TCONS_00072784 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00072784
Unique NameTCONS_00072784
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4106

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00072784 ID=TCONS_00072784|Name=TCONS_00072784|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4106bp
TCAAAATACAACTACTTACTATTGAATCAAACCTCAATAGTGAATAATCC
TTGATTTGACAAATTTTCTATTCACAACGATTAATTACCAGCTAGACGCG
GTCGCGCGGGAACGCGTTGATTATTCCGGTCAATAAAATAGACATTGTCA
ATCTTTTGAACTCTTGTTATGTCGGTCGGGTGTGTGTATAGTATTTAGAA
GGTACCATTATAAACAATAGTTTAGATACGACAATGGTTTTGAGTAGTGG
TTGATGATAGAAAGATCTTTATAAAATGTAGCTGGATAACAAACTGACTG
AACAACTGACAAAAAATCTGTCTTTCTCTTGGGTAAAAAAATGTCGGAAA
TTAAAGATTACATGCTTGATTTATACGTGAAAGAAGATCGTGTTGAACGA
GTAAAACATTACACCGAACATgttgaaaaattgtttgatgTTGAACTCAA
GTTTACATCAGGTGAAGGAAAACAGTACATGCCAGTTGCTGGACAGTGGC
TTGATGTCGAAGGTCAAAGAAGGAATGTTATCAAAGCTAGGGAATATGTC
AAGGGATTATCAAGCCCTGAAGAGGTTATACGATTCACATTTCCAGAGGA
AATCTACGAGATAATTTGTGGAAAAGAAGGGGACAAATATTACGAACTTG
AACAAGAAACAGCAGCAAACATTGTATTTTACTCACCAGTTGAAGTTGAA
ATATCAGGGTCAATAAATGCTGTCACAAAAGCCTCTACTGTAATTGAAGA
TATAATCAAAGACTTTGTTAATAACCACTCTCCGCCTCCATTACCATTAA
ACGAAGAATATACAGAAGATAACCCAGACTATAATACATGTGTTGTAGAA
CGAGATAGTGGAATTTATCTAAAATGTCCTCTGGGCTATGACTCTCAATC
AGACCTTTCTTTAAACAGAAGCAGTATCGTAACAGTTGATGAAGGTCTTG
AAGCAGACTCTGAATTACATTCACAACATTATAATTTAGATGATAACCGT
AGTGACAGTATCTCACCTAGAAACTCAACAGATAACGAAGAACTAATGGA
ATATGCTAAAAAATTGGGTTACAGTGAAAGCCAGGTTAAAtcagcaataa
aaaaacttggTCCAGATATTGTAGATCAAAATGATTTACTTCACGAGTTA
ATAAAAGCATCTAACTCTATACGAGATAATAAATTTTTAGAGGACAATTC
AGGTAGTTTGAAAAAACTATATGATACTGCTTCAAATCTTTCCACTAACT
CTGATAATGGATTTCTTCGGCATATCGTAATTGATGGATCAAATGTTGCA
ATGAGCCATGGAAATAATCAAGTGTTTTCCTGCCGTGGGATTGCCATTAT
CGTTAACTATTTTCAGAAACGTGGACACGGCGTTACGGTATTCGTTCCCG
CATGGCGTAAAGAAACGTCCAAATCATCCACGCCGATCATCGATCAAGAC
ATATTAACCAGACTGGACAGTGATGGTGTGTTAAGTTTCACGCCGTCACG
TCGCGTTGACGGCAAACTAATACAATCATACGACGATCGTTATATCGTAC
GTCTTGCCATGGAAACGGATGGGATAATTGTGTCAAACGATCATTTTCGT
GACTTACAAAAGGAAGAACCGAACTGGAAAGATTTTATTAACAAACGTTT
ATTAATGTATACCTTCGCTGGTGATATTTTTATGCCACCTGATGACCCGT
TAGGTCGACAAGGTCCCAACTTAAGTGATTTTTTACGTAAGAATACAATT
GAACGGCGTATGACGCAGTATTGTCCTTACGGAAAGAAGTGTACGTTCGG
ACCAAAGTGTAAATTTTATCATCCAGAAAGACGTTTTTCAGGCTCGTTTG
TTAAAAAGCCGTTACCGCCTTTACCGAATCAACATCACCACCCCAGTGGG
GGCGGAGGGAGTGGGTCACGCCCTCGCTCAGATCCTGGTCATATTAGTTT
ATCTGGTGATAATAAACAAAGGCCGATCAGTTTACCGAACTTGGAACAAT
TATACGTTTCTCACCCTCACTCTTTACACAGACATATTTACATGAACTCA
CAACAATCGCGCCCCGTTAGCGGGCCTCCTTTCCCGGAGAACGCCGCTAA
TAATCAACAACCCTATCCACTTTATGCGGCTGCCCGTGAACAGAATTTAG
CCGCGCGTGCAGCAGTTGAACTTATGAACCAACAGAAACAATATAGCGGT
GATTATTCACATTTTAATCATACGCAACCTTATGTCATGTATGCACAGCG
ACGGCCACCTTCTGGCGAATTTGTTGCGATGCCGCCAAATCACGAGGGTA
TCGGCCGTCCGTTGTCGTCAGATTTCGGTAGTCGTCCGTCATCGGGCGAA
TATAGTTACGCTGGAAGTTGTAATGGGAGCCGACCCGCATCGGGTGATTA
CGGGAATAACAGTCGCCCATCTTCAGGTGATTTTGGCTCCATGCAGTGGG
GCTACCAAAGACAATTTCCTTCTCATGGCGGAAATTTCTAtccgaaaaaa
gttttttataaatCACGTGGTGGACCGACTTTACCTGAAACAAAGGAAGA
ACCGCGACCGacccctaaaattgacattgTTAATAAACTACGCGAACTCT
ACCCTGAGAAATACGACCAGATTTTGTGGATTTTACGAACATATCCCGAG
ATAAAATCGGTTGACGAAGCTCTGCCTTATTTGAAAGAGTGTATAAAGGC
ACaataaattttggtttgataCTGAATTTCATTGGCAAAATGCTGATATA
TGcagaataattttaaaaaaattctccaaaaaaagaaaattattttttgc
aatgtttataTATTACGACTGCACGCTGCGcataaattttgttttatatt
ttctgttcagttcttcaaaatattatttgaaaccggaattttccaatttt
gaatccGAAATTCGCGATTTTCAGCTTGATTTTTCATAAGATAAAATTGC
TGACGTATTAAATAGACTCCCTCAAAATACGTCATTTTGCTACCTTTTGC
CCCTGTTTTTGTTCCTTTAAGATTTTcagtttatttttgaaacaattttt
tgcaaaacattTACGAAACATTTATATTTATTGACTATTAATGTTTTTAA
GAGAAAAATATAGTTTTCAATACTATTCTTTTAATATTATATAAtatatt
ttactgaaaatttactaaaaagtttttctttcaaaattttgtatttttAG
AAAAAACCCTTTTATACAAATACCTTTTTCTATATTTTCTATCTGTACAT
TTATATTGACATTTTTTCCAAGATATCTTAGATTGCTGAAACCTTTCGAA
CTATTTCCAACTGTCAGATTTCATTAGTCGACTCGCGGAAAGGATACAAA
ATATTCGTGCAAGATTTCCAATATGCTCTTTATGAAATTTTTCTATTAAG
TATTATTTTCTATCTCTGATATTTTCTTATTTTTATACTATTATATATTT
TTGTGAATTCCATTTTATAAGTGGACCAGTGATTACATGATGATCGTCAA
