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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00072784 ID=TCONS_00072784|Name=TCONS_00072784|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4106bp TCAAAATACAACTACTTACTATTGAATCAAACCTCAATAGTGAATAATCC TTGATTTGACAAATTTTCTATTCACAACGATTAATTACCAGCTAGACGCG GTCGCGCGGGAACGCGTTGATTATTCCGGTCAATAAAATAGACATTGTCA ATCTTTTGAACTCTTGTTATGTCGGTCGGGTGTGTGTATAGTATTTAGAA GGTACCATTATAAACAATAGTTTAGATACGACAATGGTTTTGAGTAGTGG TTGATGATAGAAAGATCTTTATAAAATGTAGCTGGATAACAAACTGACTG AACAACTGACAAAAAATCTGTCTTTCTCTTGGGTAAAAAAATGTCGGAAA TTAAAGATTACATGCTTGATTTATACGTGAAAGAAGATCGTGTTGAACGA GTAAAACATTACACCGAACATgttgaaaaattgtttgatgTTGAACTCAA GTTTACATCAGGTGAAGGAAAACAGTACATGCCAGTTGCTGGACAGTGGC TTGATGTCGAAGGTCAAAGAAGGAATGTTATCAAAGCTAGGGAATATGTC AAGGGATTATCAAGCCCTGAAGAGGTTATACGATTCACATTTCCAGAGGA AATCTACGAGATAATTTGTGGAAAAGAAGGGGACAAATATTACGAACTTG AACAAGAAACAGCAGCAAACATTGTATTTTACTCACCAGTTGAAGTTGAA ATATCAGGGTCAATAAATGCTGTCACAAAAGCCTCTACTGTAATTGAAGA TATAATCAAAGACTTTGTTAATAACCACTCTCCGCCTCCATTACCATTAA ACGAAGAATATACAGAAGATAACCCAGACTATAATACATGTGTTGTAGAA CGAGATAGTGGAATTTATCTAAAATGTCCTCTGGGCTATGACTCTCAATC AGACCTTTCTTTAAACAGAAGCAGTATCGTAACAGTTGATGAAGGTCTTG AAGCAGACTCTGAATTACATTCACAACATTATAATTTAGATGATAACCGT AGTGACAGTATCTCACCTAGAAACTCAACAGATAACGAAGAACTAATGGA ATATGCTAAAAAATTGGGTTACAGTGAAAGCCAGGTTAAAtcagcaataa aaaaacttggTCCAGATATTGTAGATCAAAATGATTTACTTCACGAGTTA ATAAAAGCATCTAACTCTATACGAGATAATAAATTTTTAGAGGACAATTC AGGTAGTTTGAAAAAACTATATGATACTGCTTCAAATCTTTCCACTAACT CTGATAATGGATTTCTTCGGCATATCGTAATTGATGGATCAAATGTTGCA ATGAGCCATGGAAATAATCAAGTGTTTTCCTGCCGTGGGATTGCCATTAT CGTTAACTATTTTCAGAAACGTGGACACGGCGTTACGGTATTCGTTCCCG CATGGCGTAAAGAAACGTCCAAATCATCCACGCCGATCATCGATCAAGAC ATATTAACCAGACTGGACAGTGATGGTGTGTTAAGTTTCACGCCGTCACG TCGCGTTGACGGCAAACTAATACAATCATACGACGATCGTTATATCGTAC GTCTTGCCATGGAAACGGATGGGATAATTGTGTCAAACGATCATTTTCGT GACTTACAAAAGGAAGAACCGAACTGGAAAGATTTTATTAACAAACGTTT ATTAATGTATACCTTCGCTGGTGATATTTTTATGCCACCTGATGACCCGT TAGGTCGACAAGGTCCCAACTTAAGTGATTTTTTACGTAAGAATACAATT GAACGGCGTATGACGCAGTATTGTCCTTACGGAAAGAAGTGTACGTTCGG ACCAAAGTGTAAATTTTATCATCCAGAAAGACGTTTTTCAGGCTCGTTTG TTAAAAAGCCGTTACCGCCTTTACCGAATCAACATCACCACCCCAGTGGG GGCGGAGGGAGTGGGTCACGCCCTCGCTCAGATCCTGGTCATATTAGTTT ATCTGGTGATAATAAACAAAGGCCGATCAGTTTACCGAACTTGGAACAAT TATACGTTTCTCACCCTCACTCTTTACACAGACATATTTACATGAACTCA