XLOC_003692 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_003692
Unique NameXLOC_003692
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000067:530271..537534-

Legend: gene
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>XLOC_003692 ID=XLOC_003692|Name=XLOC_003692|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7264bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000067:530271..537534- (Clytia hemisphaerica)
CCTGGCTATCAAAGGTGACATAAAAAGTAAGTTCAATTTTGCTTTAAATT TAAACTTTAATTGAAAAATTAAAAATTTAAAAAATCATATGTTATAATAT TTTGCAGCCATAATTTAATTGGTTCCCAAAATACTATTTATGAATATGTG TGGCAGTATAGAATTTAGACGGCTGTAAGTACAGTGTAAGGATCTAAATT TTAGAGGACTTAAAATTTGGGCCTCACAAACGGTCGCTTTCAGATAGTGT GTCCCTTGCAATCGGGTTTCGAGCCCCTGGTTTTTAGCTAAATACGTTGT TATATGCATCTCCATTTTGGGTTGATGCAGCCTAGTCACAACATAAGTAC CGTGTTTGTTTCTTTGTTTATGTAACCTATGCTTATTCGCTATTTTTTCG TCTGTTTATGTTTATGTTTCTTTCTGGTGGCGACCCCTTACTCATCACAA GTGGATTCTTTTAATACTTCCTGAACCCATAGTAAAAACTACTTGTCCAA AGGACCTTTCATGAAATTGTTAAGATGTATTGTATTGGATGAGTAAAGTA AATCTAATCAATACCCATGTTGCAATAGCCGAATTGCCCAAGAAAATATG AAATTGCAAAGGGAACGGCGGTTAGCACGTGGAAGGGGATATCTTGGGAA TCAGTAGGTACCGTGTGCCCAAAAGGGTTACACTTTTCACTCTTGAAGAT CTTTAGGAAAATAAATCAATCCCTGAAACGGTCCCAAAATCACAAAATTC GGAACTTGAAGTGTCGCGTTTTCGAAATATTTGGTCTAAAATCTTTCGAA AAATCTCTCGTCTCATAAATATCAAGATTTTTTGATCTTTTTACTCGGGT ATATCCGTCATCTATCAAGAAAGCTGATGAAATCTTCTTTTCCTTACCTG AAACTTGTCAAACAATCGAAACTATTATTTTGGCAACTGATGACACCGAT 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GGGAGTGCTTAGTTTTTCAAAGAAATAGAAAAGCTCTTATGGTGGTGACT TAAAACAAAATTTCTCGAAAAAGGCTAAAGACACATAACATTGATAGGCT TTTTGGTTGCGAAGGATAAACAGCAGTCTGATGAATCTTTTGGATAATTT CAATGATTATTTGTTATCACATCCATATGATCGCCTATCGGATTCAGAAG ATTCAATTTCAATTTACTTAGGGCAAGAATTGCTGGCGTGTAATAAATTA TCTAAAAGGCAAGTAAACATGATCATTCTTATTTTGCAGTTTTTAATTTT TAGCTCTATAAAAAAATGGTCATTGTTTTCAAAAGTTTCAAGAAATACCT TAAAGGAAATCATTTTTGCGAATTTTGTTGAATTTTGCTATAAAAAAAGT CTACCTCTCCAAAATAAGCCAAGTCAAAATTTTCTATTAAGGTTTATGAT TTTGTTATTTCTTCGATTCTTGTGAGATTTGGTTCCTATCTCGGCATTTT TGAACACATGACAGAATATTTTTTTATGACAACCCATGATCTCAGAATAT TTTCCACAACCCTTCAGCACAGGTGAAACACCGAACCGAGTGTACCCAAC AAACCATGGAAAACACATCACTACCATCACCACCAGTTGGCTTTCAAACT AAACAACAGGAAGATGCTTTTATAGTAGACTGTTCCAACATGATTTGGTT CTATCCGAATCATCCATCATACCAAATTTCACTTCGGTTGGCAATTTTCT TGAATACAATATTTTCCTTGTTATCAATTGTGGTGAATCTGAAGAATTGC CAACGTTTGTTAAGACACAAGGATGGAAAAGCACCTTCATCTAACATTGT