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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00063521 ID=TCONS_00063521|Name=TCONS_00063521|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1961bp
AATTATCAACAGGTGCCCATGATATCCCCAACTTTTGATTACAACGTTCC
GGCACGAGCGAGCACAGATCTTTCATCAACACATTCGATCATCGCACATC
AACAAGCTACCACCATTGGTTTGTTACACGGCAACGACCACTTATTTGAA
CAACATAGAGGAGGAGGCACGTGTTCGGTGTACGGAGGAATGACAATGCC
TGAACGATCGGTTGAAAGCCCTATCGACAGTCAAAACATGAAACCTGGAA
CACCACCCAAGAGACGTCGTGAACGAACTACCTTCACTAAAGCACAACTC
GATGTATTAGAAGATCTCTTTGGCAAAACAATGTACCCTGATGTTTTCAT
GAGAGAAGAAGTTGCCAAAAAAATCAGTCTGGCTGAAGCTCGAGTACAGG
TCTGGTTCAAAAACAGACGTGCCAAATTTCGTCGGTCACGAGAAAGCCCA
GGACGACACTTCGATCACACCAAATTCTTACAACGTGATAAATTCTTACA
AGACGATTTGGTTCGTTCATTCAAATCAGGACCAAGCAGTTTCTTACCAC
CATATCAATATCAAAACCCGTTATGGAAATACCCACCACCTGCAACAGAG
CACAGCCCAACATACGGTACGTCACAGGTAGTAGACGATTCTTTTTATAG
ACAATCAACGAACGGTTATAACTCAGTTTCGCCTTACACCGACTACCCTT
CGTCTTACTCCACTTCACCACGTCAACAATATTTCTCCACACAATACTAC
AGTCCACCCGGTGGTAACCATGACTACAACTCATGCGCACCAAGCACCAC
TACATCGAACACTGTACCTAGTATGTCCTTTTCACCTCACGAAAACACAA
CGAAAACAGATCTCAATTTACCGAACACTTTTCAATGGAGCGGCAGTGGT
GGCACTCCGCAATACGGAATGACAGCCGGTGGATCAAACATATAAACATT
CAGGAGTCGTCTTTGACAACTCAAAACTAAAAACGAGAATACAAAACTAA
AATATGGGGGACCATTCTCTTGACACAGACGCGCAAACGGCAATCAGAAT
CAACCATCATATGGGTTGGAGACTTGGATAATCCTGGGAAAAGAATGCCG
CACTCAAGCGGGTTTTTGCTCTTCGATTATTCTTCGTATTACTGGTCGAG
CAGTCAGTCGGTATTTTACTGACAGAGGTATCTAGTTCCGATTTTAATTA
CTCGAAGGATGAAACTTTTAAAGTTTTTATAGAAAATGTAAAAAACTAAC
ATCAGATAATTGTGTAATTGAGAATGGAACGCCCGTCTACCGGATGGAGT
TGGAATGCAACAGGAACATTATGAAAAGAAGAAGATTTGTTTTCTTTCTT
CGAAGAACAAAGAAAGAGATTCAAACTTGATACATTTTCATAAATAAACA
AAAACAACGTCTTGAACTATTTTCCCTAGAAACAAACTAAAAATACTTGT
TTTATTTTTACGTATTATTTGAACCATATTTTTAAATACTTTTATCCAAT
TTTTTTTTATTTTGGGAATTGATGACCAATTATTAAGTTGAACCCTGAAA
TCACCAAGTTTTTAGTTTTCGATTTTTACAGGTTTTTAATGAGATCTTTT
ATTTTCTTTCGTGTACATATATACTCATGACATTTATTTTTCTTCTAAGA
GCATCGTTTTATTTTACATTTATTTTTTTAAGTTGTATTTTTTTCTCGTC
CTTATTTTTCTCATATATACTTTCATTCGATATTTCTTTTTAAGGAAACA
ATTTTAATGTAGCTAGGGAAATAATTCTAGGTGGCTGCTGTCTTGACGAC
TGTCAGCTTTTAATAGCAATTTATTTGTAATGTTGTACATAAAATGTGTA
TAATGCTAGTGGGTTTATAACATGATGATAATAGTTACATATTGAAAAAA
GAACTCATTCTATTGTATACACAGacaattttaattcaaaagaccgaaca
aataaaaacaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at scaffold_391:81782..102116- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00063521 ID=TCONS_00063521|Name=TCONS_00063521|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20335bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_391:81782..102116- (Clytia hemisphaerica)
AATTATCAACAGGTGCCCATGATATCCCCAACTTTTGATTACAGTAAGTT
ATTCATCTTCTTGATTTGACTTTAGGGTTTTATTTGATATCTTTCTTAAT
