XLOC_001338 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_001338
Unique NameXLOC_001338
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000020:383816..405142-

Legend: gene
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>XLOC_001338 ID=XLOC_001338|Name=XLOC_001338|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=21327bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000020:383816..405142- (Clytia hemisphaerica)
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AATCTAGTCAATGAACTCTGGCAACCTCGCCGTCGGCAAACTCGTACCCA GAGCCACCTCCACCACTTTTTCATTTTACTGGAGGAAATGATACAACCGT GAGGACTATCAGAACGAGAAAACAAACTAAGAGACTGGGAACGAGTTTGT CCTGTCCGATATTAAGAACATTATCCTCCACTAGAAGTACACGGTGTTTA TATAATCTCTCATTTCCAAAAATCATTTTTTATAGTTCCATGTCATTACC AATCTTGTCCATTCGGGCAGCTATGCACTATGGTTAAAAATCTCCCGACA TGCACTTGTCCGAAATGCAAAGACATGATTATGTCACCGGTATGTGGCGA GTTGAACGGTGTTACGTATAAGAACGAATGTGAATTGAGACAAGCTGAAT GTTTACAAGGAAGAGAAATAAGAATGACACGTGGACCATGTAAAGGTATG TATTTTTACGGTCTCCACTTTCGTGTGACATGAGCGAAAACTTTTTGACG TTTTTGTAAGGTCATTGGTCGGTTGAAAAATGAAGCAATTCCATAGGTCG AAATTGACGTAACGGATGAAAAAAAGTTTTCTTCTACTTCCTTCAACTTT TTTTTGTTCGCGCGAAACTTTTTTATGACGTAATCTTTTCTTTAAGCAAA AAAAGGTTAAGAAAAAACTCTGGCCCATTTCGTGCGAAAGTGGAGACCGA CCTTTACGGTCTAAACTCCAAAGCTCGAACGCAAATCTGTTCTTGTTATG GAAATTTCGAGTTATACGAGTTGTAGGGGGTTCAACTTGTGGAGAATTCA CCGGCATAGAAACTTGAATGTGTAATCAATTGATTATTAAAAAACGATGC AAATCTTCTACGCTAAGAGATAGTTCGTATTATAGAAAATTCGATTAGTA GAAGCTCGAATTAGAGAGAGTCGTAGTTGATTTGCTTCATTTTCCATTTC CATTAAAATGCATTATCCAAATTTCATTATTCCAATTCAATTCGCTTTTC TAGCTAAAAACATCAGTCGTGTGGTATGCCGTGAAGATGGGATGAGAATC GAAGTGTTGAAATCCTTCGTTGGCAATGAACAAATCACTCAAAAACGCTT GACGTTATTGGACAGTAACTGTGTCTTCAAAAGCAATGAAACCCATCTCT TCATTGAAACAAAGCTAAACGAATGTGGTACAAAAGCCAACTTTGCACTA ACCTCTGTTATCTATTCAAACACAATTCGTACAGAGATCGACCCCAATGC GGTGATTATACGAAATAAAGATTCCGTACAGATTCCAGTTGAGTGCTTTT ATTCAATAACCGGTAAAGGGAAAGTTGAAATAGCAAGCCGTGGAAAGTTT GGAGACCGTATCGAGGAAAGATTACGTGGGAATGGTATCGGTGTCCGGAT TAAAAGTGATAATCAACGGAAATACCGGTCAGCTCAAGAAATGAAAATTT CTTTGGATAAGGAATCGAAGTACATTGTTGAATTGAAAGCAAAAGCCTTG AAAGTACCTGCTCAAGCACATCTTTATCCGAAGTTTTGTTACGCGACTCC TGTCGACCGTAGCGATCGTTGGATGAGATACACATTGATCAGAGATGGGT