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The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000082:483431..503101+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_004581 ID=XLOC_004581|Name=XLOC_004581|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=19671bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000082:483431..503101+ (Clytia hemisphaerica)
NGTATCTTAGTATTGCTACGGGATTATTATTTAGCTATAACACTGGGATC
TCACGCTCCTCATTGTCCCgactgtttatcaaattttcttACTGGAAGAG
CTGAGCttctcaagtaaaaaaaaccaACATCATCAATCAGGAATTGTGTA
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AAAAAGAGACAAAGAGGAAAAACTAAAAGAAACATTCTTGTAAacaaatc
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TAGCGGAAGAAGGTGCTTGTTGATGTAAAACTGTCAACAAAGAGGACGAT
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TGTCCGTTCCAAAATTGGTCCAACCAATCGTCACTTCTCTCACTATCTCA
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AGCCACTCTTTTTAATTCAACAATTAATACTGGGGTCTTTCCCCATGAAC
TTAAGCTTGCAGATATCATTCCATGTCATAAAAAAGATAGCGCCTTGGAA
AAGTCAAACTATAGACACATAAGCTTGTTACCTACAATATCTAAAGTCTT
TGAAAGACTCATGGTAAATCAAATGCTGCCTTTCTTAGACACTTTCCTCT
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TATGTTTATCATATTTAATGAAGATGACATCTGTAACTTTGCTGAAGATA
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TATCCAAAAAAGCAAAACTAATGTTAGATTGGTATGCACAAAATTCATTG
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TTTGTCTCTGTTCTAGGACCTCTCTTATTTTTAATCTATATTAATGATCT
TCACAATGCAATCTTTTCaagtgaaacttttcatttcGCTGATGATAccc
atattttacattttaatgatgAGTCAATCGTGACCTAAGATCCCTCCAAA
CTTGGCTCAAAGGCAATAAAATATCCCTTAATGCtggaaaaacagaattt
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aattggaggtaagaaaatttttcaaagttcaaatatCAAATAGCTTGGCG
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attacttNCAATGcccaaaattatacattacttccattaaattctaatta
ttcgttttataaataggtaggcccattaaagtattacttgtttaaCTTTA
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tgtatcttttttgtagtgttaaatggtaaataaatacttacttacttacc
ggttagtgtaaaacgcaggtcacaggtcgcaggtcacaggtcacaggtca
gtgatgacaggttaactctaatcaatgtcattgcagaggagaatgtttgg
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cgcagtttgcgccgtgtataacgcagaccagaaaatatttgaaaccatat
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atggtttacatataataaaacccCGGAGGGGGGTCTCTACCTTCGCAGAG
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tcatcacattcggcatgctgaatatttttggtgtttttctcttgtaagat
atgatattttgtaattctgtcaatatttttgtcaaaaattgtcattaagt
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taatctttgtgtaaacttgcatatgttttgcatattttccaactaaatCC
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TggaaatgggaatcctcatatATCGAAATAAAGCATCTtcagaaaatttc
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GTTTGGTTTCTATAATGaaaagaaagtcgttattgtgaactttgaacatg
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GAACATTTGGTGAGTTCCTGTACGTGgctgcaatcaaaaaaatcataacc
acactcataaaaaaatcacgtttgcgtctttttttacgtttttcttgcct
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TGCCTGTGCATGATGTAACTTGCGCGGCAACAAAAtcgccttctgttggc