CTTTTTACTTTAAGTATATGCGTCCAAAACAAGCCAAAATACTGAGTCTC
AGAATGCTTTTAGGAAGAGTATAAAAATAGCTTTCCAATGGTACCAAAAC
AATCTTCTAAATCAAAAGCTACAAGCTTTTATGGCACTTTAAAGTTTTGA
ACTTCAAAAAGAAAAATATATATCTAGCTAACACTGCTTGGCCTACCTAC
ACAACCCTATTTCCATCATATAGGAGGATATTTTCACAAATGGCCGAAAT
CCTGTGTAGGTCGAAAACTGAGGAACAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTTTTGTTTTGTGGGTTTT
TGTATTTATTGTTTCCATTTTGAGTAGTTGAAGGTTTTATACTTCTAGAC
TATATATATATTTCAACCTCATGTCTGAGGGTGATTTGAAATTGTTTTGA
TCCTTAAAAATAATTTTTAAAGGCCTCTTTAATTATCAGCACTAGTTGAA
ATTGAAAACTGTTCAAAGTTTTGATTCGTTACAAGAGTGTGGTCACAAGC
AACATGATTTTTGAACAAGTTCAAATGTGGTTTAAAGAACATCTACTGAA
GTTTCTTTGAAATTTTGCCATTCCAAAAGTAAATTTAAAGAAAAACAACA
ATGTTTTTAAATTGAGCAAAAGCTTTTCGATTAAAAATCATCTTCAGTGC
TACAAATGATCTACTGAAGAATTTCGTCTTTTTACCGTAAATTATTGAAA
GAATGTTTGTCTAACTTCTTATCGTAAATTTACTTAAACAGTCACGGAAT
GTTTCTTGTGTTAATTGCAAAGAGGAGGTTGGCTGAGAGGGGGTCCCAAG
ATGATATTGCATTTCAGATTACGCTCGTCTAAAAAAGCGTAGGATTTTTT
GAATAACGAAGTTCGAAGGTTCGTTTAGTTTCTTAATAAAGAGAAGTCGT
CTCTGAATCGTTACTTTGACCACAGCCTACAGGTCCAAACCAAAGCGTAG
GTTTACAAAATATTTTATGGGGCAATAAATTGTCTCAAAATGATTTGTTT
GATGTCCCTCATTAATAAAGGTTGGTGTACGTATGCGAGTATTGCAAAAG
ATCATATTGTGCTGGCAAACAGAAAATTATTTATCTTACATGTTTCACGA
AAGCTTTGGTTATAATTTACCTTATCTGAATGAATTTCGTACTGTCGACA
ACAAGTCTTCTTGTAGTAATTGTTTGTTTGGATGAGACANTTATCTGAAT
GAATTCCGTACTGTCGACAACAAGTCTTCTTGTTTGTTTAGATGAGACGG
ACAATCCTAGAAAATAAAGAAGTTTGGTATGAGTATGAGTTCAATATAAA
AAGTTGCTAGAAATGAGGTCGAAATAGGGTGTAGGTTTCTGTGAAGCTTT
ACCTACAAACATAGAAGCAAAGAAGAGGCTTAAAGTTGTAAAAACATTGA
AGTCATTGAACATTGAAGGTTTTACTCCTTAAAATTACCAGAGCATGAAT
TTCAATTAATTTTGACAAAGTACGAGGTAGCCTTGATATCCAAGCTGTAA
TTTCTTTTCTTATTTCGATGTTTTTACTATTTACAGCTTCTTGCTCTACC
ATCTAGGTAGGCTTGTAAAGCCAGGGTCGGTAAGTTTTTATCTTTGCACA
ATATTTAGATTGACACAGTACGCATGTACTGTCTTCTAATATTGGAATAC
AAATCGCTTTAGGAAGGCCAAAACAAGAGACATCAAAAATAAAATGAAAA
GTTTACAGGTAGAGGATTTTTATTTGTAGTTGACAATACTGTTCCATTAG
TTAACGATACTAAATCTCGAGGCTTAAGATTCTTAAGATTTGAGGAAATA
ATTTTTCAAAAAACAAAGTATGACATTGATATTTTAAAACATCGATCGGA
GAGCAACAGGTGTAGTAGAGGTGAGAAATATCGAAATTTTACCTCAATAA
ATGTCAGAAAGAAAACAAGATTGACTTTCGCTGGTAACTATTTTTGAATG
TTCTAACGGTCCAATTTTGAGGGCCATTATTTTTGGCTGAGAATACGGTC
GATGAATATATAAATGGAATGAACTTTTAAATCTCAGCCGGATTCTACTT
TTACCTGCTGGAATTTAGATTGAATGCAAATTTAGGATTTCAAGTGTGGG
TCTTATTATTTCTAAATATTGTTAATGGCAATAACTAATTTCACGAAAAT
TTTATTTGTTCATTTTCTTCTAGTTCAAGAAAAGAAAAGATTAATATTCG
ATAGCTATTGATTACAAAATGGCAAATGAGAACGACATCCTTACACGTCA
AAATAATGAAATTTTGTGGTAAAGTCAGTCAGATGATGGGATTTTGAAAA
TTGAATTTCAGTACAAAATAGTCAGGATGGGTTCATCTTTCCATTTTCTT
TGATTCTTGTCTTCAAAAAGAGAAGTTTTGGTCTTGAAGCGATTAGTTAA
AACAATGTTTCACTTTTACATAAAAGAGATCGACCGAAAATTAGGGAAAT
CTAATCAGAACTTTTTTTTCAAAATGGACGAATACAGGATACAACACATA
ATGTCAAGTAAACCCAAAAAACCTTGCTCGCCCTGTACCACGCACCGTTT