CAACAATCGCGCCCCGTTAGCGGGCCTCCTTTCCCGGAGAACGCCGCTAA TAATCAACAACCCTATCCACTTTATGCGGCTGCCCGTGAACAGAATTTAG CCGCGCGTGCAGCAGTTGAACTTATGAACCAACAGAAACAATATAGCGGT GATTATTCACATTTTAATCATACGCAACCTTATGTCATGTATGCACAGCG ACGGCCACCTTCTGGCGAATTTGTTGCGATGCCGCCAAATCACGAGGGTA TCGGCCGTCCGTTGTCGTCAGATTTCGGTAGTCGTCCGTCATCGGGCGAA TATAGTTACGCTGGAAGTTGTAATGGGAGCCGACCCGCATCGGGTGATTA CGGGAATAACAGTCGCCCATCTTCAGGTGATTTTGGCTCCATGCAGTGGG GCTACCAAAGACAATTTCCTTCTCATGGCGGAAATTTCTAtccgaaaaaa gttttttataaatCACGTGGTGGACCGACTTTACCTGAAACAAAGGAAGA ACCGCGACCGacccctaaaattgacattgTTAATAAACTACGCGAACTCT ACCCTGAGAAATACGACCAGATTTTGTGGATTTTACGAACATATCCCGAG ATAAAATCGGTTGACGAAGCTCTGCCTTATTTGAAAGAGTGTATAAAGGC ACaataaattttggtttgataCTGAATTTCATTGGCAAAATGCTGATATA TGcagaataattttaaaaaaattctccaaaaaaagaaaattattttttgc aatgtttataTATTACGACTGCACGCTGCGcataaattttgttttatatt ttctgttcagttcttcaaaatattatttgaaaccggaattttccaatttt gaatccGAAATTCGCGATTTTCAGCTTGATTTTTCATAAGATAAAATTGC TGACGTATTAAATAGACTCCCTCAAAATACGTCATTTTGCTACCTTTTGC CCCTGTTTTTGTTCCTTTAAGATTTTcagtttatttttgaaacaattttt tgcaaaacattTACGAAACATTTATATTTATTGACTATTAATGTTTTTAA GAGAAAAATATAGTTTTCAATACTATTCTTTTAATATTATATAAtatatt ttactgaaaatttactaaaaagtttttctttcaaaattttgtatttttAG AAAAAACCCTTTTATACAAATACCTTTTTCTATATTTTCTATCTGTACAT TTATATTGACATTTTTTCCAAGATATCTTAGATTGCTGAAACCTTTCGAA CTATTTCCAACTGTCAGATTTCATTAGTCGACTCGCGGAAAGGATACAAA ATATTCGTGCAAGATTTCCAATATGCTCTTTATGAAATTTTTCTATTAAG TATTATTTTCTATCTCTGATATTTTCTTATTTTTATACTATTATATATTT TTGTGAATTCCATTTTATAAGTGGACCAGTGATTACATGATGATCGTCAA ATGTAAAATAAATAGATCATTCCCGCTCCCATAAACGCCGGATTCAACAT CCAATTCATGGTATTCATAAAGTATTCTTTTGTACGGAAAGATTTCAAAA ACCGGTTTTTGCCATTAGAAGCTATAAACAATAGAACTAGTGGCAAAAAT CCGGTTTTTGGGGTGTTTCCGTACAGATGATTACGTCGTGAATATCTATC CGTAGTATATGAATGGGGGTGTCCGATGGTTAGATATACGATTGTCCGGT TGGAATAGGGGAATGATCTATGTTTACACAGTTAGAACAAAAACAACCTA TACTAGTTTTTATATAAAAACTCTTTATAAGAGTGAAAAGTACACCCCGT GTTGGGCCTTGTATTTGTAAATCAAGACAGTGCACTCTGCATACACTTCC CAACATGGAACAGAACTTTTTTCAACTAAGGAAATTTTGTCTGTGTCACG GGAATGCATTTTTGTATTATTCCGTATGTAACTAAAACAATTTTATCTTA TATAGTCACTTTTTTGAAAAAAATATAACCCTTTAGAAAAATAGATTTGA TAATAAAGTCTTTTTTTAATTCTGAAAATCACTGGTCCTGCTAATCTTAT AAAATG Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00072784-protein >TCONS_00072784-protein ID=TCONS_00072784-protein|Name=TCONS_00072784-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=788bp