ATGTAAAATAAATAGATCATTCCCGCTCCCATAAACGCCGGATTCAACAT
CCAATTCATGGTATTCATAAAGTATTCTTTTGTACGGAAAGATTTCAAAA
ACCGGTTTTTGCCATTAGAAGCTATAAACAATAGAACTAGTGGCAAAAAT
CCGGTTTTTGGGGTGTTTCCGTACAGATGATTACGTCGTGAATATCTATC
CGTAGTATATGAATGGGGGTGTCCGATGGTTAGATATACGATTGTCCGGT
TGGAATAGGGGAATGATCTATGTTTACACAGTTAGAACAAAAACAACCTA
TACTAGTTTTTATATAAAAACTCTTTATAAGAGTGAAAAGTACACCCCGT
GTTGGGCCTTGTATTTGTAAATCAAGACAGTGCACTCTGCATACACTTCC
CAACATGGAACAGAACTTTTTTCAACTAAGGAAATTTTGTCTGTGTCACG
GGAATGCATTTTTGTATTATTCCGTATGTAACTAAAACAATTTTATCTTA
TATAGTCACTTTTTTGAAAAAAATATAACCCTTTAGAAAAATAGATTTGA
TAATAAAGTCTTTTTTTAATTCTGAAAATCACTGGTCCTGCTAATCTTAT
AAAATG
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00072784-protein

>TCONS_00072784-protein ID=TCONS_00072784-protein|Name=TCONS_00072784-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=788bp
MSEIKDYMLDLYVKEDRVERVKHYTEHVEKLFDVELKFTSGEGKQYMPVA
GQWLDVEGQRRNVIKAREYVKGLSSPEEVIRFTFPEEIYEIICGKEGDKY
YELEQETAANIVFYSPVEVEISGSINAVTKASTVIEDIIKDFVNNHSPPP
LPLNEEYTEDNPDYNTCVVERDSGIYLKCPLGYDSQSDLSLNRSSIVTVD
EGLEADSELHSQHYNLDDNRSDSISPRNSTDNEELMEYAKKLGYSESQVK
SAIKKLGPDIVDQNDLLHELIKASNSIRDNKFLEDNSGSLKKLYDTASNL
STNSDNGFLRHIVIDGSNVAMSHGNNQVFSCRGIAIIVNYFQKRGHGVTV
FVPAWRKETSKSSTPIIDQDILTRLDSDGVLSFTPSRRVDGKLIQSYDDR
YIVRLAMETDGIIVSNDHFRDLQKEEPNWKDFINKRLLMYTFAGDIFMPP
DDPLGRQGPNLSDFLRKNTIERRMTQYCPYGKKCTFGPKCKFYHPERRFS
GSFVKKPLPPLPNQHHHPSGGGGSGSRPRSDPGHISLSGDNKQRPISLPN
LEQLYVSHPHSLHRHIYMNSQQSRPVSGPPFPENAANNQQPYPLYAAARE
QNLAARAAVELMNQQKQYSGDYSHFNHTQPYVMYAQRRPPSGEFVAMPPN
HEGIGRPLSSDFGSRPSSGEYSYAGSCNGSRPASGDYGNNSRPSSGDFGS
MQWGYQRQFPSHGGNFYPKKVFYKSRGGPTLPETKEEPRPTPKIDIVNKL
RELYPEKYDQILWILRTYPEIKSVDEALPYLKECIKAQ
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at scaffold_84:72998..86822-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00072784 ID=TCONS_00072784|Name=TCONS_00072784|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13825bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_84:72998..86822- (Clytia hemisphaerica)
TCAAAATACAACTACTTACTATTGAATCAAACCTCAATAGTGAATAATCC TTGATTTGACAAATTTTCTATTCACAACGATTAATTACCAGCTAGACGCG GTCGCGCGGGAACGCGTTGATTATTCCGGTCAATAAAATAGACATTGTCA ATCTTTTGAACTCTTGTTATGTCGGTCGGGTGTGTGTATAGTATTTAGAA GGTACCATTATAAACAATAGTTTAGATACGACAATGGTTTTGAGTAGTGG TTGATGATAGAAAGATCTTTATAAAATGTAGCTGGATAACAAACTGACTG AACAACTGACAAAAAATCTGTCTTTCTCTTGGGTAAAAAAATGTCGGAAA TTAAAGATTACATGCTTGATTTATACGTGAAAGAAGATCGTGTTGAACGA GTAAAACATTACACCGAACATGTTGAAAAATTGTTTGATGTTGAACTCAA GTTTACATCAGGTGAAGGAAAACAGTACATGCCAGTTGCTGGACAGTGGC TTGATGTCGAAGGTCAAAGAAGGAATGTTATCAAAGCTAGGGTTGGTTGT TAATATAGCAAATGTTTTGATTTCATTTAGTTATTTTTATAACCATTTTG AATACGAGAACCCCTTTAGTGTTCGTGTGTTTTTTGTTTACTTTGGAAAG TTTATGTTTACATACCAAATTAGGTTTGATCAAAAAACCGTCATCGAAAA AAAGACACAAGTATTCATTCATGCAGGCCGTGTTATGACAGTGTGGCTTT AACAGAACTTTTCTGACAAGAAAAAATGATAGTGATCTTTAACAATATAA TATCTTACATTTTTTCATATCACTGTAATAAAAACCTCTCACATTCTTTA TTTGATATCAATCTAATATATTCCTTTATTATTATTCTTAGGAATATGTC AAGGGATTATCAAGCCCTGAAGAGGTTATACGATTCACATTTCCAGAGGA AATCTACGAGATAATTTGTGGAAAAGAAGGGGACAAATATTACGAACTTG AACAAGAAACAGCAGCAAACATTGTATTTTACTCACCAGTTGAAGTTGAA ATATCAGGGTCAATAAATGCTGTCACAAAAGCCTCTACTGTAATTGAAGA TATAATCAAAGACTTTGTTAATAACCACTCTCCGCCTCCATTACCATTAA ACGAAGAATATACAGAAGATAACCCAGACTATAATACATGTGTTGTAGAA CGAGATAGTGGAATTTATCTAAAATGTCCTCTGGGCTATGACTCTCAATC AGACCTTTCTTTAAACAGAAGCAGTATCGTAACAGTTGATGAAGGTCTTG AAGCAGACTCTGAATTACATTCACAACATTATAATTTAGATGATAACCGT AGTGACAGTATCTCACCTAGAAACTCAACAGATAACGAAGAACTAATGGA ATATGCTAAAAAATTGGGTTACAGTGAAAGCCAGGTTAAATCAGCAATAA AAAAACTTGGTCCAGATATTGTAGATCAAAATGATTTACTTCACGAGTTA ATAAAAGCATCTAACTCTATACGAGATAATAAATTTTTAGAGGACAATTC AGGTAGTTTGAAAAAACTATATGATACTGCTTCAAATCTTTCCACTAACT CTGATAATGGATTTCTTCGGCATATCGTAATTGATGGATCAAATGTTGCA ATGAGGTAAGTCTTGAATTTCAAAACATTCTCAACATGATTTTGTTTGAT AGGATTGCTATATAATTTGTACGAGTAAGGTTCAAAAACTTGTCCTTGAA ATTATGAGCAGGAGTTACTTCAAAGTTGCCATCACATGTCATGTTATGCA GGTTACGCCATCAGTTGTTCTGCCAAAGGAATTCATTCTTGTTGAAGTCA