TCONS_00007703 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00007703
Unique NameTCONS_00007703
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length780

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00007703 ID=TCONS_00007703|Name=TCONS_00007703|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=780bp
CAaacacttatttttgctataaaTACCCCCTGTTTCATGTAAAATGTCAC
ATTCAAAACTCAGGATGAAGACTTTGATCGTTTTAGCAGCCTTGATCGTG
GCCACTTTGGCCTGTTCAGACAAATCTTCTATCTGTTCTCGATACAACAA
AAGACAATGTACCCATCCCTATTTGAAAGCAAATTGTGCTAAATATTGTG
GACACTGCTCGACAGGATGTGTTGACAAGAACACAAGTTGTCCACGATGG
GCTCCATCATATTGCAAAACCAATGCATACGTGAAAGCAAACTGCAAGAA
AAGTTGTAACATGTGTGGCCCAAGTACCCCTGCTCCACCAACAAGTGCAC
CAGGAACCTACCCACCCCAAGGATCATGTGGACGTCCACAAGTTGCAATG
TCCAGAGTTGTCGGAGGACAAAACGCAAAAGCTCATTCATGGCCATGGCA
AATCGGACTTCACCGCAACGGTGGATTTATGTGTGGAGGTTCAATCATCA
ACAGCCGATGGGTTGTTACTGCTGCTCATAAATCCACCGTTGCGGTGAAG
TCCGATTTGCCATGGCCATGAATGAGCTTTAGCATCTTTTCCACCGACAA
CTCTGGACATTGCAACTTGCGGGCGTCCACAACTGCTTAAGGGCGGGTTA
GTAACAGGTGGATTTGTAACGCCAGGACAGAATCCACATGATTTCTTACA
ATTGGTTTTGACATACCAGTTAGTGTAGCAAACACCTGCCCAAATTGGAC
ATTTCACGTTTAGGTCAACGCAGTCACCtt
Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00007703-protein

>TCONS_00007703-protein ID=TCONS_00007703-protein|Name=TCONS_00007703-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=175bp
MSHSKLRMKTLIVLAALIVATLACSDKSSICSRYNKRQCTHPYLKANCAK
YCGHCSTGCVDKNTSCPRWAPSYCKTNAYVKANCKKSCNMCGPSTPAPPT
SAPGTYPPQGSCGRPQVAMSRVVGGQNAKAHSWPWQIGLHRNGGFMCGGS
IINSRWVVTAAHKSTVAVKSDLPWP
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000079:155793..169152+

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00007703 ID=TCONS_00007703|Name=TCONS_00007703|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=13360bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079:155793..169152+ (Clytia hemisphaerica)
CAaacacttatttttgctataaaTACCCCCTGTTTCATGTAAAATGTCAC ATTCAAAACTCAGGATGAAGACTTTGATCGTTTTAGCAGCCTTGATCGTG GCCACTTTGGGTAAGTGAATATTTTTGAGTCACCCATGCTAATAAGGTCA ACAATTCTAAGACTATATTCTAAATTTCTTTGGGCCTTGTTTTAAGTTAT ATTCTGAGATCCTAAGACGAACCTAAGACTTTAAGTTTGAATGCTGAAAA CCAAAGTCAACCCAGTTTGGCACACAACGCTGTTTAAACGTTCAACTAAC GTTTTTAACGTCCATAAcgttaataataataacatatgttttaagtggca tgctccgaaaaattctacagcttttaggcagctaatgaattgtttccacg aagggccactAAAACGTTAAATTAACTTTTAAAAAACGTTGGGTGCCACT GCGAAAAATCTACCTTCCAACCCCTACCCTATTCTTTTTATAGCCTGTTC AGACAAATCTTCTATCTGTTCTCGATACAACAAAAGACAATGTACCCATC CCTATTTGAAAGCAAATTGTGCTAAATATTGTGGACACTGCTCGACAGGT ATATTGTGATTTATATGATCTTCTCTCCCAAATAGACATTCCCCCcacta attgttaagagaaaaaaatgaaaaagcagGTTTTTTTTTTGAGGTACCGG