XLOC_002706 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_002706
Unique NameXLOC_002706
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000048:282627..301578-

Legend: gene
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>XLOC_002706 ID=XLOC_002706|Name=XLOC_002706|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=18952bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048:282627..301578- (Clytia hemisphaerica)
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GGGTGTGTTTAACATTCATGACATTTGGCATATCATAATTGGTTGCAAAA TGGGGTAGTTTTGATATGTTTCATTTTGTTTAGCGCAGGTTTTCGTACAA CAAGGGATGGTTTTCCCTTAATACAGAGGTGAAATTCTTTTGGGAGTCAC TTAGGACAGAAAATTATTTTTTTCGATCATATCACCTCGTGGTATCCAAA GTTTCTATTGCATTTTAAAAATCTCTTTAAATTTTGCACTATTTTTTCCA TACCAATTTCTTGGAGAGTGGTTTCCATATGATCGATAAAATAATTGCAC CTTACGAGAGAATGGACACTTTTATGAGGATTTTACTTTTTATCGGCGAT CCAAAAAAAAACTGCAATCTGATTGGTTAAAAAGAGNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATATCTGCAATC TGATTGGTTAAAAAGAGTACAATATATCTTGTATTTTACATGTAAAAATA TAAATTGACGAAAAGATGTTGTTGCATTGTAGCGGTAACAGCAATCTAAC GTCACTTTGCTACATAGTGCCCTGCGTTTTTTTTTCAACACAAAAAGTGC ATTTTTTGGGTCACTGATAAATCAGTTATCAAACATTTGCTCGTACAATA TGGAAATATTTCACTCGTTTGCGGAACTCGTAAAATATTTCTCATATTGT ACTCGCAAATGTCCGATAACTATTACATATCAAAATTCATCTTCTGTATA TAACTTGTACAAAATTAGTTAATGATTTCTCTTTCATTCTTTACAGCTTG ACCACCGTACAGCAGGATGTCAAGTGAAACAAACAGTTGTCCATCACAAT GCCTAAAGCAGTCATCTAAACCAAATTACATTCTCCCACTTTACCATTTT TG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004787TCONS_00004787Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004786TCONS_00004786Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00004785TCONS_00004785Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00004785-proteinTCONS_00004785-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000048supercontigsc0000048:282627..301578 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
SLC9C1PREDICTED: sodium/hydrogen exchanger 10 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.01 0 0 0 0.06 0.01 0.01 0 0.02 0 0.06 0.02 0.01 0 0.01 0.01 0 0 0 0.01 0.01 0.03 0 0 0.83 0.71 0 0 0 0