tgatcatattgggcgttttggcgttaccaccctcaaagCAGCGGGTGCCT
TTATTATCTCACAGTCACAAcactctgtccaccattttaaatgagttaac
aatagatccaaaagggtgCCCTCATCGAGGAAGATCATTCACTTTGGTAT
CCGGTTTTgggaagtagtaatgttttcgattgttttctatggaaaatGGT
ACCGTCTGTAGGGATTCACGGAGTGGGGATGAATAAATTTGAAGCGGTCA
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TGAAATCTCTTGTTGAACTgatgtgaaaatgaaagtccttaaattaacat
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TCTCCATAAACTCGAACGATTTTTCCGGTCTCTTGAGGAGATTCTTAGGC
TATTCTGACTCTCTGTAACTCAAATTTCTGTAACTCGAACAATTACTGAT
TATCCCCTTGGCGTTCCAGTACTCGACTATATTACACTTCCCTACTTGCT
CTAActttaatcattaggtaggtccaatcagATGGAAGCTATTTTTACAA
GAAGTTATGTCatctaaatttcaaaatgttataATCTTTTATCAGCAAAT
TTCCAGATATGAATCCTGACGTTTTTCTTAATAGTGGTGTCCTATCTTTG
AGGATGCCAACTTCAGCTAACTAATAGAAGAATGTTCCTTCCCTGACTAT
CTGGAAATAATTTTATGCTAGGAAATGACCAAAAATTCATTATATTCTAT
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CTGACTATCtggaaatataattttatgCTAGGAAATGACCAAAAATTCAT
TATATTCTATAGTCATTTTATACAAGAATGATCATttaaaacttcttcaa
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AgcgttttttaaatttttgtttttcaaaatgactGCTGCTGATTTTTGAC
AAGGATTTCAAAAATCATGTTGTAATTATGTTGAATCAGATTGAAACCTA
AAattgtaaaagattttcaaaaaattatatacCTGATTTAAAGTCTCTTA
TACGATATTTCAAGAATCAACGAAGTAAGTTATGAACTAAAAGAACATTG
TGATggatttatgaaaattttattttgaggCTAAAAGAAGTTATACCCAA
ACTCTTGTATTATGATGTCATAAACATTACCTAACATTACATCATAAATC
TTTCAATTTGAAATCTTAATCTACATCATAATCCACTAAGTTCCAGTGAA
TGAAACTGCTTCATTTTAATATTTGACAAGCCACTATCCATTTGAGTCCT
AGGTTCGACTTCTCCTTTCAAGATAAATCGATAAGATTTTTCAAGGTGAT
ATGGGATTGATTTATCAggaatttttcactttctaaATTGACCTAGATTC
AAAGACTTCTGTGGATACGATAAGCTTCCCTTACTAGCTGTATCACCTAT
CatccttttttcttcaaaataccCACCAGCTTAAATGTTCCAAAGCAACA
ATACCCTTTTCAGGTTAAAACCCACCTTGTGTAAATTCAAAACAAGGCGT
TTTAATAAGATGACATGAAAATTTCCATCCTCATCCTGGTCCAGATTTAA
CTGTTTTGAGTTGAACCTCTTGATTTGAACCATTCTGTATTGTTTCTTGT
TAGGGAGCAAACACTTCATCGCTTGAACAGGACATTGGTCCGGTCAATGA
ACATTTCTTTGGTTTGATAAATGTAAGTCCTCTTATTGATATGTTTAAAG
TAGAGTCTTGCTTTCTTTTCTTGAAACAACCCACTTGTATCTATCACTGA
ATAAAATTTCTGAActattaatttttgattttagtttGGAAACACTTGTT
ACTGCAATTCAGTGCTGCAAGCCCTCTTCTTCTGCCGTCCGTTTCGTGAG
AAGGTTTTAGCTTACAAGCCGCTGAGTAAACGCAAGGAGAACCTTCTGAC
TTGTTTGGCTGACTTGTTCAATAACATTGCCACTCAAAAGAAGAAAACTG
GCGTTATTGCACCCAAGAAATTTGTAACCCGACTACGAAAAGAAAATGGT
AATCTTCAATTCATTTCAGTCAACATACATTTAAAacatataagaaccag
taaattttgactGTGACTCGCCTATTATAACACATTTCCACCACTTTGAT
TCCTCTTGGCAAGTGGcgaaatttactcattttcccCTAACGGAATTATT
TTAAGGAAATGTTCTTTAGTTCTTAGTTACGTAATCCTGTCATATACAAA
ATGGATTTGACCTTTCTTTCAGAGCTCTTCGACAATTACATGCAACAAGA
TGCACATGAATTCTTGAATTACCTTCTCAACACCATCGCTGAAATATTAC
AAGGTCCGTCTTTTATTAATTTGGCATGGGAAAATTTGCTAAGGGTCAAa
atgttttctgaatttttgacTTCTGTGAAACGTACTTCACCCTTATAGAA
GAGCTAAGAATTCCATGTCTCAGAATAAGAACCCAACTCTCTTTACACGC
TCCACCCTAATCCAACGATCCAATCCTTCAAAGAAACCTCCAACCCCTTc
gtcttcttttcttctttacttTACCCTCTAGATAGGGATTCATGCTTAGC
TCGCTTTTTTCCAGGTGAGAAGCAGCGTGAAAAGGAGAAGGATCGCGAAA
GAATGGGTAGCGTGAGTAGTGTGAGCAGTAAAACAAGCGCTAGCTCAGGT
TATTCATCAGCTACCATGCACTCGACATTTAAGACACCTCCTGAACCGAC
