TCONS_00012728 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00012728
Unique NameTCONS_00012728
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length6082

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00012728 ID=TCONS_00012728|Name=TCONS_00012728|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6082bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00012728-protein

>TCONS_00012728-protein ID=TCONS_00012728-protein|Name=TCONS_00012728-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1436bp
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FGFKEVATLYSDEISSKEIAQRFESQMKNDSIPIIASQMFPQSSDSVKLV
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EHIEHPLPYTAQVFDAVNGIALALSDLVSRKTISHRTNALTVRAHLFTKL
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VIDIVIGAARSECTARIYEQLRERGIPVISYASTSTLLSKKTNYPNLFRL
CPSDEHQAKALSDLVEKYNWDRVGIVAAKGIYGQELSDDLSQELGIRTIG
VTNKQLYDRGSKRMTKQISKLKDSGSGVNLMITNPQDSLQLYQEAFELGM
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LLRKMKSMKTLERGFHSSTGKKMHFNKFQDVAPRYELVNLNGNSWVTVGS
YEDKQLLLTNSVVWPGGTVKFPPSNPPVDPNGKKEPLKESSGTSQGLIVL
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GTGVRSIMQPNGNGHIKRHSLEAAVELTDPMIPRHL
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000147:160800..203674-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00012728 ID=TCONS_00012728|Name=TCONS_00012728|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=42875bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000147:160800..203674- (Clytia hemisphaerica)
ATAGATTATAGACTGAAAATTAGTAAACATTGAAATATCTGGTAAAGAAA TTTTATTTTTTGGGACCTGAAAAATTTTGATTGGATTTAAATCTCAAATG TCCGAGTACCTTGTTGGCAGGTTAGTGAAAATATTTCTTTCTTTTTTTAA TTTTAATTATATTTTAGATTTTTGAAAATAATAATATTTTATTGAAAAAA TAACGAGCTATCCACGCGACAATTTGGTTTGATTTAAGGGTTAATTGGAT AGAAGAGCTTAGGGAGGAATGAACTTTTTCATATCAGTATGGAAAAGTTG TGAAGATTTTTAAGAATTTTAAAGTTGCTAATTTCTTTAGAGTATTATGA TTGTACGTCGAGTTAAACTTTATACTAACTGTAAGATAAGAATGTACTTT ACGATTGGCAAATATCATACTATACTTGGATTTATTTGGCGACACCACCA CCAAGAATTAATCAGAAGATCGTCCTGATGGTGAAATATCATATTGAAAA ATTGAAACACTGTAATTTTCAAAATCCCTGCTGATTTTGTGAGCTGTATA TAAGTAAGGTACTTTTCCATCCCAGTTCCCTGTATTTTACTGTCATTGGC TCAAAATCTTTCACCTGGTCANTCCCAGTTCCCTGTATTTTATTGTCATT GGCTCAAAATCTTTCACCTGGTCATTGAGGGTTATATAAATATTAAATAC CATATGATCTAGATGATCTTTAATTCAGTTACATATCTAAATGCTATGGT CTAGATCTGTTTACGCCACTCCACTTTCGATGATTGCTTTTGTCTGGGAA AGCCAATATCCTTGCCATACTTTCAAGTGTCAATTTCCGTAATTTCAAGG ATTCGTTTCTCAAAAAATTGACAGAATCATTTTGGTGTACTTTTATCAAT GGCAGGAAATAAATCAATAATGATTTGAAATCTATTTTTTGACTCTGATG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000147:160800..203674-

>TCONS_00012728 ID=TCONS_00012728|Name=TCONS_00012728|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=103464bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000147:160800..203674- (Clytia hemisphaerica)
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GGAGGAACGGTCAAATTCCCACCCTCAAATCCACCTGTAGAGTCTCAAAG
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GGAACGAGGATTCCATAGTTCAACGGGAAAGAAAATGCACTTCAATAAAT
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CTCACCTGTTCACAAAACTAGAAGCCTATAACAGTGATAAAAACGGATAT
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CAAGATTTGAAAAATCCACTATTCCCTGGAGGTCAATCAGTACCAGTCGT
AGGAGCCGGCAAAGTCATGTATAAGATTGCAGCATTCTTCCCGAGAGATA
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GGTGCTCGAGTTATTTTCCTATCCGCTTTACCTAACGACGTCGCTAAAAT
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AGCTTTCTATGTCAAATTACTTGCTAAATGGTTATCCAAAGATCGCTTGA
CATATCCTGGTATTATTCATGAAGAACATGTTGCCACTTTGTATTCAGAT
GAAATTTCGTCCAAAGAAATTGCACAACGTTTTGAAAGTCAAATGAAGAA
