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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00067732 ID=TCONS_00067732|Name=TCONS_00067732|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2048bp
TTGCAAATGCATGCACCATACACCCCAAATAAAATTTTGTATTGCACCTA
TCGATCGCTCAAAGATGGACATTGAGGTTGagcaaaacgaaaaagaaaat
gatgaagaacAAACAATAAACAGTAGTAGTGAATCCAGCGATTCCGAATC
GGATTCTACCTTACCAAGAACACTGACAGCTCCAACGAAGCTTGATCGCC
ATGGATTCATTGTCGGGCACCGTTTACATGATAAAGTATCTTCATTGCCT
AACCCAGGGTACACAACAACCATCGGCAAACGTCGGGAACGAAAATGGCT
TTCTATGTTCGTAAACTGGGACTCGTATATACGTCGGAATCCTAAACAGT
TACGACGCCGATGTCGCAAAGGGATTCCACAGGCCGTCCGCTCACTAGCC
TGGCAACATTTGTGTGGTGCACACAAATTACATgaacaaaatccaaaact
ttttgACAAACTATTAGAATCAGAAGAAGGTTCTAAATGGAGTAACATTA
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GACAAAGGGTTAGGTGCAGGTCAACTTTATCAAGTTTTATTAGCGTTCAG
TGCGCATGTACCTACTATAGGATATAACCAAGCGTTAGCTCCTCTTGCAG
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TATGAGACTTGACGGTCTCATTTTCGAGCGCTTATTACGTAAATATTTAC
CGTACATTTACAGACACATGAAATCGTATAATATTGATCCTTTGATGTAT
ATTGTCGAATGGTTTGTATGTGTTTTTGCAAGGTGTCTACCTTTCCAGAC
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TCAAAGTTGGGCTAGCTATACTAAAGCTAGTGTTCCCTAGCGCCAGTTCA
CTATCTGATAAAGACGATTTCCAAACGACGCAGATTTTATTAGATTTACC
TAAAGACGTGACAATAGACACCATTTTGATTCCAGaggttttgaaatata
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AATCCAGAATTGAGTTTGAGTCGATATTTTTCCTTAAATGTCAAATTGGA
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GGATTTTATCGGAAACTGAGGATATGGTGATGATGAtttcttaataagat
tttttaaatgatttttattaCCTTATTATAATTACAATGCAAGATTTTAG
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TATTGTCCTTATTTTGacagaagaaaaatgataagCGATGAAGAACAGTT
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AACCAATTTtcgtggaactaatttttgcgatcGGGGTTTCTAAATtaatt
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TTAATTATTactgtttttttaaatagaaaaaaCGTATAACTCCCCGTATT
TCGATTTTTatagaacaaaaaaattaagataattTTTTAACCTAGAGTTT
CATTTTTCCGCTCTTTTTCAAATTCCTTCCGTGTAAGtattgtttatatt
ttcattatatttttaaaatttggtcaGTCAGTTGTTTATAAATGCAATTT
TTGTATAGTTTAAAACGGAAAATATTCAAACTTACAGCTTAACAAGCG Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00067732-protein >TCONS_00067732-protein ID=TCONS_00067732-protein|Name=TCONS_00067732-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=407bp
CKCMHHTPQIKFCIAPIDRSKMDIEVEQNEKENDEEQTINSSSESSDSES
DSTLPRTLTAPTKLDRHGFIVGHRLHDKVSSLPNPGYTTTIGKRRERKWL