MSEIKDYMLDLYVKEDRVERVKHYTEHVEKLFDVELKFTSGEGKQYMPVA GQWLDVEGQRRNVIKAREYVKGLSSPEEVIRFTFPEEIYEIICGKEGDKY YELEQETAANIVFYSPVEVEISGSINAVTKASTVIEDIIKDFVNNHSPPP LPLNEEYTEDNPDYNTCVVERDSGIYLKCPLGYDSQSDLSLNRSSIVTVD EGLEADSELHSQHYNLDDNRSDSISPRNSTDNEELMEYAKKLGYSESQVK SAIKKLGPDIVDQNDLLHELIKASNSIRDNKFLEDNSGSLKKLYDTASNL STNSDNGFLRHIVIDGSNVAMSHGNNQVFSCRGIAIIVNYFQKRGHGVTV FVPAWRKETSKSSTPIIDQDILTRLDSDGVLSFTPSRRVDGKLIQSYDDR YIVRLAMETDGIIVSNDHFRDLQKEEPNWKDFINKRLLMYTFAGDIFMPP DDPLGRQGPNLSDFLRKNTIERRMTQYCPYGKKCTFGPKCKFYHPERRFS GSFVKKPLPPLPNQHHHPSGGGGSGSRPRSDPGHISLSGDNKQRPISLPN LEQLYVSHPHSLHRHIYMNSQQSRPVSGPPFPENAANNQQPYPLYAAARE QNLAARAAVELMNQQKQYSGDYSHFNHTQPYVMYAQRRPPSGEFVAMPPN HEGIGRPLSSDFGSRPSSGEYSYAGSCNGSRPASGDYGNNSRPSSGDFGS MQWGYQRQFPSHGGNFYPKKVFYKSRGGPTLPETKEEPRPTPKIDIVNKL RELYPEKYDQILWILRTYPEIKSVDEALPYLKECIKAQ Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_84:72998..86822- Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00072784 ID=TCONS_00072784|Name=TCONS_00072784|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13825bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_84:72998..86822- (Clytia hemisphaerica) TCAAAATACAACTACTTACTATTGAATCAAACCTCAATAGTGAATAATCC
TTGATTTGACAAATTTTCTATTCACAACGATTAATTACCAGCTAGACGCG
GTCGCGCGGGAACGCGTTGATTATTCCGGTCAATAAAATAGACATTGTCA
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AGGTAGTTTGAAAAAACTATATGATACTGCTTCAAATCTTTCCACTAACT
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GTGAATCCTAAGTGATTATCATTTAATGAGTCAACCACCTTCGCTTCATT
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TGCGGTTGTCAGTAATGATACCCAGATTCCTTATTAATAAGGTTGTAAAA
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TGGACGTTTCAAACAAAAATGACATTAATTATCTTGGTATTCAAGCTATG
TCTTACTAGCTATTCTCCTTTTTAACCAGGCATCATGTACCATGGTGATT
CTCCTCTTTGTCTTTTTCGCCCCATGTTATCAATCTCGTGCCTAGAGCCA
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TATTACAAAATCACACCCAATCTTGTACCCAGAGCCACTTACACCACTTT
TTAATTATACTGTGTGTTGTTTCATTATCATCCCGACTGGATATTAGAAT
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TGTACGCAATATTTTTATTAGAGAACAATTATGTGTAGTTCCACGATAGA
TTCTACTTTCTTATGTACATGCAAAAATCTGTTATTCCAAGCTGGGTGGC
TTTGCAATTTAAATCAAGTTGCAATAACCCATTGTCTCATCCACATCGCA
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GCAGACAAATCATGTTCCAAGCAATTAATTATAGACAGATCAATTGTAAG
CTATTTGATAATGATAATATAAATTAAGTAGCAACTCTTACTCTCGGCTA