TGATTCCATACCAATCATTGCATCTCAAATGTTCCCTCAGAGTTCTGATA
GTGTCAAGTTGGTTGATTTCGTCGAAAATAAAGGAGAATTTAAGGAAGTC
GGGAACTGGGACGAGTCTGCAAGTCCAAGTCTCGATTTACAAGTTGGAAA
AGTATCATGGCCTGGTGGTAGCTCTCAAATTCCAACCGATAAAGGGAAAC
CGGGTAAAGCTTTATTCCGAATCGGATTCGTATCTCCAACTAATCCAGCA
TTGGGAAATTTGGGCGAATACGGTAAAGAGTTGTTATCAGCCTTCCGAGT
GGCTTTAGAAGTCATCAATAAAGATGATTATTATCAAATCGAATTAGATG
GTTTGACCAAGGATGAAGGTTTTGACGGTAACCGAAGCTGTCAGGAAATT
GCCGAACAAATGAAAGAACAAAATTTGGTAGCAGTAGTTGGTGCTTATCG
TTCACAATGTTCAATGAAGATGCACGAGGTCTTAGGATCTGAGGATGTCA
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TGAAATCATGAAATTGATTGTACGCAAGTTTGGATTTAAAGAGGGCACTT
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TCAACATACTGAAGGTCAACCGAAATTCACAATTTCTAACCAAGTGTGTA
CCGTGGCCGAACATACTACGATTTCTTGATTCATTGGTACGATATGGCAG
ACAAGAAAGCTTACCCTGGTAGAATCTGGAGACCAGGAAAACAACCATCT
GTCAGCCCCTACGTTGGACAAGTTGTGCGGGCTGTTTCTGCCTTCCATTC
CGTACTTGTTGATTTAGCAAATGAGAAAAAAATTGCACAGCGAATGTATG
GTGAAGGTTGGGTTTGGATAGCAACCGACGGTGCCACCAGTCTGTATGTT
GGTGATAAAGCCGATATCAACCTCACCACCAGTGGTTTCATCGGAGTTGG
TCCTGAAAATTAAAACCTCTGGATCACGAGTCAATATAATCGTTGCTAAT
GGCAATGATTTCTACACCATTGTCAAACAAATTAAAGTCAAGACTGGTAT
GATTCATTCCGATGATGAATATTATGGCAAAGAATTGAGTGACGAAATCA
TTTCCAAATCGAAGAATTCTGGGATTTACATCAAAGAACGTGTTTCATTC
TCCTCCACTTCGTCTACCGTAGCTATCGATAAAAAATTGCAAGCGAATCG
AATATGCCACAGATCTCATACCGTTCGCAATCAATGAAACTATTGAACAA
AGACACCTACCCCAACTTCTTCAGGACGAGCTCAAACAACAAGAAAGAAG
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TGAAGGATGAAGGAAAGAATCCAGTCACCGATTGTCAGAACATTGCGAGG
ACTTTTCACGGTGATAGCAACGTGGTCGGTGTGGTCGGAGCTTACTCGTC
GTCATGTTCTGTTGCTATGCAACAAGAACTTACCAGCAGCAGAAGCAGCT
TTCAAAATTGCCGTATTTACTGTCAATCGTATCAAAAACTCTCCTGTCAA
ATTTCGGACAGATTTCAAAGCAACATTTGCTTATTCAGCATCCATAAATG
TATCACTTGGCTTTACTGCGCCGCTTGATGACTCATACGGCCCTTTGAAG
CCGCTTGGAGAAGAATTACTCGAACAGAATAAACACTGGATTGACATGTG
TACAGTGTTCACACAATTCAAAACAAACACGAACAAACGAAGATACTAAC
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TCGGCTCAGACGGTGCAGTATCGACCATGTTCACACGCTCTCAGAATTTA
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TCGATGTCACTTATATTGATACTGGCCTCTATTCAAGCAATTGTTCGTCA
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AGTGAACGGCATCGCTTTGGCTTTATCCGACCTCGTGTCCCGTAAAACGA
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AGAAAAAGATGGCAGGTAAAGGATGGATATGGCTTGGATCTGATGGTGCC
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GTAGCTCTCAAATTCCAACCGATAAAGGGAAACCGGGTAAAGCTTTATTC
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GACGGTTGGCTTCGATGTCACTTATATTGATACTGGCCTCTATTCAAGCA
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GCACTGGGTACTAATAAACGCATGTGGTTTGACAAAAACAAAGACGGCCC
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CGAGTTATTTTCCTATCCGCTTTACCTAACGACGTCGCTAAAATTGAACA
AATCATTCAAGAGAAAAAGATGGCAGGTAAAGGATGGATATGGCTTGGAT
CTGATGGTGCCACAAGTGATCATTTCTCATTGAATTCCAAACTTGCCAGT
ACTATGGAGGGTATGTTAGGTGTCAACCCTAGACGTGGCGATGGAGCTTT
CTATGTCAAATTACTTGCTAAATGGTTATCCAAAGATCGCTTGACATATC
CTGGTATTATTCATGAAGAACATGTTGCCACTTTGTATTCAGATGAAATT
TCGTCCAAAGAAATTGCACAACGTTTTGAAAGTCAAATGAAGAATGATTC
CATACCAATCATTGCATCTCAAATGTTCCCTCAGAGTTCTGATAGTGTCA
AGTTGGTTGATTTCGTCGAAAATAAAGGAGAATTTAAGGAAGTCGGGAAC
TGGGACGAGTCTGCAAGTCCAAGTCTCGATTTACAAGTTGGAAAAGTATC
ATGGCCTGGTGGTAGCTCTCAAATTCCAACCGATAAAGGGAAACCGGGTA
AAGCTTTATTCCGAATCGGATTCGTATCTCCAACTAATCCAGCATTGGGA
AATTTGGGCGAATACGGTAAAGAGTTGTTATCAGCCTTCCGAGTGGCTTT
AGAAGTCATCAATAAAGATGATTATTATCAAATCGAATTAGATGGTTTGA
CCAAGGATGAAGGTTTTGACGGTAACCGAAGCTGTCAGGAAATTGCCGAA
CAAATGAAAGAACAAAATTTGGTAGCAGTAGTTGGTGCTTATCGTTCACA
ATGTTCAATGAAGATGCACGAGGTCTTAGGATCTGAGGATGTCAAAATGC