SMFVNWDSYIRRNPKQLRRRCRKGIPQAVRSLAWQHLCGAHKLHEQNPKL
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AHVPTIGYNQALAPLAAVMLMHMPPDECFWVLVSVCRYYVPGYYGDKMEA
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KDVTIDTILIPEVLKYNIEEREFQKFHQDVYRENPELSLSRYFSLNVKLD
EQDEESD Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_473:135588..146475- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00067732 ID=TCONS_00067732|Name=TCONS_00067732|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10888bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_473:135588..146475- (Clytia hemisphaerica)
TTGCAAATGCATGCACCATACACCCCAAGTAAATTGCAAGGGTGTGCCAG
ACTGACTCTTCTGGGGTGCTTAATTGTAGGGCTTGGGATTTGGATATATA
CATACTTTAAAGGAAGAAACTTTTGTAAAAGAAACTTTTGAGAGGCGAAA
AAAACGCAAAATTTTGGGAATACCTTACTTACCTGTACCTTTATCCAGGC
GGTGTCAATCGAACTGTTCGATTATCGAACTAATCGAACTTAATCAAACC
CTCGAACCCAATCGAACACCTATCGAACCGGGAAAACTTTCATATTAAGT
TCGATGACTGTTCGATTATACGATTATAGTTTGATTGCAGTTCAATGAAT
ACGATTTGATCAGTTCGATTAAGATCGATGGAGTTCGATTGATTTGATTA
AATTGATTTATACTGACCTTGCCGCTGAATTTTTTATTTATATTCCGAGG
GCGTATTGGCCATTCTTGCGGGCCATCCTATATCTATCCCATCGGATGGG
ACAAGCTGGAGCTTTTACAAGCTCTTTGGTCCTTAATTTGTAAAAGAAAA
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AATCATCGAACCACATCGAATTTTCATCGAACCACATCGAACTTTCATCA
AACTTAAATCGAATTCATCGAACATCAATCGAACTTCATCGAACAAAGAA
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AGCTGTTTGATTAAGTTCGGTAATCGAACAGCTATCGTTCGATTTTGTTC
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GACACCACCTGGCTTTATATATATTCGCTCCTTACAGTACGCCAATACAC
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TTCTTTTCTCATGGCATTACAATGTTTTGTGGCTTTAAAGCTATGTATTA
CACCATAGACAAGGGGCTAAAAGAGTCGGTCATCGAAAAAAAATTTGTTT
GCGCCACCTGCTGTTGCCCACACCCGCCCACATATTTTCAGTTGATTTTC
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CATGGCATGATTGGTTTTATTAATTTCCCTTTTTCTTTTTATATACATTA
CAAAGTTTTATAATACTAAAAAGTGATTTTTTTTCAACTAGTAATTTTTA
CAAGCTTTGGACCTTTTGGTATTGATTTGTTCTGAGAATTGAAAACAATT
TTTCAGGTTTGCATAACTTCAACTTTATCAATTTCAAGTGATTTTAGAAC
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TCTGATTTCCCTTTAAAAAACTCCACTGACTCTACCTAGCATCAAAACAA
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GTGTAGCTATTAAATATGCAACATGACATTGTGTCCTACAGAAGGTCTAT
CTTTACCCTTTTTGTTAATTATCAGGTTAACATAGAGTGCAGGATTGGGT
ATACAAAGTCTTATATAATTTTGTACTTTTTGTTATTATTTGGAACCAAT
GAAAAGACTAGGTAGAAAGTTCTCCAATTCAGGTATTATCTAAATCTTGC
