XLOC_039817 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_039817
Unique NameXLOC_039817
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_391:81782..102116-

Legend: gene
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>XLOC_039817 ID=XLOC_039817|Name=XLOC_039817|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=20335bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_391:81782..102116- (Clytia hemisphaerica)
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GAAAGAAAAGACATCTAGAAGGACGGAGAGAGATAACGAAGAAAGGAAAA ATCTAATTGAAATATATAGAGCGCCGAATACAAGAATAATTACCTAATTA CCAATCAAAAACTATTGATGACAACAAACAAAAGCATACAACAAGAGGGC GGCATTATTAAAGCATACAAAAATACAGGAAATTGTATGTGTTTTCGAAC TGACAAAGAAATAAGTAGGGGTTAAATTCTTTACTTAAATACACAACACC TTACTGTGGTTAATGAGCACTATTCAGTGACGGGTAGTCAGTGATTTTGT AAAGACATACTCTTGACAGTGTATTTAATTCAAGATGGTTGTCCTTTCAG CACCACCCAAGAGACGTCGTGAACGAACTACCTTCACTAAAGCACAACTC GATGTATTAGAAGATCTCTTTGGCAAAACAATGTACCCTGATGTTTTCAT GAGAGAAGAAGTTGCCAAAAAAATCAGTCTGGCTGAAGCTCGAGTACAGG TAAATTCCAATTGATTTGTTTGTAATGAATGTTTATGACTTGAATAATAC TACAAACTACTTCAAAGTACAAACAGATTGAGTAAATGTATTGCCATATG ATTGGTCTAGCGCAACCGTTAACATAGGGTTTATTATTGATTTTCTGATT AATATAGAAGGATATAGAATTTGGAATCGTTACCTTCATTATTTCTAAAA TTTTCGATTTCGTTTGCTTACAGGTCTGGTTCAAAAACAGACGTGCCAAA TTTCGTCGGTCACGAGAAAGCCCAGGACGACACTTCGATCACACCAAATT CTTACAACGTGATAAATTCTTACAAGACGATTTGGTTCGTTCATTCAAAT CAGGACCAAGCAGTTTCTTACCACCATATCAATATCAAAACCCGTTATGG AAATACCCACCACCTGCAACAGAGCACAGCCCAACATACGGTACGTCACA GGTAGTAGACGATTCTTTTTATAGACAATCAACGAACGGTTATAACTCAG TTTCGCCTTACACCGACTACCCTTCGTCTTACTCCACTTCACCACGTCAA CAATATTTCTCCACACAATACTACAGTCCACCCGGTGGTAACCATGACTA CAACTCATGCGCACCAAGCACCACTACATCGAACACTGTACCTAGTATGT CCTTTTCACCTCACGAAAACACAACGAAAACAGATCTCAATTTACCGAAC ACTTTTCAATGGAGCGGCAGTGGTGGCACTCCGCAATACGGAATGACAGC CGGTGGATCAAACATATAAACATTCAGGAGTCGTCTTTGACAACTCAAAA CTAAAAACGAGAATACAAAACTAAAATATGGGGGACCATTCTCTTGACAC AGACGCGCAAACGGCAATCAGAATCAACCATCATATGGGTTGGAGACTTG GATAATCCTGGGAAAAGAATGCCGCACTCAAGCGGGTTTTTGCTCTTCGA TTATTCTTCGTATTACTGGTCGAGCAGTCAGTCGGTATTTTACTGACAGA GGTATCTAGTTCCGATTTTAATTACTCGAAGGATGAAACTTTTAAAGTTT TTATAGAAAATGTAAAAAACTAACATCAGATAATTGTGTAATTGAGAATG GAACGCCCGTCTACCGGATGGAGTTGGAATGCAACAGGAACATTATGAAA AGAAGAAGATTTGTTTTCTTTCTTCGAAGAACAAAGAAAGAGATTCAAAC TTGATACATTTTCATAAATAAACAAAAACAACGTCTTGAACTATTTTCCC TAGAAACAAACTAAAAATACTTGTTTTATTTTTACGTATTATTTGAACCA TATTTTTAAATACTTTTATCCAATTTTTTTTTATTTTGGGAATTGATGAC CAATTATTAAGTTGAACCCTGAAATCACCAAGTTTTTAGTTTTCGATTTT TACAGGTTTTTAATGAGATCTTTTATTTTCTTTCGTGTACATATATACTC ATGACATTTATTTTTCTTCTAAGAGCATCGTTTTATTTTACATTTATTTT TTTAAGTTGTATTTTTTTCTCGTCCTTATTTTTCTCATATATACTTTCAT TCGATATTTCTTTTTAAGGAAACAATTTTAATGTAGCTAGGGAAATAATT CTAGGTGGCTGCTGTCTTGACGACTGTCAGCTTTTAATAGCAATTTATTT GTAATGTTGTACATAAAATGTGTATAATGCTAGTGGGTTTATAACATGAT GATAATAGTTACATATTGAAAAAAGAACTCATTCTATTGTATACACAGAC AATTTTAATTCAAAAGACCGAACAAATAAAAACAA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00063521TCONS_00063521Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063520TCONS_00063520Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063519TCONS_00063519Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00063518TCONS_00063518Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
OtxTCONS_00063519-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_391supercontigscaffold_391:81782..102116 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.02 0.04 0.04 0 0.07 0.04 0.3 0.7 0.29 0.22 0.21 0.1 21.87 23.92 1.63 1.3 34.47 26.56 26.18 27.86 24.35 21.91 4.54 8.85 7.93 9.34 0.3 0.45 0.04 0