CAATCATTTCTTACGCTTCACCGTCTGTCTTGTTATCCAATAAACAGAAA
TATAAATACTTCTTCCGTGTACCACCATCCAACTTGTATCAAAGTGAAAT
CATGAAATTGATTGTACGCAAGTTTGGATTTAAAGAGGGCACTTCTGCAT
CCAGTATCAGAGACTTGGTCGCCAAACGTTTGAAAGCATCAGAAAACGTA
CGAACAGGCCTCTCGTCTGTCATGGGAGATCCAATCTATTTCAATCAACA
TACTGAAGGTCAACCGAAATTCACAATTTCTAACCAAGTGTGTACCGTGG
CCGAACATACTACGATTTCTTGATTCATTGGTACGATATGGCAGACAAGA
AAGCTTACCCTGGTAGAATCTGGAGACCAGGAAAACAACCATCTGTCAGC
CCCTACGTTGGACAAGTTGTGCGGGCTGTTTCTGCCTTCCATTCCGTACT
TGTTGATTTAGCAAATGAGAAAAAAATTGCACAGCGAATGTATGGTGAAG
GTTGGGTTTGGATAGCAACCGACGGTGCCACCAGTCTGTATGTTGGTGAT
AAAGCCGATATCAACCTCACCACCAGTGGTTTCATCGGAGTTGGTCCTGA
AAATTAAAACCTCTGGATCACGAGTCAATATAATCGTTGCTAATGGCAAT
GATTTCTACACCATTGTCAAACAAATTAAAGTCAAGACTGGTATGATTCA
TTCCGATGATGAATATTATGGCAAAGAATTGAGTGACGAAATCATTTCCA
AATCGAAGAATTCTGGGATTTACATCAAAGAACGTGTTTCATTCTCCTCC
ACTTCGTCTACCGTAGCTATCGATAAAAAATTGCAAGCGAATCGAATATG
CCACAGATCTCATACCGTTCGCAATCAATGAAACTATTGAACAAAGACAC
CTACCCCAACTTCTTCAGGACGAGCTCAAACAACAAGAAAGAAGCACAAA
CTATTGTGGATATCATCAAACACTTTCGTTGGACACAGCTTTGGTGAAGG
ATGAAGGAAAGAATCCAGTCACCGATTGTCAGAACATTGCGAGGACTTTT
CACGGTGATAGCAACGTGGTCGGTGTGGTCGGAGCTTACTCGTCGTCATG
TTCTGTTGCTATGCAACAAGAACTTACCAGCAGCAGAAGCAGCTTTCAAA
ATTGCCGTATTTACTGTCAATCGTATCAAAAACTCTCCTGTCAAATTTCG
GACAGATTTCAAAGCAACATTTGCTTATTCAGCATCCATAAATGTATCAC
TTGGCTTTACTGCGCCGCTTGATGACTCATACGGCCCTTTGAAGCCGCTT
GGAGAAGAATTACTCGAACAGAATAAACACTGGATTGACATGTGTACAGT
GTTCACACAATTCAAAACAAACACGAACAAACGAAGATACTAACCAACAA
ACTGGATTGAGATCCAATAAGAAATTCAGGGGAAATCGACGAAAAAGGAA
ACAAGGCATCATGAAACATTCGAATTACATTTTTACGTTATTTATTTGGG
GCTGTATATTTTCATTTCACGATGACGTCGGAAAACCTAGTGATTTAAAT
CAAGGTGGTGTATTCTCAGTATTATACGGACATACAGTAAATAGACCTGG
AACAGGTGTAAGGAGTATTATGCAACCTAACGGGAACGGTCATATAAAAA
GACATTCGTTAGAAGCTGCCGTTGAGCTTACAGACCCTATGATACCAAGG
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GTACATCACAAGGCTTGATCGTACTGGCTGTCGTGTTCAGCATATTTGGT
CTCCTTGTCATCATCTTTATGTTATACATCGTCCGCCGCGTGCGATATCG
TCATCTCTACATGCAGGGCAACAGTTGGGTAACCGTCGGGAGTTATGAAG
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CCATAGTTCAACGGGAAAGAAAATGCACTTCAATAAATTCCAAGATGTAG
CACCACGATATGAATTGGTTAATTTAAATGTTTCATATATCGCACAAGTG
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GAAAGTGATCACTTCTGGTATGGTTGGCAAAGGATGGACATGGATCGGCT
CAGACGGTGCAGTATCGACCATGTTCACACGCTCTCAGAATTTACAACGT
GCAATGCAAGGCATGGTGGGATTCCGTCCGAAATCCGGAAACGGACCATT
ATTTGAGTCATTATACAATGAATGGCTAGGTGTCGATCATTCTGCTGATA
GACAGTTGAAGGATTCAGGATCTGGAGTGAACCTAATGATTACCAACCCT
CAAGACTCGTTACAGTTATATCAAGAAGCTTTCGAATTGAAATTACCAAG
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GACGGTAACCGAAGCTGTCAGGAAATTGCCGAACAAATGAAAGAACAAAA
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GTGCCACAAGTGATCATTTCTCATTGAATTCCAAACTTGCCAGTACTATG
GAGGGTATGTTAGGTGTCAACCCTAGACGTGGCGATGGAGCTTTCTATGT
CAAATTACTTGCTAAATGGTTATCCAAAGATCGCTTGACATATCCTGGTA
TTATTCATGAAGAACATGTTGCCACTTTGTATTCAGATGAAATTTCGTCC
AAAGAAATTGCACAACGTTTTGAAAGTCAAATGAAGAATGATTCCATACC
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TTGATTTCGTCGAAAATAAAGGAGAATTTAAGGAAGTCGGGAACTGGGAC
GAGTCTGCAAGTCCAAGTCTCGATTTACAAGTTGGAAAAGTATCATGGCC
TGGTGGTAGCTCTCAAATTCCAACCGATAAAGGGAAACCGGGTAAAGCTT
TATTCCGAATCGGATTCGTATCTCCAACTAATCCAGCATTGGGAAATTTG
GGCGAATACGGTAAAGAGTTGTTATCAGCCTTCCGAGTGGCTTTAGAAGT
CATCAATAAAGATGATTATTATCAAATCGAATTAGATGGTTTGACCAAGG
ATGAAGGTTTTGACGGTAACCGAAGCTGTCAGGAAATTGCCGAACAAATG
AAAGAACAAAATTTGGTAGCAGTAGTTGGTGCTTATCGTTCACAATGTTC
AATGAAGATGCACGAGGTCTTAGGATCTGAGGATGTCAAAATGCCAATCA
TTTCTTACGCTTCACCGTCTGTCTTGTTATCCAATAAACAGAAATATAAA
TACTTCTTCCGTGTACCACCATCCAACTTGTATCAAAGTGAAATCATGAA
ATTGATTGTACGCAAGTTTGGATTTAAAGAGGGCACTTCTGCATCCAGTA