TGAATTCATCAGGTCATGTAGGATGTCTGTTAGTCACGCAGAAAAGCATT
AAAGTTTTTATTAAATCTAAGGAAAAGGATTTACCTCTTTACTTTGTATC
TTAAAAACAGAAGTACCTTGGGTGCCAAATGTGTAGAGAAGATTGACTTT
TAAATCTGGGTAGTGAGGCTGCTATGCAGCCTGAAAATGTGTCCGCTAGT
CACTAAAATTAAAATTAAAGTTCTGCTAGTGCCTTAAAAAGCTTTTTTAT
CAAATAATTCAGCCTTTAAAACAACTTTGACTACATGTGTCTGTACCATT
TCTGTATCAAATCATGACAGTGTTGATTTAATTTTAATACTGATTCCTCC
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TCACGTGTCCAAAACAAACTTGTAAAACAATTGAACAATCAAAATTAGCC
ATATTTGGTTTGATTTTTTATTTTGACATGTGACATTTGTTTTGATTTTG
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CTTTAAGCTACCGTACTAATTTTCACTAAAACAAGTTTGCACTAACAATT
AACATGATTTTTGAGATGAAAGTGATTTATAAAACATGTAGAGCATTTTT
AAATTTTGTGACTAACGAACATGAAATAAATAGAAATAAACTAAAATAAA
TGCAAACAGTGCATGAGAAGTTACTGTCTGCATTGTCACAAATCAAATTA
ACCATCAGGCAACTTTGATTTTACTTGTTTTTGCATTTTCGACCTTACAT
GTGTCGGGTAAATAGTGCTCACACAAAACTAATAAAAGGTACTCCTTAAA
GTTTGTTAACAATTTTCCATCTATAAGCATTACATTTGTTAGCAAATTTA
CTTAGAAAGAGTTCCAAGGCTTACAGATCTCATCGTGGTTGAGAAACATT
TCTGTCCGTTAGTCACAAAATTAAATGTCCGTTAGTCACGGACATATCAT
ATGTTCATATTCTTAGCTATTTTATCCTAATAAAAGGTTAGGNGGACATA
TCATATGTTCATATTCTTAGCTATTTTATCCTAATAAAAGGTTTTAAAAC
AAAGTTAGCCAATATGACAAAAATTTCCAAGATTTCAACTTAGGAACAGC
ATTTTTAATGTGTTTGAAAAAGTAGTTCATTTTTGGTGTTACATTTGGTG
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TGAGAAAAAGTTTGCCTACTTTTTTAAAACTATGACCCCTAAGGATTGTT
ACTATAATGATTGATACTTAATTTCTTTTCTCTAGCTTGACTAATGAGAT
GTTAAGTTCTCAAAATCTCCGTTAGTCACATATGGAATGCATGATATATC
TACGGACCTAATGATGACTACTACTGCCCCAAATGTCTCCTTAGGGTATA
CTTCCTTCAATGTCAAAACTTATTTATGTTTCCTAGCATTTTAAGCCTAT
ATTGTGACCTCTTCTAAAAAAGACTGTTTTGGCCTTTGGCCAACTGTTAA
CGTCTTATGGCTGTAAGTAAGCAGTCAAGACTTGTCTTTTTGGATATTAT
TTCAGATAGAGTTGTTATTGGTATTATATTTCGCGTGTTACAAAATTTCG
CGGATACTTAATTTCGCAATTTGTTAGGATAAATTTCGCGAAATTTAATA
CCGTTTAAATTTTTCAACAATAAAAAATCGCGAAAAATTTTCGAAATAGG
TCGAAAATCGAAAATACTTATTTGTTACACTTAGTTACTATTTTTGTCAA
TAGTTTTGTTACTATATTTGGTATGTTTGCACCTACGTTGTGTTTCAAGC
GAAATCAGTCATTTTCTTGCCTTATTCCCACTTTTTGAATATTATGCCCA
ATTTAAATTTAATACACGCGAAAATTTCCAGAAACTGGCAATCGCGAAAT
TTAGTACACGCGAAAAACGTTTCCTCGAAATAATATCGCGAAATTTTGTA
ACACGCGAAATATAATGCCAATAAGGTACCTGATCTACCCAACCAAACAA
AATATTTTTCCTTGCGTACAGTATGTGGCCCCCAAAACGTCGATCAAATT
TAAAATTTCTCTCAAATCTAGAGGAAAAGAGGTTTTACAAAATTTTTTGC
TGCATAAAAGACTTTAACATCTCTACTTTATTTCCTGGAAGTTCTTTTTC
AAAATTTTCAATTTCAACAATATTTTTCAATCGCTTAAAGATAGGTATCT
TTTTTCTAATGGCCCCCAAAACGGAGGTTTGCAATTTTAGCGATTTCTCG
AGATATCTTTAAGATATTAATACAAAATTTTGACCATAGTTTGGAAATGT