GCTTTTAGTCTCAGAAATGTGATTCAAAACTAGGGTAGAGGGGAAACATT
AGGACAGATTTGATCCTTCTTCTCGGGAAATTCACATAATGATTATTTGT
CAAATGGTAGGGAAGCAAATTGGATTAGAATTCTGTCTGCAATCGATACA
AAATAAATCTGCAAGCTTTTTATGAAATTATGATCCAGTTAAAAAGTTTT
GAATAAAAAAAATTCGTTCGATGTTAATCGTGCATCCTTTTCCCTTTTTA
ACCATTTTCATTAAAGAAGGCCATGATGAGACATTCACTTTTTCTATAAG
GACACGACACCCAATGCCCCATTCACAGCAATTGAATCCTTCCTTTACTT
TTAACTTATTAGAGAACTACGAAGTTTGATTAAAAACCCTACTCTTCAAT
ATTAACCAATAAAACAACAAAATGAACACTTTGTTTTTCAAATTTTATCA
AATGTCATAAGTTAGTAGCTTTTTAAAGAAAATAATTAAATGTTTTCACT
TTTTACTAGACGTGCTTCGCAAACCCCAGGTGGAACCCCCTACAGAGTAA
GATTTCGTCCCCCGTGGAAAATTAGTCACCAGGCTGTCGCTCATGGTTTT
TTTTAAAAGTATCAACAATTAAAGAATGCAGGATATTCTTCTCGCTTATT
CCAAAATTAAAGCGAACAATTTAAAAAGAATGAGCTTATGTTGGATGAAT
TTGGAAAACATTTGAGGTCTTATAAGCATAATGGAGCGCAACAAACAACG
TCACATAGTATTTAAAGGCGCGACGAAAAGATTTTACAACCGATGATGAA
AAGTTCACGGTCTAGGTCATTTGGATTCTGTAGAGATGGCAAGATGGTGG
CATTGTTACTATTATTAGCGTAAAAATCCTTGCATTTTTGGCCAACAGGC
GATCATAACTTACAAAACACTTGAAAATGATATATTTTGCTCTCAGGGGT
TTCGAATTCATTAAAAATTGATGGCAGTAGTTGGACCTGATTACGCGGGA
TTAAGCCTTCATGTGGAAAAATATCAAAATCGATAGAATAACGTATAAAT
TTTACAAAAAATATTAAAATACATAAAAAATTGACCGAAAAAGAGAAATT
TTAGTTTGATTTAAACAAATAAATGAAATTATTTGATCTAGTTCATCAAA
AATTTACCAAGTACTTAAGCAATTTTGATATCGATTTCATTTTCTATTGG
GATGATAGGACTGTTTGAGGATCAAAATAATCTGACCCAAAGCAACCGAA
AGAAATTGAGGAGAAGAGGATTTCTTCACGACTGAAGAAAATCTTGTGAT
GTTGGATTACTTGAGGGTCAGCTCAGATCGCTTTAAGATTAATATGTTCC
ATTACAATCAACCAATTCAAATGATAGAATTTTTTGAGGCGATTGGGGTT
AATGATGTACTAAAAGTTTCGAATAAATTTTTGCTATGGACCACGTGGTA
ATATCCGCTCTTCAAATATTGGGAGTAGAATATTTTTTTCAAAAGGGTTC
AAAATTCAAGACATCCAAAAGATGTACAAATACTGAAGATATTATAAAAA
AAATTGGAAAAAAATAAATCCTTGCATCTCAATAGTGGAATTAAAATCAT
TTTCACCGTAAATCTGGTGCGAGTGTAATCGGTTCTATGTTTTTATGAGA
TAGAATATCACTGTCTGCTCTCATGAATTATGTCTCTGAAAATATATTTT
CACTGTACGAGGTCTGTTCAAGATTAAAAAAATACGCAACCGCAACATAT
AAGATGTTTATAAGGCGTTTTTACACAACCATTGCATTTACTGCGAAAAA
TGTGTTTGTTGAATATTTTTCTTGAAGGACGACTCGACCAAAAAAACATC
TGCTCAACAAATTTGCCTTTTACTCTGGGTAGATATTATACTTTGACAAT
AAATGTGTCTCTTGTCCACGTTCACTTAATCATATATGGAAAATGAGAGT
CATTCAAAACTTCCCTGGCACTGACACGTGTACATCCAACATTTTGCAAA
TACCGTGCAAAGGGTTTCGTAAAGTTGATGCCAAAAATATACAACTGAAC
GAAATTTTAACTCAATAGAGAGAGAGTGACAACGGGGTGAAATTTTTATG
AATATTTTAAGTTGACCTTGTTTGAAAATTGACAACTCATTAATCAATAA
GCCAATCAAGTGTAAAACGTCCCTCAGTTGAAACTTTCACTGTCATTCCG
TTCAAAAACAACTTTGCAAAGTACGTCAGTCAAGTCAGTATCTTTTAACA
CCTGTGCCTTCTCTCATGCGATAACTTTCTACCGATAGATAAACGCACAT
CACAATCAATTGATACAATAACCATTCTCGAAAGTAGTTTGAACGTGAAA
ATCTTTCCATCCTTGACAACTTGTCTTATTGAGCAGAACATTGAAATTAG
AGTGTTATAAGAGGCTGAACAACATTTTAAGGTACAAACGGATAAGCATA
AATAAGTCGACAAGATTACACGAGAATGTCATGAGCAGATCAACTTTATT
ACTTTCTTCGGATTAAAGGCATAAAATTTTATATGTGAGGGGCTTGTCAT
ACTTAGTATATTGATTCAAAGTCTAGATTAACACTAATTTCATATCTTTA