TCAGAGACTTGGTCGCCAAACGTTTGAAAGCATCAGAAAACGTACGAACA
GGCCTCTCGTCTGTCATGGGAGATCCAATCTATTTCAATCAACATACTGA
AGGTCAACCGAAATTCACAATTTCTAACCAAGTGTGTACCGTGGCCGAAC
ATACTACGATTTCTTGATTCATTGGTACGATATGGCAGACAAGAAAGCTT
ACCCTGGTAGAATCTGGAGACCAGGAAAACAACCATCTGTCAGCCCCTAC
GTTGGACAAGTTGTGCGGGCTGTTTCTGCCTTCCATTCCGTACTTGTTGA
TTTAGCAAATGAGAAAAAAATTGCACAGCGAATGTATGGTGAAGGTTGGG
TTTGGATAGCAACCGACGGTGCCACCAGTCTGTATGTTGGTGATAAAGCC
GATATCAACCTCACCACCAGTGGTTTCATCGGAGTTGGTCCTGAAAATTA
AAACCTCTGGATCACGAGTCAATATAATCGTTGCTAATGGCAATGATTTC
TACACCATTGTCAAACAAATTAAAGTCAAGACTGGTATGATTCATTCCGA
TGATGAATATTATGGCAAAGAATTGAGTGACGAAATCATTTCCAAATCGA
AGAATTCTGGGATTTACATCAAAGAACGTGTTTCATTCTCCTCCACTTCG
TCTACCGTAGCTATCGATAAAAAATTGCAAGCGAATCGAATATGCCACAG
ATCTCATACCGTTCGCAATCAATGAAACTATTGAACAAAGACACCTACCC
CAACTTCTTCAGGACGAGCTCAAACAACAAGAAAGAAGCACAAACTATTG
TGGATATCATCAAACACTTTCGTTGGACACAGCTTTGGTGAAGGATGAAG
GAAAGAATCCAGTCACCGATTGTCAGAACATTGCGAGGACTTTTCACGGT
GATAGCAACGTGGTCGGTGTGGTCGGAGCTTACTCGTCGTCATGTTCTGT
TGCTATGCAACAAGAACTTACCAGCAGCAGAAGCAGCTTTCAAAATTGCC
GTATTTACTGTCAATCGTATCAAAAACTCTCCTGTCAAATTTCGGACAGA
TTTCAAAGCAACATTTGCTTATTCAGCATCCATAAATGTATCACTTGGCT
TTACTGCGCCGCTTGATGACTCATACGGCCCTTTGAAGCCGCTTGGAGAA
GAATTACTCGAACAGAATAAACACTGGATTGACATGTGTACAGTGTTCAC
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TTGAGATCCAATAAGAAATTCAGGGGAAATCGACGAAAAAGGAAACAAGG
CATCATGAAACATTCGAATTACATTTTTACGTTATTTATTTGGGGCTGTA
TATTTTCATTTCACGATGACGTCGGAAAACCTAGTGATTTAAATCAAGGT
GGTGTATTCTCAGTATTATACGGACATACAGTAAATAGACCTGGAACAGG
TGTAAGGAGTATTATGCAACCTAACGGGAACGGTCATATAAAAAGACATT
CGTTAGAAGCTGCCGTTGAGCTTACAGACCCTATGATACCAAGGCATCTA
TAGTGATCCCAATGGGAAAAAAGAGCCATTGAAAGAATCGAGTGGTACAT
CACAAGGCTTGATCGTACTGGCTGTCGTGTTCAGCATATTTGGTCTCCTT
GTCATCATCTTTATGTTATACATCGTCCGCCGCGTGCGATATCGTCATCT
CTACATGCAGGGCAACAGTTGGGTAACCGTCGGGAGTTATGAAGATAAAC
AACTGTTACTAACCAACAGTGTTGTATGGCCAGGAGGAACGGTCAAATTC
CCACCCTCAAATCCACCTGTAGAGTCTCAAAGATCGAAGCGAGAGCACAT
TTATTACGTAAAATGAAATCCATGAAAACATTGGAACGAGGATTCCATAG
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GATATGAATTGGTTAATTTAAATGTTTCATATATCGCACAAGTGTTTGAT
TCGGTGTTAGTACCAACATTCGCGCTTCACGAACTTCACAAAGAGAAAGT
GATCACTTCTGGTATGGTTGGCAAAGGATGGACATGGATCGGCTCAGACG
GTGCAGTATCGACCATGTTCACACGCTCTCAGAATTTACAACGTGCAATG
CAAGGCATGGTGGGATTCCGTCCGAAATCCGGAAACGGACCATTATTTGA
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AACCGAAGCTGTCAGGAAATTGCCGAACAAATGAAAGAACAAAATTTGGT
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CGATGTCACTTATATTGATACTGGCCTCTATTCAAGCAATTGTTCGTCAC
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TGCATCTCAAATGTTCCCTCAGAGTTCTGATAGTGTCAAGTTGGTTGATT
TCGTCGAAAATAAAGGAGAATTTAAGGAAGTCGGGAACTGGGACGAGTCT
GCAAGTCCAAGTCTCGATTTACAAGTTGGAAAAGTATCATGGCCTGGTGG
TAGCTCTCAAATTCCAACCGATAAAGGGAAACCGGGTAAAGCTTTATTCC
GAATCGGATTCGTATCTCCAACTAATCCAGCATTGGGAAATTTGGGCGAA
TACGGTAAAGAGTTGTTATCAGCCTTCCGAGTGGCTTTAGAAGTCATCAA
TAAAGATGATTATTATCAAATCGAATTAGATGGTTTGACCAAGGATGAAG
GTTTTGACGGTAACCGAAGCTGTCAGGAAATTGCCGAACAAATGAAAGAA
CAAAATTTGGTAGCAGTAGTTGGTGCTTATCGTTCACAATGTTCAATGAA
GATGCACGAGGTCTTAGGATCTGAGGATGTCAAAATGCCAATCATTTCTT
ACGCTTCACCGTCTGTCTTGTTATCCAATAAACAGAAATATAAATACTTC
TTCCGTGTACCACCATCCAACTTGTATCAAAGTGAAATCATGAAATTGAT
TGTACGCAAGTTTGGATTTAAAGAGGGCACTTCTGCATCCAGTATCAGAG
ACTTGGTCGCCAAACGTTTGAAAGCATCAGAAAACGTACGAACAGGCCTC
TCGTCTGTCATGGGAGATCCAATCTATTTCAATCAACATACTGAAGGTCA
ACCGAAATTCACAATTTCTAACCAAGTGTGTACCGTGGCCGAACATACTA
CGATTTCTTGATTCATTGGTACGATATGGCAGACAAGAAAGCTTACCCTG
GTAGAATCTGGAGACCAGGAAAACAACCATCTGTCAGCCCCTACGTTGGA
CAAGTTGTGCGGGCTGTTTCTGCCTTCCATTCCGTACTTGTTGATTTAGC
AAATGAGAAAAAAATTGCACAGCGAATGTATGGTGAAGGTTGGGTTTGGA