TCTTCGTTGTTGGTTTTTAAGCCTTAAACAAAAAGGTCACTATTATTGAC TGTGTTTGAAATCATGTTTATTACACTTTTGATCCATTTTGCTATTCCAC TGGAAATCAATATTATCTTCTCCAAGCAAATCTAACAATAAATACAGCAA CCACTTTTTGATGTCCTTTTCATATTGGTTTTATGACATTTTCTTACTAA TTATAAAACTTAACTTGTCACATAGTCTTCAGAAGGTCAGAAATTTGCAT CCCTTGAGTGCAGATATTTTTGTGGTTATATACCAATCTTTTTTACATAT TTGGATTAATTCAGTGCTAACCTTTCCAAATTGTGAAAAAAGCTTTGAAC TCTTATGACTTTAAATAGAGATCATTATGTCCTTTGAAAGTTTTGTTAAA GCTCATACATTGTTTGGCGTGCCAAAATTGCAACAATTTAACTAAACATC TCTTGCTGTTTTCTTAAATCCCTCTCGTTCTAAATTTTATAAATCATAAA TTCAAAAAGATTTAACTGACTAGAAATTGTTAAATTTAATGGGAAGCTTA GGATTATGTTTTCCGATTCTCAAAATTCTTTTTCAGATGAATTTTAATTA TACACAAATGTCTCGTCTTAACCAGGCCCCAGTGGATAAATTTTTATTGA GAATCTAAATTGTTTTAAAATTTATCACATTAGACATTAAAAAAAATTTT CATTTATTTAAAGTCGTAATGGTTGAAATTTACAAGCTCATTTGATATGA TTTTTCAAAATTTTACAAAGTTCTCAACAGGCTTGAAAGGAAACATTTAA AAATCAGCATTCCTTGGAGTTATTTGTTACCATGAGTTTTTCTTTTAATA AGTCAAATATCAAACTCTGTCACCGTTCATATAATTGGGTTTGAGGTTTG CTGGCATTTTGGTTTTGATTCTAATTAAGATCTAATACTAAATCATTACT TAAGATTTCAAGTTCATGACAAGACAATATGAAACAAATTGTTTCAGAAT AACCAGGTTTCAGGGACTCTTGTGCTTACTGCTTATGTGTTTATTTGGTG TCATAGGAAAATCTTGGTGATGAAAAATCTTGTTTTTTTTCTTGATAATT CTGTAAGATTTGTATTTGAAGAAGGGTTTGTTTTGTGAAAGAAAATACCA TGTCAACAAAAGTTTTATCTTTTCTCAAACATTACATTCAAATTACAAAG AAATCATGTTCTAAGAGGTGGTTATTTTTATGTCAAGGGATTGAGATTTT ACGCAACATTTTTTTGTTAGATGATGGTGATACTTTCACTCTTGGTTAGA TTATGGTCAATAAAGCCAAGAGAAATGATCTGGTATATGCAAATTTTGAT AAAATCCAGATCAACCAAATTTCAATATTTTGTCACTTTGTATGGTAGAA TTTCGGTTTTTACTGTTTATATGGTGTCCTTTAGAGTCTTATTTTCAGGA AATGTACCCTTGGGTATTTTTCTATTTGATCCAAGTCCTTCCAACTGCAT CAGCTGATTTTAGCCTTGTTTGCAGTTTTTGGCAGACTGCCTGCATCCAA TTTTATAGTCTATCCCATCAAAGAATTTTAATTGAAATTCCACAAAGGAG CTGTTCTAAGTCATGGGCTATATTAAATCTGCACAGCTGGTCTGCTGTTT TTCATGTTTGACCAAAAGCATAGTCGCAACATTGTTATAATAGCTCACAA ACAAGATTTAAGAATGTCTACGTACAGGTTAGACAATGGATCAGTTTGAA GCCAACATTCTTTGCCTGATTATCACTTTAAAGTAATGTCAAAAATGTTT TACGTTTTCTTTTTTATGAACATCTGGGTTTTTGTTGGCTATTTAGTCGT TGAGTTCTTGTACTACTTAACACTGTTGTTAGACATTCTGCAACTGAGTA TGCAGCTTACAAATTCATGAAATTATTTTTCAACTTTCCAGATTTTCAAG AAAACCATTAAAAGGAAATTCGTGTCAAATTTAACTTTTTTTAGAAACGA GAATAAGTTTCTGTTTCTGTCTCGAGTCATTTCCACAAAAACTTCACGTT AATTTCCTATCCAAAAAAAATGTTTTTAAAACAGCATTTTTAATACTAAT TTGATGGGTTTTTTCTTTCTTAAAATAGAAACCAAAGTGGATGTTTTATA AAAATGGTATTTCATATTTCTCTCTTCTTTCTTTATTAGTGACGTAGAGT GAATGAAGTAATCAGCTGCGAAGTAGTTAACCTTTTATGGTCCTAATGTT TTTTCGAATGACAACTTTTGTTTACTTTAAAACTTTGCATCATGAACTTT CAATGAATTTTCAATTTAGGTATCATTAACTTTTAGACTTTGTCTTTGTC TAAGCTCAAGTACCATTGCACCTGATTGCGCCATTTTTATGGTAGTTTTT TTTTTTAGATTGAAGTAAGTGTGCTTTCAGTATCATTCCTTTCATCGAAA CTTTTTAAATCTTGGAAAGAACATGCTTAATTATTCCAGGCGAATGTTTA TCAACTATAAAAAAAATACCAAGATTTTGGGAATAAAACATCCAACATAC TTGATAGAATAGAAAAAATTTCTACAAGAATTAAGTAGTGTAGCTTGAAG ATTGTGCTTTTCCTTGTAGATGTTTAGATTTTGAATGCAAATTATATAGA ACCATTTTTGTTTTCATTCAAAGTTGTTTCGTCCTACACAATCAAAGTCC TTTTTCAAATAACAAAACTTATGTTGTTTCGAAGTTTGATTAACTGCTTA ACTGTGAAGTTGTGACGTTAATAGCTCTACTTATAGTCCTAGTGTCCAGT CCCTTTTGTTTTTATTGGTGTGTCTCATGGTTATAAAAGGAATATATTTC CTTCCACTTTGGGAATGTTTCATCCAATTTCCAAGTAACTTAATTTTACT GTTTATCGATTTTGCTTCTAATTAAAAAATGCAAAAGATGATGTTTTTCT TAGTGTATTTACCACGATTGCTATCAAAACAAACTCTAGGTTATCTTGTG GCTTATGATGTTTTTAATTTAGACCAAAAAAATTCAGAATACTTTGGGAA CTCTCTGTATTTTCTCTCTCATTTTCTCACAACTCTTTTCAATTTTATTT TTTTGCGGTGTGAAAGAATTTTGAAGCATTTTTGTTGGCTTAAGAAAACA ATGTTTATCCATACTTTCTCCTCCTCCCATCTTTTGGCTTTTGGAGAGGA ACCGTAAAAAACGTCAGTCCATTCGAGTTCTATAGTGTCAATTATTTTAT ATGTTGACGTCATTGTCAAGTCTTATGTAGCAGTTGAAATTAATTGTCAT GAAAAGCTTATTTTATTATTTTATATTTTTCCTTCATTTCCCCTCTTTTC TTGCTTTTTTGATAATTTTCTCTTTTATATATTTGATGATCGTCTTAAAT TCATTGACGAGAAATTAATTCTTAGTTATCTCCTTCTTTTATGCCTCATT ATTGATCATCCTATTACATATTACACGTGTGTTGTCAAAATATGTCATCT TATGCTTTTATTACCATATTATTATAGAACGAAACTTCTCATTTTTTTGC ATTTTAATGTTCCTTACAGTATCAACATAAAACACTGAATAGTAAAATCT CATTTTAATTTCAGCATTCCAATTTATCTTTGCCTATCTTATACTATCAT ACTACCTTGGACCAATTACACAATCTTATCAGTATGTAACTTCCCATAAT TTTATCAGTATAGCTTTTTTCTTTTTCATCGTCGATTCTAGCATGGATAT GGAGCCATCTTTTTAACAATTCCAGAGAAAGATATTTCCTAGTTTTGGAT