TCONS_00007088 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00007088
Unique Name	TCONS_00007088
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5794

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000073:546825..586360-

transcript sequence

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AGCAAGTTATTTGATTTCAAATATCTCTTGGCTTCATTTCGTGGTCAATG
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aaatgacgtcattaacgCTCTGGCTGCGGATAATTATGGTTCCATCAATC
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CTCTCAACACTCTCAAATATGGAAATCTGGCAAGACTCATCAAAAATAAA
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AACAAAAGCTGCAGCGCGATCAAGAACTAATGAAACGGTTGACCGGTATA
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ATACCCATCAAAAGAGGCTTCACACGTGTTGGTTGTGGAGGAGATGGATA
CGAAGTGGATTTGTTGGTTCGTGGCAAGGGAATCACTAACGAACACTGTC
TAATCGAGTTCGACGGAGAAGCTGTTGTCTTGCATCCCAAGAATGAGCTT
TGTTCGGTGGACGGGGTACCTATATCCGAACCTACGCGACTTCCACAAGG
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AAGAAGGATTTACAATCGGAAAAGGAACAACTGGAACAGATGGAAAGACA
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CATTCGCTAGAAAACGAGCAAACAAACGCCATCGAACGAATCGAGTTAGA
GCGACAGAAACTGGTGACTACTCAAGAGAATGAGAAACAAAAACTAGAAA
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CAAAACGCTTTTGATGAGCAAGAAAAAGAACGCGCGAACATTGAGCGCGA
AAAAATGCGCTTGCTCGATCTCGAGGAGCAGCATAAGCGGGCGCTCGAAG
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AAGAGAACCTCCAACTGCAAGCTGAACGCCATAAACTCGTTAAAATGGAG
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GAGAGAGATTTTCGAACGCGAGAAACAAGAAGAGATCGCGCGCATCAAAG
AAGAGATGTCACGTGATagcatgacgtcatcatcacCCTCGTCACCAGTC
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GATTGAGCGATTTGCGTCGAATCGCATCGGAAAAAGCTGAACTGGAATGG
ATCGAGAAGAAACGAGATTTGGAACGTCGTGAGATCGAGGAGAAGGAGCT
GGAAAACAAACGAGAAATGTTGGAAAAGTTGAAGAAGGAACAAGAAGAGA
AAGCAGAACAAGAACGACAGGTCATCGCTCAACAAAccgaaaaaatgaaa
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ttcacgACGCTGGAACGAAGTCTTGCGGAAGAGCGTTCCAAACGAATGGA
AACGGAGAAAagATTACAAGAAGAAGAGACGAGGAATCGAACGCTAGAAC
ATAAACGCGGTGGCGGTGATACGCGAAGTAACGGTGCAATGAGCGGTAAC
GGAACTCTCAAACGGCGTGTCCCTTCATACACACTATCGATCCGTTCCGG
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TGTAGAGGGTATCTCTTGAAGATGGGAAAATCACGGCTCAAAGTTTCCTG
GAATAAAAGGTGGTTCGTGTTCGATCGGAAATTACGCGCGCTTTTATATT
ACCAAGATGAACGAAAGACAAAATCGAAAggcattttatattttcaatct
aTACAAGAAGTTTACGTGGACAGTAGCATTAAGAAAAGCCCGAACTCTAA
GACGACTTTTTGCGTGAGGACGCCTCAAAGGAACTTTTATCTTTCTGCAC
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GAAGGTGCTTTCACTAGTATGACCTTATAAGGAGGTTGGATATCCGTATA
AGGAGTGTTCGGTTGATTATGTGTGTCCACCTTAACAGAGTGTGACTGGT
TTGGTCGATGACCTTAAAGTGTCACCTGTTTTACATCTGGTGGAATTGGA
TAAACCTTGGTTGACAACCCTGGGCCGAAGTCCGTAGAAGCGCTTGCTTG
GGAAACAGTTGTAAAGAACATCACTCCCAGAGATGATTATAAGATGGCTA