TAGCAACCGACGGTGCCACCAGTCTGTATGTTGGTGATAAAGCCGATATC
AACCTCACCACCAGTGGTTTCATCGGAGTTGGTCCTGAAAATTAAAACCT
CTGGATCACGAGTCAATATAATCGTTGCTAATGGCAATGATTTCTACACC
ATTGTCAAACAAATTAAAGTCAAGACTGGTATGATTCATTCCGATGATGA
ATATTATGGCAAAGAATTGAGTGACGAAATCATTTCCAAATCGAAGAATT
CTGGGATTTACATCAAAGAACGTGTTTCATTCTCCTCCACTTCGTCTACC
GTAGCTATCGATAAAAAATTGCAAGCGAATCGAATATGCCACAGATCTCA
TACCGTTCGCAATCAATGAAACTATTGAACAAAGACACCTACCCCAACTT
CTTCAGGACGAGCTCAAACAACAAGAAAGAAGCACAAACTATTGTGGATA
TCATCAAACACTTTCGTTGGACACAGCTTTGGTGAAGGATGAAGGAAAGA
ATCCAGTCACCGATTGTCAGAACATTGCGAGGACTTTTCACGGTGATAGC
AACGTGGTCGGTGTGGTCGGAGCTTACTCGTCGTCATGTTCTGTTGCTAT
GCAACAAGAACTTACCAGCAGCAGAAGCAGCTTTCAAAATTGCCGTATTT
ACTGTCAATCGTATCAAAAACTCTCCTGTCAAATTTCGGACAGATTTCAA
AGCAACATTTGCTTATTCAGCATCCATAAATGTATCACTTGGCTTTACTG
CGCCGCTTGATGACTCATACGGCCCTTTGAAGCCGCTTGGAGAAGAATTA
CTCGAACAGAATAAACACTGGATTGACATGTGTACAGTGTTCACACAATT
CAAAACAAACACGAACAAACGAAGATACTAACCAACAAACTGGATTGAGA
TCCAATAAGAAATTCAGGGGAAATCGACGAAAAAGGAAACAAGGCATCAT
GAAACATTCGAATTACATTTTTACGTTATTTATTTGGGGCTGTATATTTT
CATTTCACGATGACGTCGGAAAACCTAGTGATTTAAATCAAGGTGGTGTA
TTCTCAGTATTATACGGACATACAGTAAATAGACCTGGAACAGGTGTAAG
GAGTATTATGCAACCTAACGGGAACGGTCATATAAAAAGACATTCGTTAG
AAGCTGCCGTTGAGCTTACAGACCCTATGATACCAAGGCATCTATAGTGA
TCCCAATGGGAAAAAAGAGCCATTGAAAGAATCGAGTGGTACATCACAAG
GCTTGATCGTACTGGCTGTCGTGTTCAGCATATTTGGTCTCCTTGTCATC
ATCTTTATGTTATACATCGTCCGCCGCGTGCGATATCGTCATCTCTACAT
GCAGGGCAACAGTTGGGTAACCGTCGGGAGTTATGAAGATAAACAACTGT
TACTAACCAACAGTGTTGTATGGCCAGGAGGAACGGTCAAATTCCCACCC
TCAAATCCACCTGTAGAGTCTCAAAGATCGAAGCGAGAGCACATTTATTA
CGTAAAATGAAATCCATGAAAACATTGGAACGAGGATTCCATAGTTCAAC
GGGAAAGAAAATGCACTTCAATAAATTCCAAGATGTAGCACCACGATATG
AATTGGTTAATTTAAATGTTTCATATATCGCACAAGTGTTTGATTCGGTG
TTAGTACCAACATTCGCGCTTCACGAACTTCACAAAGAGAAAGTGATCAC
TTCTGGTATGGTTGGCAAAGGATGGACATGGATCGGCTCAGACGGTGCAG
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CGAACACCAAGCTAAAGCCTTGTCTGATTTGGTTGAGAAATATAATTGGG
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GACGATTTGAGTCAAGAATTGGGGATTCGTACTATTGGTGTGACTAATAA
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AATCTGGTTTGAAAGCTGTGGTGAACTGGGTGAATAAGAACGATTCATTG
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TGTACCGTGGCCGAACATACTACGATTTCTTGATTCATTGGTACGATATG
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TGTTGGTGATAAAGCCGATATCAACCTCACCACCAGTGGTTTCATCGGAG
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GTATGATTCATTCCGATGATGAATATTATGGCAAAGAATTGAGTGACGAA
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GAAGCACAAACTATTGTGGATATCATCAAACACTTTCGTTGGACACAGCT
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GAAGCCGCTTGGAGAAGAATTACTCGAACAGAATAAACACTGGATTGACA
TGTGTACAGTGTTCACACAATTCAAAACAAACACGAACAAACGAAGATAC
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ATAGACCTGGAACAGGTGTAAGGAGTATTATGCAACCTAACGGGAACGGT
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GATACCAAGGCATCTATAGTGATCCCAATGGGAAAAAAGAGCCATTGAAA
GAATCGAGTGGTACATCACAAGGCTTGATCGTACTGGCTGTCGTGTTCAG
CATATTTGGTCTCCTTGTCATCATCTTTATGTTATACATCGTCCGCCGCG
TGCGATATCGTCATCTCTACATGCAGGGCAACAGTTGGGTAACCGTCGGG
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CGAAGCGAGAGCACATTTATTACGTAAAATGAAATCCATGAAAACATTGG
AACGAGGATTCCATAGTTCAACGGGAAAGAAAATGCACTTCAATAAATTC
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TCTGCTGATAGACAGTTGAAGGATTCAGGATCTGGAGTGAACCTAATGAT
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AATTACCAAGTGTAATTGACATCGTGATTGGTGCCGCTCGTTCAGAATGC
ACAGCGCGTATCTACGAGCAATTACGGGAACGCGGAATCCCCGTCATTTC
TTACGCATCTACGTCAACTCTCTTATCAAAGAAGACGAATTATCCCAACC
TTTTCCGCCTCTGCCCGTCGGACGAACACCAAGCTAAAGCCTTGTCTGAT