AAACAAGTCCTTAGTATTTCTATGAGGAGAAATCTTAAGGAACCTCCCAG ATTCTCCACTTAGTCTTGGCATGATTTTGCATGACTTTAGTGAGTACTCA ACACTCACAAATTTTCGTACTTTTTTTTTCCTTTCCAGTTCTCTCCTTAT CCCTCTCATAAGAATTGTGTTATTGTTTTTGAGAGAAAGGCTACTTGAAA ATGAGAGACGACTTTGATGAGCAATTTATAAGCTGACTATTTGATTTCAC TAGTGAATTTGTGATTTTATACGGCCCTATTTTTCAAGTATAAACTGTCA TCACTTACTACTATGAGTTACAATTGTTGATTATATCATCATATTCTTAA GCTGTTGAAATTGACCCCTTTTGTCGTGTCTAGTCTAGGAAAAAAGCTGG CCAGGAATTAATTCATTTAGATTTTCATGGAGCCATAGTATTACAATTTT AAGTCATTTTCTAGTAAACATCGTTTACTAACTTTACAGGGTAAAAGTCT TACACGTTCTTTAACTTGTTTTATTCTGTCTTTATACATAAACATGCTAA TCACAGTTAGTTCGTAAAATATTATAATTTTCAGCGTACCATTTACAGCC CTTTTTTCAAGGTATCTTTTTGATTGTGTACCACGTAAAGAATCTTTTCT ATCTTGATTACTTTCTCCATTGTGATGGCTGATGATTAATCTAATTAGCT CTAATTTTGTTATTTCAAGATCTAATTGCAGTTGAAAATGTAGTTTGATG CATTCTTAAAAGTCATACGTATTTTTCCTTATATAGAAAAGTCTAGCATG TAATTAAAAGCTGGTAACCAAAACCCATCTCTTGTCAAGAAAGAAAGATT TTTGCATTTCATCGTGCATTTAACTCCTTAAGAAATTGTCCTGTTATCAA TTTTTAAGATATTGAAGTGTGTTTAAAATGTCTATCCTATACTAAATGCG TAATTTTCCTCTGTAAGTTTGGCTACTTTTTTTCTAATAATCATTTTACC TCAAACCAAGTTCGAACCAGGTATTTCAAGCATCTTTTTACTTGATAACC TTAAATCCAAGCTAACGTAATCTCATAACAGATCATCCGTTCTACGCACA CCACGCTCTGCTCTAAAGGGATATGATGGTGAATGCGCTCTCTTAACGAA GTCATGGCCTTTAGAGTAAATATATGCCATGCGCGGCGTATCAGATTTAG TGCTAATGAGAAGATTGCTAGTAAGGTGTTTACCCGAAAATGAAGTTAAA TCCATATGTTGCTTAACTGCCATTTTGTTGAAGTAGGCTACTTTACACTC TTTGAGTTGCTATCAAGTTATCAATACAATTTTGTTGGAGAGAGGGTTGA CTATCATCTCAGAATTTTCGGAATGTTGTTAATAATAGTTCAAATCAAAT TTAAAAAAGAAAAAAAAGATTATATTATTATGACAGGAAAAGTAATGCTA CTTTATTGACAAGCCGGCTTTTTGTTTTGTTTTACGTCTTGTTTGTTGTT AGCAATGTTTGTCATTATTTTAATGTCTTTCTAACAAGCAGGACCTTCCT CAGGAACAAAGTCAATGTATAATGTAATGTAATGTAGGAAGTACATACCA TAAAGTAGTCTATTTCAGTGTAATGTAATAGATGCACNATAGGAAGTGCA TACCTAAAGTATGTAAGTTCAATGTTAGTGTAATGTAATAGATGCACAAT ACCAGCTTTTTTAAAGTTTTGTCGGATATTATAATTATGCCTTCACTTTC TGAGTCCGATGCATAGAATTTTTTTATTCAATCTTGCCAGTAATCCTAGC CGATGTCCTTTAGACGTTTAATGGACGTAATGGACGTCGGGGCAACATTT CATGGACGTTGTGGACATGAGATGAAGGTTTAAACAACGATTGTGTCAGC TGATTTATCGGACTGAAACTAGGTTTAAAATGATGTGCTTAAGTCATAAC TTTGGTTTCTGGCTCGAGCACTATATTGGTTGACTGGTTAAAGTAATTGG GTTAATGTTCCTTGCTGCAGTGCGATACGGTCGGAAAAAGAGTTTTGAGT ACCTCTATGTGGTCAGTTCTCTATTAGACCTTAATGGTTCTTTAACGTTT ATTTGAATTCCAAATTCTCTTTCTCTTCAACTGTCTCTTGTTATATTACG GTGAATCCTAAGTGATTATCATTTAATGAGTCAACCACCTTCGCTTCATT TAAAGAGGAGAAAGAAAAATGGTTTTTAATCTCCTACAAGGCTTACAGTC TCCTTTCAAAGTTGATATTATCTGATCCCGGAGGAAGTTGTCTGTACACA AACTCAGTATTTACGGCTTATTTCAAAATTCATTGCCGTAGTAATACGAA GCAATAAACGTGAAATACACTCTGGTACATAGTACGCAGGAAGGGGCAGG GGCTTGTGAACCCGACGGGAGTGTGCCGTAGATATGTTCGAAAAAAATAG GCTTTGCGTTTGACTCGCTTATTGAAAATATCTACCGAACAGTGTACATC AGCTTATAAGCAAAAGTCTCTGGATATGGAAAGTTATTAACAAACTTAAT TAAGTTTGTTAATAACTTTCCATATCCAGAGACTTTCCTGAGTTTATTGG TCTTAAAATTCTTTCAGCCTAAATTTATAATTTTGTTTTTCTCGTGAATT CTTAAGGATTGCCTGATTTAAAAATCGATTGTCCTTTGGCTTTTAAAGAT TCATGTTTACATGCTTTTAATTTCTTTTTAATTCATCACGTTACAAAGGT TAGGTCCCTTTAAAGGTGTTAATCCAAAAATTTGCGATAAATCTTTTTGT AATTTCGATGGTAAAACTTTGACAGGTTGAAAACTATTTCTGGAAATTTT TGCGGTTGTCAGTAATGATACCCAGATTCCTTATTAATAAGGTTGTAAAA TTTGATTTATTTTTAAAACGGCCGTTCTACTTTTAGCTCTGGGAGGCGCA CTTTGTCTTATCATCTAAAGTATGACTTAATTTTTGTTGAAAAAGGCGTG TTTTTGATTTCAATGCTTGTCTAATCTGTGGCTTTAATTTTGAATTCATT GATTTTTATACATCTCTTTTACATTCAGCTCGAACCTCCCTCCCCTAACT CGCGTGTAGAATTAACTTGCTCGCACCTCGGATTGTCTTCTCTAAACTTT TTGTGGGATATGAAAATCCTCCACATTGTATACCTTTCTTTGACTGACAT CATAATTTTGAATTTCTTATCAAGTGTTTTTGCTGTTTGGATCCTTCCAG ATAGACAAACAACTGGCAGGCTTTCAGAAATCACCAACTGACTCCAGGCC AGATATCAGTAGAGTTTTCTACCAAGTCCTTAGTTTAGGTTGGCTTATAA ACATGAGACAGAGCTATCATTTTGTCATACTGTATTCGGAATCTAGAATT TGAAAAGCTTAACTCGTACAAATGTCACGCTAAGTCTCATATTTTACCTA TAAGAATTCATTATATGCTGTTTTGGTTCTAACAATAAAAATGTTATGAT AAACGTCAAGAATTATCAGGAATGTTGGTCTATGATGTTCGAAGTGTCTT TTTATATAACATTCAACGTCAATCTGAATTTTTATCTCATATCTTTTCTT CATAAAGGTTCTCATTACTTTCTTTAACTCCCTAGCTTTTTTCTTTAAGA ATTATACAATAGATGATTAAAATTTTAAGGGGGCTTTATGATTTGATGGA ATGCCATTAACGTATGCAAAAACTTCTCTTTTGTCTGTCATCATCATTAA TGGACGTTTCAAACAAAAATGACATTAATTATCTTGGTATTCAAGCTATG