TTGAACAAAAGGAAATTATGCGATGTTAAATGTTTGGAGTGATAATGTTA
GAGCAACCTATGGTCGCTAACATGATAATTAGTTAAAAGGCCGGATGCGT
GTATGACTGGTTGCAATTTTGTCGTCATGTGCGACATATAGCTCTGTTTT
AATTTAGCAATAAATTTTCTGGATCTGGAGATTCGCAATAATTTCATCTC
GCCGAAGAAATCAGCCGAAAATTTGTGTACCCGTAAACGACAAAAAAGCA
TATTTAcagttttgaaatcttttgaagaGTTTTATTTGCCCGAAAAGGGA
AAATGCGTAATTAAATCTCGCAAAAATCAAGTAGCATAGAATAAAACTCC
AAGTTAAAAATGTGAATGATATCAAAACCAAAAGTCTCTAAACCAAAAAG
GCTGAAATTCCTTTTAGTGAAGAAATGTTAGCTAATACATTAAATCTTta
ctttagattttttatttataactttatttatattttgaaaatcttgaatt
ttttacATTGCTTTCAACAATTGAAATTGTTAGTGTAGGTAACCTGTTGC
GACTTTAACCTAAGAGTGCCACTCTACGAGCTTCttatcgcgccatccag
tctattacaaagctttaagtggaccccgtcTCTAGAATATTTAACCCATT
ATTCTAAGCTGACTGAAACCGTGTCGACACTATTTTTTAGTGCagaaaat
gcattttttttaaatatccaCTCATCCTTCTTTCTCTCatctttgaattt
gttttgttttttaagaattctatataaatcaatatttttttgtcaCAGTA
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TTCTTTTGTCTTTCAGACACagtgaagtttttttaactcgaaactcGATA
ACTcaatatctccttaactcgaacaagcgTTATGTTCACTTCAG

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transcript from alignment at sc0000073:546825..586360-

Legend: exon

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>TCONS_00007088 ID=TCONS_00007088|Name=TCONS_00007088|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=39536bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000073:546825..586360- (Clytia hemisphaerica)
ATTCATCAAACAGCACTCACCGTTTGATATTATATCTGTTAAGGGAAGCA
AGCAAGTTATTTGATTTCAAATATCTCTTGGCTTCATTTCGTGGTCAATG
TGTTAACCGCTTCATGATTCTAATATTTCTTCTTCTTTTTATAGAATTCA
TAACACAAAATTCATATGAAAAACAAATACACATTGATGTTGTTTTAAAA
TTGTAAAAGAGACTTGAAATTTTTTAGTATAGTGATGGTTGCCCAAAGAT
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GAACGAGGCGTTCAAAATATTATACATACTGAGGAAAATGAAGTCAAAAT
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AAAGAAGTTATTAACTATAAATATGGAAAAAAAATTTTGACCTTTTTATA
TCGATACTGATCCCCAAACTAGTCAAGACCTGAATCTGTTTTTTGTTAGT
TACTACTATGCCTTCCATCACTCGATAAAGATTTTTTTTAATAAAAGTTT
TATCACAGGGTAATAATTTATATGAGTAACCTTTGTTCCTTTTTATTCTA
CAGCCCTTCAATTTTGAGGCCCATGATGGTGTGAGTTCAAGTTTGAAAGA
GGTAAGATTTTCATTATGGAAACTAGTTGTTGTTGTGTTTTCTCTTAGAT
GGTGTTATGACCTTTGTGGTCTTTCATTAACCTTCCGAAATATTTGATTT
TCATGTTTGTATATCTTTTACTCTATCAGAATTTAAAATAAGATTTCTCT
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TTTTATCACACGCCGTTAAACCGAAAAATGTTAAAGGTTAAACCCATTAT
TTTATGATACTTTATGATATATTCCTTAAACCCTTACCTTAGAATACTAT
TTTTTCGGTGCAGAAGAGGAAAATACATTTTTCTTGTTATGAATGAGTAC
ATTTCCTGTCTCGTGTCTTAAATTTCATTTCACAAAAAAAATGTAAACAA
AATTTCTCACAGTGAATGACAGCGTCCAGCAGATCTGTCTTAATACCTTG
TCATAGAGAACAATTTTATCAATATTTTTTGCCCCCATGAAAGAGTTTTA
AGTCAAAGGAAAAGTTTTAACTGATTTAAAATTCCAAAAAATTATTTTGT
TGTGTGAGGCAGAAATAATGCTTTTGTATTATACTCTCTTGTCACTACAA
AAACACTTCATCACACATGCCACATTCCTTCGTAACAACATTTAGTTTAA
ATGATGTTTGTTTGTTTTACAAGTTACGTAAGATACATCTTCATGTTTAC