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GTACTATTGGTGTGACTAATAAACAATTGTATGATAGAGGATCCAAAAGA
ATGACCAAACAAATTTCAAAGGAATCTGGTTTGAAAGCTGTGGTGAACTG
GGTGAATAAGAACGATTCATTGACGGTTGGCTTCGATGTCACTTATATTG
ATACTGGCCTCTATTCAAGCAATTGTTCGTCACTGGCAAAGATCGAGCAT
CCATTACCTTACACTGCTCAAGTTTTTGACGCAGTGAACGGCATCGCTTT
GGCTTTATCCGACCTCGTGTCCCGTAAAACGATAAGTCACCGCACAAACG
CTTTAACAGTGCGTGCTCACCTGTTCACAAAACTAGAAGCCTATAACAGT
GATAAAAACGGATATTTAAGTGCACTGGGTACTAATAAACGCATGTGGTT
TGACAAAAACAAAGACGGCCCACTTCTTCATGATGTTGTCAATCTAGGAT
CCAATCCCCCAGAGTGGAAACACGTGGCAGAGTTTTCAGTTGATAACAAC
GGAAAAGAGATTTTGCAAGATTTGAAAAATCCACTATTCCCTGGAGGTCA
ATCAGTACCAGTCGTAGGAGCCGGCAAAGTCATGTATAAGATTGCAGCAT
TCTTCCCGAGAGATACTCGTCTTGGTGCTCTCTCAGATTTGGGACATTTC
TGGATCCGTCAATCTGGTGCTCGAGTTATTTTCCTATCCGCTTTACCTAA
CGACGTCGCTAAAATTGAACAAATCATTCAAGAGAAAAAGATGGCAGGTA
AAGGATGGATATGGCTTGGATCTGATGGTGCCACAAGTGATCATTTCTCA
TTGAATTCCAAACTTGCCAGTACTATGGAGGGTATGTTAGGTGTCAACCC
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GAATTTAAGGAAGTCGGGAACTGGGACGAGTCTGCAAGTCCAAGTCTCGA
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ATCAGCCTTCCGAGTGGCTTTAGAAGTCATCAATAAAGATGATTATTATC
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AGCTGTCAGGAAATTGCCGAACAAATGAAAGAACAAAATTTGGTAGCAGT
AGTTGGTGCTTATCGTTCACAATGTTCAATGAAGATGCACGAGGTCTTAG
GATCTGAGGATGTCAAAATGCCAATCATTTCTTACGCTTCACCGTCTGTC
TTGTTATCCAATAAACAGAAATATAAATACTTCTTCCGTGTACCACCATC
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TTAAAGAGGGCACTTCTGCATCCAGTATCAGAGACTTGGTCGCCAAACGT
TTGAAAGCATCAGAAAACGTACGAACAGGCCTCTCGTCTGTCATGGGAGA
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GGTACGATATGGCAGACAAGAAAGCTTACCCTGGTAGAATCTGGAGACCA
GGAAAACAACCATCTGTCAGCCCCTACGTTGGACAAGTTGTGCGGGCTGT
TTCTGCCTTCCATTCCGTACTTGTTGATTTAGCAAATGAGAAAAAAATTG
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TGAGTGACGAAATCATTTCCAAATCGAAGAATTCTGGGATTTACATCAAA
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GAAACTATTGAACAAAGACACCTACCCCAACTTCTTCAGGACGAGCTCAA
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TGGACACAGCTTTGGTGAAGGATGAAGGAAAGAATCCAGTCACCGATTGT
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CGGAGCTTACTCGTCGTCATGTTCTGTTGCTATGCAACAAGAACTTACCA
GCAGCAGAAGCAGCTTTCAAAATTGCCGTATTTACTGTCAATCGTATCAA
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CAGCATCCATAAATGTATCACTTGGCTTTACTGCGCCGCTTGATGACTCA
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CTGGATTGACATGTGTACAGTGTTCACACAATTCAAAACAAACACGAACA
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ACAGACCCTATGATACCAAGGCATCTATAGTGATCCCAATGGGAAAAAAG
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CGTCCGCCGCGTGCGATATCGTCATCTCTACATGCAGGGCAACAGTTGGG
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GTATGGCCAGGAGGAACGGTCAAATTCCCACCCTCAAATCCACCTGTAGA
GTCTCAAAGATCGAAGCGAGAGCACATTTATTACGTAAAATGAAATCCAT
GAAAACATTGGAACGAGGATTCCATAGTTCAACGGGAAAGAAAATGCACT
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GTGTCGATCATTCTGCTGATAGACAGTTGAAGGATTCAGGATCTGGAGTG
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CCTTGTCTGATTTGGTTGAGAAATATAATTGGGACCGAGTAGGCATAGTT
GCTGCTAAAGGAATCTATGGTCAGGAATTATCGGACGATTTGAGTCAAGA
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GATCCAAAAGAATGACCAAACAAATTTCAAAGGAATCTGGTTTGAAAGCT
GTGGTGAACTGGGTGAATAAGAACGATTCATTGACGGTTGGCTTCGATGT
CACTTATATTGATACTGGCCTCTATTCAAGCAATTGTTCGTCACTGGCAA
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GGCATCGCTTTGGCTTTATCCGACCTCGTGTCCCGTAAAACGATAAGTCA
CCGCACAAACGCTTTAACAGTGCGTGCTCACCTGTTCACAAAACTAGAAG
CCTATAACAGTGATAAAAACGGATATTTAAGTGCACTGGGTACTAATAAA
CGCATGTGGTTTGACAAAAACAAAGACGGCCCACTTCTTCATGATGTTGT