TGTGTAAATCATATATAACTGTACGATTATAGTTCTCTATGGCTTAACGA
CGGATGAACAGTTTTTTAGCTCCTATTCGCGTCTTCTAATTCCAACATAT
TTGCCTTGATTTAAAATAACGGTTTTCCATCCTTCAAGTCAATGATGAAG
AAATAGTAAGCGGTTTAAAAAGATTTTAGAGTTGAGGATATTTCTCAACC
ATATAGGTGACATTCTTTTGAACCGATAAGATTTGAAATAGTTAAAAAAA
AGAAATCAAAGCTAGGGGAAGAGAATTATTGGGTCGAAAAAAAATTGGGA
AAAGAAATGCAGTAACGAAGCGGACAAACGTCCTTAAAAGTTCTGATGAA
GGAAAGTCATAGTTTTTGGGACCCAAGTGTATTGGAGGGAAATGAAAGTT
ATTGAAAAGAAAACGAAGGGAAAATCAGGCTTGTTATTTAGTTATAATGT
AACGATTTCATAAATTTGAATCGCATGTTTTTCTCTCACGTTAATCAAGG
ATGACTTTAAACCAATTGACGCATTCTTCATAGAGAAAAGAGAGAAAATG
ATATCCAATCAGAAAGGATTTGTAGTGACCACTAACTACATTTAGAGACC
AATGAAAGTTCAACGGTCAAATCACAAAATGTTGCTAAATCAAAAAAAGG
GGTAACAGCTACAGTGGCCACCTGAAAGCCGGATATCAATGTTGCCATGG
ACAACATTATTCTAAAAAAGTGACAAAATCTTTGGACAGGGTGTCCCTTA
CTTTTTAAATCATCAAGAAGCTTTGAACTTTGGCCTGAGCCAAGAAAAAA
TTAAAGTTGAAGGCTAATATTATTCAAATTGACCTCTCTAAGAGTAACTT
TTTCGCTGGTTTCATATCTCTAAGGGTCGGTTCGGAGGTCCGGTCTGCAA
ATACCTGACATTCTCCGACCCAGTCCCCCTCTGGAGAATTAATAGTTTTC
TTATAGAAAGTGTAGATGCAAACTATGGACTTTCCTTGCTACAAGTAATA
ATTGAAAGCTCTTTACCTAAAGTTCGAGTGACGAGTTATAAAAATCGAAA
ATATTTTCCTTCATTTTGACGGAAGTAGAATATCGACTATAATGGAATCA
ATTAGCGAGTTTGCGAGTTCACAAAGAAAGAATCAGCAACAAACAAATTT
AAGTCGGATGATGAACCGAATCAACACATTAATTGGATTGCAGAAAGAAC
AAAAATTATTTTCGTCTCGAGAAAAAATTATTTTCTTGATTTTTCCTTCC
TCTAATTGAATTCATTTCGTGATTTCTTATTTTGCCCAATACGACCATGG
GCCTCATAAGATTGATCGATTGCCCATTGATGGGTTAATATTAACCCTTT
AAGTGCTACGGTCCTTTTTTCTAAATAAAAAAAAATCACTAGCTTAAACT
TTAAAGGCTTATATCCCCGGATCTGGAAGAAGTTAGAAGCTCGTTGGATA
GCTTAGAGTCTCCTCTTTCTTTTGGGCGCCTTCGGGGTTGGTTAGGGGAA
TTAAAGCAGTCCACTGCATGGGCCTGACTAAATGGCAGAAAGGTGCTCAG
TAGTAAAACTTCAAATCAATTCGCTAGAGGACAGAATAAAGTAAAATGGG
CAAAATTCGGAGGTTCTTGGATCACTCGTTGACCAAAAATGGTCAAAAGA
GGTCAAAATCTCAAAAAAGTGGATTTTTGTCAAATTTTTGCTTTTTTAGA
CTCTTCGGCTTAAAATCTCGCTTGAAAGACTACTCACTTTCGATTTTTTA
TTTGCTTGACCGTAAAGCACAATCCAATTCAAATGAGTTACACCAAGAAT
GACGATTTCTAACTCAAGCTGGTCATTACAGAAGGGCTTCACTCTCATAG
CCTATGTCCAATATACTCGACATCTTTGGCACTTAAAGGGTTAACCTTTC
AAAAAAAAAAAAGTTATCAGTCATCTTGAAAGTGTCAAACACTCATAAAA
AGGGCAGAGAGGGCAGTGAAAGCTTTCCGATAGTGTGGAGTCGAAAAGAA
ACCCCACTGTTTTTTCACAGCAAGGTTGACAGACCTTTTACATTCATATT
TTTTCAAGTCAATTAACTAGTTCTCCATCCAAAAGTGGAAAGGTCAACAT
CTAAAATATGTAGTCATTACTGATGTTTGTTGGAATTCCCCTCTTTATAG
CTTTCAGAAAATACGAATGTAAATGCAATGCAAAGACGGGTCTTAACATT
GGTAAGTGGATATGATAGGTGTAAATTAAAAGTAGTTTAGCGTCAGATTA
TTTTCAATGAAAACAAAACACAAGTCAATCAAAGTAGACACTTTTCACAA
TGGATAGAGTACAGTTAAATCGCCTAATTCTAATTCGAAAGATATCAAGT
GCACTATTTGAAGACTTTGAATCAACCCTTCTTTTAGCATTACCTCTAAG
ATCCCCCAAAAGCTGTATTAATCAATTTTATATTGATTTTTGATGGATTG
AACATTAAGACGAATCAAAAAGGTGCTCTTTCAAAAGAAATTAAACAAAT
CTCATTAATGAAATGCGAGAAAAAAGAATATTTACTCGAATCTAATTTAA
AGATCGCTGCAGGCTGCCTGATTAACGCAGCATCGCCAGGGACAACCAGA