CCTTTATTGAAGTCATTGCATTTTTCAGGGAAGTGGATAAGGAAAATAGT
CCTCGGCTAAATTTCAAAACGTAGCCCCCACCTTCACAAAGCACAAAGCA
AGCAAATTCCCAATAGATGATTTTTTTAAGAGGGGTCAAACCTTCCCCAC
AGCATAGATTTTTAACATAATAAGCTCTGCCCCCAGTTCTATTACTCAAC
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ATAACGGCTGAACTATGAAATATGACCCAGTAAACTTGAAAGGCTACTGG
TATACTCAGGCTGATTAATGAAAGATATCGTTGTAAATCAATTAAATCCT
TGCGTTCATAGGTTTGTAGCAACCTTGGGAACACTATCATAGACCAAGCA
TTTGCAGGGTACAATACAACTTTATTTACATACGGAGCCAAAGGGAGCGG
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TCATACTCAACAATTTGTTCGCTGCTGCAGATCAGTGTGATTCTGATACC
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GTTCGCTGCTGCAGATCAGTGTGATTCTGATACCTCCTTCAGATGTGAAA
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GTAGAGGCATTACCTTACACAAATCGAATGTTTACTTCCATAATGGCGGA
AATTACGTAACTTAACAACACATGAAAAACCTCTATATGTGAAGAAATTC
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GTTACCCCAGATTTGATAGCGCTTTATATGGCATGGATAGCTTGTTGAAC
GAGGTTTATCTCTCGTCGTACTAAATGTGATGCTTTCCATTACGAATATA
AAAAGATTGATTCTTTCCTACAATCAAACCTCTGTGTAAAGAATGAGATT
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CAATGGACTAAGTATAAACTTCCTTGGTATGTTTTTTTCTTCGTCCTTCA
GTTTCTTCGAATTGTGTGGGGACACGATATCTGATCTTGTATCGAAAAGA
CAACATCGAAAATCACAAGAGGGAATTGTCAAACTAAAAGGTATGCACCT
GACTTTATAATGTTTTTCCCGTATGGTTTCGAATCGAATCGAATTGAATT
GTTGCTTCTTCTTTGTCACACGCTCTGCACTTTAAAGCCCCGATTCGTAT
TTATAGATATGTGTTGTTAGGTAAAATATCGCGATATTTTCTTTCAGTGC
ACGAAGATTCTCGTAATATCGCGATATTTTCTTTAAGTGACGAAGATTCT
CGTAATATCGCGATCTTTTTCTTTCAGTACGTGAAGATTCTCAGAAAGGA
ATATACGTCGACAAATTGAGCCGTCATATAGTGACGGATGTCGAAGATGC
CACCAAATTATACGACAAAGGCGTCAAAAGCAGGTATGGCGAACTTAGCT
CTCTTAAATGTAGAGAGATTGATGCGTATGCGTGTGTTATATAGTTTTGT
GAAAATGTAGTGTAAATAAGCAAATAATAAGGAAATCTTGAACTTGGTGT
ATAATAAAAGAAAGAAGACATTACAATAAATCAATAATCAAACTTCTAAT
TCCCGTTATTCGAACAGCTATTTGAAATGACGTGGATAATCATCGATACG
TCATCCTAATATCAAACTTTATGTTTTCAAACTGATTCGAGTCTAGTCTG
TTAAAACATTATAAATATATCCTTAGAAATCGCCTGGCGACATTGGACCC
CGACTCCAAAGGGACATCTCATACCATCTTCAGTATTAACTTCACACAGG
CTCGTCTCAAAGACGGTCTACCAATGGAGTTGGTCAGCAAAATTAACATC
ATTGATCTTGGAAGCCGTGATGGGTATCAAGGCAATTTTGGGGTGAATCT
TGTCATAAATCTTTCTGATATTTTAGCTATAAAATGATTTTCTCTAACGT
TATAGATAGATAGAGTCGATATTTTACGTGGATAACCCAGTAATCTAGGA
CTTTTAGACAGTCTTTCGATTGTTTTTCACGGGGTCCACGGCTAGCCGGA
TCGGTTATCTATGAACTGAACGACACATTGGAGTGGGGATTCGGACTGCA
AATCCCTGGTTTGAAACGTTGGCGTTTTTGATCATTTGGCCATCGCTCCT
TAATTTATTAACTTGAATCATCACTATACTACTTGTCCTAGAACATCACG
TTTTCTCCGGATTTTCTCTCTCAGTACAGAAGGATGCAGCCTAGTAAATA
ATTCTCCTGTCTTTCATAAAGTATTGAAAAAACAGTTGATGTTGACTCTA
GAACTATCATTTTGTGTGAAGCCACAAGTTTGTGCACTCGTATCTTAGAA
TCTTATAATTTCCAGTCACCTGTTTTTAGTCCCCAAACAGCTGGTGATTT
CGTGGAATTTCATTATCTGACCGTTCGATTTCTTCATTTTGCAGTTAAAC
GGTTTCCAAAACGGGAAGATGCCGACAGATCAAGAGCTTTTGGATGAAGA
CGAAAAGAAAGGGCCTTTAGAAGCTCTAAATGACGTCATTAACGCTCTGG
CTGCGGATAATTATGGTTCCATCAATCCGATGAGAAGTTATGGAAGCATG