GTTTTAGAGGGTTTTGGTTGTCAAAACGCAGATTTGGGGCCCCCAATAAA
ACGGAGGTGTAGTTAAAATCAAATTATTAAGCCCAGTGGTAATAGGGGGG
AAAACTATGAACATATTTGTGGCCCGATAGATGTAAAATTTATGATTTTT
ATGAAATATTTCAAGATTTTCGATATTTCAAAGTCCAAACTGAAAATTTA
GAAATTTTCAAAATGACAATTATGATTTAACAACGTCTTAATCAAGTTTC
TGAAAATCAATGTCTTTTGAAGTCTTTATAGTTCCATTCATGTATGGAAT
AAGCTGTGAAAATTTCAGAAGAAAAGCTTAACTGAAACTGAAAATATTAA
GCTTTAAAGGTATTTTTCTCCTATATTTTGCAAAAAAAATGACAGAATTT
GCCGTTTTTGCTGATTCAGCAAAATATTGTATATATAATGTTATTTTTTT
GTTATAAGCTATTAACTCAACCTGATAGGAATGGAATTCCACGATTTTTT
GCTGTTTCTCGTATTTAGAATTTTCGGTTTTATCAATGCTGATTCTAGAG
TCCCCAAAATACTGGTTGACCTTTAAGATGCTATATCTTTTACCCATCCT
CTAAAGTCACAGATGTATCTGCATTTTCTGAACGGCATTATGTGTAGAAA
GTTTCCTATACCCTATTTTCATAACTTATTTTCAATATCCAAGGAGCTAG
AGTGAGTTATATGCAATTTTTATCTAATGTTGGAGTTAAAATATTTCTTC
AGACGCAAATATGTTATTTTGAATGTGTCTCATACCATCAAAAACATGCT
CATGTTTTAGTATAACCATCATTCTTTCAAAATAAACAAAAACCATTTAA
TTCTGATAAATGTACAAGTCAGAATCCTCATTTTAATGACAACCTCCGTT
TTGGGGACCATATACTGTATACTCTTTCCTTCTAAACAAACTTATACTTT
ATTTGTACAAGTTTTTAAAATCCACAAGTAAGGAACGTCTAATAGCTTAG
CTTCTTAGATAATCTAAGCATGGCAAACGATAGCCCTTGAACCAATAAGC
ATAAATATGGTATAATATCAGGGTTAGTCAAAGCAAATTTTTCAGAAAAT
GAGCAAGCATTCTAGCAACCTCAGCCCTGACCCAAAAAATGTGTACCCTA
ACCATATCGTTAACTAGTTCAAAAGTGTAATAACCAAATGAGGGTTTGTA
TATCGCAGTCGAAACTATTGCTTATTATAATGTGCAGTGAATTGATATCT
TTATTGAATAAAATGGAAGATCATTGGAGTGTCATTGATGGACTTCATAA
CACAATGAGACCATCTTTCTCTATTCATTATACTCAGAGATTCCTTTATA
ATCTCCATAGGATTGAAGACTAACAGTGCCTCGCCCCCTGGTCATACTTA
TCATTTTGTAAGAGAATAATGTTTAGCTTGGCAGCACGTGGCCTTCATGC
ATTCTTTAGTAAAGTAAAAACAGGAACATGGATTAGAAGATCCATCAACA
GTCAGTTTTTCGAGTTATGATGTTCAACCTTTTTACGTGCCAAGTTCCTT
TCATCAGTTATTTTGGGACCTTTGTAATAATCTTTGAATTGCAATGCACT
CTTATTGAACTGTCAAAAGAAGGGGAACGTGTTGATTATATCCCCTACCC
TGCAGCCTCAGGACGTTGTAAGTCTAAGACACGTGCTATAACATCGCCAT
TCTTATAAAAAGTAAACATGACATCATCAACAAGACGTCATCAACAAGTT
AATTGTTTTTGTTGTTATTGTCATGTCAATGGCTTTAGAGATGTTGAGAG
AAAGGAGAGAGCAGAATCTACCAAACAGACAGTGTTTTTAAGAGAATTCA
AACTCCTTCGTAGACCTTTTGTTAAGAGTATTACCATATGTTCAATACAT
GTTTTCACTTGACAACCTGTTAAGTGATGATGGCATATAAAAAGTTGACG
GACCAAACTTTCTTTTTATTGTTCAAGTAAGATTACCTTGAGACACAGTG
CTCAGTTGAGATCTAATAGAAAGATAACGAAGAAAGGAAAACATGCAGGT
TTGTTACTTTATTCATACTTTATGCTCTATAGACATGTGCTGCCCATTTT
TGGATTTTTAGAAGGATTTTAATGATAGGTTGTCGACGTGAATTAATTTG
AGAGGATAATGCTGATTGCAATTAAAGTTATCAATTCGTTAACAGCGAGG
AGAAAATTAGATTTTAATATTTCATGACCACCGCTTATATAGCCTCTCCT
GTCTTTTGGATATGTTGTGATTTGAATGTAATGGCCGTTACTTTTGACTA