CAGTGTTGTTTAGATTGTCTCCATGAGTTTGGGGAATAAAGAAAGGACTG
AAGCAAGGACTTTTCATATTAGGAGCACAATAATATAATAGAAATTTCGT
GCCCTAATTAAGTTTTAGTGTTTGTAAAAAGAAAAATGGATGGAGGGAGG
GTAATTATTTCGTTAATTAGCTGTCTTTATCCATACAACTACGCAGAGTC
AACCAATTAACACTGCAGGAAGTCTAAAGAAGGTTTTAAATACTTTTGAC
TTTAGTAAGCAAACAAAATATAAAGCCTGCATTGGTCACATTGGCATGTA
GCGAGGTGATGTTTACCTTTATTGTAAATCCAATTAGCTTTCTCATACCT
CTTCAACAATAGGAAAAAGAAATCAATAAGGATTTGTAAAAGAATGAGCA
GGAGTTTTGAGGAATGCATCATGTACGAAAACATATTAATTGATGTAGAT
CGAAAAATAAAGATAAGAAAGATTTGTCAGTTTGTATCTNCAGGAGTTTT
GAGGAATGCATCATGTACGAAAACATATTAATTGATGTAGATCGAAAAAT
AAAGATAAGAAAGATTTGTCAGTTTGTATCTAAAGATGCGAAAGGGGTTT
AGTGAAACAACAATAAATCTTTTAGTTCCTTTTGGTTAACATAAACAATG
AAGCTCCATAATGACTTAATTTGAATTTAATAAGGTAGGATTTGGAGTTC
TTCCGCTTGGCGTTAAACACTCAATAAAGCCCGACTAATTGTACTTGACA
CACAAAAATCGCGCTAAGCCTTTCACAAAAATAATGCGCCATTTCAAGAT
AACTTGAAGCACTTTTTCGAAAAACATACTCAGAGAAAACGAAGAGGGAT
ATAAAATAAATTTAAATCTCTGAAACTAAAAACAAAATCTTTTCAAAGGG
AAAATTTTTTACACAATAAAAATAGACCAGCAAAGATTATCAAAAATTTT
CATTTTGAAGTTAAAAAGAAATAATTTTTTGAGAACAAAATGAAAAATCA
CGAAGTAAAACAACTATCCTATCTCTGAAGTCNAATAATTTTTTGAGAAC
AAAATGAAAAATCACGAAGTAAAACAACTATCCTATCTCTGAAGTCCTGA
AGAGACAAATGATTTGAGATCCTGTCGGTGGATCCTTTTGAAAGATAATC
GAAATAGTGAAGGTCGTCGTTTTGAGGAGTGTAAAGAAAACAAAATATTA
TTGGTGCCGTTAGTTGGCTGATCCCTTCGTCTCCAAACCTTCATCTCTTC
ACATCATAGCGCCCCTTCTCTCTCTCTCATCGTCCTCCACTCGGCTTCTC
TTTAAAATCTTTCAACTCCAAAGTTGTTTCAATAAAGAATGTTTCATCAC
TGACATTTTGAATGTTTATAATGTGATATTTGGATCTTGTAAAGAGATAG
AAAGAAACAACATTTTTTGATGTCACATCCCTTTTCTCTTTGCGAAGACC
TAATGGCCCAAACAAAAATAAACTAACAAACAAACAAACAAGAATGGTTG
GTCAGAGAATTAACTAAAATCAAACGAGGAAGCCCTGAGGTCGAAAGCCT
TACAACTGTTGCGTGGTTTGGTTTTATTTCCTGCTTTCTGCAAGAGGTCA
CGAGTAAAAGAAGAGGGAAATAAAAAGGCCATGGGAAAATGATAAAAATA
GCCTCTCTATGGCTTATATGGCACAGCCAAAAACCCTCTTTAGCAGAGAT
TAGCAATGTTTTTTGTGCAATTTGAAGACTGTGTTTTTTTCTAATCCGTA
TCAAGGAGTTTTCTTCGTAAGGTTAATTGCAGAATGGAGATTTGCTGGAC
ATTTTGCAAACCTTTAAGGTTCAAAGGGCATTGAAGAGATCTTTCAACAG
CGACTATCTGTATGTCTACGTCTAACGACATGTATAACGTGTGCGAGCGA
GTTTAAGGGGTCAGCGCGACCTTTTATTGTAACTTTAAATTTTAGAGATA
TCTCAAATTAAATGTGGATAAAATATTCAATAGATGGAATGAGATACATT
CCAATACGAGCTAATTCGCCGCAGATTGTGTGATAATTTTTCTTTTTCCA
AAGCAAATTTTGTTTTGTTTTCAGCCTTTAAACAGCTTTAAAGTACAGAG
CCTAGACTCGAGCTTTCCTACATTTAGAAAGCGTCCACATGACGTCTCCC
AAGTTTTGTATACATAGGAAGGATAAAACGTATCGATTCTACACGATAAT
GAAATTTTAAAGGAAATGTTTTGATTTTTCATTTGAAACTGATAACAGAC
AATAGATTTATCAGAGTAAAACTTCCCATGGCATATGCTCAGAAAAAATA
GGGCTCGATAAAATATTGGGGGTTTTGTCTTGTGGTTGACATTATTTTGT
GTAAAGAAGAGGAAACACAATGATAAAACACAATTTCAACGGTTAGGGTT
CAAAAATTGGAACAGGGAGGGCAAGGAAGAAAGAGCGAGATGACACATTA
AATAAGTAGACCAAATTTAATCTACAGTAAACGATGTTAAAAAAATAAGT
TAAAGTAACATCGAGAGACAAACACACAAGGGTTCAAAAGAGAAGAAAAG
GAAAATAGCATATGGGAAAAATGAGGTTTTTCACCAAAACCATATTTACT
