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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00000632 ID=TCONS_00000632|Name=TCONS_00000632|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3062bp NNGATCGAACTGAACTTGACCTCCCGTAATTCAGACAACAAAGAAAAATG GATCGAAAAAATACGATTGAACAATGAAAAAGACACCATATATTTAAGTT TTATATGCAGATATATTGACGATTTGTTTCCTGCGTATAAATTATTGGCC TCCTATATACGTTACCTCTCTGGCATGTGCAAAAGCGGATCAAGTACTTA TCGACGGTACTTATTGGCCTCTTCCAGATAGTtttcgtacatgggggtgg aggatatagtgtctgggggggggtagtgaaaaatctacaaaatttgcctt gtccgggggagggggtaaacttgctctgtttctgtttgggggtaattttg aatgtccaggtggtcaactgatgcttgtccgggggattatacctgctgtc cgggggtcaaaaaTCACAATGCCCGGggagtaaatttccaaaaaatgtta tatcctccacccccatattcaaattttttctggaaaagcccttcAGGAAT ATTGATTTCCAGAGATGATATCGATCAGGGTTTAAACAAAGAAGCTATTG TATATTGTTACTTTGCCACGAACACCGTTCAACCAAACCCTTTCTGTGGA ATTTCCAGGTTAAAAAGAAAGTCTGTTTCAGCAGAATTGACTGTCCACAC AGTTTAATACATTGCTCTTAGAGTaaaaaagatataatcaaaagtaatag cacccctgtctcacaaccccggtgaaactttttcctacagcggggataaa aatttcgatcgaaatctcaatggggataaaaatactATTGTTCCAACGTT AAAAATTCCAGtgtggatggttttggagtacaatctctaaacaatgaatt tcgaatggggatgaaatcaaagtcaatttctcagttgggctgaaattcta gggtatttttcccaccgggtacgaaatttttgccaaattttccagtggga aaatAGCGGGTCTGTTACACAGGGGTGTGTAATTACCTTGTTGGAAAGAT AGTCAAATTCTGAACATATGCGTTAAAGATTATAGAGCTAATCGTACCAA TTCTGTACCATGGGCAGTCACGCCCtgtggtttaactcactaaaaacTTT TGTTGACATTGAGCACGCGCAATTAAtctttagtgagttaaaccaacCTC GTCACTTCGTGGCAAAGAATTTGCTATTTTGATCCTAAGAGTCTAGTAGT ACCTTTTTTGATATCTAAAACACCAGATATTTGGGATGAGGAAGGTCGTT GTACAGATTAGAAAAGATGGCCATATGacttaatttttcacaaaggGAAG TATATTGGCAATTTATATAGgaaatttaagaaatataaagaaaattaaat gcAAAATTTTGTACAGTTTATTATTACTAGAGCGCTTTAACCCCTTTACC ATTtactattattttttctttgttttttatacaTTATTATAACTGAAAGA TTTAAAActaatattttattattatatataggaaaataatttttttcata ccttTTTGATGGAatagttttaaaaattaattttgtcttTATGTGTAGAA GAATTTCTTTTAtaactttcaaaatttagcTCCTTGATTTGCAACAACTT AATTTAATTACGTGTCATACAGGGTGTCCGAANgctgaaattctagggta tttttcccaccgggtacgaaatttttgccaaattttccagtgggaaaatA GCGGGTCTGTTACACAGGGGTGTGTAATTACCTTGTTGGAAAGATAGTCA AATTCTGAACATATGCGTTAAAGATTATAGAGCTAATCGTACCAATTCTG TACCATGGGCAGTCACGCCCtgtggtttaactcactaaaaacTTTTGTTG ACATTGAGCACGCGCAATTAAtctttagtgagttaaaccaacCTCGTCAC TTCGTGGCAAAGAATTTGCTATTTTGATCCTAAGAGTCTAGTAGTACCTT TTTTGATATCTAAAACACCAGATATTTGGGATGAGGAAGGTCGTTGTACA GATTAGAAAAGATGGCCATATGacttaatttttcacaaaggGAAGTATAT TGGCAATTTATATAGgaaatttaagaaatataaagaaaattaaatgcAAA ATTTTGTACAGTTTATTATTACTAGAGCGCTTTAACCCCTTTACCATTta ctattattttttctttgttttttatacaTTATTATAACTGAAAGATTTAA AActaatattttattattatatataggaaaataatttttttcataccttT TTGATGGAatagttttaaaaattaattttgtcttTATGTGTAGAATTTCT TTTAtaactttcaaaatttagcTCCTTGATTTGCAACAACTTAATTTAAT TACGTgtcatacagggtgtccggaaaaaagtatcgagtcgtaccacttct atagaaagaaatttttttgtgtgtgtttcactaaatttgcaatgtttatc aaagtttctttctgtgtcatattaattaTTGTCATGAGACATATTTTATG Aataataacttttacaaaaaacaattctcaataactttaacgtcatgaaa atggtaaaggaagttaattctttttaatcataatgactggtgtaaaaata attgtgttggtatatattttcttacattttgttaaacacacgcaacaacc ttctactcagaatcatgttcgaactcgatacttttttccggacaccctgt actgTAATTGTCTTACGAGTTAGCAAACTTGTCGTAAATATTTTCAGCCT CTTAAAAGTCACTCGGGAGATTAAAGGTGGtaaattttataatttgaaaa tccttttttaccattaaacttttttcttcattatatttTTACTACCTCTG AAATCACTATTGCcttcttttttgtaaaatattttttatattatgttaaa cgctaaaagaatatttatttttctaaaataattgAAGTTGATCTACAAAC TTTTATCCTCATCAAaacttttgttattttatttgaATGTCTTTTGTTGT AAAAAACGTGGTTATTGACTccactaccttatcggccaaaacttagtcgg cctttattttag Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000002:499652..502713 Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00000632 ID=TCONS_00000632|Name=TCONS_00000632|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3062bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000002:499652..502713 (Clytia hemisphaerica) ctaaaataaaggccgactaagttttggccgataaggtagtggAGTCAATA
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CAGTTCGATCNN
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00000632-exon-sc0000002-1491911889:499652..502713 | TCONS_00000632-exon-sc0000002-1491911889:499652..502713 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00000632-exon-sc0000002-1510915933:499652..502713 | TCONS_00000632-exon-sc0000002-1510915933:499652..502713 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00000632-exon-sc0000002-1575043694:499652..502713 | TCONS_00000632-exon-sc0000002-1575043694:499652..502713 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000002 | supercontig | sc0000002:499652..502713 . |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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