TATGAGAAGCTTTCTGACTATATTTACTTCAAAGTCGTTTAGGATTTGGA
TCTTTTGAGATTTGATCTTAGAAATAACGTTATATTTTTTTTGTTGTGTA
CTTACCTTCATCAATTGAACGTTTAAAGATAACCATATACACATTCCTTT
CCTCGGTGACCCGATGGGAATGTGGGACTGGGATATGCTAAAGTGTCTAC
GTGATTCCTGATAATTATGACCAGGGTTCAGTAGTATTTTCTATTGAGGA
TTAACTTCAGGGTATTTTTATCAGTCAATAAGATTTTTTGGCTGATTTCG
GGGACAACACGGCTTTCAACCTTTAGAAACGGGTTTTTCATTTACCAATG
CATGTGTTTTTGGTTTTTCCATGACATGTGACTATAAACAGGGAAAATTT
AATTCGATGCTCCTATGTAAATACAGCATTTAGATAGCTTTTCCCTGTTT
TGTTCCATTTTGAACTTTGGTATTGGTTAACGAGGGATAACCCATGGAAA
ATGTTTGTATGTATAAAATAAAATCAGAGTAAAGTCTAAAGTCCCTTCGG
GAGACATCCTTTTAAGAATTCCCTTTGTAATTACTGCCTACCAATACAAA
GTATATTTTAGGACTTTCGACTGTTTTCGAGTAGATTTTCATCCCCGCCA
GAACGCGACTCGAAGAGCTGTTAAGAAGCTGCGAAATACCAAAAACGAAT
TTGAGAGTTTCTCGTTACTTCGCTACTTTTACTAATGATTGGAGGTTTTT
TTTGGTAAGGTACTCGTTGAGTTTCTTAAAACCATTTGCAACGTTTTTTT
AATACGAAATCGGGGTTTACCTTGTATTATGTGTATTGTATCCAGAATAG
ATCAGACTGTAGTTGATATAGTGCTGGAAATGTTAATAATTATGACTTTG
TGTATCAACCATCATGAATTTAGAAAGTTCACACCCTTTCCTCTCCTTTG
CTTCCTCTGTAATTTTCTGGTGGTAAAAACCTCTATTCCTTTAAAGAAAA
GGTATGGTTTCCACGCCTCTCCTTAAAAACTTGATCCTCACTTTGGAGAA
TCATTTTAAAGCTGTTTTGTTTACGTTTTGCGAACGTGATTTGGGTAAAA
ACAACAACTCTAAAAAAGGCTCAAAATATTTATTTTTAGCAGCTCTGTGT
TGTGACTTGTTCGATAATCCTGGATGTACTCCAACCTTTTGTTTACACTT
TACAAAATAAAAGTATAATCTTTCGTTTACTTTTGACCTTCTTATTGCAT
GGATTCTTTTTAGAAGGGCGTTATACACCCTGGGGTGGCCAAAATTTCGT
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TTAGACTCCATCATTTGAAATTCAATGGAAAACTTTCATCCCCATTCTGG
GATTTCCACCGTGGCTGCGAGACAAGAGTGTCCTTATTAAAAAACACTAT
TAACAGCTCTTGCTCGTTTGAGCCATTTGAGACCCAAAGATAGAATTTTT
TAAAGGATTTTCCGTTTGGTTTTACTAATTCAGCATTATATCAATTCAAA
AGTGCTTTCAAGTCATTTCTATTTTGATGAGGTCATCATGATGTCTCTGT
AAGCACGTCCATAACAGTTTGATGTCTGTCGTAATCTAGTTAATGTTTTA
TTCCGTATGAAAAAAGGCTTTTTGTTTACTTATCCACTCAAAGTTACGGG
CTTACAACCTATTTTTTCCTCTTATGAAATATTCCTTTTCCTTGATAATA
TTGAAGATTGATAGCCACATAAACTTTACACGAAGAGTGAAATTTCTTGG
CTTTTTTCTGCTAGTAGAAATCATGTTTTTATTATCATTCGCTCATCGAT
TCATACAAGGCTTGTTATAATTTGAGATTGACAAAGGGCGTAGAATTTGA
TAAAGGGAGAAAACCAATTAACATTTTTCAGCAATTTTCATTCTATTTCT
GATAGAATTTTTGTTTGTGACATTAGGTAACGCTAGAGATACTCAAAGAC
TTCGTCATTTTTTAAAAGAGTTCATGAAAAGTGCAAAAATTAATTTTGGA
TTTCTTGTACGTTTTATTTTTGTTGAGTAAGATTAGAGATTGCTGTCAAA
TCAGTGGGGCTCTGAGAAAGGAATCCTAAAATCCTCAAAAGCTCTAACAT
TGAAAGTTTCGTATTTGCTTGCCTTTATTAAAGCAATCATTCTGATGTAT
TGGGTTTATTGTTCTTTTATATTTTTGGCTTTAAACTTTCTCCTCAAGAT
TCTAATTGTATAGCCTTCCCTCCTTATTTCTTATGTTAACATCTTAATAT