GAAGCTTATTTCCTGACGAAAAGCAACTTTGAAATAAAAGCTATTGAAGG
ACTGATATCTCATACCTTAAGTATCAACGCAATAAAATTGGTTATTTTTT
CGCAATTCTTTTAATCTTCTACCTTCTTCTATTTTTTACCTTTCCTAATG
AGAAAAAGCGTCGGAAAAAAGGTTGAAGAACCAATCAAATTTCACCATGT
GTCTAATACTCTAAAATTCAGTTTATTTGATGGTCATTTGACTCATCATC
AATTTCAAGGAATTTGGTTTTTAACTGTTAATAGCCCCATCAGGTTTAAG
CATTTTTTAATTTTAAAGTAGATTTTCTGACTATGAATTCTGGAAAATAT
TTCATGGAAATCCTTGATTATCCGTAATTCGTTAAAGCAAATAATAACTT
ATACTGTACCCTAAAATAATGTTCAGACTATATACAAAATGATTAGGTCC
ACAAATTAAAGTCTCAGAATTAATTAATTTTCTTTGATTTAGTTTGGTTG
ATGATTACAATTTTAAACTATATTTAAAATCATTAAGTTAAATCATTACT
GGTATAGGTAAAGAAAGATCATCGGAAAAATAGTAAAGACATGCAAAAAT
TAACATGTAAAAAAATTTGTATTAATTAAATTCAATATCTTAGTGGGGGT
GTGAAAATACGGCTGACACGAAAACAATCTCTAAAAAGTATAAACGTGCC
TATTTTGCGTGATTTAATGTTGTAAAAAGATCGTTGGAATTTAATTTTCA
TATTTTGGTGAAACTTTTCGAATTTCAATATGGAGGCAGCAGGCAGGCAC
CAGGGGTGACAAATTGAAGAAATTTTGAAGACACGATTTCAAGAAGGAAA
ACTTCAGAGAAGGGCGTCACTGCAGCCACATTCCCAGGAAAGCACCGGTC
GTTTCACGCGCTTCCTCACGAATGAATGAGCTCCACAATCACGTGACAGT
TTTGTTTGAAAATTCTTTCGACCTTTCAGTAGACTGGTGAAGAAATTATC
AAATTGTNTCACTGCAGCCACATTCCCAGGAAAGCACCGGTCGTTTCACG
CGCTTCCTCACGAATGAATGAGCTCCACAATCACGTGACAGTTTTGTTTG
GAAATTCTTTCGACCTTTCAGTAGACTGGTGAAGAAATTATCAAATTGCA
TTTTTAATTGGTCTTGCACAAAACATGCTTAACCTTGCACCTTTTATTGG
AAAAAATTTCTTCACAATCATCGTTCTTTGACTTACTTTAAATAAACCAC
ACTCAACCTTTCTAAATGCTTTACTTAATAGTTTATTGAGAGATCTTTCT
CCTTAATCAATGCATATCAGACTTTGAAAGAGTTTTAAGATGTTCCAAAT
CCCAAAATTTAACACCTAGGGATTTTGAAAGCAAAATATAAAGTGTAGCA
GATTTGCCGAGCAAGGTGATTAAGACGTGCTAATACAATAAGATCGTTAG
GAGTGCTAACCAAAAAAGAAAGAAACAGAGGGATAATCAGCAGCTTATTT
CGTTGAAATACAAATAATAGTACATGTTGATATAATCAGAGCATAGTACA
AAATAAATGGTCAGGTTATTTATTGATGTTTTGCTTCATTTTCACGGAAA
GATAACAAAAACAAATCTTAATCCTTACTCTCTACAATTTTCTTCTTCGT
TTATCGCACTCAAGGTAGGGGAAAATAGCAACTCACTTCCGAAGAATAAC
TTTTGATCATTCGAAATTCAACAAGCCGAGCTTTCCACACAACAATGAAA
CAAAGGGCGAGAGATAAGGCATAAATATCCTCTTCTTGTTTCCTGTTGGT
TGATACCAACGGATTATTAAACGACTTAAAATCCTCACGCGTTATTTACA
AAAACATCATGCCTCTCGCCTATTCTTCGGAAAGCTTAAATATGGTAGTT
CAGTCACGACCACTCCCAAATTTTCAAGAAGCTAAATTACAACAACCCAT
ACATCCATACAGTGTTACTGTCATCGAATTTTAGTCCTTTTACATTTTTC
TGCTCAAAACGTGGCTACGCAGAAAACCCTTACATCCATTTCTGCGAAAC
CTTAAGCGACAAATCATTGGAATTTGAAGTTATTTATAGTTAGCATTTGT
CATTCGTACTAGTTTCCTCAAGGCTTGATTATTCTTAAGGGCTCTGACCA
TAGTGAATTTTTCATAATTGCCGTGTTTAAAATGTGTTTTCTGACTGATG
TAACCAACAAAACTATGGCATGTTATACATTTTCTGTTAGACAAACTATT
CCTGAATCTGAAAATTCAAAAATTGCATTGAAAAAATTTGATGAAGGAGA
AAATGAAGACTTTTGCGAGGAAGAGTATTTCAACTTTGAAGAGCTTAGTT
TCGGCGAAGAAAAAACATTTTGAAAAATTTTTCCCAGTAGATGGTGTATC
TTTTACCGAACAATAAAAATTTTTGCGGAAAATTTTTGTAAATGCTTCTT
TGTCTCGAAATCTTCAAAATAGTGGTTTTTCATCAATTTTTCATCTGGAT
TTTCCTTCAAAAAACAGTCATAACTTTTGACACATCTTTTTAGAAAAATT
TTCCGCAAAATTTAAGATAGTTCAATTCTTTGAGCAAAGTTTGAAAAAAG