AAGTACTTTGTGTTAAGTTAGGAAACTGGTTAACTTACCCCAATCCATCT CTCAACTAACGAAAATGGCAATGACAATAGAATCTTGTTCCAGGAAGTGA ATCTTACACAAAATGACGGTACCACGAGTACAATTTGATGAAACCACTCA TCTCTAATTACCCTAATTACCTGGCTAGATCGGGTTTCTCACATGAAGGG AAGAGTGTCTAGTTTTAGAGCTATTGTTTTTGAAGTGAAAAATAAGTTCT GAAGcaataaaaatacaaattcataTAAGCTATCAACGTTTCCTTTGTAA TCACATTCAGGATGTGTTGACAAGAACACAAGTTGTCCACGATGGGCTCC ATCATATTGCAAAACCAATGCATACGTGAAAGCAAACTGCAAGAAAAGTT GTAACATGTGTGGCCCAAGTACCCCTGCTCCACCAACAAGTGCACCAGGA ACCTACCCACCCCAAGGATCATGTGGACGTCCACAAGTTGCAATGTCCAG AGTTGTCGGAGGACAAAACGCAAAAGCTCATTCATGGCCATGGCAAATCG GACTTCACCGCAACGGTGGATTTATGTGTGGAGGTTCAATCATCAACAGC CGATGGGTTGTTACTGCTGCTCATTGTGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCCCGATGAAATAAagctttttagtagaact cgaGTTtcctctgaacattcttactatcagtgTTAAAGATTTCTATTCTT Taatatacaaaaattaaataaaacttcgtccacgaatcaagtttatgttc aatttcgttatccgttaaattttgttttgaaaagttattttctcaagcca gaaaatgaaaagtcctttataagcacacacgatttcagactcaatttgta gacatagagtcgctggagaattttggaggaaagtatcaagtcATAtagtt caccttaaagaaaacattgattgaaAGATCATTTGATGAAGTATTGCCAA GCTTACAgaccttttttagtccaaatattttcttacactgatgtcagaaa caatgaatctcgtctcaactaatttttaaagcttcaatgagctaataaga tttcacctatggataaaagggcttattaaaaatacacgatgtatgagatt atgagcatgcatacctcgtaatttttttaatcggcgagcatggttacgat agcatacatctcctgtttctttatacctccatggttcgGCATTCATCCTA CCGAGAGTATCACACAATGCACCGGTAGAGAATTGAAAATCTATAAATTG CTTGGTAATCACCGTTAATCACTTCGAagttagagaaaaaaattcttttt gaaggTAACTCCTTCACtttgggtgctttttcactacgctagatagataa gtggttttcatcaacggtccttttcataaatttctaagagttgtaaaaaa tatacaatgaagattcgtgcttagcatcagattttgatcgcttcatatca gTATTCCAGATTTAaggtcgaaaattggtcattaaaccttttgttctcca agagagggctagacctctcttggcttaatgaccaattaagcgaaaaagga agcataaataaattggttgccataaaagtagcagaatgggcagtgggatt cttttgtaaaaaaatggtcatatgggaaaagtccgatagagttgaagagc aaactttcatctgtattgatttgatacaaaagacgagaggaatcttgtca cagaaaatgttcattagaaggctgtaattctaaatcccttgatatgcgag ttgatgatttttaataaagttTTCTTCAGATTCAAAGGGTTGCAAACGCT TTGACAGCTAacttgggagtcagtaatgctttcctataaattttctttgt ttcagctaatcgattttcgccaggAGGCTCAGTAAAAAACCACCCTAAAC TTAACATAACATTCAtagaaaagtaataaaattgagACACGTTCGATATA CAATTCTTATTGTCCGTCACCAAAGACTTGATTTCAAAGAAAGTTTAACT GTGATACTTACTGTATCTCCATCCAAGATTTTTGGATGGTCGCTATGATT TCTTTTTAGTTTTGCCAATCTTGTGAATGATGTGACCGTGGGAATCTCgt gataaaaaaaaacgtgtgtaATGACATTAGAAAGAATTAGAGTGAATTGC AAGCAGATCCTGGCTAAAACTTCTTGCACTTTGGGGAAAATCACATTTTA TTGTCAATAGGGAAATTaagctaaaatatttattcgcCATAGTATCTACG ACTACAAGTATATGTATGACTTCAACTATACTTCACAGGTCGATACTAAT TTGAGCTGTAAAGCTGCTCACTACATTtttttactctcttgctatttgtc ctattttatCTGAgtctcatcatcaggtaggtccagtCAGTATATTGCTG AATGGGAAGGGAAATTACGATATCCCAGGAAAGGCAATCTCGCAATGTAT