TAATTTCATCTTCTTCAGATAAAATTTTGTATTGCACCTATCGATCGCTC
AAAGATGGACATTGAGGTTGAGCAAAACGAAAAAGAAAATGATGAAGAAC
AAACAATAAACAGTAGTAGTGAATCCAGCGATTCCGAATCGGATTCTACC
TTACCAAGAACACTGACAGCTCCAACGAAGCTTGATCGCCATGGATTCAT
TGTCGGGCACCGTTTACATGATAAAGTATCTTCATTGCCTAACCCAGGGT
ACACAACAACCATCGGCAAACGTCGGGAACGAAAATGGCTTTCTATGTTC
GTAAACTGGGACTCGTATATACGTCGGAATCCTAAACAGTTACGACGCCG
ATGTCGCAAAGGGATTCCACAGGCCGTCCGCTCACTAGCCTGGCAACATT
TGTGTGGTGCACACAAATTACATGAACAAAATCCAAAACTTTTTGACAAA
CTATTAGAATCAGAAGAAGGTTCTAAATGGAGTAACATTATTAAAAGAGA
CATCCCTCGCACATTTCGTCATCACACCATGTTTAAAGAAGACAAAGGGT
TAGGTGCAGGTCAACTTTATCAAGTTTTATTAGCGTTCAGTGCGCATGTA
CCTACTATAGGATATAACCAAGCGTTAGCTCCTCTTGCAGCTGTGATGTT
AATGCATATGCCTCCAGATGAATGCTTTTGGGTTCTCGTCTCCGTCTGCA
GGTATTACGTACCTGGATATTACGGAGATAAAATGGAAGCTATGAGACTT
GACGGTCTCATTTTCGAGCGCTTATTACGTAAATATTTACCGTACATTTA
CAGACACATGAAATCGTATAATATTGATCCTTTGATGTATATTGTCGAAT
GGTTTGTATGTGTTTTTGCAAGGTGTCTACCTTTCCAGACAGTTCTACGT
GTATGGGATGTGTTCTTTTGTGAAGGTGTGAAAGTACTGTTCAAAGTTGG
GCTAGCTATACTAAAGCTAGTGTTCCCTAGCGCCAGTTCACTATCTGATA
AAGACGATTTCCAAACGACGCAGATTTTATTAGATTTACCTAAAGACGTG
ACAATAGACACCATTTTGATTCCAGAGGTTTTGAAATATAATATTGAGGA
AAGAGAATTTCAAAAGTTTCATCAAGACGTTTATCGGGAAAATCCAGAAT
TGAGTTTGAGTCGATATTTTTCCTTAAATGTCAAATTGGATGAACAGGAC
GAAGAATCGGATTGATTTTTCGGATTTTATTGGAATTTTCGGATTTTATC
GGAAACTGAGGATATGGTGATGATGATTTCTTAATAAGATTTTTTAAATG
ATTTTTATTACCTTATTATAATTACAATGCAAGATTTTAGTATTTTACCT
TAAAGCTGGGTGTCCACTAAAGAAAAAGTTCATTGGAAATGATGAATCTA
AACAAAAAAAAATTCAGACATATATCTAGAATTAAAAGTCTATTGTCCTT
ATTTTGACAGAAGAAAAATGATAAGCGATGAAGAACAGTTTATTGTTGAT
TTATTTCCGCCATAGCGCAAATAAAACAAAGTATTTTTAATTTCAGTACT
TCAGACATATGTATGTCTGGATTATTTTTTGCGACAAACAAATTTGCCTA
ATCAATGAACTTTAATAAAACAAGTTTATTGGCCTAATGGAACCAATTTT
CGTGGAACTAATTTTTGCGATCGGGGTTTCTAAATTAATTGGCATTTTTG
GAAGAATTTTGCCCACTCTTTGCCTAAATTCTTTAATTTTCTCAGGGTTT
TTGCGAATTTTCAATAAATGTTGTATTTCGTGGTGGAAATTTAATTATTA
CTGTTTTTTTAAATAGAAAAAACGTATAACTCCCCGTATTTCGATTTTTA
TAGAACAAAAAAATTAAGATAATTTTTTAACCTAGAGTTTCATTTTTCCG
CTCTTTTTCAAATTCCTTCCGTGTAAGTATTGTTTATATTTTCATTATAT
TTTTAAAATTTGGTCAGTCAGTTGTTTATAAATGCAATTTTTGTATAGTT
TAAAACGGAAAATATTCAAACTTACAGCTTAACAAGCG Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_473:135588..146475- >TCONS_00067732 ID=TCONS_00067732|Name=TCONS_00067732|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=2448bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_473:135588..146475- (Clytia hemisphaerica)
