XLOC_001995 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_001995
Unique NameXLOC_001995
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000030:818129..828605+

Legend: gene
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>XLOC_001995 ID=XLOC_001995|Name=XLOC_001995|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10477bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000030:818129..828605+ (Clytia hemisphaerica)
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TAATTCTGATTTAGCTGATTTTTGCCTTGAAACAAAGACCTATTGTTTTA
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TTACGCATTAGGATGCGAAAAGTTGACATAGAGGATTGACATTAAGAATC
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AGCTAACGGGATTCATAAGGAAAAAGTTTGCTGATGTTTCTattctttgg
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CGGATGtgtaaaaagttacaaaaaaacCTTCGGAGGTATCCGGCCAAGAA
CAAAAGACAGGGCAATTAGTATCTATTAACTGTTTTCGCTGAACAATCAA
CATTGTCGAATATTTTTCTCTAACTATGACTATAGGGGtatataagaaaa
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CTCTTATCCTTTGTTTAACACAGCATTTAAGTCTTGGCACTTATTATTGC
AAGACTTTGATAAGCTTTTTTTTTACTATTGATACAGTTATCTTCAAGGA
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TACGGAAGAACGACATGGACACATTgaagatgattttgattttgacttca
TTAATGACGTCATACTCCAATGCCTTCCCAACAGTTATGGTGAGTTCTGA
TTGGTCGAATACAGTATTATTGAATCTCTTACTCTTCAAATGCGAATCTG
CTGGTTTCAAACTTGAAAGTGTGGCTGTTTGTTTCCCAGCTGgtaacaac
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AACGTTGGAACAACGTTGTTTGCCAGGTTGGTTATAGGGGTTGTAGGGTA
TCGAAGTAGTTTTGGCTGGGGTATTTTGTATGCTTTAGTCTTTTGAGTTT
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gctacattttcttatttctttagGACGAAAGCCTTTGCATAGATGACGCT
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TACTGATTGTGCATGCGCAGATGCTGAGTATGTCTGTGAGAAGGAATTGT
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GCGAAGATAGCAGCTTTATGGAAAACTTGTTTGGAAAGAATGCAgtcaag
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AATGTTAAACGTAAGTCATTTATATTCTACACATACATTCAAAAGTGAAA
ATTGCATTGCTAAAAATGTCTAGATCCGACTTATAATAAGTTATATTAGG
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TGGATTCTCGCCACGAGCCTCATTGAAAAGAGATTAATTGGAAGCTAAAT
TTAGGTCAAATTTTAAGGTTAAGCCTAATCCGTGGATCTCTGAAACGAAC
GGAGGTACCAACACCAGCCAAAGGTTTCTTCTCGATTTCAAGATATCATT
TCGTTTGGATCTATAAGGATTTAAGGGAACTATAGGGCAAATATGTGAGG
TATTTTTGAGGTATTTTCAACACAAAAGCTCTCACTACAGGACATCTGTG
TCAATGCAAATCTATATAAAATAAATCTGTGTCTTACGTAGAAAGTATAG
AGTGCTCTTAGCTTGAAACACAGTTGGGGTACTAAAAAATCTGCAATATG
TATAATCTATGTTGCTATCTCAAAAAAAAGGTATTGGGTTTGTTATTTAA
TCTttaatatttctttactttttcttaatctttacAGGAATTTCTCAGAT
GACTCATTAAGCATGGTACGATTGACATTTATGGATGATCAAGGAGGGAC
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GGTCCAGTGGTTCTTAAACTCAATATTTGTATTGTTGTGAACCATAAAAG
TTTTGCTTTAATcctaaattttcattattttctcaTTAGATTTGACGACA
CATGTCTTGACAAATTCGCAAACAGATTCTAAATGAACTGAAACTCGATA
ATGAAATTATGACATCAAATTACCgcaaattcaaggaaaagccaCCCACT
GACGTGATGAGTGGTGCTAATTTGgcgaatcaaatcaaaatttaatgaca
TTTATTGAATGCGCAAAACAAAGAACAAAACAAATCGATTTCAATTTCAT
CCATTGTTGTCATGACAACACTGCAATCAAAATTATGATTGGTAAAGCAC
TTTTGAATTACGTCACTCATCGAAGTTGCCCATTTTTGGTGGTGTTAATT
AGCTACAGAGTATCATATGTCGAGAGTTTGGAGTTTGATTTTAGCGAGCT
ACAGACCAAAAAATAGAACATTAGTATTTTTATATCATGATAATAAATGC
AAGtcgtttaaaggttttatttttacacaagtgttcccgtttcatatcag
ccacatatttcatatcaggacagtgtctgcttaTTGTTCCATTATGCTGA
tagaagcaaaaaatgtttttcttttcttctttttggccaatcttgctcca
tattcgtgtcaatccaatatgaaaaagcttgtgcattaaaattgacgagt
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ATTTAATTAATTTACAAGACAATTATTGAAACACTGAATATATTTTGATG
AATTCAACGATTTACAGATGTGATTTAGTGCGAATTACACGACTTATTTT
TCTTTCCATATTTTATAGTGTATatttattgaaaacaaaattgatgaaaa
agggaaatttaTAATAAAAGATATAAATATTGTGAGACTGtaaatattat
attttaaaaactaaaagatttatttattttcaaattataaagttTTAGTA
AAAAGATATATATTGTGTACAAAAAAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00003572TCONS_00003572Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003573TCONS_00003573Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003574TCONS_00003574Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003575TCONS_00003575Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00003576TCONS_00003576Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Conserved uncharacterized secreted proteinTCONS_00003573-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000030supercontigsc0000030:818129..828605 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.53	1.13	0.56	0.33	4.98	2.78	4.74	4	1.6	2.48	2.05	1.13	12.3	9.21	6.31	5.31	4.63	9.57	13.19	16.02	4.48	4.64	2.76	2.93	2.51	2.3	119.76	120.95	3.63	2.82