TCTTACTAGCTATTCTCCTTTTTAACCAGGCATCATGTACCATGGTGATT CTCCTCTTTGTCTTTTTCGCCCCATGTTATCAATCTCGTGCCTAGAGCCA CTTGGGACCGGTCTGTCTTATTCAGACATACCAGTTATCAAAATAATATA GTCTGTTGAACTAGATTTTATTCCAACAATGAGTACATCAAAACAGTCTA TATTACAAAATCACACCCAATCTTGTACCCAGAGCCACTTACACCACTTT TTAATTATACTGTGTGTTGTTTCATTATCATCCCGACTGGATATTAGAAT TCCTCTTCACAATGGTCAAAAGCTATGATACGGGCAAACGGATCTTCGGA TGTACGCAATATTTTTATTAGAGAACAATTATGTGTAGTTCCACGATAGA TTCTACTTTCTTATGTACATGCAAAAATCTGTTATTCCAAGCTGGGTGGC TTTGCAATTTAAATCAAGTTGCAATAACCCATTGTCTCATCCACATCGCA ATAAATTTTAAATTGCATCGTAATTAACTGAGCTAAATAAAATTCATATT GCAGACAAATCATGTTCCAAGCAATTAATTATAGACAGATCAATTGTAAG CTATTTGATAATGATAATATAAATTAAGTAGCAACTCTTACTCTCGGCTA CCTAATAGCCGTAGGGGTGGTTCGGAATAAGGTCATCTCAAAATTTAATA AGCGGGGGGGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGGGGGGGTTGGAATAAA AATGTCCTTGGTGGGAAATGTTCGAAAAGGAGACTAATACAGCAGAATTA GGGCAAAAGAGGGAACTATCAAAAAAGTTGGAATAAGAATGTCTAGGGTG GAATTTTTTTGAAAAATTAATAAGCACCCCCCACCCCCGGCTATTAGGTA CCCGAGAGTACGCAGGATTGTCGAGAAAGATGCCTCGTTCAAGATGATAT ACTTGTCGGCATTTTATACTTGTGCTACTATATTTCAAAGCCCTGCTTTT TCCAGCTTTGAAAGTTGATTGCGTGGATTAAAAAAAAAAATTTAAATCTA TCACAGGCCATATTTTAGAAAGGCAGGGCAGCGTCCGTTGGTGGCCAAAA AGGGCACTTTTTCTACTGTTTTTGCCACTGAAAAGACTGTTTTTACCAAA ATTGTAGTGATTTAAGGAGGGGCAACGGCCAATAACCGGACGCTAAAAGG TCATGAAAAATGGCCTGTATCATTAGAAAGAATCCCAGGGTTTGAAATAG TCATTGAATCAATCAAAAAGGGGCTTTTATTAGATTTGAATGTTATCCTG TCCGTCAATTCTTTTAACGTTCAAGCTTTATCTTTTAACCACAATAATTT ATGTTTGATTTCTTCTCATTTCAGCCATGGAAATAATCAAGTGTTTTCCT GCCGTGGGATTGCCATTATCGTTAACTATTTTCAGAAACGTGGACACGGC GTTACGGTATTCGTTCCCGCATGGCGTAAAGAAACGTCCAAATCATCCAC GCCGATCATCGATCAAGACATATTAACCAGACTGGACAGTGATGGTGTGT TAAGTTTCACGCCGTCACGTCGCGTTGACGGCAAACTAATACAATCATAC GACGATCGTTATATCGTACGTCTTGCCATGGAAACGGATGGGATAATTGT GTCAAACGATCATTTTCGTGACTTACAAAAGGAAGAACCGAACTGGAAAG ATTTTATTAACAAACGTTTATTAATGTATACCTTCGCTGGTGATATTTTT ATGCCACCTGATGACCCGTTAGGTCGACAAGGTCCCAACTTAAGTGATTT TTTACGTAAGAATACAATTGAACGGCGTATGACGCAGTATTGTCCTTACG GAAAGAAGTGTACGTTCGGACCAAAGTGTAAATTTTATCATCCAGAAAGA CGTTTTTCAGGCTCGTTTGTTAAAAAGCCGTTACCGCCTTTACCGAATCA ACATCACCACCCCAGTGGGGGCGGAGGGAGTGGGTCACGCCCTCGCTCAG ATCCTGGTCATATTAGTTTATCTGGTGATAATAAACAAAGGCCGATCAGT TTACCGAACTTGGAACAATTATACGTTTCTCACCCTCACTCTTTACACAG ACATATTTACATGAACTCACAACAATCGCGCCCCGTTAGCGGGCCTCCTT TCCCGGAGAACGCCGCTAATAATCAACAACCCTATCCACTTTATGCGGCT GCCCGTGAACAGAATTTAGCCGCGCGTGCAGCAGTTGAACTTATGAACCA ACAGAAACAATATAGCGGTGATTATTCACATTTTAATCATACGCAACCTT ATGTCATGTATGCACAGCGACGGCCACCTTCTGGCGAATTTGTTGCGATG CCGCCAAATCACGAGGGTATCGGCCGTCCGTTGTCGTCAGATTTCGGTAG TCGTCCGTCATCGGGCGAATATAGTTACGCTGGAAGTTGTAATGGGAGCC GACCCGCATCGGGTGATTACGGGAATAACAGTCGCCCATCTTCAGGTGAT TTTGGCTCCATGCAGTGGGGCTACCAAAGACAATTTCCTTCTCATGGCGG AAATTTCTATCCGAAAAAAGTTTTTTATAAATCACGTGGTGGACCGACTT TACCTGAAACAAAGGAAGAACCGCGACCGACCCCTAAAATTGACATTGTT AATAAACTACGCGAACTCTACCCTGAGAAATACGACCAGATTTTGTGGAT TTTACGAACATATCCCGAGATAAAATCGGTTGACGAAGCTCTGCCTTATT TGAAAGAGTGTATAAAGGCACAATAAATTTTGGTTTGATACTGAATTTCA TTGGCAAAATGCTGATATATGCAGAATAATTTTAAAAAAATTCTCCAAAA AAAGAAAATTATTTTTTGCAATGTTTATATATTACGACTGCACGCTGCGC ATAAATTTTGTTTTATATTTTCTGTTCAGTTCTTCAAAATATTATTTGAA ACCGGAATTTTCCAATTTTGAATCCGAAATTCGCGATTTTCAGCTTGATT TTTCATAAGATAAAATTGCTGACGTATTAAATAGACTCCCTCAAAATACG TCATTTTGCTACCTTTTGCCCCTGTTTTTGTTCCTTTAAGATTTTCAGTT TATTTTTGAAACAATTTTTTGCAAAACATTTACGAAACATTTATATTTAT TGACTATTAATGTTTTTAAGAGAAAAATATAGTTTTCAATACTATTCTTT TAATATTATATAATATATTTTACTGAAAATTTACTAAAAAGTTTTTCTTT CAAAATTTTGTATTTTTAGAAAAAACCCTTTTATACAAATACCTTTTTCT ATATTTTCTATCTGTACATTTATATTGACATTTTTTCCAAGATATCTTAG ATTGCTGAAACCTTTCGAACTATTTCCAACTGTCAGATTTCATTAGTCGA CTCGCGGAAAGGATACAAAATATTCGTGCAAGATTTCCAATATGCTCTTT ATGAAATTTTTCTATTAAGTATTATTTTCTATCTCTGATATTTTCTTATT TTTATACTATTATATATTTTTGTGAATTCCATTTTATAAGTGGACCAGTG ATTACATGATGATCGTCAAATGTAAAATAAATAGATCATTCCCGCTCCCA TAAACGCCGGATTCAACATCCAATTCATGGTATTCATAAAGTATTCTTTT GTACGGAAAGATTTCAAAAACCGGTTTTTGCCATTAGAAGCTATAAACAA TAGAACTAGTGGCAAAAATCCGGTTTTTGGGGTGTTTCCGTACAGATGAT TACGTCGTGAATATCTATCCGTAGTATATGAATGGGGGTGTCCGATGGTT AGATATACGATTGTCCGGTTGGAATAGGGGAATGATCTATGTTTACACAG TTAGAACAAAAACAACCTATACTAGTTTTTATATAAAAACTCTTTATAAG AGTGAAAAGTACACCCCGTGTTGGGCCTTGTATTTGTAAATCAAGACAGT GCACTCTGCATACACTTCCCAACATGGAACAGAACTTTTTTCAACTAAGG AAATTTTGTCTGTGTCACGGGAATGCATTTTTGTATTATTCCGTATGTAA CTAAAACAATTTTATCTTATATAGTCACTTTTTTGAAAAAAATATAACCC TTTAGAAAAATAGATTTGATAATAAAGTCTTTTTTTAATTCTGAAAATCA CTGGTCCTGCTAATCTTATAAAATG