ATAAAATTTTGTATTGCACCTATCGATCGCTCAAAGATGGACATTGAGGT
TGAGCAAAACGAAAAAGAAAATGATGAAGAACAAACAATAAACAGTAGTA
GTGAATCCAGCGATTCCGAATCGGATTCTACCTTACCAAGAACACTGACA
GCTCCAACGAAGCTTGATCGCCATGGATTCATTGTCGGGCACCGTTTACA
TGATAAAGTATCTTCATTGCCTAACCCAGGGTACACAACAACCATCGGCA
AACGTCGGGAACGAAAATGGCTTTCTATGTTCGTAAACTGGGACTCGTAT
ATACGTCGGAATCCTAAACAGTTACGACGCCGATGTCGCAAAGGGATTCC
ACAGGCCGTCCGCTCACTAGCCTGGCAACATTTGTGTGGTGCACACAAAT
TACATGAACAAAATCCAAAACTTTTTGACAAACTATTAGAATCAGAAGAA
GGTTCTAAATGGAGTAACATTATTAAAAGAGACATCCCTCGCACATTTCG
TCATCACACCATGTTTAAAGAAGACAAAGGGTTAGGTGCAGGTCAACTTT
ATCAAGTTTTATTAGCGTTCAGTGCGCATGTACCTACTATAGGATATAAC
CAAGCGTTAGCTCCTCTTGCAGCTGTGATGTTAATGCATATGCCTCCAGA
TGAATGCTTTTGGGTTCTCGTCTCCGTCTGCAGGTATTACGTACCTGGAT
ATTACGGAGATAAAATGGAAGCTATGAGACTTGACGGTCTCATTTTCGAG
CGCTTATTACGTAAATATTTACCGTACATTTACAGACACATGAAATCGTA
TAATATTGATCCTTTGATGTATATTGTCGAATGGTTTGTATGTGTTTTTG
CAAGGTGTCTACCTTTCCAGACAGTTCTACGTGTATGGGATGTGTTCTTT
TGTGAAGGTGTGAAAGTACTGTTCAAAGTTGGGCTAGCTATACTAAAGCT
AGTGTTCCCTAGCGCCAGTTCACTATCTGATAAAGACGATTTCCAAACGA
CGCAGATTTTATTAGATTTACCTAAAGACGTGACAATAGACACCATTTTG
ATTCCAGAGGTTTTGAAATATAATATTGAGGAAAGAGAATTTCAAAAGTT
TCATCAAGACGTTTATCGGGAAAATCCAGAATTGAGTTTGAGTCGATATT
TTTCCTTAAATGTCAAATTGGATGAACAGGACGAAGAATCGGATTGATGC
AAATGCATGCACCATACACCCCAAATAAAATTTTGTATTGCACCTATCGA
TCGCTCAAAGATGGACATTGAGGTTGAGCAAAACGAAAAAGAAAATGATG
AAGAACAAACAATAAACAGTAGTAGTGAATCCAGCGATTCCGAATCGGAT
TCTACCTTACCAAGAACACTGACAGCTCCAACGAAGCTTGATCGCCATGG
ATTCATTGTCGGGCACCGTTTACATGATAAAGTATCTTCATTGCCTAACC
CAGGGTACACAACAACCATCGGCAAACGTCGGGAACGAAAATGGCTTTCT
ATGTTCGTAAACTGGGACTCGTATATACGTCGGAATCCTAAACAGTTACG
ACGCCGATGTCGCAAAGGGATTCCACAGGCCGTCCGCTCACTAGCCTGGC
AACATTTGTGTGGTGCACACAAATTACATGAACAAAATCCAAAACTTTTT
GACAAACTATTAGAATCAGAAGAAGGTTCTAAATGGAGTAACATTATTAA
AAGAGACATCCCTCGCACATTTCGTCATCACACCATGTTTAAAGAAGACA
AAGGGTTAGGTGCAGGTCAACTTTATCAAGTTTTATTAGCGTTCAGTGCG
CATGTACCTACTATAGGATATAACCAAGCGTTAGCTCCTCTTGCAGCTGT
GATGTTAATGCATATGCCTCCAGATGAATGCTTTTGGGTTCTCGTCTCCG
TCTGCAGGTATTACGTACCTGGATATTACGGAGATAAAATGGAAGCTATG
AGACTTGACGGTCTCATTTTCGAGCGCTTATTACGTAAATATTTACCGTA
CATTTACAGACACATGAAATCGTATAATATTGATCCTTTGATGTATATTG
TCGAATGGTTTGTATGTGTTTTTGCAAGGTGTCTACCTTTCCAGACAGTT
CTACGTGTATGGGATGTGTTCTTTTGTGAAGGTGTGAAAGTACTGTTCAA
AGTTGGGCTAGCTATACTAAAGCTAGTGTTCCCTAGCGCCAGTTCACTAT
CTGATAAAGACGATTTCCAAACGACGCAGATTTTATTAGATTTACCTAAA
GACGTGACAATAGACACCATTTTGATTCCAGAGGTTTTGAAATATAATAT
TGAGGAAAGAGAATTTCAAAAGTTTCATCAAGACGTTTATCGGGAAAATC
