XLOC_038218 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_038218
Unique NameXLOC_038218
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_349:639003..672167-

Legend: gene
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>XLOC_038218 ID=XLOC_038218|Name=XLOC_038218|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=33165bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_349:639003..672167- (Clytia hemisphaerica)
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NNNNNNNNNTAAATTGAAACAATAAAACTATTAGCAGTCGCCCGGTCTAT TTTTGGGTGCTTCCGTATAAAACATTACGTCATGATAATCGCGATTTGTT TTTCGCGATTTGCTGACTTTATTTGAAGCTTAGGAAATAAAGTAGGGATT TCACAGTCTCTGCAATTAATGGCTTATCAGAACTAAGTTATCAATGGACA CAAACGTCTTTTGGACGTCTAATGTACGTTTCCAGGACGTCCAAAGGTCT TAAAGCCGTCCATAGACGTTGCGTGCCCATAGGAAAAAACTATTCCTTTA ACCAACGGAATGTCGTTATTTGAGCTCGACTTGTCCTATCTTAAGTGGAT AAATTTTCGCGGTATTTGCGTATTCTTTCCTCAACTAATTGCCTTCATTT TCCTACGGGTTTTGGCAAAAATCCTGAATTTTTCGTTGGTACAGTACTAA ATTTCGGAAAAATAGCGGAAATCGTGAAAACCGCGAAAATTAATCCACGC AAAAATTTGCCATGTAATAAGTTTCGTTTGGATAGTTAAGCTCCTGTTGA GATCATGGGTTTTGTGTGGTTAGACGTGAAACCTTCCATTTAAATTGCAT GTTTTTGTAATATATCAATTTTTTGTTGTTATAAATGTTGCATCTTTCCC CGAATCTTTATTTCAAGAAAGAAAAGCACAAATGAATTTTATAAAGGCTT GTCTACATTGCATGATTTTATTTTTTAAAGTGTAGACCAGCCCTTATAAA CTTTGCACCACACAAGACTTTTGCACCAAGTTCAACAGGGATCTTATGAA ATCTAAAAAATGGATAGATCTTTAATCTAGAGTACTAAAGATATTTCGAT GTATATTTTAGGATAAGAAATTGTTTTAAGACATTCTACAAGTAGATTGT TGTTTATAAAATTTGAAGTATCATATTTTGTACTATTTTTTGATAATCTA 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TTTCAACGTCCATCTAACGTTCATAACGTCCAAATAACGTTAGATGAACG TTAAAAGAACGTTGTGTGCAAGCTGGGTAGCGATTTTAATCCTTCAAGGA TTTCCGCTGTTTATTCATGAATTTTGCATTCTACCAACGTCGCGAAGCCG GAAATAGAATATTTTTTCAGGCAAAAATATAACCCAAAACTTGTCCCAGG GTAGATTTCATTTTAACTCAACACCCGAATATTTTTTAGGTTTTTTGCTT TACAAAACTTAAAAAAAATATTTTTTTTGTCTTTTGTTAGTATCTTCATT TTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTCTTTCATTATTTATTTGATATGAACTTA TACTTAGAAAAAAATTTTTGCTTTACTTTTAAATTAATTAATTTTATGCC AATACATAAATAATGAAATAATTTTTTTTATTAATAATTTTAAAAAATGT TTTATTAATTTACAAACCTACTATCTACCTTTTAGAAAAGTTTTTATGTT TTAAAATTTTGTTTTTTTTTCAAACTTTTTATTTGTTCTGTCGCGATCGT TATTCCCAAAAACAACGAATTTTCTTTTGTTAACATAAATTGTGAATTAT TTTTAAATTCTTATTTTATCTGTCATGTTAAAAGTCACGTGACAACCTTT TTAACCAATGAGATTCAATTATTTGGATGGAAATTTCACACTAAAAAGTT TTGTTACACCCACAATTCAGTTTTTTCACCCAATTAAAAAAATTCGTGAA TATTCATGACATAATGTTTTATACCCAAAAGAGACCGGGTGTTTGCCATT AATTTTGTATTCAAACAATAAAGCTAGTCGCAAGCGCCCGGTTTGCTTTG AGTATTTCTGTATAAAACATTATCTCATAAATTATAATCACACGTACTAA AATCCTGAGAGCAATTTCTAGTCAGTCATTTTTCAGGTACTCTCTTTGGG ACTTTGCTTAAAGGCTGAAACCATAATTTTCTTCGAAATTTTGCCATTCC AAAAGTTTAAAGAACAAAGTTTTTAAAATAAAACTTTGTTGTCTTTCTTT AAATGAAACCCTGATAATTTCTTACTTTTATAAATTTATTGAAACAGAAT TTAATTTTCGAAGAATATACCTTTTTCTACCTTACCAGCTGGCATAGAAC GTTGTTTCAACGTTTATCTAACGTTCACAACATCCATATAACGTTAGATG AACGTTGAAACAACGTTGTATACCTTTTTCTACCTTACAATATATTTTAT GCAACCAGTCGTTCACCAGATGCAAAACATTAAAAATTGGGGATTATTTT TTGACATATTGGACGATAGTATCAAAATTTATATATGTAAACCTTGGGAA TTATATTTCACTATTGTATAATTTTTCATTGTATTTTTGTAGAATTCCAT GTGCTCGTCATCTCTTCTCCCCAGCTGGTACACAACGTTGTTTCAACGTT AATCTAACTTTAAATGGACGTTGTGGACGTTAGAAAAACGTTGAAACAAT GCTGTGTGCCAGCTGGGTCTGCTACTGTGTAGTTTTAGTTTTTTTGTAAT TTTTGTTTTAATTTTATATGTTATTGCGTGTGTGTGTCCGTGTCAAAATC GTAAAAAGAAATGATTTTTCTATTTAAACATTCTTGATTTTTATATTTGT ATTATTTTTCCAAATTTTCTCATCATGGAGAAATCATTATTTCAAATCTT TCTTTGGTCATAAATCGCCTGTAAAATTACATTTCTACATACATCAAATA ACTCCCGTTCATTCCAGAAATCGAATACACGTTTTTTTTTTAAGAAACAT GAAGCTCAGAATGCC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00060866TCONS_00060866Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060865TCONS_00060865Clytia hemisphaericatranscript
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TCONS_00060863TCONS_00060863Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00060862TCONS_00060862Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
LIM domain-binding protein 3TCONS_00060864-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_349supercontigscaffold_349:639003..672167 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
LPPPREDICTED: lipoma-preferred partner isoform X2 Homo Sapiens
PDLIM7PREDICTED: PDZ and LIM domain protein 7 isoform X1 Homo Sapiens
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.09 3.11 4.5 5.32 89.99 69.07 151.87 164.02 81.88 127.28 72.61 59.12 207.15 223.45 59.3 71.31 75.02 82.05 208.02 156.37 38.52 44.33 23.85 31.41 64.41 68.56 95.15 107.63 107.78 159.33