CAATCTAGGATCCAATCCCCCAGAGTGGAAACACGTGGCAGAGTTTTCAG
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CCTGGAGGTCAATCAGTACCAGTCGTAGGAGCCGGCAAAGTCATGTATAA
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TGGGACATTTCTGGATCCGTCAATCTGGTGCTCGAGTTATTTTCCTATCC
GCTTTACCTAACGACGTCGCTAAAATTGAACAAATCATTCAAGAGAAAAA
GATGGCAGGTAAAGGATGGATATGGCTTGGATCTGATGGTGCCACAAGTG
ATCATTTCTCATTGAATTCCAAACTTGCCAGTACTATGGAGGGTATGTTA
GGTGTCAACCCTAGACGTGGCGATGGAGCTTTCTATGTCAAATTACTTGC
TAAATGGTTATCCAAAGATCGCTTGACATATCCTGGTATTATTCATGAAG
AACATGTTGCCACTTTGTATTCAGATGAAATTTCGTCCAAAGAAATTGCA
CAACGTTTTGAAAGTCAAATGAAGAATGATTCCATACCAATCATTGCATC
TCAAATGTTCCCTCAGAGTTCTGATAGTGTCAAGTTGGTTGATTTCGTCG
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CCAAGTCTCGATTTACAAGTTGGAAAAGTATCATGGCCTGGTGGTAGCTC
TCAAATTCCAACCGATAAAGGGAAACCGGGTAAAGCTTTATTCCGAATCG
GATTCGTATCTCCAACTAATCCAGCATTGGGAAATTTGGGCGAATACGGT
AAAGAGTTGTTATCAGCCTTCCGAGTGGCTTTAGAAGTCATCAATAAAGA
TGATTATTATCAAATCGAATTAGATGGTTTGACCAAGGATGAAGGTTTTG
ACGGTAACCGAAGCTGTCAGGAAATTGCCGAACAAATGAAAGAACAAAAT
TTGGTAGCAGTAGTTGGTGCTTATCGTTCACAATGTTCAATGAAGATGCA
CGAGGTCTTAGGATCTGAGGATGTCAAAATGCCAATCATTTCTTACGCTT
CACCGTCTGTCTTGTTATCCAATAAACAGAAATATAAATACTTCTTCCGT
GTACCACCATCCAACTTGTATCAAAGTGAAATCATGAAATTGATTGTACG
CAAGTTTGGATTTAAAGAGGGCACTTCTGCATCCAGTATCAGAGACTTGG
TCGCCAAACGTTTGAAAGCATCAGAAAACGTACGAACAGGCCTCTCGTCT
GTCATGGGAGATCCAATCTATTTCAATCAACATACTGAAGGTCAACCGAA
ATTCACAATTTCTAACCAAGTGTGTACCGTGGCCGAACATACTACGATTT
CTTGATTCATTGGTACGATATGGCAGACAAGAAAGCTTACCCTGGTAGAA
TCTGGAGACCAGGAAAACAACCATCTGTCAGCCCCTACGTTGGACAAGTT
GTGCGGGCTGTTTCTGCCTTCCATTCCGTACTTGTTGATTTAGCAAATGA
GAAAAAAATTGCACAGCGAATGTATGGTGAAGGTTGGGTTTGGATAGCAA
CCGACGGTGCCACCAGTCTGTATGTTGGTGATAAAGCCGATATCAACCTC
ACCACCAGTGGTTTCATCGGAGTTGGTCCTGAAAATTAAAACCTCTGGAT
CACGAGTCAATATAATCGTTGCTAATGGCAATGATTTCTACACCATTGTC
AAACAAATTAAAGTCAAGACTGGTATGATTCATTCCGATGATGAATATTA
TGGCAAAGAATTGAGTGACGAAATCATTTCCAAATCGAAGAATTCTGGGA
TTTACATCAAAGAACGTGTTTCATTCTCCTCCACTTCGTCTACCGTAGCT
ATCGATAAAAAATTGCAAGCGAATCGAATATGCCACAGATCTCATACCGT
TCGCAATCAATGAAACTATTGAACAAAGACACCTACCCCAACTTCTTCAG
GACGAGCTCAAACAACAAGAAAGAAGCACAAACTATTGTGGATATCATCA
AACACTTTCGTTGGACACAGCTTTGGTGAAGGATGAAGGAAAGAATCCAG
TCACCGATTGTCAGAACATTGCGAGGACTTTTCACGGTGATAGCAACGTG
GTCGGTGTGGTCGGAGCTTACTCGTCGTCATGTTCTGTTGCTATGCAACA
AGAACTTACCAGCAGCAGAAGCAGCTTTCAAAATTGCCGTATTTACTGTC
AATCGTATCAAAAACTCTCCTGTCAAATTTCGGACAGATTTCAAAGCAAC
ATTTGCTTATTCAGCATCCATAAATGTATCACTTGGCTTTACTGCGCCGC
TTGATGACTCATACGGCCCTTTGAAGCCGCTTGGAGAAGAATTACTCGAA
CAGAATAAACACTGGATTGACATGTGTACAGTGTTCACACAATTCAAAAC
AAACACGAACAAACGAAGATACTAACCAACAAACTGGATTGAGATCCAAT
AAGAAATTCAGGGGAAATCGACGAAAAAGGAAACAAGGCATCATGAAACA
TTCGAATTACATTTTTACGTTATTTATTTGGGGCTGTATATTTTCATTTC
ACGATGACGTCGGAAAACCTAGTGATTTAAATCAAGGTGGTGTATTCTCA
GTATTATACGGACATACAGTAAATAGACCTGGAACAGGTGTAAGGAGTAT
TATGCAACCTAACGGGAACGGTCATATAAAAAGACATTCGTTAGAAGCTG
CCGTTGAGCTTACAGACCCTATGATACCAAGGCATCTATAGTGATCCCAA
TGGGAAAAAAGAGCCATTGAAAGAATCGAGTGGTACATCACAAGGCTTGA
TCGTACTGGCTGTCGTGTTCAGCATATTTGGTCTCCTTGTCATCATCTTT
ATGTTATACATCGTCCGCCGCGTGCGATATCGTCATCTCTACATGCAGGG
CAACAGTTGGGTAACCGTCGGGAGTTATGAAGATAAACAACTGTTACTAA
CCAACAGTGTTGTATGGCCAGGAGGAACGGTCAAATTCCCACCCTCAAAT
CCACCTGTAGAGTCTCAAAGATCGAAGCGAGAGCACATTTATTACGTAAA
ATGAAATCCATGAAAACATTGGAACGAGGATTCCATAGTTCAACGGGAAA
GAAAATGCACTTCAATAAATTCCAAGATGTAGCACCACGATATGAATTGG
TTAATTTAAATGTTTCATATATCGCACAAGTGTTTGATTCGGTGTTAGTA
CCAACATTCGCGCTTCACGAACTTCACAAAGAGAAAGTGATCACTTCTGG
TATGGTTGGCAAAGGATGGACATGGATCGGCTCAGACGGTGCAGTATCGA
CCATGTTCACACGCTCTCAGAATTTACAACGTGCAATGCAAGGCATGGTG
GGATTCCGTCCGAAATCCGGAAACGGACCATTATTTGAGTCATTATACAA
