XLOC_041090 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_041090
Unique NameXLOC_041090
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_440:377701..439900+

Legend: gene
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CCCTCAAGGTGCCACCAAGAAGTGCTCCAgtaccattggaaaggtaaaca ttTTGATCTCATGTAGTGAATTTTCCTGTacttcgaactaaaacattggg TCCCTCATGCAAAAAGTAGTTTAAAATAATTCGAATTTTCCTTTAATTCG AAAAAAGCTGTCGGTCGCACTTGAAGATTGAATTAGAAAGAGGCAACTGt attcaatttcttttaaaaaattagacTCTGTAACATCAGACAAAAATAGG CGATTTTGGAGGTAAAAAGCAcgtcaaaaatataattaaaaagattttcc atAATAGGCGCATACGCAACCCACCCGCTTATGCTTTCTGGTAAAGTTTT ACTGTGAGCAGCGCGTGATTTGAATCAACTATGTATGATTGTATTGAGCT TAGAGGGATAGGGtttataaatattttcacaaGAAATTTGGACTCAAAAT GTTCtgaatttgtaaaaaatatctttaCTAAACAAGGGCTTGGCTATCAG ATCAATCGTAGTATTGAATGTAAACTTCATGAAAGCAGGATATTTTGTCA TCTCGCCAATGTTATTTAATTAATGATTTTTGACTGGGAAACTAGTTGTC TTTGATAATGAGATCACCCCCTTCTTTCAGCAGAAAAGGTTGTTTTTCTA TGGAGACTTTGATTCCATTTTTGCTAGTTTGGGATCTTTTTATCTCATTA ACATTTTATTAATGATACTTTGTTTTTGAGCTTATGATATTCATGTGATA TTAATCTTGCgtttgtgtttactttgagaTGCAATCTGTTGTGATTTCTT TTGgggaaaataatatttgaaagTATAGGAGCTGTATATCAAGGTCTACG TTTAGTCTGCAGACTTTCCGCTGTAAGAATATATTCAGCCTTGTTGTGAT TTTGTTTTAGAGATAATGGTCATATATTTAAATGCATATAAACTTTGTGT 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ACGTATTTACACTTTTGCATCCATTAGCTTATGACATGCATTATGACTTG AGCTGATCTATAAATTAATCAAATAGTTAACATTGCTTTTGCGGACAGAA TAAAATGCGGGAATATTTTTTGGTATCAAgtgaatttgaaataaattgat tttaaaactttaaaatttatcTTATTTTATAGCAATCTATTTCGCAAGTT TATTGACCTCTGTGAAACGGGTAATATTTTCTTTGTAGGTTTTGAAGATC GATGAAACGGACGAGGCAGATGCTGAAGCCATAGCTACCAAGGTAAATAA TCAAGTAACTTACTCTACTAACTACAAATGTTTCTCTAGACAACTTTTGC GTTTTCTGTGCGACTTCTTCTTCACTATGTTTGATCAGGTTTTCTCAGGA TTATCACTATCAGTGTCTTTTTCATACCTCGGTCGTAAATTTTTCACTCG TAGTTAATTTCAAGTCATAATAGTCACGACTAATACACTAATGAATCTCG ATAGCTGTTAGTCCTATTCAAATTATAGAACTAGAAGGAACTAGAAAGCC GGCCAGGTTGATTCTTTATAAAATAAATAGATTAAAAATAGGACAAGTTA GGATCTGATCGTTTTTACTCTATTGGTTTCTTTCTCTCGCAGGTGGTTAG CGACAAAGAGATTGAATCACTGAAACAGCGTTTATTTATGTCTCGTAAAG AACTCGACTCTTATATCTCCTTCACCAAGAAGATGGAGCGCGAAAAACGA CAATCCATTTCCGAAAAGGAAGAACTCGAAACGAAGATTCAATGGCACGA AAGACGTTTATCGCGTTTCGAAAACGAAAATAAGACCCTTAAACAAGAGC GCGCTAACCTGATGAACCAAATTTACGAGCTCCGTAGTAAATCAAGTAAA GAGAGCGGACACACGCGACAGAAATCAGTCGACGTTGCGGCTCTTTTAAG 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CCAATCGTATGGAGATTAAATCCATGCAGAAACCGGTTGAGAAGTGTGAT TGCTCGAAAGAAAAAGAAGTCTTGAAACGTGACTACGAGGAAGCAATGGG ACGGTTAGAGAGTTTAGAAGACGAGGTGAACAGGCTACACCAAGATAAAC AACAATTGTTGATGAGCTTTTTGAACTTACAAGCGTCTCAACGGTCGTCA CGTGATGTGAGCCGGATTGACGTTGGCATGACGACAGATGATGATTTGTC TGATGAAGAAGGTGAGTATCTTAGAGGAGGCTcaaaccacagatatctaa gcccgaagggctagatttgcagctttaagctttctccagcaaaaaaaagt gaagctaaaatttgactttttaaatttcgtgccgatggatNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNagtcacgtgactctggtaggaaatccttccaaagatgagc ttcactttttgaacaaagctgcaaatctagcccttcgggctttacagata tctgtggctCAAACCATTCTTTGCTTATAATAACGTCTCCTTtggtataa tgtgcgcgcggtcgactaagttcctatatatcgctcaaccattttcaaaa