AATCCCTCATCTAATGTCCCTTACGACTCATCGGTAAGGCTTGTAGAGAT
TCCGTTATTGTCGTGATTTTGGAACGTTGAGAGCCTGCTGCTTTAGATTT
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AAGGTTGATCAAGGAAAATTGAACGAGATTTTCTGTTTAGTGAGATTAAA
GATACGGCACTTTCTCTGTATCAACAACCTGCACCAGTCTGAAAACTGAA
GTTCTCCATAGCTCTTATTGATCTTTCCACTTGTGGTTTATTTCAGAACT
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CTTTGTTGTATCTCACCAGCTGAAAGAGCACTCCGTGATACTCTCAACAC
TCTCAAATATGGAAATCTGGCAAGACTCATCAAAAATAAACCGACGCTGA
ATGAGGTATACCTTATCGGCCAAAACTTAGTCGGCCTTGATTTTAGTCGG
CCTTGATTTTAGTCGGCCTTAATTTTAGTCGGCCTTAATTTTAGTCAGCC
TTAATTTTAGTCAGCCTTAATATTAGTCGGCCTTAATTATTAATCGGCCC
TAATTTTAGTCACCTTGTCAAAATTTCGTCACTAAGGGCCGACTAATAAT
TAAGACCGACTAAAAATTTTCAATTATTATATCTTCGTAAATTCTTTGTT
AAAGTAATACCGATGTGAAAAGTGGGTTAAGGAAAGCTTAATATTAATAA
ACTTTTAATTGGCAGTCGGCCCTAATTTTAGTCACCAAGCCAAAATTTAC
AATTAGGGCCGACTAAGTTTTGGCCGATAAGGTAGTAAACTATCAAATTT
ACTCACTGACCTTTATATACACTGGACCAACTTTCTCAATCTCGGCCAAG
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TACTCAATAGAGGTGTAAATGCATCGAGAGCGCGAGATGATGTAGCGCCG
TTGAACGTTAGTTTTTAACACTGCAATGGCTTTTTTACGGGTACCAATTC
AAAAAAAATTCGATCAAAGAGGGTGGTTATAGCTTGGTCCAGGGTTTATA
AAGGTCAGTGAATTTACTTCATAAGATAATCGGGATTTGAAACCCATTAT
AAAGGTCGTTTTGACGCCGCAAGAAAGTTGACCATCTCCTTTACTAGCGA
GTTATCTACCATTTTGCGGACGGAGCGAAGGAGTGACTGAAAAGGTTTGG
AATAACCCGCAGTTCTGACCCGCAAATTAGATGGCGGTGAAAGTGCTGAT
TTACGATAACGGCCCCAGTCAGTCAGGATCTCTATAAATTAATAACTTAC
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GAAATATTGTATTACTTATCTGAAAGCAAAATGGTTTGTACAGAGTGAAG
TACACAATTTAAAGATCTTTTCTCACTGGTATGTTTTCTTCGCACATATG
CAGACTGATCAAAGACTTCCCTGTAGATATTGTCAATCTCAACTTTAAGT
ATTATTCCGCTTTAGGATCAGAACGTGAAGTTGATTCGAGAACTGAAGAA
CGAAATTGATACACTGAAGAACAGCAATACGGTAAAATAGATTTTCTATG
CAGCAAAGTATTTGCGGAAAGCTAACTGTACAGCACACAGTAGTTTTCAA
TGTTCTTACATCTTAGCCCGGAGAGTTAAATTGGGAATGATTTGAGAGCT
TTGTAGTCTCAAAATTGATTTTCTACTTTGACAACTATATGCTATTCTCT
AAAATACTTGGAGGGCATCTAAATAAATGTCCTAGTTTAAAAGTTAAGTC
GTGCAAAAGCTCATAAAATACCTGTTTCACACCAGTTCGTTCATCACAAG
AGACATAAAATTTACCATATGTCAGTACCACATACAAATTATTGAAGCCA
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ATATCTTGTCCATTGAATACATAGGCTCTATTTTAAAGGTGAAGTCTATT
AAACTTCCGCCACGGTATTTAAAACATATCCTTTAATAAGTTATAGTCCC
TTTTTCTCAATAAAGAATTGTCTGTGGGAGTTGGTTACCTAGGCATTTTT
GATATCATTCCTTAACTGTCTACACGACCCAAGTAAATAAACATGAATTT
ATGTTCGTATGATACGAGCAATTTTCTATTGGGGTTTCTTATCGATGGAG
TATTGCAAAAAATCTTGTTTTTAGGGGTTTGTTGTGTAATACATGAGAAT
TTTGAAGAGATGAAGAAGAGTTGGAGTTTCTTGTACGTGTTTTTGGATTT
TTTGGTTGGGGTAAATTGAGAAACTTTTTCCGGGAAGATTGAATTCACTT
CATGGTTAAGTTGGGAGTGTTGTTTTATACTGCGTAGAACTGACAGAGGC
TGTTGTATTCAACTTTATTTACTGGATAACACATCGTTAAAAACGCAAAA
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AAATTGACTGAATGGACTTTTAACACAATTCGGTATGAGTTTGAATAGAT
ACCGAATCAATGATCGGAGACCGTCCTTGTTTTACTATCACTGTATGCTA
GCAGCCGATGAGAAAAGACGACAGAATTACCATAAAGCAGTGAGTAAATT