TGAATGGCTAGGTGTCGATCATTCTGCTGATAGACAGTTGAAGGATTCAG
GATCTGGAGTGAACCTAATGATTACCAACCCTCAAGACTCGTTACAGTTA
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TGGTGCCGCTCGTTCAGAATGCACAGCGCGTATCTACGAGCAATTACGGG
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CCAAGCTAAAGCCTTGTCTGATTTGGTTGAGAAATATAATTGGGACCGAG
TAGGCATAGTTGCTGCTAAAGGAATCTATGGTCAGGAATTATCGGACGAT
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GTATGATAGAGGATCCAAAAGAATGACCAAACAAATTTCAAAGGAATCTG
GTTTGAAAGCTGTGGTGAACTGGGTGAATAAGAACGATTCATTGACGGTT
GGCTTCGATGTCACTTATATTGATACTGGCCTCTATTCAAGCAATTGTTC
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TCACTTGGCTTTACTGCGCCGCTTGATGACTCATACGGCCCTTTGAAGCC
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CAGTGTTCACACAATTCAAAACAAACACGAACAAACGAAGATACTAACCA
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CTGGAACAGGTGTAAGGAGTATTATGCAACCTAACGGGAACGGTCATATA
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GAATGTATGGTGAAGGTTGGGTTTGGATAGCAACCGACGGTGCCACCAGT
CTGTATGTTGGTGATAAAGCCGATATCAACCTCACCACCAGTGGTTTCAT
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This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR000337GPCR_3
IPR001828ANF_lig-bd_rcpt
IPR028082Peripla_BP_I
Vocabulary: Cellular Component
TermDefinition
GO:0016021integral component of membrane
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0007186G-protein coupled receptor signaling pathway
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0004930G-protein coupled receptor activity
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0007186 G-protein coupled receptor signaling pathway
cellular_component GO:0016021 integral component of membrane
molecular_function GO:0004930 G-protein coupled receptor activity
Blast
BLAST of TCONS_00012728 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: GRM3 (Metabotropic glutamate receptor 3 OS=Homo sapiens GN=GRM3 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 92.4337 bits (228), Expect = 1.885e-18
Identity = 96/392 (24.49%), Postives = 163/392 (41.58%), Query Frame = 1
Query: 3160 SLAKKLPSVIDIVIGAARSECTARIYEQLRERGIPVISYASTSTLLSKKTNYPNLFRLCPSDEHQAKALSDLVEKYNWDRVGIVAAKGIYGQELSDDLSQELGIRTIGVTNKQLYDRGSKRMTKQI---SKLKDSGSGVNLMITNPQDSLQLYQEAFELGMVGKGWTWIGSD--GAVSTMFTRSQNLQR-AMQGMVGFRPKSGNGPLFESL------YNEW--------------------------LGVDHSADRQVSYIAQVFDSVLVPTFALHELHKEKVITSRVSKIEARAHLL--RKMKSMKTLERGF------HSSTGKKMHFNKFQDVAPRYELVNLNG----NSWVTVGSYEDKQLLLTNSVVWPGGTVKFPPSNPPVDPNGKK 4185
            ++ + +P +I  VIG + S  + ++   LR   IP ISYASTS  LS K+ Y    R  P D +QAKA+++++  +NW  V  VA++G YG+   +   QE  +R I +   +   R + R +        L+   + V ++     DS +L   A         +TW+ SD  GA  ++   S+++   A+   +  +P       F+SL       N W                          L +D S   Q S I  V ++V     ALH++  ++ +    +K+     +L  +K+     L+  F      +      + F+ F D   RY + N        S++ VG + +   L  NS+ W   +V     + P  PN  K
Sbjct:  133 AIQENIPLLIAGVIGGSYSSVSIQVANLLRLFQIPQISYASTSAKLSDKSRYDYFARTVPPDFYQAKAMAEILRFFNWTYVSTVASEGDYGETGIEAFEQEARLRNICIATAEKVGRSNIRKSYDSVIRELLQKPNARVVVLFMRSDDSRELIAAA---SRANASFTWVASDGWGAQESIIKGSEHVAYGAITLELASQPVRQFDRYFQSLNPYNNHRNPWFRDFWEQKFQCSLQNKRNHRRVCDKHLAIDSSNYEQESKIMFVVNAVYAMAHALHKM--QRTLCPNTTKLCDAMKILDGKKLYKDYLLKINFTAPFNPNKDADSIVKFDTFGDGMGRYNVFNFQNVGGKYSYLKVGHWAETLSLDVNSIHWSRNSVPTSQCSDPCAPNEMK 519          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00012728 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
GRM31.885e-1824.49Metabotropic glutamate receptor 3 OS=Homo sapiens ... [more]
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