TCONS_00065576 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00065576
Unique Name	TCONS_00065576
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	5277

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at scaffold_440:417494..439900+

transcript sequence

>TCONS_00065576 ID=TCONS_00065576|Name=TCONS_00065576|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5277bp
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transcript from alignment at scaffold_440:417494..439900+

Legend: exon

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>TCONS_00065576 ID=TCONS_00065576|Name=TCONS_00065576|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=22407bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_440:417494..439900+ (Clytia hemisphaerica)
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tttgtgaatattatattgtttgttTGTTAAAAATGTCTTATCTATTTTCA
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GGACACCTTTCTGCACTACTGTATGTTTTTTATCTGAACTGGGTCCAACG
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GATCTTGTGTAGCCAGTATCTGACTAAttctttgaacattttttcAATGC
ATTTCTCTAATAATGTCATTTTGGAATACTTTTTTAGATTCCCAAAAGTA
TTCACTGTTGTTCTGTTTACTAAATAATAGTCAATGTTTAGTTCGACAAG
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AGTAGTTTTTCTTGGTACTTTAGAATTAGGTAGTACGGTACTGGCTTTAA
TGGGACTTGTGAAAAAGTGAAGAGATTTCTGGTTTCAgattttgttgtgt
ttttgttttgttttgataaagatTAGGAACCCATCAATGAACGTCTGATA
TGACTTGCTTGACATATGAAATGATTGTCATCTTAAACATTTGTCTGAAT
TTTGCGAAGTAGTTTTTGTAATATTACAGTGatttgggtcattttttttt
tctaaaaaaggaaatttttggagGTTGGTTGCAACTTTTGctactttttg
tattttttttaatatttttaaagtacaaagattttcaaaaatgttctttt
taaagaactatTAGCAGAATGTTTAATGTGGACTGAGCTAATCATTATAT
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TTTCTATTCTATTTTCCAAAATCTAGTAGGTACCCAAACATGAAAATTAC
ATTCACTTTCTAACCATTACATTGTCTTTCACTTGTATAATTTGAAGACG
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GGGAAATTCTAAACTGTCTGATCTGACTTTTCacaattcaaaaagaaaag
ttggTTTAATGTTGTTTTCATGAAATGGGCGATAATCATTTATTCAATTA
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tttaatcAGCTGCCTTCCATTGCagaaaaagaaacttttatgatcgtttt
ataaaaagtaaaatggtaCCTCTTGTGActgttatttttacattttgaaa
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ttttttttggacttgtatGTTTGTTGTTTTAATACCTAAAGCAGTTGAAT
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GCGTTATGTGTAACGCTTTCATCGTCATAATATGTGAGCATGTTGTTTCC
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TTATGTAATAGCATCTTCCTTTTCATCATTTCTTCCTttgctttttctct
ttttcgatGTAAATGTAATGAGAAATGATATGAAAAAGACTTTTAATCAA
TTGAATGCCGACTTGTGCTTCTTATGTTGATGTTACTGTGTTTTATCATT
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ATAGTGTTGCTTTTTGAAGCATTCGAATGCTTTAGGATTTTGTATTTGAT
ATTATTGATATTGTACTCAAtgtacagtcaactctctctctcgttcgaat
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GTACCTTCTGTAATTctaatctttctgtaattcgaactaaaccACTGATC
CCCTCAGCTTGGAATTTAAATGACGTACCttctgtaattcaaatctttct
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TTTTTTAAGGCAGCACACAAAAGTTTTTAAAGAGTCGTAGATCATTGTTT
GTATTTTCAAACTAAAAGGCTTTGATATCGATTAGTCTGGAACTATACTT
TGTAGTATTGAATTATTAGTTTTATCTTATATGAAAAGACCAACATTTTT
AGCGTGTAAGTGTTGACTGGACGTTTGGTTTTCTGATTCTCTCAATCAAA
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CGTACTGACAACCTATCAATCGTCTATTTGCTATCTGTTTGATTGATAAA
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TTAGGTAAATAGTATAGAGGACCTACCTATCTTACATATGTCGTCCCTCA
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GTCATTACAGCACAGCCAATGTTTGTACTAACCGAACAAACTatgatttt
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Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_041090	XLOC_041090	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00065576 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00065576 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00065576 (transcript) - C. hemisphaerica