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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00005003 ID=TCONS_00005003|Name=TCONS_00005003|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2382bp
cgccgaccgaccgaccctctttttgggGTAGCTTgacccgtaaaacaaca
aattaaatttgtctcgcctaatatcataataatatatgaCACGGGTTAAA
TGaacattatatttatttttaattaattgtgATGGATATAGTGTAAAAGA
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tttgagaaggggcgccAAGAAGGATTTTCCAGACGCCCCTATCAAAAGAT
TGGCAACTGAAAAGCCAAAAATCGCGCCCCTTATCACcttaaaatttctt
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ttgatgacgtaatgttttatatggAAACACACAAAAACGCGTATGACAAC
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GATGGCCAAGTACTGCAGTTGgattctctttaactcgaacctgtATATAA
CTCGAACGTCTCCTTCACTCGAGAAAAAGTTTTATCATCCCTTCTGTTAA
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ATTACTATTCTGAAGTTCCGGCATCAACGGTTGTAATTCTCTGGCTGGTT
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TTCTTTTGttgatcaattttttaaaagtttgaatCTTTTCAGTGTAAGTG
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GTTTGATGAATGAACCTTTACGGAGACGATTGGTGAATGCGTTGTACTGT
TTGTTAAAATAGTATGTCCAGTTTTAGAATCTAATAACGTCCGAATTTTT
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GAGACTTGTTGACGTTGAGTTAGTGCATTGTNCATCTTGGATGATATAAT
GAGTTTGATGAATGAATCTTTACGGAGACGATTGGTGAGTGTGTTGTACT
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TTGAATTCCTGTTATAATTTTGATGTGAGTATGTTGTGAGTTTGGAAGTT
TGGAGTCTTGTTGACGTTGAGTTAGTGCATTGTTTATAGTCCATTGTTTG
AATGGCGCTTGTTTCTTGATTTTGTATAGCGTTTATTGAAGATGGAAAAG
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AGACAAAATATGCCTTCCAATGGAAGTAAAATATTGTATCTTCAATTGTA
TCAGTTCTAGTGTATCCTCAAGAAACAAACTCTCAATTTTTAATCCATAG
AAACTTCCTAAAGGAAAGTAAGTAACTTTTAT Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000050:478067..480448+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00005003 ID=TCONS_00005003|Name=TCONS_00005003|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2382bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000050:478067..480448+ (Clytia hemisphaerica)
cgccgaccgaccgaccctctttttgggGTAGCTTgacccgtaaaacaaca
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00005003-exon-sc0000050-1491911889:478067..480448 | TCONS_00005003-exon-sc0000050-1491911889:478067..480448 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00005003-exon-sc0000050-1510915933:478067..480448 | TCONS_00005003-exon-sc0000050-1510915933:478067..480448 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00005003-exon-sc0000050-1575043694:478067..480448 | TCONS_00005003-exon-sc0000050-1575043694:478067..480448 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000050 | supercontig | sc0000050:478067..480448 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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