ttctaagtTCGTGTACGACTACATtacatgacatcaattttcgtatcaat ttttaaatcctcagatcACTCCGATCGCATCGAAGGATCCTCagtgcttt atattttaaataatgaGATTGCTCCAAAACGAAAATCttccaacccccgg accttattaggacacCAAATAAGTGTAGAAATCCCGAACGTTGTGAATAT GAGATTTTTTTAAGAGAGATAACCATCCTCATTCAATAGTGTATCCAGAA CATTCTTTGGACATAGACGAGAAGTAtcacatttttcttcatttaaggTA CACAATCTTCAGGTTCTTATCATTCATCACGTCGAAACACTGGTACCAGC TCTAACGGGGATACTAGCGACCTCCAAGAACGCTTAGAAGACGCTCTCAA TCAAATTGAACGCTTAGAAATCGAGCGGGAAGAAATGCTGGAGTCGCTCT GCAAGCAGGCTGATGCTAACAATGCTCTAAAAGATGAGATTGAGGATCTG AAGAACGGTGGCAATGGCGGTGGATCTTCTAGTAACGTTGATACCCGACC CAGTTCGCGCACGGGAAGTCGGCCTAATAGCGCCATCTCGAAGAGTGAAA GCATGGCCAGTATTTCATCGGAACGATGTCCAAATTGCATAGAAAACAGT AAGTCACTTATCTCATGTAACACTTGTCAATTTCTCGAGGTCAACCGAtc ctgaattcctcattttcgATTTTGTAATAATGGATTTGAAACTAAGCCAG TATATCTATTCATAATTTTGTTTGCCTATTCTACAAAAACATTCcacagc tccattaaaaacgcagacaattcattccaattcttaTTCGACACTTTGCA GTCAAAACATCGTAAGCtctctggtcattaaaatgttatattaaaGTGAA GACATTGCGGTGTTGAATCGAACAATTACGTCACGTGCTATCTTTTGTTT TGACGGTTGGTTGAATAACTGCAATCTTTATGCAAGCTCAGCGTTTTTGA AGCAGCAATTCAGACCTCGGaaaacataatttcaatttGGCTTTAATGTA TGAATCGATATGCTCACAATGcaacttttattttcaatttaccAGCTAAC GAGATCCGCAAGTATCTTTCCATCATTGAAGAACTGACCGAAGACAAACT ACGTCTCGAACGAATGCTGAACGATCTGGAACTAGACAAAGACAAAGCTG AATCCGACCTCGCTAAACTGACGGAAGATTTCTGTCAGATGGAGAGTGAA ATGACTTTAGTAGACTCTGAGAAGGAGAGCACGGTGCGAAGCGCAAAGGA GGAGACCAAGTTGTTGCTACGCAACATGCAATCGTTACAAGAGGAGAATC AACTGTTGGAAGAGAATCTGAAGAACTTGGACGAGGACCGACGCGAAGTG CTCCAGAATTTGAAACAGGCCGAGGAGGACCGGTTAGGTTTTATCCGGAC TTTGCAATTGATAACGGAACAGAAAGAAAGTGTTGAGGAACAAGTGGAAC TTTTGAAAGCGGAAAACGAAACGCTCAAAACTGGAGGTGAGTTTATGATA TGATATGAGGTGAAGTGGATGTATGGGATTGTTGTTTTTCATCACTTGAT CAATCAAACCCCTCCCCCTCCCCGActctcttttctttttacataacCTG GCAAGGTTCTTCTTCCCGaccttcaatttcaaaataatgtCAAAGTAATA ATTCCCCGCCATTGTCATCCCTATTTCGGGAAATTATTCCGTTTAACGAT TTCAATTTCCTTCTCCTTTACGAAAATCGCCTTCTTTTAAACACcacttt taatttttatctGCCTAATTTTTCTAATGAAAACCAACGGTCCATACATC CACTTTTTTCTTggcttttgaccatttttctaaCGTTTGCTACTAATCAA AATGACCTCTTCTGATTTGTATTTTAGTGACGTTTTGATAAAGGAAAGTA GTTATTGTACTTTCCACTTTGCTTTTTACGCACGTATTATCTTTACCGTA AATTATTTTTATGACAATTTGCTTTTTATGACAATTTGCTTTTCAATTAA TTATCATGCATGGTAATAACTCTTGTATGACACTCGTTAACTTCCGATTT CGCGCACTTTTACGtttaacaaatatttctatGCACACTTTTGAACGATA TGCATAACCTATTTTTGTACGCACATAAAGATAGGAACGTTTTCACACCC GCGCACGCACATAATGACACGAACCCTTTGCACCTACACATTAGCTGGCA AgctaatttgataaaaaaggtaaattttaaaagaatttaaacTTTAAAAG GTTATAGCCAAACATTCCATCATAGTTTTGCAATGTCTTCTTGAGACCAC TATAAAGAAATTAGCTTGCCAACCACTCCCAGTCACATCGTCTTGTGTTA AATTCTTTCGACTGCAAACGACGTGTCAACCCAAACTCAACGCAACCGAG AAAAACTGAAACCAGCAACAACTAACATTATAACCGACATGCGCGAAATC GGACGGAGAGAAAAAATATTCCTATATTGGTAAGATTCATTTTccttctg tttttctttttcataaaaagtcaCAGGCAACTCAATTGTGTCTCCTTCGG ATTTACCAAAGGCTATTAATCgctgtgatgacgtcatcaacgaGCACGAG GAGTCTGGCGGCGACATTGCCGGCCAAGAAGATTTCGAGCTCGTCCAACG TTTGTTATCGCAAGAACAAAAGGCGGACTTACATCTTGCGCTTAAGCGCT CTATCTCAACGCCCCTTGGGGACTCGGTAACGCCCACGACGGAGAGGGCG CCTTTGGAACGTTACCATTCAACGGCAGTTACTTCGCCACGTGAACACCC