GGGCAGGCGAAATCGTCGGCCTTTTCAATACACGTCAGATCTGAATCTGA CGGTATTCCAAAAAACATAAGACGTATTATAGAGTAATATGGTTGTAACA TGATATATAATATACTATTNtcaatttttctaaaaaaaaagcaATTCTGA TTCCAGGCAGACCTTCAAGATTGAATACTTAATCCATTGCTCTTCGGGAA CTAGTCTCATCGAGTTAATAGTTGAGGAATACTTTGTCGGGAAAACAGTC GTTTATCTGGGTGGTAAATTTTAGTCTCTTTCCGCCGAACAAACCTGTTG TAAAGGGtataaaatctttcaattttttttctgacttcTTTCCAGGGGGA gcacaaattcaaatttttacagaCGAGAGTAATTGAAAATTAATGAACGG gggaataaaaaactttcaccAATTTCAATTAAATTCTAAATTGAGATAAA TTCACCTGTTTATATAGGGATTTAAATTTCATCAACTTTCCATATGCAgc gctattttaatgaaaatgtagTCAAATAAAGATGAACTATTATGAGAATG AATTTGATATATTCTGTTAATTTGAGAAACTTTCGAATGTCGGAAATGTT TGTAATCAGCACTTCAAAGCAAAAATCAAGTGATTTGATTCAATCagctt ttatttttgaaagaaacttaTTTGTTTAAACAAAActgtgaaaaattatt gaatagTTTTCTCAATCCAGTCTCTGAATTGACCAACTCTTGCAAAGACA CTAATTGCATCTTTTGTGTCACATTTTGGTGATCCCCAGCTGACAGCTCC ATGTAGTGTCCATGAACCATTACTGTTTTGACAAACGAATGGACCACCTG AATCACCATGACAACCTGACTGATTCTTGGTTGTATCGAAGTTTGCAGCA CATATCATTCGATCTGTAATCTTTCCGATCTTCGAATTATGTTTTGCGCA AGTTTCTTTACTTTGAACAGTTAGACCAAGTTGTTGAAGGATGGTGTGTG AACCTCCTTGGTGACCGATCTTTCCCCATCCTTAAATTTATTGAAATGAt gacttataaaaaaaagttaaagccTCGGTATATATATACGTGATCATTAA ATTTAGGGCCGAGAGAATGATAATGCAAACCTAAAATTATGTATTTGAAA GCCTTATAAAACTTTAATATATAATATTCGATGGAGGATACTATTAGATT CTAGAAATTTCGtataatattttaatatatatataatataatataccCTT AAAATCCACTTAGAGGTACCTTTTCAAATatcacaaatttacaaaattag gATATTTTGCCTCCATCCCGATAATAATCAGAGATCCCAGCATTTTTGCT TGggcaaatttagaaaatcacaTAACGACATTACTAACTAACGATCCTTG TCATCATACCATTCAAAACTCTGTTTAATTGAATATTATTTGACTACTTG GCTTAGCTTACCGGTGATGTAACATTTGCTACCAACTTTTGGAGCATCTC CTTGGCTTGGTAAACAGACTGGTTGAACATTTCGTCCGAATTTAATTGGT TGTTCCAATTGTAATAAAGCAATGTCGTTATCAAACTTAGATTCCCTTGA ATTTTCATAACTATAGTGGACAACAGCTTTTGATACTTTTATGATCTGCT CGCCTTCATTTATTCTTCGGTCATGATCTCCTAAAAGATTCAAAAAGTTA GGGTTTGTTAACATAACCTTTAGCTTTATGATATAAACATTTTCTTCTAC TCCTGTAACATCTTGTTTTGGACGTGTGTGCCTGATCTTCCCTAATTGTT GACGGAAGTTGACAGAAAGTAGACAGTCCTCTTGCGATGCCGATTTTGAA ATCAATGCGCGGGTATCTGAAGGCTATTTTTCAAGCAATGTTttaaaact atcaattttctgtCGATTTTCTACCGTTTTATACATCAAACGGATACAAA GGGAGAGATTAGCtatttaaattaaatttctttacttttgaaaactagTT GAGCCTTTTTTATtgttaaagtatttttttgctttttgattGAATGGAAT TTGATTTACCTAATTTGACAGTAAAGTTTGTGGTCAGCAAAGACATTCCA TTAACACAATGAGCAGCAGTAACAACCCATCGGCTGTTGATGATTGAACC TCCACACATAAATCCACCGTTGCGGTGAAGTCCGATTTGCCATGGCCATG AATGAGCTTTAGCATCTTTTCCACCGACAACTCTGGACATTGCAACTTGC GGGCGTCCACAACTGCTTAAGGGCGGGTTAGTAACAGGTGGATTTGTAAC GCCAGGACAGAATCCACATGATTTCTTACAATTGGTTTTGACATACCAGT TAGTGTAGCAAACACCTGCCCAAATTGGACATTTCACGTTTAGGTCAACG CAGTCACCtt

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000079:155793..169152+

