XLOC_003961 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003961
Unique NameXLOC_003961
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000073:546825..586360-

Legend: gene
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>XLOC_003961 ID=XLOC_003961|Name=XLOC_003961|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=39536bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000073:546825..586360- (Clytia hemisphaerica)
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ATCTCATCTCATCTTCAAATTTCTTCTTTTTTCTCTACTCATCAATTATT GATGACTCAGCAAAAAACGCTGTTTTAGAAGTGGGGAGAATTCTTTGGAC TTTTAATAAATGATGATGGATGGATGGATGGATGGATGGACAACTCGAGA GGATAGATATGCGTTGATGATGGAGAGCTTTCTTTTCAATTCTTCATTTC TCTTCTTCTTTTGAGATAAAAAAAGCTCTTTTCTCTTCTAATAAAACTCA CTGCGTGATCTTTTAAAAGGCTTCAGAGAGGAGATGACATGAAACATTCA TTGACTTTTATCATTCTCCGGCAGATGGCTGTCTTTCTTTGAACGCCTCT TTTTCAGTTCGCAATGCTTCTTAGAATCTTACTGTATCATGCATTTTTGA AGACCAATCGGTGTGTTTTACGGATAGGAAACTGTTGATTTAGATTGATC GTTGCAGCCCTTTGTTGATCGTTTGCTTTCTGGCGACTAGTGAGACTTAC CTTAGAAAAGTTTCTTTGGAGCAGCCGTGTTAACTTTTGGTCCAATACTT GATTATTTTTCCATGTTGAAGTGACTTCATAGCGAGTTTATGTACGTGTG TTTTCCTGTGACGGAGAGGGTTTAGATTTAGCTTCTGAGTTGTCTAGGTC TTGATCAACTAAGGACGACGGTAAATCAGCACTTTTACCGTCCTCGATTT TGTGGGTCAAAACTGCGGGTTATTCCAAATCGCTTTAGAATTTTTACCGT CCTCAAAGTGCAAATACATAAACTCGCTATTCATCGGTTAGACTTTCTTT ACAATAAGAAATTAGAGAAGAGAAGACATCCATTCATACACAATGATCAC GAATTTCGGGTTGAGTCCTTCCAAAGTGATCCACCCGGTCACCTCCATGC AAAACATCATCGGGCAATGGCAAGAGGATGACAGCGGAGAAAATAAACCC AAAATATGTATCATTTACATGTATGCTAACAATAAGGTACTTGTCGCGAT GGCTTCTTGCAAGTGCATTACAGTGGAGCCTCTTTAACCCGAACCTCTGT AACTCTATTCTTAATTCGAACAGGTTTTCTTGTTTTTTTTTTCAGTTAAC TTACTCCATAACTCAAATTTACCTTATCTGAAGTAAATTTGTGTTCCCCG TATGGGTTTGAATATCTTCGACGCTTATTGCACCTCTAACCATTACATAT TCCGGGGGTCATTGTTTGCATTGATGGCTATACAATTTATTAGCCTGACG AAATTATTTGGTTCACAAAACACACAAAATCAAATTGAATCATCTGTTCT TCCCTGGGTGAAATTTTCAAGATTGTCTCTTTTATTACACTGTTTCTTAA GCCGTTCCTTGATCAAATTCCCTTTCATTTTCTAGCAACGCGAGCGGGAA CTAGCGGAACTACATAAAGAACGAGAGAGAAGAGAAGAGTTGGAACGACT TCTTTTACACNTTACACAAAGAGCGGGAGAGAAGAGAAGAGTTGGAACGG CTTCTCTTACACGAACGAGCGCAAGAAAACGTCCTCGAACGAACGCTGAA TCAAGAGAAAGAAAAATTCACGACGCTGGAACGAAGTCTTGCGGAAGAGC GTTCCAAACGAATGGAAACGGAGAAAAGGTTTGATATTTTTTTTAATGAT TCTTACTTATTCAATCTTACTATGTTACAGTACTGATAGCACTGGAGTAG GCGCTTAAAACACACAACCGAAATTTTGTTTTATTCAAGTGCAAAATCAT CATTCATAACAAGTTTAAAAAAGGCGTAAGAGGGCTCACTTTGCATACAC ATTTTGTAACTGCCAGCCGAAATCTTTAGCAAACTCAGTTGAAATCTGGC GTCAATAAAACTGCATGTATTGGTCACAGATATTGTCAAATTTTAGCCTG CTATCTGCTCGGAGACCTGTCCCAGTCCACATCATTGTCATGTTTGAAAA TTGAAAAGTAGCAGATTAAGCGTTGTAACTAACTATCACAGTCAAGCCTT TTGTGCAGTCCGTTTTTAATAGACCTTTTCATAAATTACGTTACGAACAT CACTTGCCTCGTTTTGAAATTATTGCCATGATGATTAACTCCCAGCAGTT TTCATTAAAACTACTTTCTATTCATAATAAAATCATTTTTTTCTCAAGGG ACATAATAACCATGGTAATTGTTTGAATACCAGGGAAGTGATGTTCGTGA CGTAATTTATGAAAAGGCCTATTGAATAACGGTTCTTTCTTTTGCTTTGT TTCAGATTACAAGAAGAAGAGACGAGGAATCGAACGCTAGAACATAAACG CGGTGGCGGTGATACGCGAAGTAACGGTGCAATGAGCGGTAACGGAACTC TCAAACGGCGTGTCCCTTCATACGTAAGAAATCTTCCGATTCTTCCATGG AAGAGTTTTAGGTTTCTCAGTCATTGTGCATTTTGCGATACTGAAACTTT