Coding sequence (CDS) from alignment at scaffold_84:72998..86822-

>TCONS_00072784 ID=TCONS_00072784|Name=TCONS_00072784|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=7101bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_84:72998..86822- (Clytia hemisphaerica)
CCATGGAAATAATCAAGTGTTTTCCTGCCGTGGGATTGCCATTATCGTTA
ACTATTTTCAGAAACGTGGACACGGCGTTACGGTATTCGTTCCCGCATGG
CGTAAAGAAACGTCCAAATCATCCACGCCGATCATCGATCAAGACATATT
AACCAGACTGGACAGTGATGGTGTGTTAAGTTTCACGCCGTCACGTCGCG
TTGACGGCAAACTAATACAATCATACGACGATCGTTATATCGTACGTCTT
GCCATGGAAACGGATGGGATAATTGTGTCAAACGATCATTTTCGTGACTT
ACAAAAGGAAGAACCGAACTGGAAAGATTTTATTAACAAACGTTTATTAA
TGTATACCTTCGCTGGTGATATTTTTATGCCACCTGATGACCCGTTAGGT
CGACAAGGTCCCAACTTAAGTGATTTTTTACGTAAGAATACAATTGAACG
GCGTATGACGCAGTATTGTCCTTACGGAAAGAAGTGTACGTTCGGACCAA
AGTGTAAATTTTATCATCCAGAAAGACGTTTTTCAGGCTCGTTTGTTAAA
AAGCCGTTACCGCCTTTACCGAATCAACATCACCACCCCAGTGGGGGCGG
AGGGAGTGGGTCACGCCCTCGCTCAGATCCTGGTCATATTAGTTTATCTG
GTGATAATAAACAAAGGCCGATCAGTTTACCGAACTTGGAACAATTATAC
GTTTCTCACCCTCACTCTTTACACAGACATATTTACATGAACTCACAACA
ATCGCGCCCCGTTAGCGGGCCTCCTTTCCCGGAGAACGCCGCTAATAATC
AACAACCCTATCCACTTTATGCGGCTGCCCGTGAACAGAATTTAGCCGCG
CGTGCAGCAGTTGAACTTATGAACCAACAGAAACAATATAGCGGTGATTA
TTCACATTTTAATCATACGCAACCTTATGTCATGTATGCACAGCGACGGC
CACCTTCTGGCGAATTTGTTGCGATGCCGCCAAATCACGAGGGTATCGGC
CGTCCGTTGTCGTCAGATTTCGGTAGTCGTCCGTCATCGGGCGAATATAG
TTACGCTGGAAGTTGTAATGGGAGCCGACCCGCATCGGGTGATTACGGGA
ATAACAGTCGCCCATCTTCAGGTGATTTTGGCTCCATGCAGTGGGGCTAC
CAAAGACAATTTCCTTCTCATGGCGGAAATTTCTATCCGAAAAAAGTTTT
TTATAAATCACGTGGTGGACCGACTTTACCTGAAACAAAGGAAGAACCGC
GACCGACCCCTAAAATTGACATTGTTAATAAACTACGCGAACTCTACCCT
GAGAAATACGACCAGATTTTGTGGATTTTACGAACATATCCCGAGATAAA
ATCGGTTGACGAAGCTCTGCCTTATTTGAAAGAGTGTATAAAGGCACAAT
AAGAATATGTCAAGGGATTATCAAGCCCTGAAGAGGTTATACGATTCACA
TTTCCAGAGGAAATCTACGAGATAATTTGTGGAAAAGAAGGGGACAAATA
TTACGAACTTGAACAAGAAACAGCAGCAAACATTGTATTTTACTCACCAG
TTGAAGTTGAAATATCAGGGTCAATAAATGCTGTCACAAAAGCCTCTACT
GTAATTGAAGATATAATCAAAGACTTTGTTAATAACCACTCTCCGCCTCC
ATTACCATTAAACGAAGAATATACAGAAGATAACCCAGACTATAATACAT
GTGTTGTAGAACGAGATAGTGGAATTTATCTAAAATGTCCTCTGGGCTAT
GACTCTCAATCAGACCTTTCTTTAAACAGAAGCAGTATCGTAACAGTTGA
TGAAGGTCTTGAAGCAGACTCTGAATTACATTCACAACATTATAATTTAG
ATGATAACCGTAGTGACAGTATCTCACCTAGAAACTCAACAGATAACGAA
GAACTAATGGAATATGCTAAAAAATTGGGTTACAGTGAAAGCCAGGTTAA
ATCAGCAATAAAAAAACTTGGTCCAGATATTGTAGATCAAAATGATTTAC
TTCACGAGTTAATAAAAGCATCTAACTCTATACGAGATAATAAATTTTTA
GAGGACAATTCAGGTAGTTTGAAAAAACTATATGATACTGCTTCAAATCT
TTCCACTAACTCTGATAATGGATTTCTTCGGCATATCGTAATTGATGGAT
CAAATGTTGCAATGAGATGTCGGAAATTAAAGATTACATGCTTGATTTAT
ACGTGAAAGAAGATCGTGTTGAACGAGTAAAACATTACACCGAACATGTT
GAAAAATTGTTTGATGTTGAACTCAAGTTTACATCAGGTGAAGGAAAACA
GTACATGCCAGTTGCTGGACAGTGGCTTGATGTCGAAGGTCAAAGAAGGA
ATGTTATCAAAGCTAGGCCATGGAAATAATCAAGTGTTTTCCTGCCGTGG
GATTGCCATTATCGTTAACTATTTTCAGAAACGTGGACACGGCGTTACGG
TATTCGTTCCCGCATGGCGTAAAGAAACGTCCAAATCATCCACGCCGATC
ATCGATCAAGACATATTAACCAGACTGGACAGTGATGGTGTGTTAAGTTT
CACGCCGTCACGTCGCGTTGACGGCAAACTAATACAATCATACGACGATC
GTTATATCGTACGTCTTGCCATGGAAACGGATGGGATAATTGTGTCAAAC
GATCATTTTCGTGACTTACAAAAGGAAGAACCGAACTGGAAAGATTTTAT
TAACAAACGTTTATTAATGTATACCTTCGCTGGTGATATTTTTATGCCAC
CTGATGACCCGTTAGGTCGACAAGGTCCCAACTTAAGTGATTTTTTACGT
AAGAATACAATTGAACGGCGTATGACGCAGTATTGTCCTTACGGAAAGAA
GTGTACGTTCGGACCAAAGTGTAAATTTTATCATCCAGAAAGACGTTTTT
CAGGCTCGTTTGTTAAAAAGCCGTTACCGCCTTTACCGAATCAACATCAC
CACCCCAGTGGGGGCGGAGGGAGTGGGTCACGCCCTCGCTCAGATCCTGG
TCATATTAGTTTATCTGGTGATAATAAACAAAGGCCGATCAGTTTACCGA
ACTTGGAACAATTATACGTTTCTCACCCTCACTCTTTACACAGACATATT