TTCGAAACAAAAAGGTTAATTACCTATTAAAACTTAGCACTTTTTATAAA
AGAAGGTGATGCAACATATTATTAAGGTCTTTTTAAAGTTCATAACGTCA
TTTTTGCAATTAAGTTCTTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNTTATAAAAGAAGGTGATGCAACATATTATTAACGTCTTTTTAAAGT
TCATAACGTCATTTTTGCAATTAAGTTCTTAATTACTCTTGTGGGGTTTG
ATTAAGAAGCATTTTATAAAGGCAATTCTTTATTAAAATTGTTAAAGAAT
CTAAAACATTACTTTTATGTTCAGATACTAAAATCTATTTTCTGACTATG
GTCAGAGCCCTTAAACCTTCAATCATGGTCGTAATATTTGAGAAAAAAGG
GAAATCCACCGGGAAGTTTTGAAACCACAATCGATTTGTAAGTGCTCTAA
NATTTCGACCATGATTGTTGGTTCTTATTTTTTTTAGAAATTTCAGCCCA
GTTCTTTTCATACAAAAGAAGGAAGCCCTTTTTGAACTTCACTATTCATA
CTATATCAGCATGTGAGAGGTGCCACCAAAAGAGCAGAAATGTCAAACAT
TTAATTGAGACTTTCCTTTCGGCGCAAGAGGCATATATGGATTGCATGAC
AGAGTGAATGNGATTCATACTATATCAGCATGTGAGGGGTGCCACCAAAA
GAGCAGAAATGTCAAACATTTAATTGAGACTTTCCTTTCGGCGCAAGAGG
CATATATGGATTGCATGACAGAGTGAATGGCGGTGCCGATTTCGTAATCC
CTCACTTTCCTTTTCATCAGTTCTTCATCCTGTCAAAGCGCCAGGTCGTT
CAAAAATACCAGCGAATTCACTTCGATCGAAAAGTTCACGGCGAACAAAA
CAAAAAGGATAATTGACACGGCATTTTATTAAGCTATTGTCTTTAGTTAT
TGTCTTTTAAACAATTAAGAGTAATAGGAAAAGGTATTAATTTCTTAAAA
CAATAGCATATAAAAAAGAAACAGAAATAAATAATTAAAAGTTTGAAGNT
ATTAAACAAGTTAAAGTTATTAAACAATTAAGAGTAATAGGAAAAGGTAT
TAATTTCTTAAAACAATAGCATATAAAAAAGAAACAGAAATAAATAATTA
AAAGTTTGAAGAAAACGATAACAATGTATTTCGTCTTAATTAGCTATTAC
AATTTTAATTGTTCATATTATGGCATCAAGTGTTTTAAAACCTTTTTAAT
TGTTCTTTTAAAACTTTTTCTTTTATTTCACTGTCATCTTATTCATCTTA
AGGCATACAAAATTAAAACAATAGGAATGTAGCTAAAATTATTACCCATA
CACCTTTGTTCCCCTTTTAAAAATCCAACAAAAAGAGCGAGTCAGTGGAT
ATGGGATATTTTAATCCCTCCGCGTAGAAGAGCTTTTATTGTTCCTCTAT
CAAAAGCTCACTCAGTAGGAGAGATCTCTTTTTTTTCTCAAGCGGCTCGG
CTTTTGTTTTAAATGGAAAACCGTTTAAATTGGTTGCTTATGATCCGAAC
ACACTCAGTTTATACAGATAACACTCTCGGGAAACACCAGCGTTTTTTTA
AGAATACACATTATTTATCGCACTACGACTGCATTCGAGCACGTGAGCTA
AATTGTCAAAAACTGCATCTTGTTGCATCTTGAGTACTACTGTAAAAACC
AAGTCTTATTGGCAAACAAAAGAAAATCATTAGCATTATTTAGTTTTTTG
GTAAGTCAATATTATTTTCGTAATCTTTCTCTTTTTCGGGACGAAAGGGT
CCTTCTAGTAATAGGGTTCTCTTTATTGCTTGCATCTTCTTAAAAGGCTT
GTTTCGAACAAACTAAAGGTATTGTAATGAGTTGGAAATAGTTTTCTTTT
TGGCTTATATGTTGCAGTTTTTTTTATTGGTCGAATGAAAGGGGCTTATT
TAGAAAGGTGAGCAAATTACCGGTTGTTGTTTTGAAAAGTTATAAAGACT
TCTTAATCACCTTACTATGCAGAAGTATCCGCCTTTACGGAAAAGTAAGC
TTGCAAAATCTCTTTTATCTTTTAACAAATTGGTACTACTGTAAGTCAGC
TGAACAGACTTTAGAAGTTTACTTTCAATACAAAAGTAGGCGACAACACT
GTTTAAGCTTTAAAAACTTTTTCTGTAACAATCTGTTTTTATTATCCACA
TTAAATCGAGTTTTAAATTATAAAGCCTTTAGGATATTTAATTTGCTTAG
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AGAAGATTTTCACATTTTTACGCATAGAGACATGATTGATAAAAAATTCT
GACCTATAATATTTTCTGAGAAAAAAAACCAAAGTACAAATCTAGTGTAA
TTGAAGTTGTTCTTATTGCATCTATTGAAACGTTTCATTTGATCATTGAT
GGTTAAACTACCTTCTAAAAACGTGTGAAAACCACTTCTTTCTATGATAC
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AAGTATCGATGACATTTTACTTTTTACAAAACACATTTCATCGCTTCATT
