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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00004338 ID=TCONS_00004338|Name=TCONS_00004338|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3617bp CCTTCCTATATTTCCAATTCAAAAGGACTGCTTCTTTATAACTTCAAAAA CttgagaaaattcacttcaaagaaggggatttttttctgggacaccctcA AAACAATGCAATTTGTGCCTGAAAGAGGGATATCATATTATGACTTCAGa acttgaattaattttaacaagacgactcagagtcgaaaatttcgcatagt GCTCGATTATTCGTAgataaaataatcatattaaacGACCGGGGAGTACT AGGGTTGGAGAATATCAGGTCAGACCTGAGAAAACTGGCCCTAACAGAGA ATAAagctacccttagagagacaagGCAAAAAAAGTGACTCTTAAATAAA GCACATTTTCATTTTcgactttttaagtttttcgtACAGTACCTTAAATA ATTCAGAGACTTGGGAAGGTCAAAACCAGAATTTTAGCATCAGCACACAC CTGACACCTAGTTATGCCTAAGTTACTACCCACCCTCACCATTAATAGAA TGCAATAAATAGAACGGGACTAACTATTGGAATTTTTccttcgtgattgc gtgatgagaggtcaaaacgtgattgTGATTTAAAAGGTTTTTGAGCCGTG CTatgtgatttggactttttcaaagggatgcgtgattgtccatttttttg ctgatttgcgtgatcgttattgaagacaaaaattgcgtgatatcgtgatc agagttaccgcttGGTAATCGATAGATTGCATATCAATagattttaaaat aattgataaatcCAGATTTTAAGGGAAGCGCGATTGGCAATAGATTGATT GATTTTCCATCGATTGACTTAAAAGATGTTCGATTGATCACAATCGACAG CCCAGaacagccaatgaaaaaaatctacaatCAATCTATACTCAAGACTT TAGAATTGTCTTGATTGATTACCTATTGATTATCAAAATCAATCGATATC CAATCAATCGGTTGGTTAGCGATTACTCATCGATTggaaaaagttattga ttgtattgcGTGGAAAAGTCTGGAACTGACACATTGCACCACTACCTGCC ACATAGAACTATATAGAACAGCATAGAACTTCTATAAATTATATAGATTG ACACCCCTTGCCATAAATTCCTCTGTGAAATACTTAGTAAATGATAATCT GTAAACATAAGATCATACCTGCTGTCTGTGTTGTTGTTTATGTGTAGTGA TGTTCAAGAGCAATTCTTTAATTATAAGATTCCTAtcactttattggtgc atttactaactacacaaacataaaatactacgctaaaagaaatataaacc tctttaaagcactctaaaaagaccaaaaacatgataaaaatacaaacaaC CAAAGCATAAAACCTGACAGCATGCTGAATACGCCATTTGTTAAAAATGA GCAATGTTTACAAATGCTTGGTTACGTCTACCTAGCACTTGCGGACTGAA ATTATGAAACAAAATGCGAAATTTTATCTTAGCGAGTTAGTCCATCTTTA GAATTTTATTAGAATATTCGAGAAGTTTCTAACACCGTGGCCACCGTGGT caggcactttcgttttcaaaattttattccaCACCGACGAccaccgcgaa aggctatcgtaatactttcgctatgccaAATTAATAAATGTTAGGAATTA ATATCCAAATGTGGTCTTTTTCatacattattttttattaccCTTTTATA CATATACATACATCAATTTTTATTGCACCGATTATctcattttataaaat ttttcagctttttgaatgaagagaatttcaaattaggttcattttatttg tacatGTGTATATACATAAGTGCAGTAGTACGAAAACTCTGACTAGTACA TCTTTTTACTTTCTGTTGTGACGAAagatatcttttaatattttaagtgc aaaaataaataaataaaaattctaaTAATAAGGTTGATGAAAATCtacca atcaaaatttaaaaaaaattttctttagcaaGTCCATGCACCGCAATTGT TTTGTACTGATTGTATGACTTTTGTCTGCTCTCCTCTGTACACTGTCCCC CGTTTTCGCAATTtgtaaaaaactaataaattggGTGGTTTCTACAAGGA TGTGTATTAAAAGAATGATTTCCTATCGGGCCCATTTTATTAAACTGTCC TTATTGCATCACTGCATTCGGTCCTAAACCAGACCCATACCCATTAACCA ATCATATTTTGGACTGATGACGTGATTTTAATGATTGAGACTCcgcattt tgaaaattctaaaacatGATGTGAGTTCTCGAGCTCGTTTGTAAGTGGAG