TACATGAACTCACAACAATCGCGCCCCGTTAGCGGGCCTCCTTTCCCGGA
GAACGCCGCTAATAATCAACAACCCTATCCACTTTATGCGGCTGCCCGTG
AACAGAATTTAGCCGCGCGTGCAGCAGTTGAACTTATGAACCAACAGAAA
CAATATAGCGGTGATTATTCACATTTTAATCATACGCAACCTTATGTCAT
GTATGCACAGCGACGGCCACCTTCTGGCGAATTTGTTGCGATGCCGCCAA
ATCACGAGGGTATCGGCCGTCCGTTGTCGTCAGATTTCGGTAGTCGTCCG
TCATCGGGCGAATATAGTTACGCTGGAAGTTGTAATGGGAGCCGACCCGC
ATCGGGTGATTACGGGAATAACAGTCGCCCATCTTCAGGTGATTTTGGCT
CCATGCAGTGGGGCTACCAAAGACAATTTCCTTCTCATGGCGGAAATTTC
TATCCGAAAAAAGTTTTTTATAAATCACGTGGTGGACCGACTTTACCTGA
AACAAAGGAAGAACCGCGACCGACCCCTAAAATTGACATTGTTAATAAAC
TACGCGAACTCTACCCTGAGAAATACGACCAGATTTTGTGGATTTTACGA
ACATATCCCGAGATAAAATCGGTTGACGAAGCTCTGCCTTATTTGAAAGA
GTGTATAAAGGCACAATAAGAATATGTCAAGGGATTATCAAGCCCTGAAG
AGGTTATACGATTCACATTTCCAGAGGAAATCTACGAGATAATTTGTGGA
AAAGAAGGGGACAAATATTACGAACTTGAACAAGAAACAGCAGCAAACAT
TGTATTTTACTCACCAGTTGAAGTTGAAATATCAGGGTCAATAAATGCTG
TCACAAAAGCCTCTACTGTAATTGAAGATATAATCAAAGACTTTGTTAAT
AACCACTCTCCGCCTCCATTACCATTAAACGAAGAATATACAGAAGATAA
CCCAGACTATAATACATGTGTTGTAGAACGAGATAGTGGAATTTATCTAA
AATGTCCTCTGGGCTATGACTCTCAATCAGACCTTTCTTTAAACAGAAGC
AGTATCGTAACAGTTGATGAAGGTCTTGAAGCAGACTCTGAATTACATTC
ACAACATTATAATTTAGATGATAACCGTAGTGACAGTATCTCACCTAGAA
ACTCAACAGATAACGAAGAACTAATGGAATATGCTAAAAAATTGGGTTAC
AGTGAAAGCCAGGTTAAATCAGCAATAAAAAAACTTGGTCCAGATATTGT
AGATCAAAATGATTTACTTCACGAGTTAATAAAAGCATCTAACTCTATAC
GAGATAATAAATTTTTAGAGGACAATTCAGGTAGTTTGAAAAAACTATAT
GATACTGCTTCAAATCTTTCCACTAACTCTGATAATGGATTTCTTCGGCA
TATCGTAATTGATGGATCAAATGTTGCAATGAGATGTCGGAAATTAAAGA
TTACATGCTTGATTTATACGTGAAAGAAGATCGTGTTGAACGAGTAAAAC
ATTACACCGAACATGTTGAAAAATTGTTTGATGTTGAACTCAAGTTTACA
TCAGGTGAAGGAAAACAGTACATGCCAGTTGCTGGACAGTGGCTTGATGT
CGAAGGTCAAAGAAGGAATGTTATCAAAGCTAGGCCATGGAAATAATCAA
GTGTTTTCCTGCCGTGGGATTGCCATTATCGTTAACTATTTTCAGAAACG
TGGACACGGCGTTACGGTATTCGTTCCCGCATGGCGTAAAGAAACGTCCA
AATCATCCACGCCGATCATCGATCAAGACATATTAACCAGACTGGACAGT
GATGGTGTGTTAAGTTTCACGCCGTCACGTCGCGTTGACGGCAAACTAAT
ACAATCATACGACGATCGTTATATCGTACGTCTTGCCATGGAAACGGATG
GGATAATTGTGTCAAACGATCATTTTCGTGACTTACAAAAGGAAGAACCG
AACTGGAAAGATTTTATTAACAAACGTTTATTAATGTATACCTTCGCTGG
TGATATTTTTATGCCACCTGATGACCCGTTAGGTCGACAAGGTCCCAACT
TAAGTGATTTTTTACGTAAGAATACAATTGAACGGCGTATGACGCAGTAT
TGTCCTTACGGAAAGAAGTGTACGTTCGGACCAAAGTGTAAATTTTATCA
TCCAGAAAGACGTTTTTCAGGCTCGTTTGTTAAAAAGCCGTTACCGCCTT
TACCGAATCAACATCACCACCCCAGTGGGGGCGGAGGGAGTGGGTCACGC
CCTCGCTCAGATCCTGGTCATATTAGTTTATCTGGTGATAATAAACAAAG
GCCGATCAGTTTACCGAACTTGGAACAATTATACGTTTCTCACCCTCACT
CTTTACACAGACATATTTACATGAACTCACAACAATCGCGCCCCGTTAGC
GGGCCTCCTTTCCCGGAGAACGCCGCTAATAATCAACAACCCTATCCACT
TTATGCGGCTGCCCGTGAACAGAATTTAGCCGCGCGTGCAGCAGTTGAAC
TTATGAACCAACAGAAACAATATAGCGGTGATTATTCACATTTTAATCAT
ACGCAACCTTATGTCATGTATGCACAGCGACGGCCACCTTCTGGCGAATT
TGTTGCGATGCCGCCAAATCACGAGGGTATCGGCCGTCCGTTGTCGTCAG
ATTTCGGTAGTCGTCCGTCATCGGGCGAATATAGTTACGCTGGAAGTTGT
AATGGGAGCCGACCCGCATCGGGTGATTACGGGAATAACAGTCGCCCATC
TTCAGGTGATTTTGGCTCCATGCAGTGGGGCTACCAAAGACAATTTCCTT
CTCATGGCGGAAATTTCTATCCGAAAAAAGTTTTTTATAAATCACGTGGT
GGACCGACTTTACCTGAAACAAAGGAAGAACCGCGACCGACCCCTAAAAT
TGACATTGTTAATAAACTACGCGAACTCTACCCTGAGAAATACGACCAGA
TTTTGTGGATTTTACGAACATATCCCGAGATAAAATCGGTTGACGAAGCT
CTGCCTTATTTGAAAGAGTGTATAAAGGCACAATAAGAATATGTCAAGGG
ATTATCAAGCCCTGAAGAGGTTATACGATTCACATTTCCAGAGGAAATCT
ACGAGATAATTTGTGGAAAAGAAGGGGACAAATATTACGAACTTGAACAA
GAAACAGCAGCAAACATTGTATTTTACTCACCAGTTGAAGTTGAAATATC
AGGGTCAATAAATGCTGTCACAAAAGCCTCTACTGTAATTGAAGATATAA
TCAAAGACTTTGTTAATAACCACTCTCCGCCTCCATTACCATTAAACGAA
GAATATACAGAAGATAACCCAGACTATAATACATGTGTTGTAGAACGAGA
TAGTGGAATTTATCTAAAATGTCCTCTGGGCTATGACTCTCAATCAGACC
TTTCTTTAAACAGAAGCAGTATCGTAACAGTTGATGAAGGTCTTGAAGCA
GACTCTGAATTACATTCACAACATTATAATTTAGATGATAACCGTAGTGA
CAGTATCTCACCTAGAAACTCAACAGATAACGAAGAACTAATGGAATATG
CTAAAAAATTGGGTTACAGTGAAAGCCAGGTTAAATCAGCAATAAAAAAA
CTTGGTCCAGATATTGTAGATCAAAATGATTTACTTCACGAGTTAATAAA
AGCATCTAACTCTATACGAGATAATAAATTTTTAGAGGACAATTCAGGTA
GTTTGAAAAAACTATATGATACTGCTTCAAATCTTTCCACTAACTCTGAT
AATGGATTTCTTCGGCATATCGTAATTGATGGATCAAATGTTGCAATGAG