CCTAATAGCCGTAGGGGTGGTTCGGAATAAGGTCATCTCAAAATTTAATA
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GGGCAAAAGAGGGAACTATCAAAAAAGTTGGAATAAGAATGTCTAGGGTG
GAATTTTTTTGAAAAATTAATAAGCACCCCCCACCCCCGGCTATTAGGTA
CCCGAGAGTACGCAGGATTGTCGAGAAAGATGCCTCGTTCAAGATGATAT
ACTTGTCGGCATTTTATACTTGTGCTACTATATTTCAAAGCCCTGCTTTT
TCCAGCTTTGAAAGTTGATTGCGTGGATTAAAAAAAAAAATTTAAATCTA
TCACAGGCCATATTTTAGAAAGGCAGGGCAGCGTCCGTTGGTGGCCAAAA
AGGGCACTTTTTCTACTGTTTTTGCCACTGAAAAGACTGTTTTTACCAAA
ATTGTAGTGATTTAAGGAGGGGCAACGGCCAATAACCGGACGCTAAAAGG
TCATGAAAAATGGCCTGTATCATTAGAAAGAATCCCAGGGTTTGAAATAG
TCATTGAATCAATCAAAAAGGGGCTTTTATTAGATTTGAATGTTATCCTG
TCCGTCAATTCTTTTAACGTTCAAGCTTTATCTTTTAACCACAATAATTT
ATGTTTGATTTCTTCTCATTTCAGCCATGGAAATAATCAAGTGTTTTCCT
GCCGTGGGATTGCCATTATCGTTAACTATTTTCAGAAACGTGGACACGGC
GTTACGGTATTCGTTCCCGCATGGCGTAAAGAAACGTCCAAATCATCCAC
GCCGATCATCGATCAAGACATATTAACCAGACTGGACAGTGATGGTGTGT
TAAGTTTCACGCCGTCACGTCGCGTTGACGGCAAACTAATACAATCATAC
GACGATCGTTATATCGTACGTCTTGCCATGGAAACGGATGGGATAATTGT
GTCAAACGATCATTTTCGTGACTTACAAAAGGAAGAACCGAACTGGAAAG
ATTTTATTAACAAACGTTTATTAATGTATACCTTCGCTGGTGATATTTTT
ATGCCACCTGATGACCCGTTAGGTCGACAAGGTCCCAACTTAAGTGATTT
TTTACGTAAGAATACAATTGAACGGCGTATGACGCAGTATTGTCCTTACG
GAAAGAAGTGTACGTTCGGACCAAAGTGTAAATTTTATCATCCAGAAAGA
CGTTTTTCAGGCTCGTTTGTTAAAAAGCCGTTACCGCCTTTACCGAATCA
ACATCACCACCCCAGTGGGGGCGGAGGGAGTGGGTCACGCCCTCGCTCAG
ATCCTGGTCATATTAGTTTATCTGGTGATAATAAACAAAGGCCGATCAGT
TTACCGAACTTGGAACAATTATACGTTTCTCACCCTCACTCTTTACACAG
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TCCCGGAGAACGCCGCTAATAATCAACAACCCTATCCACTTTATGCGGCT
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GACCCGCATCGGGTGATTACGGGAATAACAGTCGCCCATCTTCAGGTGAT
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TACCTGAAACAAAGGAAGAACCGCGACCGACCCCTAAAATTGACATTGTT
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TTTACGAACATATCCCGAGATAAAATCGGTTGACGAAGCTCTGCCTTATT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: Molecular Function
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GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category |
Term Accession |
Term Name |
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Blast
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The following BLAST results are available for this feature:
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