CATCTTTTCAGGTGAGATATTGTTCATTCCCATGCCGAGGAAATAATTTC TACGTCCAGAGAATGCCTTCAAAAAAGCTTGCAAATCTAAGGGATTGAAT TTTTGTGAAAATATCCAGTTGGTGTCCAAAGTCGAACCCAGTTCCTTTAA TCACTTTTTTATGATTCTGGATAGCGCTCATTATTGTTCATCAGTAAAAT TAAAAAGTAGTGGCTCTGGGTACAAGATTGAATTAATGTTTTAAGAATAA GCTGAAATCTAGTGGAGAACTCTGAAAACTTTTTGGCAAAGAACCGAGAA TGTACCTCAGAAATTTCCCAGAAAACCATGATATTTCTTAAGTGACCCCT CAAATTGGGAGGTAATGTCTATTAAAATGAGTAATTTAAGTTTCTCAGAA AAATAAACGATACGGAGAACAGTTGTAGAATCAGACTTGAGAAAGGCGTA TCAAGTTTTTTTTAAAGAATGAATTATTGTTTTTCAGGTTGTGTGACGGA CATGGTAACAGCTTTCATGATCCTCACCGTATGGAATGTGCAATCCATAA TGGCGGTCAACCATCAATTCTCTTGTCCAGTCTCATTTTTCACTTATCTC ATTGTCATTGTTGCCGCCTTCATTATCTGCATGACAACCATATTATTGAT CGCTGACCGTTACCTGATCGTAACATGCCCTTTTCTTTACGAGGAACACA TTACGAAGAACGCCTCAACGTACGGGAAAATCATTGCTTATATTTTTATC ATCGCTTTGATCCTCTCTGGCATCGGATTCGCTATCTCACCCCAAGTCTT GTATTTCATCATTACTGTCCCCTATATCGGCTGTCTTCTATGGGCTGTTT TTGTATATCCTGCGTTATTCTATGAACGGTTTTATTTAACCACAACTTAC ACGTCCTACCAGTTAAAGGTTGGTTTACATGAACGACGAAATCACGAAAA ATTAACAAAGTGTAGCTGCTTACATTCTTTCATGACTGTTTTTCTTTTAT CTCCGCATCTAATTTTTACTTATGGCTGGTTTCAAAAGAATCAGCAGATT ACCTCCTTAATGTTCCATACAGCTTTGTTATGGAGTTGGGTGATGATTGC ATTGAAGCTTGTTATCTCCGCCATCTCATTTAGCTTTGGAATCGAAGGTC GAGGTTTTAAGTGGAAGATTTTTAAACGAAAGCTGAGTAAGAGACGAATT GATGACATTCAACTTAAGAAGCTAACAAATATTTGATGGAATTTCATGGT TAGTGGATAATTCATTATGCATGATGATTTTTCAAAGAGAAGGCTTTATT CACTGATTTGAGGGGGTGGTTCTCCGACCCTTACATCCAATGACCACTAA AACTAACCTCTGGTTAGTAAACACTTTTCCTTTTCTGCTGGTAATTAGCT GATAGACTAAACAACTGTTACAATTTGAACTGACGTCAATCCGCCAAAAC ATTAAATTATCTACCATGAATTTCAAAGCAGGAAAATATAAGGAGGAATT TTTGGTCAAACAAACGGGAGAGGAGATTGTACTTGTTAATATTTTAAGAA ATTTGAGAGAAGACAAAACATGGTGCTGGGTATCTGCGGATGGTAAGGGT AAGGGTTTATCACCTTTCAAAGTCTCTCTAAGAGTCGAAAAAATCAGGAA AATTTAAATTAGTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00006526TCONS_00006526Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006525TCONS_00006525Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006524TCONS_00006524Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00006523TCONS_00006523Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00006525-proteinTCONS_00006525-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000067supercontigsc0000067:530271..537534 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.14 0.16 0.06 0.03 2.2 2.03 0.52 1.04 0.46 0.4 0.82 0.35 1.46 1.01 0.16 0.39 1.18 1.46 1.88 1.26 1.08 1.1 0.51 0.84 1.3 2.1 0.04 0.12 0.12 0.34