AAGCTTTTCCTGTGTTGAATTCGTTCCCAACCCCTTTAGTTAATGATGAT TTTGGTAGCACTTAGCCCGGGGTCCACTTAAAGCTTTTTTTATAGACTGA ATATGCTCTTGCTTAGATGGACTGTAAAACAGTCGACCAGACTTTAGTTG TTTTTTTTAAGGTAAAAACAGTATGAAGCAATGTTTTTATTTGAGGATAA GGAATTGCAAATTTGTTATTGATGTTTGTTTCTCATTTTTGATTATATCT TTCAACTCCAAGTAGTTTAATTGCTATTTGGATTTTTAACATTTTCTCTC GAAATGGCCACCTCGCCAAACGCTCTTAGTCTACTTCACTGGACTCTAGT AGCACTTTTGCCCCTCTNGGCCACCTCGCCAAACGCTCCTTGTCTACTTC ACTGGACTCTAGTAGCACTTTTGCCCCTCTCGCCAATCAAAACAGAACTC TGTTGCTTTGATCCTTTGAATTTGAAGCATTTGTTTCCCTTTCTCGAGTA CACATTTTTTTATACAAGCAGCTTTATACAAGAGGGCTCAAAACAGCCGA TTTTTTCTTCACTATCTCGTAAAATAAAAGCTTTTTAGATAATTTAACCA CGGCCAACGATAGCCCTTAACCCATTAAGCATAAATATGGTATAATATCA GCTAATTTTCCAGTAAATGAGATAGAATGCTAAGCAACCCCACCCCTGAC ACGAAAATTGGAGTTGCTTATAGAAAAGAAATGTGTACGCGCCAAGAGAT TTTTTCCAACTAGTAAATTACTTTTCCACCTGAATAGAGCCCATGTCTAT GGAAATTCAAAATTCATGTTTCATTTTTGTACGAGGGATGTTTATAAGCA ACTTCAATTTCCGGGTTAGGCCTTTTGGTTGCTTTAGCTCATTTACTGAA AAACTAGCTTTGACCACCCTTAATATTATACCATATTTATGTTTATTGGA TAAAAAAGCTGTAGTTTGCCATGGTTAGATTATCTAAGGTTTTACTTTAC TACGAGNGGGGTAAAAGGGCTGTCGTTTACCATGGTTGGATTATCTAAGG TTTTACTTAACGAGATAGTAGAAATGATTTGTCCCTTAGCAGATTACAAT TTTGTTAGCTACCTTTTTTACGGTGATCTTGAGATGATATTTACATGTCC TTTAGAATTGATGGAATTCGTGTTCTTTTTTTAGATGTCCTACTGAGGAA AGTGTTGAAATAATGGATTCAAAATCACCATACATCAAACTACTTATACC TGGTATCGAATTTGACAACGCCAAGCGTACTGGATTCCTTGTCCGCTGCA AGATTCGAGCATGCTTCCCACGTGATCCTAACAACAAAGCTATGTGTTTA CCACAATGCAATTCGAATAAAAACAATAATGGTGACCGAGTTGTTGTAGA TACCAATAATAATCGGCAGAAACGTGAGTTGGCTGAGTTTGGGAAGCGGA GAGCCAGACGTAGTGCTGTAGAAAGGTTCTATATTGATTTAACGGCGGAA GAAATTGTTGACATGTAAATAAAAATGATAAAAAATGGTTTTTACTTGAA TGGATACTATCTATCTTTCTAAGTATGAAGAAAGTATTTCGCTTGAAATA TTATAGAGAGCGTACCATTCATTCCTTAATGAACAATGGGGTTAACAATG ACACAACGTCGTTTCAACGTCCATGGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00002499TCONS_00002499Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00002499-proteinTCONS_00002499-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000020supercontigsc0000020:383816..405142 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
20.18 19.76 6.52 5.34 3.87 3.35 6.27 6.21 3.68 6.03 5.21 2.97 20.12 17.95 10.85 6.79 18.35 30 25.94 33.46 12.06 11.98 19.73 18.61 6.1 6.38 8.55 5.07 46.03 45.37