CAGAATTGAGTTTGAGTCGATATTTTTCCTTAAATGTCAAATTGGATGAA
CAGGACGAAGAATCGGATTGATGCAAATGCATGCACCATACACCCCAA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00067732-exon-scaffold_473-1575043694:146448..146475 | TCONS_00067732-exon-scaffold_473-1575043694:146448..146475 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067732-exon-scaffold_473-1575043694:135588..137607 | TCONS_00067732-exon-scaffold_473-1575043694:135588..137607 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00067732-exon-scaffold_473-1510915933:146448..146475 | TCONS_00067732-exon-scaffold_473-1510915933:146448..146475 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00067732-exon-scaffold_473-1491911889:135588..137607 | TCONS_00067732-exon-scaffold_473-1491911889:135588..137607 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_473 | supercontig | scaffold_473:135588..146475 - |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
| Term | Definition |
|---|
| IPR000195 | Rab-GTPase-TBC_dom |
Blast
BLAST of TCONS_00067732 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: TB10A (TBC1 domain family member 10A OS=Homo sapiens GN=TBC1D10A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 275.789 bits (704), Expect = 1.991e-83 Identity = 133/320 (41.56%), Postives = 201/320 (62.81%), Query Frame = 2
Query: 179 APTKLDRHGFIVGHR-LHDKVSSLPNPGYTTTIGKRRERKWLSMFVNWDSYIRRNPKQLRRRCRKGIPQAVRSLAWQHLCGAHKLHEQNPKLFDKLLESEEGSKWSNIIKRDIPRTFRHHTMFKEDKGLGAGQLYQVLLAFSAHVPTIGYNQALAPLAAVMLMHMPPDECFWVLVSVCRYYVPGYYGDKMEAMRLDGLIFERLLRKYLPYIYRHMKSYNIDPLMYIVEWFVCVFARCLPFQTVLRVWDVFFCEGVKVLFKVGLAILKLVFPSASSLSD-KDDFQTTQILLDLPKDVTIDTILIPEVLKYNIEEREFQKFH 1132
A ++D+ GFIVG + + +P + ++RE KWL M NWD ++ + K++R RC+KGIP ++R AWQ+L G +QNP FD+L S KW ++I+RD+ R F H MF G G L++VL A++ + P GY QA AP+AAV+LMHMP ++ FW LV +C Y+PGYY +K+EA++LDG I LL+K P ++H+ IDPL+Y+ EWF+C F+R LP+ +VLRVWD+FFCEGVK++F+VGL +LK S + + ++T + L L + + L+ EV++ + ER+ ++ H
Sbjct: 51 AERRIDKFGFIVGSQGAEGALEEVP-----LEVLRQRESKWLDMLNNWDKWMAKKHKKIRLRCQKGIPPSLRGRAWQYLSGGKVKLQQNPGKFDELDMSPGDPKWLDVIERDLHRQFPFHEMFVSRGGHGQQDLFRVLKAYTLYRPEEGYCQAQAPIAAVLLMHMPAEQAFWCLVQICEKYLPGYYSEKLEAIQLDGEILFSLLQKVSPVAHKHLSRQKIDPLLYMTEWFMCAFSRTLPWSSVLRVWDMFFCEGVKIIFRVGLVLLKHALGSPEKVKACQGQYETIERLRSLSPKIMQEAFLVQEVVELPVTERQIEREH 365
The following BLAST results are available for this feature:
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