XLOC_043153 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_043153
Unique NameXLOC_043153
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_496:505753..517408-

Legend: gene
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>XLOC_043153 ID=XLOC_043153|Name=XLOC_043153|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11656bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_496:505753..517408- (Clytia hemisphaerica)
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CCATGTCTAAGTAAGGGTAGGTGCACATTCGATACTCGTTATGTAGCATC GCATATGCAAATTCAGGATAGACGGCCCCACATCAAGGCTCTACCGAAGT CTCTTTTAAGAGCACAAAAAGAAAACTCGAGAAAAATGTAAAATTCTATA CTAACAGTTTCAAGAAAATATAATTTCTTGTTTTTTTTCCTATAAACCAA AGGTGACTGAAGACGAAGAGAACATATATAAAACGTTGAGAGAACTTTCC GATATTTGCGATGAAATGCTGGAAGAGGTAAGAGACGTAAATCAAATGAG TCGAAATAGTTTTTATGATATCACACTTTGAACTGCAGTATAAAAACAAA ATGCAAAATGAATACTCTTGTATTAGGTACCCTTTCTCTTTTGTACGTCC TGCATAAATTCTTACTGTTCCAGTACTTGTTCTTGAGTCTAGAGAATGTG ATTGGTCAAACAATCGTCGTTTTTTGTTGTTCTTTTTGTTTTCGTTAGAA TTCTTAAAAGGGGAACTGAAGAAAAATATTTTTTAAGTTTTAATATGAAA ATGTACATTATTTTTTCAGTCCAGCAAAGCGAGTGCAGAGCAAGTGTTTC ATCTGGTAGAAACATGTGAATATAAAGAAGTTTTAGCACGTCTGAAAGAA TCGGCGCTCTCCGGTGAACTTGATAAAGTCGAAGAAACTGCAGAACGATT GGAAAGTGTGCTTAGTGAAATTTTACAGGTATGTCGATGAGTTAATCATA ATAAAACTAATCTAAAGCACCTGATTGAATGCAAATTTTTTGACTGCCTG GGCTTTTATCAATAGCCTTTTAAATAATTCCTTCAAACATGAAAAACAGA AATCCCTTATTTTCAAATAAAAACTACTATTACTACTCTACCTATTTTAC TTCTTTTTATAGTCCATCCAAGCAATAGTTCAAAATAACTAGAACTGCAA 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GAAAATTTTGAAGTCTTTATTGATGTATGGGATACGCAGGTTGACGAATT ACTTACATTACTGAGGAATATCACCGAAGGTCACACGGAGAGTAAGTCGA AACAATTTCAAAATACTCTTCCTTCAAGGCTTCAATTGACTGAGTCTGTT TGTTTTTCCTAGTCCTTTGCATTTGCGGTTAACATTTGTATTCTAACCAA CGTTTTTACGATCGACAATTTTCCACAAATTATTCTTATGATTGTATCAA CTTTCAACTTTTGTGATTTTGTAAACCCCATAGAAGACCTTACATAAACC ACTATCTTTTGTAGCACTATCTAGCGCGTTTATATTTACTGCATGCTTTA ATGATCTTTCCAGATAATGAATGGCTTACAATATATATACCAATGGCATC CAAAATAAATTCATAATATCTACTTGTTGTTTGTTGATGTAAAATTGCAC GAGTATGTATAAATATGCACTGTCTTATAATATGTTGCACACACTATTTT TATTAAATTTATGCATGCCTGCCCAATTTTTAGCTAGTTTATAATACGTC CTTTTAAAAGTCCATTCGTTTTAAATACTCACCAATTTTGTTTTGCTCGT CAATTGATTCCATAACCAATGCTAAGATTTAACAAAATATGTACCCTTGA AAAGATAATTCAGAGCACTCATGTAATATTTGAGAAATGGAGTGATGAGA AAAATGAGCGAATAGAAGCTTCGTTTTATACCGATGTAAGATTTACCAAC ACTTTCTTCTAGAAATGAATTATATGGGATGTTTACACCATTAAAGTGAA TTGCAACATAATTGATTAACCGTTTAAGTGCCACGGTCATTTTTTAAAGA AAATCGCTAGTTCAAACTTTAAAGGCTTATATCTCCGGATCTAGAAGAAG TTAGAAGCTCGTTTTTTTGTCAAACTTTTGCATTTTTTTTTTACTTTTTG 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AATTTTGAGCAAATTTTTGGAAGCGTAAATTTTGTGGCCCATGTGAGCAT TTGGCGTCAAAGAACTAGATTTCGAATACGTAGAATTCTGAATACCTTTG TAAGTATAGTTTTAAAATCTTTATTTAATAATTAATTTTTCTTCATTAAT GGATGACTCTTTAAAGATGTAAATAGCATTTTATTTATGAGATGGTCATG TTTTGTTATTTAGCTTTTGTGTTTCGAACTTGAAGAAAATGAAAATTGAA AATTAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00069263TCONS_00069263Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069262TCONS_00069262Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069261TCONS_00069261Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00069260TCONS_00069260Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00069262-proteinTCONS_00069262-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_496supercontigscaffold_496:505753..517408 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
CTNNAL1PREDICTED: alpha-catulin isoform X1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.09 0.07 0.04 0.01 5.04 3.97 32.82 34.38 24.71 24.52 12.72 16.61 13.6 10.74 9.43 6.64 19.62 20.46 16.73 15.74 16.31 16.38 7.1 8.86 9.28 9.22 9.73 9.62 0.8 0.62