ATCAATGAACTTTAATAAAACAAGTTTATTGGCCTAATGGAACCAATTTT CGTGGAACTAATTTTTGCGATCGGGGTTTCTAAATTAATTGGCATTTTTG GAAGAATTTTGCCCACTCTTTGCCTAAATTCTTTAATTTTCTCAGGGTTT TTGCGAATTTTCAATAAATGTTGTATTTCGTGGTGGAAATTTAATTATTA CTGTTTTTTTAAATAGAAAAAACGTATAACTCCCCGTATTTCGATTTTTA TAGAACAAAAAAATTAAGATAATTTTTTAACCTAGAGTTTCATTTTTCCG CTCTTTTTCAAATTCCTTCCGTGTAAGTATTGTTTATATTTTCATTATAT TTTTAAAATTTGGTCAGTCAGTTGTTTATAAATGCAATTTTTGTATAGTT TAAAACGGAAAATATTCAAACTTACAGCTTAACAAGCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067732TCONS_00067732Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00067731TCONS_00067731Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00067732-proteinTCONS_00067732-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_473supercontigscaffold_473:135588..146475 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
TBC1D10ATBC1 domain family member 10A isoform 1 Homo Sapiens
TBC1D10CPREDICTED: carabin isoform X2 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
2.03 2.86 1.09 0.83 9.78 6.99 12.45 13.33 7.07 17.72 9.24 7.45 38.18 43.96 40.96 24.32 8.49 15.72 30.52 24.1 2.42 2.05 7.76 7.76 4.89 5.73 23.25 17.93 19.55 15.16