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transcript sequence >TCONS_00004778 ID=TCONS_00004778|Name=TCONS_00004778|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2227bp GATAGAAATTTTTTCAGAGCAGTTAAAGTTAAGGAAGATGTCACTGGGTT CCAATGAAGCTAAGGAGGCAGTTGCAACACTTCGTGATCGTTTGAAACAT GGGCAAAACATGACCAAGATATTGGAATCACAACTGGATACAGCGCAACA GAATATAAGTTTATTGCAAGGGCAAGTGCGTTTAGCCAACGAAACCATTT TGAACTTGAAGAAATATTTCACCGAAACGGAGAACACTTTGAATGATTTG TTTACATCGAATCATTCCTCAAGAAGTTTTCAATACAATGATGGTGCTAC AAAGGAGCAATCAGATATggataaaaatcaacaaatgtCGAAAGTTGCTC GAGGTTCTACTAGATCACCAAGAACACCAGAGTCGATGGATACTAAGACA CACCATGACGACAAACGCAGGGAGCGTGAGCACAACAACAAATCACCATA CGCACAACAATTACGTCAAGTTCTGGATGCTCTACAAGACGAAGAGCCGA AGAAATCTTCACACACTCATCATCGTTTACACGAGAAAACAGAACCTTCA GAACACAGTCCATCACCTCCGCCTGCAGACCGTCGTTTGATGCAGGCTAC AAAACATTATCACCATGAGAATGAAGGTGGTGCCTTTCAAAGACGACAAC CTCATCCAGAAGAGGACTATCCAAAGATGAAACACCATAAAATGAACGGT CATCCTTCAAGAGAATCAACCAATGGGAACCATCATGACCCAATCTCCCC TAAACCATCCTATTATCAACAACACCATTCTAATGAGTTGTCACACGGTC ATCATCAGCCACATCCTCATAGCAACCATTGCATGGGACCATGTTGTCCC AGCGAAACGCCACCATCAAGCTACAAAATGATGGAGAAATCATATCATTA TGGTTCAGATGAAAAACCGACACACTATGTGGAGAAATCACCAAATGGAG GTGTTCACTATattgctgtacattcaccagagaGCACTACCAGCTCTGGC AAACATGGCGAAAGACATCATAGTCATCATTATGTTCCTTATGCTTACCA CATCCCTGGTGAGAATCCACATAAAATGATACACGAAATGCCACCGCAAC CACTTTCACCGACAACCAACAGTGGTGGTGGGCGCCGAAAGAGGGCGTAC GCCCCATTGTTACCAAATGAAGAACCACCACATTTGAAATACACCAAAGT GAAGCGAATCGATGGTAGCAAGTTGACAGCACAAAAAGTCCTCCAAGATT TCACAAAGAGGCGATTCATTGCTTATAATCCACGATACGATTTGGACTTA TTAATTGTTCCTCCGCCCATCCCTGCATCAGACCTCCTCAAGGGCGGTCA TCAATTCAAAGGAACTGAACAAAAAATGACCAACATTCGATCTCCAGTAG CCTCACcacaagaaaacaaaattcaaagcGAACGTCGATCAACAATTTAC GGAAAACCATCCAATGAGAGTCACTCCGATAAAGAGGACGAGGAAGTTTT TACGGAACCGAGAAGTCCTCTTGATGACGCAAACAATAATAATCACCATG ACGataacaacaacaataacaaaactGTAAATAATAATTCATGGCCGCAC AAGCCACAAATATATTCAGGGAAAGGTGTCTCTGTGTTACCAAGCATCAA AGAGGAGCCGAGGAGCAATAAATTGGAAGATCAGATTAATAAGTTGAGAC ATGATCAAGAAGCGAATACGATTCCAGCCGTCTACCGACAACAAGACAGT CCTTACAGTGATACCAACAATAATAACGAAAACAGTCCCATGGTGGTCAG AGAGAATGCAGCTTCGCCGATTCCTATTGTTAGACGTACCGAACAGTATT GCAGTTAGAAATGCGtttccattttttccatttctaaaaactaaaaattt tgaatttgtagTGAGTTTAGCGCGTCTTTATGTTAAATTTTGTAATCCTT AGGCTCGAAGTGGAGGTGTATTTACTTTACAGAGCAGAAGATAGATTAAT CTTTGTATCAATGGTGATTTTTTTGTCACGTTGTCTTGTTGCATTTGGAG ATTGGATTATAAAGCCAGTTGCTTTTGTTATTGTATATCCTCATTAAAAA AcgtaaatttttgaaactttgttgatatttttcctCTTCTTTTTGTATAG TTTACTAGATAGatataattttgaaagtttttggatGATTAGACaacttt gaaaatattgataaataaataattcat Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000048:126098..137079- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00004778 ID=TCONS_00004778|Name=TCONS_00004778|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10982bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000048:126098..137079- (Clytia hemisphaerica) GATAGAAATTTTTTCAGAGCAGTTAAAGTTAAGGTGGTTATGAAATTCTA
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GCATACTTAAATGTCTCGTTTTTCTGTACCAATTGCCAAATGAGAGGTCA
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GCTCCATACTACTTACAAAACAATTCATACATTTGTCGTAAACATAAAAT
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
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TCONS_00004778-exon-sc0000048-1510915933:137047..137079 | TCONS_00004778-exon-sc0000048-1510915933:137047..137079 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004778-exon-sc0000048-1510915933:127388..128601 | TCONS_00004778-exon-sc0000048-1510915933:127388..128601 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004778-exon-sc0000048-1510915933:126098..127077 | TCONS_00004778-exon-sc0000048-1510915933:126098..127077 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004778-exon-sc0000048-1491911889:137047..137079 | TCONS_00004778-exon-sc0000048-1491911889:137047..137079 | Clytia hemisphaerica | exon |
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TCONS_00004778-exon-sc0000048-1491911889:126098..127077 | TCONS_00004778-exon-sc0000048-1491911889:126098..127077 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000048 | supercontig | sc0000048:126098..137079 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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