TTACACGGATATCTTAAACAACACTAGATAGGGCTCCCTTCACAACCCAC
GAACAGGTGAAGCAAGGAATAATAATGCGCCATCTTGCGCCAGCTAAAAA
TAGGCAACAGTTCGATCAAAAGCATTCTCTCGCTTCCTCGATTCTGACCA
TCCTACTTATCCATTTTAATCCAACAAATATTGCCGATACAACTTTATAA
AGGAAAGCAAGCGCGTATTTATGCTTCACCCAGGGTTAGAGAGGCTCCGT
CTAGTGTTCGATGTAAGACATCTGTGATATTGTTACGTCATATTTTTTCA
ACCAATTACCTTGCTATGTTTGAACTGTGTTTCACATGGAGAGTACCTAA
TGTCCATCTATTTCCATCTCACCGTCATTAAGGGACGTCTTCCCGTCTCT
ATTCTAATGAAAGAGTGCTTCTTTGATGAAATAATTCACTTGTATTTTTA
AGTGTATTAAATGAAAAAGGTTTCGTTGAATTAAATTGTTATGGTTATAG
ATGTCGCTTTTGTTTCGTTGAGTGAAATGGCTGGAGCTCAAACAGATTTA
TGGTTCTTTTTTTACCATTTTTAACGTTGCTGGCTTACAGTTCTTATTTT
GTACTACTCGTTATCTCGTGGGTTTTTTTCGCTCGTTTATTAATTGGCAA
AAGTTGCTAGTGTTAGTGAACTGTNTAACACAATTCGGTATGAGTTTGAA
TAGATACCGAATCAATGATCGGAGACCGTCCTTGTTTTACTATCACTGTA
TGCTAGCAGCCGATGAGAAAAGACGACAGAATTACCATAAAGCAGTGAGT
AAATTTTACACGGATATCTTAAACAACACTAGATAGGGCTCCCTTCACAA
CCCACGAACAGGTGAAGCAAGGAATAATAATGCGCCATCTTGCGCCAGCT
AAAAATAGGCAACAGTTCGATCAAAAGCATTCTCTCGCTTCCTCGATTCT
GACCATCCTACTTATCCATTTTAATCCAACAAATATTGCCGATACAACTT
TATAAAGGAAAGCAAGCGCGTATTTATGCTTCACCCAGGGTTAGAGAGGC
TCCGTCTAGTGTTCGATGTAAGACATCTGTGATATTGTTACGTCATATTT
TTTCAACCAATTACCTTGCTATGTTTGAACTGTGTTTCACATGGAGAGTA
CCTAATGTCCATCTATTTCCATCTCACCGTCATTAAGGGACGTCTTCCCG
TCTCTATTCTAATGAAAGAGTGCTTCTTTGATGAAATAATTCACTTGTAT
TTTTAAGTGTATTAAATGAAAAAGGTTTCGTTGAATTAAATTGTTATGGT
TATAGATGTCGCTTTTGTTTCGTTGAGTGAAATGGCTGGAGCTCAAACAG
ATTTATGGTTCTTTTTTTACCATTTTTAACGTTGCTTGCTTACAGTTCTT
ATTTTGTACTACTCGTTATCTCGTGGGTTTTTTTCGCTCGTTTATTAATT
GGCAAAAGTTGCTAGTGTTAGTGAACTGTAAACTCGTCCTTAGATTAGTC
AAATCATCTCTTCACAAATATCCAATCTAGCAATGAATTTTAAGTTGACC
TATGTTGTTACCCTCCCCTTTTCAACCAAACTATGCTATACAATCTCAAT
CCGGAAATATCGTTTTGACGTCAAAAAGTATGTGAAAAATGTCGNGCGCC
AGCTAAAAATAGGCAACAGTTCGATCAAAAGCATTCTCTCGCTTCCTCGA
TTCTGACCATCCTACTTATCCATTTTAATCCAACAAATATTGCCGATACA
ACTTTATAAAGGAAAGCAAGCGCGTATTTATGCTTCACCCAGGGTTAGAG
AGGCTCCGTCTAGTGTTCGATGTAAGACATCTGTGATATTGTTACGTCAT
ATTTTTTCAACCAATTACCTTGCTATGTTTGAACTGTGTTTCACATGGAG
AGTACCTAATGTCCATCTATTTCCATCTCACCGTCATTAAGGGACGTCTT
CCCGTCTCTATTCTAATGAAAGAGTGCTTCTTTGATGAAATAATTCACTT
GTATTTTTAAGTGTATTAAATGAAAAAGGTTTCGTTGAATTAAATTGTTA
TGGTTATAGATGTCGCTTTTGTTTCGTTGAGTGAAATGGCTGGAGCTCAA
ACAGATTTATGGTTCTTTTTTTACCATTTTTAACGTTGCTTGCTTACAGT
TCTTATTTTGTACTACTCGTTATCTCGTGGGTTTTTTTCGCTCGTTTATT
AATTGGCAAAAGTTGCTAGTGTTAGTGAACTGTAAACTCGTCCTTAGATT
AGTCAAATCATCTCTTCACAAATATCCAATCTAGCAATGAATTTTAAGTT
GACCTATGTTGTTACCCTCCCCTTTTCAACCAAACTATGCTATACAATCT
CAATCCGGAAATATCGTTTTGACGTCAAAAAGTATGTGAAAAATGTCGTT
GTATTTTAAATCGCATCTCGGAGCTATTTGTTGATAAACTTCTTTTTATA
TTCTCTTTCCTTTATATGAAGATTAAACGCGAATAAATCACATAAGATCA
TTAAAGAATAATTGCCATCTAACATTAGAGTTGATTGTTAATGACTTAAA
CCGTGGTATTAACACGGATGTTAAGCTGGTGTCAGCTTCATTTATATCGG
TTTAATTTCTCTCACGCGAGAATGTATTTTGGCATTCTGTTGTATCTCAA