ATGTCGGAAATTAAAGATTACATGCTTGATTTATACGTGAAAGAAGATCG
TGTTGAACGAGTAAAACATTACACCGAACATGTTGAAAAATTGTTTGATG
TTGAACTCAAGTTTACATCAGGTGAAGGAAAACAGTACATGCCAGTTGCT
GGACAGTGGCTTGATGTCGAAGGTCAAAGAAGGAATGTTATCAAAGCTAG
G
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_045179XLOC_045179Clytia hemisphaericagene
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072784-proteinTCONS_00072784-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1575043694:86282..86822TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1575043694:86282..86822Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1575043694:85168..85931TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1575043694:85168..85931Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1575043694:72998..75798TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1575043694:72998..75798Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1510915933:86282..86822TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1510915933:86282..86822Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1510915933:85168..85931TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1510915933:85168..85931Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1510915933:72998..75798TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1510915933:72998..75798Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1491911889:86282..86822TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1491911889:86282..86822Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1491911889:85168..85931TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1491911889:85168..85931Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1491911889:72998..75798TCONS_00072784-exon-scaffold_84-1491911889:72998..75798Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_84supercontigscaffold_84:72998..86822 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.25633 1.13635 0.505085 0.514316 21.2148 15.503 14.8178 15.1324 5.82278 12.6194 8.31953 5.8691 26.7133 20.1589 10.1425 11.3283 17.1403 21.1197 31.6458 40.1735 17.9651 18.7277 10.741 11.274 11.7 11.6022 28.6365 23.7539 30.8897 33.4174
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR004088KH_dom_type_1
IPR021869RNase_Zc3h12_NYN
IPR000571Znf_CCCH
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0003723RNA binding
GO:0046872metal ion binding
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0046872 metal ion binding
molecular_function GO:0003723 RNA binding
Blast
BLAST of TCONS_00072784 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ZC12B (Probable ribonuclease ZC3H12B OS=Homo sapiens GN=ZC3H12B PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 298.901 bits (764), Expect = 2.660e-85
Identity = 147/270 (54.44%), Postives = 188/270 (69.63%), Query Frame = 2
Query: 1046 MEYAKKLGYSESQVKSAIKKLGPDIVDQNDLLHELIKASNSIRDN-----KFLEDNSGSLKKLYDTASNLSTNSDNG-FLRHIVIDGSNVAMSHGNNQVFSCRGIAIIVNYFQKRGHG-VTVFVPAWRKETSKSSTPIIDQDILTRLDSDGVLSFTPSRRVDGKLIQSYDDRYIVRLAMETDGIIVSNDHFRDLQKEEPNWKDFINKRLLMYTFAGDIFMPPDDPLGRQGPNLSDFLRKNTI-ERRMTQYCPYGKKCTFGPKCKFYHPER 1831
            ME+A KLGY+E Q++S + KLGP+ +  ND+L EL++  N            L     S +++     +L    DN   LR +VIDGSNVAMSHGN + FSCRGI + V++F  +GH  +TVFVPAWRKE S+   PI DQDIL +L+ + +L FTPSRRV G+ +  YDDR+IV+LA ++DGIIVSND++RDLQ E+P WK FI +RLLMY+F  D FMPPDDPLGR GP+L +FLRK  I      Q CPYGKKCT+G KCK+YHPER
Sbjct:  112 MEFALKLGYAEEQIQSVLNKLGPESLI-NDVLAELVRLGNKGDSEGQINLSLLVPRGPSSREIASPELSLEDEIDNSDNLRPVVIDGSNVAMSHGNKEEFSCRGIQLAVDWFLDKGHKDITVFVPAWRKEQSRPDAPITDQDILRKLEKEKILVFTPSRRVQGRRVVCYDDRFIVKLAFDSDGIIVSNDNYRDLQVEKPEWKKFIEERLLMYSFVNDKFMPPDDPLGRHGPSLENFLRKRPIVPEHKKQPCPYGKKCTYGHKCKYYHPER 380          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00072784 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
ZC12B2.660e-8554.44Probable ribonuclease ZC3H12B OS=Homo sapiens GN=Z... [more]
back to top