AGGTCATTTGGGAGACCCAATTTTTGTtgaacttcagttgagctagaatg tGTGTGTATGTCCACGAACATACATATAAAGCGGAATAATTGGTCTAAGA AGCTGAAATTTGACACACACATTCCTAAGGTAAATACCCAGGGgtgttat ttttttctcttcacttgagaaaatgattgacagattaaagtttttcacct cTCTATCAATCTATCTATTgtggttgagttacaggaggctcttgagccca ttctcgcaactatagatgcttttgagtaagcatcccgtcagcaccttgaa ctgactacccatttcccctcacatggcatgggttgacctgggccaaggtt tgttcacttgccaagtaaaCTGTCGTGAGTGGAATCGAACCTTGAtcgcc tgtacaggaatcaaggttggTGTCCACTATACCACAATGCGGGCGTTCTG CGAGCATTCTCTGCTCAATCCACAGACCGTGCTAAACTGGTAGACTtagc tgtgacagatcatttcaatggaagttgttggaatgtttacaaggctcttg acagaaaatcctttgttttattgtcaatgatgacagtatcgttattaatt ttgttagatctgacatattgatatTTGTAacttgtaagtgcactttatag ttttgattcacattgaagaatcatattttggttctcatgttattagatgc tgttttagaactttagagctagcctgattgaatgacctggctggtcatta aaatacaaagttaaatcaaaacaaaatctcCTAATCATGAAAGTGATGTC ATACATAATTATGTTTTGATCATGATTGCATGTCCGGCAGCCATCGAGAA ACATCTGAATTCCTGCCATCTTAAAATagtatgattttttattatcctAA CCACGTTGTTTTATTTACGCACAATTATGTCGGCGAGTAACTTGTCAAAA ATACTTGCGTGGCAAATATGAGATTTtgaaatggtagagtagagctgcga gcggcgCTTCGTAGTTCTTGCACTGTTGTtacgtttgttttgaaatttgc tgaTTTGGTTGGTCAGAAGCATCGGGCGGTTCAAGTTATAGTCTGCTGTT ACCCCCTGTGGATGACATGGATTTTCCggaacaatttacttttgaaaaac ttcaggatttccgtaaaattcaagattttttatgggaaaatgttggattt tcttatataaaatgGCAAGaaacagtgcgtcacaaacagccatataaaca aaactcaacattctcacaaaagttgtctttttgatttcccaaacattcgt ctcaagcgttccCTTCC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000041:526644..530260 Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00004338 ID=TCONS_00004338|Name=TCONS_00004338|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3617bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041:526644..530260 (Clytia hemisphaerica) GGAAGggaacgcttgagacgaatgtttgggaaatcaaaaagacaactttt
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TGATATTCTCCAACCCTAGTACTCCCCGGTCgtttaatatgattatttta
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TTGGAAATATAGGAAGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00004338-exon-sc0000041-1491911889:526644..530260 | TCONS_00004338-exon-sc0000041-1491911889:526644..530260 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004338-exon-sc0000041-1510915933:526644..530260 | TCONS_00004338-exon-sc0000041-1510915933:526644..530260 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00004338-exon-sc0000041-1575043694:526644..530260 | TCONS_00004338-exon-sc0000041-1575043694:526644..530260 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000041 | supercontig | sc0000041:526644..530260 . |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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