TCCTTCAAACATCTGGTTCAAACGGATTTAGATTCGAATGTTATTACTTG
CTGCTTTGTAAAGGAGTTTCTCAACTTAAGATTATTGGTAACACTGACTG
TTGGTATAAATCTCCATTCTGTGAAGGCTATCTCAGCGTTTTAAAAAGAA
TGAGCATCTATTAAGGAAAGACTCTTCAATGTTTTCATCGCGACTTTATC
CTGTTAAAGTGACATCAAGACTCTTCAATGTTTTCAATCCTGTTAAAGTG
ACGTCTGAATTGTCTTTGCAAGTAGTATGGTAGAGAAATGATGGCATCCA
TTTTCAGCTAATCGTTTGATCGCTAATTATTGAATGGAAAAATTCAATTT
CTCATGCAAAAAGACAGATGAAAGAAAGATTTTTACAAGAACCTCCCCAC
CTCTCGTTGAGTCAACTTTTCAAGTAGCTGAAAAATTTCGCGACAACACA
CGTATATCTTCTTCCTGAATAGGGGTTGACTTCATTGAACTTCAACTTGA
CTTCTTTAAAATCAAGATGTGTAACGAGATGGCATTACCACAAAAATGTG
CAAGTTACATCTCGACAGTCAATGTCTTCTTGAAGAGCTGGAAACGTAAA
CATCAAAGACTTGCTCAGCATTCCTCAACCATCATCGATGGAGACACGTC
AACGAAAATTACTGTATTCTTGAAGAAGTGGAATAAACTTCATCGTGAAC
TTATCCGTGAACCGTATTGTGCACAAGAGTTCATCAACAACGACCCGTTA
CTCACCAGTGCACTTTTTCTTGCTAGGTGGAAAGAGATTTGCCGTCAACT
GGTGCGAGAATCGCTTTGTTTTCAAGAATATTTAGAGAAATATTACCTGT
CAAAAGACTTTGCTTTTTCTAAGCGGTGGAAAGAGATGTACCGGGAGATC
GTACGGGAATCACTCTGTCTTCAGGTCTACCTTGACCGTGAGGGAGTTAT
TAACGAACACAATGAGGATGTGATGCAACCTGAAGTGGTTCTGAGTGAGA
ATTTTTTTAACGCCTGGATATTCGGTGGTGGACTTAAGATTGTGATTCCC
GATGAATCAACTCTCAAATATTGCCACTGTGTAAGTAATACCGTAAAAGT
GAACGCGATTCTTAGCTTGAACACTGTCTCGGTTTCATTTCGCCTACAAA
AAAAACATTCCCCCTTCTTGTCCTGTTATAGGAGATTCGTGTTCAACCAT
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TGACAAAACCGCATAATGAGAAAAGAGGACCTTACATTGCACTTTTGAAG
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CTTTCTCCATTCAACATCCCAGTGATGTATCAGCCAGTGTGGATAATATT
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ATTCTGCGAACATGTCTCAACGCTCGTTCGATTTAGTCGAGCAAAGAATC
ATCGATGAATCGAAAGTCAAAGAAATCGGAGAAGTTCTTGATTCGCAACT
TCACTCTTTAGAAACTCTTTTATCGACAAGTGCCCCTCCGCGACGTTCGA
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TTTTATAAGAACAAAGGGTCTAAGAGCATCAAAACCTTCTTATTAAATAT
AGACCGTCTAATATTTTCAAAGAATAAATAAGAATTACTTCTGATATACA
TGTTTTTTATAAGAATATCCAAAATTTTTGAAGCCGTGGATGATCTTAAC
TTTTTGGGTTTCAAGCCTAAAACTGTTCTTTATGTTCTTATTTTTCGCAT
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CTCGAAGCCTTTAAATGTTCCTAAGGTGTTTTTAAGATTTTGGCAACCGA
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GTTTTTCTTTCACTGGTATCTTACATTGTGTGGATTAAGTGACGCAGATA
AAATACTTTGACTTCTTGTGTTTCACTGCTTAATGATTCAGAAGAAGTAA
TTAACCGTTCTACCAATCAATTAATCAATTAGTATTTCCATTCGAAAAAT
ATGAATGCTCTTTCTCCATCAATAGTTTGGTTTTTTTCTCTCTTGTTAAA
TCATGGGAACATATTGATTACTTCAGATTTGACATAATTCTCCATATTAA
CCTGCAGTACTGCCATTGAGATTTTAGTCTTTGTGATTTTCATTTTTGTA
TGGGTATAATTTCTGATTGTATTTGTTTTCATTTTGTGAAGAAGAAATTT
AAAGATGGTGTTGACAGTTCATTTGGTTGGTTCATTTTCTCTTTTTTTGA
CGATCCCATTTTGTTGCTTATCTAGCATAGTGTTAAAAGATTTGTACTAG
TAATCTCATGGTTATAAGGGAAATTCGGGATAAATTTCCCGAGGTCAATT
TTGAAATTTTTTGAAATTTCCCGAGTGCAACGAGGGANNNNNNNNNNNNN
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NNNNTTCCAAACGATGAAAATTTCACTTTTGCGGGAAATTACAAAATCTA
GGAGGGAAATTACAAAAGCTAGGAGGGAAATTACAAGTTCGCAGGAAATT