GATACGGAGAGCAGATTCTGTAGAAGACATTGCTACGGGGGAGGACGAAA ATAAAGAGTTGGCACGCCAGCTAATCTCTTTGAAAAAcgaaattctttta tttaaaactaaaaacatAGAATTGAATAAATCATTAGAGAGATCGAACAC GTTATTACGGGAAGAACGAAAACGTAGACTTTCGGAACGTAGCCCGGCCA CGACGCCCGTCAAAGAATATACGAACGTCGAAGTTGATGTTCAGCAACAG CAACAAGAACTACCTTTGAATACCATCACTGAGCTACCCGATATGGGTGA ACGTGCTGACTATGTACCGACGCGCCGGCTAAGCGGCGAACGTCGTCGGT CGGCCGAATTTAAACTTTCGGAAGAGCTTTTAACGAGACCACGTTTGTCG TCGGGATCGTTTATTTCCGAGGACGAGGTGGCAAATCGTCGGAAATTATA CGGACAACGGAAATCGTCAATGTCGTTAGACGAAATGTATAATTTATTCG GCGTGACGGAGAAAAATAATATGGAAACAAAAGTCTTACCGATGTGAATT TCTTCCGTCTCTCGTTTTTTGTTGTTGGATTGATAAATTGGTTGTTTATT ATCTCGTACAATTAGCCTTTTACCCACAttgtaaaaataaaagatttttt gtagtATATTTTCTAAACTAGGGACTTTTTTATTAGATTTGTCACTACTG GTTTTACATAGTTTTTGGAAAGCAAATTGATTAGGATGATGTGTTTTTCA TTCATAAATCGCCGATTCCTTAACTATTGTCGaaatatacaccttttcga ccatagccgccaattgctgcgcgggcatttttttgtccgttttaccaccc taaaaccgtcccagtctttttttcgcgtccaacagaaaaaagtgtaaaaa aaggattggatcgagtttagttgGTTAAAAGTGGCACGCACCTGACCGCg caactacggtcgaaaaggcgAATTTTGGTACGGAATAACCTTGCTTGTTC TGCTTAAGTTGATTGATCTTGTCTATCTCGTGATACTAAATGGGTTTTAC ATTGGCGGTGTTAGCTTTCTACCTAAAAACCTCAAAtttagaaatgtttt tttttgcatgtgTTTCATGTTGTCTTTTATTGTTGAAAAGGgaatatttt ataaataatacttttttgtctCCTTTGTAAATAAAAGAATACTTTTGTTA TTAAAAAATACCATTTTACGAATAACAGTGCCCACCCCTATTGAAAATCT TATGGAAATGGAGCAAAAGCCGTAGAATGGGGATTTCTACATCCTTCTTT TTCGCATTTTTAGGCGAATTCCAatgtactttaatcgtagaaattttagc gagactaattttagtgtattagcgagtcaggaaaatcttgatttttttgg atttattttagcgaatcacgatttcaaaaaatttcgcgtggataaatttc aACGAATActtgtattacattattgactgaattcgttttctagcatttct ttgcactgaaacccttcctattgataaaaatgtatcaaggcaatataacc
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065567TCONS_00065567Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065568TCONS_00065568Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065569TCONS_00065569Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065570TCONS_00065570Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065571TCONS_00065571Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065572TCONS_00065572Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065573TCONS_00065573Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065574TCONS_00065574Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065575TCONS_00065575Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065576TCONS_00065576Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065577TCONS_00065577Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065578TCONS_00065578Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00065579TCONS_00065579Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00065569-proteinTCONS_00065569-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_440supercontigscaffold_440:377701..439900 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
7.17 6.84 13.12 16.45 33.89 25.86 42.8 52.38 36.12 57.52 25.48 28.82 45.37 39.34 18.39 21.93 36.83 29.04 50.45 42.88 33.57 35.46 19.13 27.11 47.69 47.78 74.15 66.27 110.41 112.88