>TCONS_00007703 ID=TCONS_00007703|Name=TCONS_00007703|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=2112bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000079:155793..169152+ (Clytia hemisphaerica)
ATGTCACATTCAAAACTCAGGATGAAGACTTTGATCGTTTTAGCAGCCTT
GATCGTGGCCACTTTGGCCTGTTCAGACAAATCTTCTATCTGTTCTCGAT
ACAACAAAAGACAATGTACCCATCCCTATTTGAAAGCAAATTGTGCTAAA
TATTGTGGACACTGCTCGACAGGATGTGTTGACAAGAACACAAGTTGTCC
ACGATGGGCTCCATCATATTGCAAAACCAATGCATACGTGAAAGCAAACT
GCAAGAAAAGTTGTAACATGTGTGGCCCAAGTACCCCTGCTCCACCAACA
AGTGCACCAGGAACCTACCCACCCCAAGGATCATGTGGACGTCCACAAGT
TGCAATGTCCAGAGTTGTCGGAGGACAAAACGCAAAAGCTCATTCATGGC
CATGGCAAATCGGACTTCACCGCAACGGTGGATTTATGTGTGGAGGTTCA
ATCATCAACAGCCGATGGGTTGTTACTGCTGCTCATAAATCCACCGTTGC
GGTGAAGTCCGATTTGCCATGGCCATGAATGTCACATTCAAAACTCAGGA
TGAAGACTTTGATCGTTTTAGCAGCCTTGATCGTGGCCACTTTGGCCTGT
TCAGACAAATCTTCTATCTGTTCTCGATACAACAAAAGACAATGTACCCA
TCCCTATTTGAAAGCAAATTGTGCTAAATATTGTGGACACTGCTCGACAG
GATGTGTTGACAAGAACACAAGTTGTCCACGATGGGCTCCATCATATTGC
AAAACCAATGCATACGTGAAAGCAAACTGCAAGAAAAGTTGTAACATGTG
TGGCCCAAGTACCCCTGCTCCACCAACAAGTGCACCAGGAACCTACCCAC
CCCAAGGATCATGTGGACGTCCACAAGTTGCAATGTCCAGAGTTGTCGGA
GGACAAAACGCAAAAGCTCATTCATGGCCATGGCAAATCGGACTTCACCG
CAACGGTGGATTTATGTGTGGAGGTTCAATCATCAACAGCCGATGGGTTG
TTACTGCTGCTCATAAATCCACCGTTGCGGTGAAGTCCGATTTGCCATGG
CCATGAATGTCACATTCAAAACTCAGGATGAAGACTTTGATCGTTTTAGC
AGCCTTGATCGTGGCCACTTTGGCCTGTTCAGACAAATCTTCTATCTGTT
CTCGATACAACAAAAGACAATGTACCCATCCCTATTTGAAAGCAAATTGT
GCTAAATATTGTGGACACTGCTCGACAGGATGTGTTGACAAGAACACAAG
TTGTCCACGATGGGCTCCATCATATTGCAAAACCAATGCATACGTGAAAG
CAAACTGCAAGAAAAGTTGTAACATGTGTGGCCCAAGTACCCCTGCTCCA
CCAACAAGTGCACCAGGAACCTACCCACCCCAAGGATCATGTGGACGTCC
ACAAGTTGCAATGTCCAGAGTTGTCGGAGGACAAAACGCAAAAGCTCATT
CATGGCCATGGCAAATCGGACTTCACCGCAACGGTGGATTTATGTGTGGA
GGTTCAATCATCAACAGCCGATGGGTTGTTACTGCTGCTCATAAATCCAC
CGTTGCGGTGAAGTCCGATTTGCCATGGCCATGAATGTCACATTCAAAAC
TCAGGATGAAGACTTTGATCGTTTTAGCAGCCTTGATCGTGGCCACTTTG
GCCTGTTCAGACAAATCTTCTATCTGTTCTCGATACAACAAAAGACAATG
TACCCATCCCTATTTGAAAGCAAATTGTGCTAAATATTGTGGACACTGCT
CGACAGGATGTGTTGACAAGAACACAAGTTGTCCACGATGGGCTCCATCA
TATTGCAAAACCAATGCATACGTGAAAGCAAACTGCAAGAAAAGTTGTAA
CATGTGTGGCCCAAGTACCCCTGCTCCACCAACAAGTGCACCAGGAACCT
ACCCACCCCAAGGATCATGTGGACGTCCACAAGTTGCAATGTCCAGAGTT
GTCGGAGGACAAAACGCAAAAGCTCATTCATGGCCATGGCAAATCGGACT
TCACCGCAACGGTGGATTTATGTGTGGAGGTTCAATCATCAACAGCCGAT
GGGTTGTTACTGCTGCTCATAAATCCACCGTTGCGGTGAAGTCCGATTTG