ACAATTTAACGTAAGCAAAAACGTCAATCGAATTTCAATCAACCATGAGA
TTACATTTAGAATAATTCTTCTAGCGCTCAATAACTTTTAAATTACTCAA
ACCCATTTCTTTAAATCGTTTCTTTTTTGTCAAAATTCATTGATTTTCAG
TCAAAAAAGCTGAAAATTCACTCCATATTTTTTAGCATCAAACTCAGGTT
TTTCACTGTCCAATGTCATAGACTTCTAACAGCCTCAATAAATAATACTC
AGCATGCTTGAAAAACATTAGATTTTAAGAAATAGCTGTAATAAGGGTCA
ACTTAGCCCTTTAGAATTCCACTTTGAATCAATGCCATCTTTGAACAAAT
ATTTAACAAGAATATTTTTTGCAAAGGTGCGTCACGAGATGGGTAGACTA
GAGTCTACTTCTGACTGAACTTTGCTTTCTGATGGTGCTGAGTCCAGTAA
AGTAGACTAGAGGATATCGCCAAACTTTGAAAACAATCAATCCCTAGGTC
ACAATTCCCTGTTTGTTTTTCTCCAAAAAGGGACTGGATCTAGTGGCATG
GATTTGCTACCACCTCAAAAAATGGAGCATGCCAAATTACACCGTCCAGT
CTATCAAAAAGCGGCCCCAGACTACAAGATGGGTGACTGGCGGCAAAATT
AGGTTGTTAGTTACGTTTGCGGTAGCGCCCATTGTACTGTCCCTGTTGGC
AGTTCCTTTTTCGAGAGATAAGTCCCTGAAAGAGTTCTTTTTTTTTTCAG
TCCCATTCTCATATGCAGGGTCCACCACATTCGGTCGACAAGGGTAGCAC
CACCGTCCCGGCTTTAAAGCTCCATTCTCAATGGGAGCCAAAACAAGCGT
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TTTTGTTACTGGTGCCATTTCAAAATGATGATGATCGCCTTTTAATTTTG
ATTGGTGGATCGTGTTTATCCTTGTGGCCTCGTTGCGGTGAAAAGTCTTT
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TGGTGGATGAAGGTTTGAGTGTATGCAATAAAATCTGCAATGTAACAATT
GAGCTGACTTTTTGCGAAATTTGCATTTATTACTCAGATACTATCATTAT
GGACAAATCAGAATGTCTCTTTTTCTTGAATCACAATCTTCTGTTTTTGA
TTCCCCCTATTTTCAAGAAAGCCACAAAAGAGTTCGTTGTTAAGCAAAAT
TTTGTTTTACCTATGCATAATGAACTGGATTCATTTCCAGTTTTATGGGA
CCAATAAGAAAAGAGGCTCGTAATTTCTCCCTAATAGTCAATATCAAATG
ATTTCCGAACAATCTTCGAAATGACCTGTTGAGGCCTCGATACTTTATTA
CTTCATTTCTCACAGTAGTTAGGTGTAGAGTTTTATCTCCATGGCAATGG
AGTTAAATAAGCCATGCTATATATTTTACTTTTGGTTCAGTTTATCCTTC
ATGTAAATTAGATTAAGATTATTTTTAATGTTTGAAAGAGATCGTTAACT
TTTATGAACAAGAAATCTTTAGAATCCTTGTTTATCACGGACTTCTGTAA
AAGGAATTGAATCTTTAGTGACGAATACCGTTGTAAATCTGTAGTGTAGA
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AATTTCGTTGACCTCATTTTTGCCGATTTTATATACCGTTCTTATCATAA
AAAAACTTCTTCTTTTTGTTTTCTTTTTTCATCTTTGAAACTTTTTGAAA
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TAAGTATTTAAGGACAAGTATCAAGAAGCAGCGGCTGTTAATGCTCTTGG
AAAAGATTTGATGGGGGCCCCTAGTGGGTTGCGTGAATGCGTGAATGGGC
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GGGGGGGGGGCTCTTTGATCAATGAGTGCTCTCAAATTGACTCTTTTTGG
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CTTAAATTAAATTCTCAGCATTTCAAATAAAAAAGGCCATTTGCATTTTC
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TTCTCTTCTATTTGTAAAACACCGACTCCCTGACTCATTACATCACCAGA
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AATATTTTTCCAAACGTACCAAATATGCGGAAGTTTAAACCCTCAAGTCT
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CTTCGCGAAAGGGTTAATACCTTGCTCTTGTTGAATGCGTGCATTTGAAA
AGCTATATCTTAAACAACACACTGAAATCGGAGACTGAATTGCAATTTTT
TTAAGTACCTGAAGTATATTCTGTGCTTTCGATGTTTAATAAAACAGTGT
TTCGGTAGTTGCAGTAGAAGAGTATCATTTTCAGCGAGCGTTTCAGATCA
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CTGCCAAGTAAGAAATTACACGAGAAATTCGCGAAAGTTTCCTTCGCGAA