GTCGAAATAGTTCATCGCTGATATTTTTGTTGTTTCTATTGTGTCAAATC ATAACAATAGGTATGAGGGTGTTCCAGGAATTTTGGTTACCTTCTCAGTC GTTCGCTGCTTTGTTTTAAGCTATTGATTATCCTGGAGTTTTAATTTTAT GCTCACATTTTAAAGAAAGGAAAGGGTCTCGAAAGGATGTTTTTCTATTC CGATTATTTTCTTCTATTGCAGACACTATCGATCCGTTCCGGTCAATCGG GAAATTCGGAAGAAGTCAACCTCCTCCATCACGTTGTAGCAGCGGGACAC GTCATTGAAAATTGTCCGGCCGTCAAAATCAACCGCTACTCGTGTAGAGG GTATCTCTTGAAGATGGGAAAATCACGGCTCAAAGTTTCCTGGAATAAAA GGTGGTTCGTGTTCGATCGGAAATTACGCGCGCTTTTATATTACCAAGAT GAACGAAAGACAAAATCGAAAGGCATTTTATATTTTCAATCTATACAAGA AGTTTACGTGGACAGTAGCATTAAGAAAAGCCCGAACTCTAAGACGACTT TTTGCGTGAGGACGCCTCAAAGGAACTTTTATCTTTCTGCACCTTCTCCT ATTGCCATGAGCATTTGGATTGACGTCATTTGTACCGGCAAAGAAGGTGC TTTCACTAGTATGACCTTATAAGGAGGTTGGATATCCGTATAAGGAGTGT TCGGTTGATTATGTGTGTCCACCTTAACAGAGTGTGACTGGTTTGGTCGA TGACCTTAAAGTGTCACCTGTTTTACATCTGGTGGAATTGGATAAACCTT GGTTGACAACCCTGGGCCGAAGTCCGTAGAAGCGCTTGCTTGGGAAACAG TTGTAAAGAACATCACTCCCAGAGATGATTATAAGATGGCTATTGAACAA AAGGAAATTATGCGATGTTAAATGTTTGGAGTGATAATGTTAGAGCAACC TATGGTCGCTAACATGATAATTAGTTAAAAGGCCGGATGCGTGTATGACT GGTTGCAATTTTGTCGTCATGTGCGACATATAGCTCTGTTTTAATTTAGC AATAAATTTTCTGGATCTGGAGATTCGCAATAATTTCATCTCGCCGAAGA AATCAGCCGAAAATTTGTGTACCCGTAAACGACAAAAAAGCATATTTACA GTTTTGAAATCTTTTGAAGAGTTTTATTTGCCCGAAAAGGGAAAATGCGT AATTAAATCTCGCAAAAATCAAGTAGCATAGAATAAAACTCCAAGTTAAA AATGTGAATGATATCAAAACCAAAAGTCTCTAAACCAAAAAGGCTGAAAT TCCTTTTAGTGAAGAAATGTTAGCTAATACATTAAATCTTTACTTTAGAT TTTTTATTTATAACTTTATTTATATTTTGAAAATCTTGAATTTTTTACAT TGCTTTCAACAATTGAAATTGTTAGTGTAGGTAACCTGTTGCGACTTTAA CCTAAGAGTGCCACTCTACGAGCTTCTTATCGCGCCATCCAGTCTATTAC AAAGCTTTAAGTGGACCCCGTCTCTAGAATATTTAACCCATTATTCTAAG CTGACTGAAACCGTGTCGACACTATTTTTTAGTGCAGAAAATGCATTTTT TTTAAATATCCACTCATCCTTCTTTCTCTCATCTTTGAATTTGTTTTGTT TTTTAAGAATTCTATATAAATCAATATTTTTTTGTCACAGTAACGTATTT TTTGCTATGTAAACCAACCATCACATGTGATTTTCCTCGAAGCACTCTCT ATGTGTGTGTGTGTGTTTGTAAATAGATCATTTTTTGTATTACCCATAAA CCCATCTTTTTGCAAAATGAAAATACCAAAACATAAGACGAATTCTTTTG TCTTTCAGACACAGTGAAGTTTTTTTAACTCGAAACTCGATAACTCAATA TCTCCTTAACTCGAACAAGCGTTATGTTCACTTCAG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007089TCONS_00007089Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007088TCONS_00007088Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007087TCONS_00007087Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007086TCONS_00007086Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007085TCONS_00007085Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007084TCONS_00007084Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00007083TCONS_00007083Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007089-proteinTCONS_00007089-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000073supercontigsc0000073:546825..586360 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
KIF16BPREDICTED: kinesin-like protein KIF16B isoform X5 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
8.43 7.05 3.32 2.49 25.2 19.93 15.93 16.54 9.65 17.8 9.98 9.49 24.44 22.42 14.49 14.1 26.36 22.85 39.12 40.54 27.16 25.2 20.1 23.99 30.76 28.97 59.55 52.72 82.43 76.86