CCATGGCCATGA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_004366XLOC_004366Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1491911889:155793..155902TCONS_00007703-exon-sc0000079-1491911889:155793..155902Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1510915933:155793..155902TCONS_00007703-exon-sc0000079-1510915933:155793..155902Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1575043694:155793..155902TCONS_00007703-exon-sc0000079-1575043694:155793..155902Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1491911889:156286..156390TCONS_00007703-exon-sc0000079-1491911889:156286..156390Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1510915933:156286..156390TCONS_00007703-exon-sc0000079-1510915933:156286..156390Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1575043694:156286..156390TCONS_00007703-exon-sc0000079-1575043694:156286..156390Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1491911889:156803..157114TCONS_00007703-exon-sc0000079-1491911889:156803..157114Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1510915933:156803..157114TCONS_00007703-exon-sc0000079-1510915933:156803..157114Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1575043694:156803..157114TCONS_00007703-exon-sc0000079-1575043694:156803..157114Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1491911889:168900..169152TCONS_00007703-exon-sc0000079-1491911889:168900..169152Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1510915933:168900..169152TCONS_00007703-exon-sc0000079-1510915933:168900..169152Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00007703-exon-sc0000079-1575043694:168900..169152TCONS_00007703-exon-sc0000079-1575043694:168900..169152Clytia hemisphaericaexon
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00007703-proteinTCONS_00007703-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000079supercontigsc0000079:155793..169152 +
Expression

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Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.0621326 0.121178 0 0 0 0 0.253754 0.032578 0.321525 0.687735 0.173118 1.40292 399.832 413.286 289.964 842.474 286.375 355.323 2142.05 1943.92 1380.97 1582.93 1098.35 1485.56 882.251 886.71 0.0851962 0 0.622417 0.320936
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR003582ShKT_dom
IPR001254Trypsin_dom
IPR009003Peptidase_S1_PA
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0004252serine-type endopeptidase activity
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0006508proteolysis
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0006508 proteolysis
molecular_function GO:0004252 serine-type endopeptidase activity
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00007703 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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