GTTACGTAAAAGTCGCAAAAATATTGTTAAGAATTTCTTTTAATTTCGGA
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TAATATTCTAACATCGTTATGTTGTTTAGACGTTCCGGCACGAGCGAGCA
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AAAGCCCTATCGACAGTCAAAACATGAAACCTGGAAGTAAGTTACTTTTT
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CGATGTTTTAATGAAGATCATGTCCAAAGACTAAGTTACATTACATTCAT
AAGACACTATCCTTATCTTATTATCAATCTCTTAATTGGTTAGAGGATCA
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TCCAGTAATAAAAAGAGAGCGTCATTTAAAACAACATTGGATGACTTTTT
GCGTACACACAGTTCGTCTTTCTCTTCTCTCCGTTACTTTAAGACGTTTC
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TAGACTAAGGACCAAAATTAACCTCCAAAGCTTAGGACCCTTTTTTATCT
TTATATAATATTTAAATAAGTTTACAGATAACAAACGACGAAAGGCATTC
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AAAAACCATCGAGTAAACAGTGGCTCGTGCAAAGTCTTTTGTTCTCTTAT
GTAACGTTTTTTTTCAAAGGGCTTCATCAAAAAATGACCTGAGGCTTAGC
AGATAGAGGAAGAGGCCCTCCNTTCAAAGGGCTTCATCAAAAAATGACCT
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TCTTTTAAGACCATAATGATTGCTTATCTATGGGACGGCAAATAGATATG
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AAATACCCACCACCTGCAACAGAGCACAGCCCAACATACGGTACGTCACA
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1575043694:102074..102116 | TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1575043694:102074..102116 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1575043694:85981..86187 | TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1575043694:85981..86187 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1575043694:83568..83716 | TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1575043694:83568..83716 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1575043694:81782..83343 | TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1575043694:81782..83343 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1510915933:102074..102116 | TCONS_00063521-exon-scaffold_391-1510915933:102074..102116 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| scaffold_391 | supercontig | scaffold_391:81782..102116 - |
Blast
BLAST of TCONS_00063521 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: OTX2 (Homeobox protein OTX2 OS=Homo sapiens GN=OTX2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 109.383 bits (272), Expect = 4.915e-26 Identity = 50/63 (79.37%), Postives = 55/63 (87.30%), Query Frame = 1
Query: 244 PGTPPKRRRERTTFTKAQLDVLEDLFGKTMYPDVFMREEVAKKISLAEARVQVWFKNRRAKFR 432
P TP K+RRERTTFT+AQLDVLE LF KT YPD+FMREEVA KI+L E+RVQVWFKNRRAK R
Sbjct: 32 PATPRKQRRERTTFTRAQLDVLEALFAKTRYPDIFMREEVALKINLPESRVQVWFKNRRAKCR 94
The following BLAST results are available for this feature:
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