AAATGCATTTTTTTTGCTATTTTATACTCAGTTTCCAGTCTTTGTGCATT
TTTATCGCTTTTTTGCCGGCAAAATGAAATAATAACATTCTAAAATTAGC
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ATCTCATCTCATCTTCAAATTTCTTCTTTTTTCTCTACTCATCAATTATT
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000073	supercontig	sc0000073:546825..586360 -

Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00007088 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: KI16B (Kinesin-like protein KIF16B OS=Homo sapiens GN=KIF16B PE=1 SV=2)

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Query:  250 STVKVGICICPRTADEKERGVQNIIHTEENEVKIS------MGNGKGQK------SYEVDFEPFNFEAHDGVSSSLKEVCSNLGNTIIDQAFAGYNTTLFTYGAKGSGKTTVLFGNKEERGIISFILNNLFAAADQCD--SDTSFRCEISFFELCGDTISDLVSKRQHRKSQEGIVKLKVREDSQKGIYVDKLSRHIVTDVEDATKLYDKGVKSRNRLATLDPDSKGTSHTIFSINFTQARLKDGLPMELVSKINIIDLGSRDXXXXXXXXXXXXXXKMPTDQELLDEDEKKGPLEALNDVINALAADNYGSINPMRSYGSMNPSSNVPYDSSNLTLYMKESMGGNCETIMLCCISPAERALRDTLNTLKYGNLARLIKNKPTLNEDQNVKLIRELKNEIDTLK------------NSNTASDGKKQQKLQRDQELMKRLTGIWEDKWSKAQKMIQDKDLNLTDLGGVGVKLETKEPHFXXXXXXXXXXXXXIIPIKRGFTRVGCGGDGYEVDLLVRGKGITNEHCLIEFDGEAVVLHP-KNELCSVDGVPISEPTRLPQGCMVCIGQNNYFRFNHPKQAALIREQTK 1932
            ++VKV + + P    EK+   + II  E+++  I+       G G   +      +Y+  F   + ++ D VS  +  V   LG  ++  AF GYN  +F YG  GSGK+  + GN  + G+I  I   LF+  ++     + SFR E+S+ E+  + + DL+     R+       L+VRE  ++G YV+ LS+H+V +  D  +L D G  +R   AT   D    SH IF+I FTQA+    +P E VSKI+++DL   +                 T   L +       L  L +VI+ALA  +  + N +    +      VPY  S LT  +K+S+GGN +TIM+  ISPA+    +TL+TL+Y N A+ I NKPT+NED NVKLIREL+ EI  LK            +S TA     ++KLQ+++  ++ LT  W +KW++ Q +++++ L L    G+GV L+++ PH + +    LS G+ +  +K G T VG      E D+++ G  + +EHC+ E  G  V L P     CSV+GV I E T L QG ++ +G+ N FRFNHPK+AA +RE+ K
Sbjct:    2 ASVKVAVRVRPMNRREKDLEAKFIIQMEKSKTTITNLKIPEGGTGDSGRERTKTFTYDFSFYSADTKSPDYVSQEM--VFKTLGTDVVKSAFEGYNACVFAYGQTGSGKSYTMMGNSGDSGLIPRICEGLFSRINETTRWDEASFRTEVSYLEIYNERVRDLL-----RRKSSKTFNLRVREHPKEGPYVEDLSKHLVQNYGDVEELMDAGNINRTTAATGMNDVSSRSHAIFTIKFTQAKFDSEMPCETVSKIHLVDLAGSERADATG----------ATGVRLKEGGNINKSLVTLGNVISALADLSQDAANTL----AKKKQVFVPYRDSVLTWLLKDSLGGNSKTIMIATISPADVNYGETLSTLRYANRAKNIINKPTINEDANVKLIRELRAEIARLKTLLAQGNQIALLDSPTALS--MEEKLQQNEARVQELTKEWTNKWNETQNILKEQTLALRK-EGIGVVLDSELPHLIGIDDDLLSTGIILYHLKEGQTYVGRDDASTEQDIVLHGLDLESEHCIFENIGGTVTLIPLSGSQCSVNGVQIVEATHLNQGAVILLGRTNMFRFNHPKEAAKLREKRK 565

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00007088 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00007088 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
KI16B	4.166e-87	34.52	Kinesin-like protein KIF16B OS=Homo sapiens GN=KIF...	[more]

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TCONS_00007088 (transcript) - C. hemisphaerica