TTGGGTGCATGATATCTTTGAAGGGACGCTCACCAATGAAACAAGATGTC
TTTGCTGTGAAACCGTATGttgagagtttttttttttaacacgtGTCTAA
GTACGTTATAATTGAAAACTTGGAATACAAATGTTGACACAcggataaaa
aataaataagttttttttctccattagGTGAGCAGCAAAGATGAATCGTT
TTTGGATATCTCAGTTGATGTAGAGCAAAACACCTCCATTACATACTGTC
TCAAGTTTGTATTCCATTCTATTCATTCGTGAAATCCTCAGAAATCCTTA
AACCTTCGGGAATGGATGCATAATATGCACATTAAAAGACTACAATTTGT
CATAAAAATTAGATTTGCCTCTTGCATTCTTAAATTAAATTTATCCCCGG
ATCGAATGGCATGCATCtgctattaaaaaaaaaatatttcttttcagaaa
CTTTTCGTGCACAGAGACGCTGTGTAGCGAACAGAAATATTTTTGCGAAA
CTTGTGGAAGCAAACAAGAGGCTCAAAAGAGGTATAGAGATTTGTCATTC
ACTATTTGGCGCTGCCGATTTTTTGAGAAGAAGTTTACCACAACTAATAT
GTATACTCCATGGTTAAAAAGATGAACTTTCTGCCCACCACTCTTTCTTA
TTCCATTCACAGGATGATGGTGAAAAAGTTGCCACAAATTCTTGCGTTGC
ATTTGAAACGATTCAAATATGTGGAACAGCAACAAAGATACACAAAACTC
TCACATCGGGTCACTTTCCCATTGCAACTACGTCTCTTCAACACTGTAAG
TCTACTGTGATTGtctgattaaatttttttgttctaGAAACGTTGGTCAC
TTGTCTGACTTTTTCCCCTCGACAAGCTTCTGCAGAACTTTAAAACCGAA
GcgtttattttatttcaatgtttttttcgtttttttagtCGGACGATGCA
ATCAACCACGATCGTTTGTATGATTTGGTGGCCGTCGTTGTGCACTGTGG
AAGGTTTGTTCATTCTGAATAAATATTGGGGAGAAGAATGCCCAAAGACC
TTCTAACTAGGCGATGTCAAACGAACACTTTCCAACTGattcgattactg
ttcgattatATCTATTGTTCGATTGTGTTCGGTTAATTCGATAGAATTCG
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CCACAAGAACGCTAGAGTTTTTGTCTACTTTTGACTCGATCAATCTATGT
TGTAAAATTGTAATTCAATCCTTTGGAAACAAGTAGACACAAAGGAGTGA
TTGCAAAAAGTCAGATTGTTTTCAATGTTAGCGGAATTCAGTTTAAAGTA
ACGATAGCCTTAATTTCTTTTACAGTGGTCCAAATCGTGGTCATTACATA
GCAATCGTTAAAAGTCATGGCTTCTGGCTACTTTTTGATGACGACATTGT
GGAAGTAAGCAATGACTCTTTCATTCGAATCTCTTATTGTTGTTAGTGAT
TTTTTACTGTAGCGTTAAATTCATGTGTACAGTtgaccctctctaattcg
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GTTTGACCTCTCTGAGTTTTTTGCATCGACGACAAGATTATCTTTTAATT
ATGGAACGTTAGTAGATCTGTCTAAACTAAATGGTTAAGCTCAGGACAAA
AGTAGGCTGGATTGGTGGTCTGCGAATGTTTTTTGGTAGCGCTGCATTTG
CATGACTTCAGGTACCCACAGTAGCTTTCAATgcaaatttttcttaattt
cagAAAATCGAATCACATTCATTAGAGGACTTTTTCGGGCTGACCACGGA
TGTACAAAAGAATTCCGAATGTGGATATATTTTGTTCTATGAATCACGGA
AAGTGTGAACACAGATGCATAAACATTCTTGCACAGCGCTAGTCGCTACA
TTTACTAAAGCTCCATGTGAAAGCCTGGAAATGAATGTACAATACAAACT
TGATGTGTGATGACTGTCCACACTGAAAGAAATTATGATTGAAACCGATG
AGGGATTTGAAATGAATTCCGAAGAGAATGGAATCAAAGATCGAAAACAa
ttcaataaaaacttttctctGCTTTTGTAAAGTCTCTTTTTAATTCAGTA
AAACAATTCGAGCTTTCGTAGGTTcgcacgcttttttataaaaataattt
cagacaAAACCTAACGGCAAATTCGGGCAATTGTGGCTTCATATTTCAAG
AGATGACAGAGAGAATAATGacctgttcttataaaaaagcgtggaCTTTC
AAACattgtaaataaaaaatgagtACGTAGTATCTAGGAGACGGGAACAG
GTGGTGAGCCACAATCACTGGTTGCCAAGATACCATGtatgaaaattata
tatttatAAACTGATGCAATTCAAAGAATAATGTTACGTTTTTACAAAAA
CCATTCTTTCTTTCttagatattttgaaattgtattcaCTCTAACATGCT
ATTGAGCACTGTGTTAATGCC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000082 | supercontig | sc0000082:483431..503101 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| USP46 | ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46 isoform 1 | Homo Sapiens |
| USP12 | ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12 | Homo Sapiens |
|
