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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00002925 ID=TCONS_00002925|Name=TCONS_00002925|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3616bp NNTCGGACGGTATTTTGGGAATTTTCTTTCGTGAATCTTCCTCCGAAATC TTCAGGTTCAGAAACTTTAAGAAAGGGTCTGTTTCTGATGATTTTGTGAT GGGACCTGGGAAAGGATGTACATATTGAATACAAATTCATTCGATGGAAT TTTTCACCAACGTTTGAACTTTCTCTGTGACCATTTACTTTATGCACAGG TGTTTATTTCCTTCATCAAACTTTATTTTCGCTCAAAAGGTTTTACCTAA AAGTTGGCTCTCCCCATTATCGCGAAAAAGGCGTTCCCTCTAATAGGTTG TACAGAGCACTTTGCTTCCTAATTCAAGCGATTTATCACGAAATTCAAGA AAGCCTTCATGTCTGGTTAGCGTCCGTTGCTTTCCCCTCtttcagatttt tgaaaacttttttttgaaacccCTCCCCTTTTGGGAATTGTCCAAATGTC AACAATTTAAAAGCCGTTTATCGAATTATATTTTGCTGAGTCTTTCTGAA TCTTTTTCACACATTTCCCCAGAGATCTTAAATACatgtttttgctttta taagcataacgcttataagcatatacaggctcagtttttgttacctaaac aatggctctattgtttgagaacaatagaatgctaagcataatgcgagcct gatatagggacagacacttgcttataaaaaaacatgtattttcatatgag tttaaaaaaaactgtttaaTGGACTCTCACTAATTGGAGCTTTTATAATT CAAATACTGCTTAATTTAGCTCCCGTTCGTAAATCTTCATAATTCGCACC TCTTTAGAACTCGAACATTCAAGTTCGAATTAGTGAGAATTTGTTTTGGT GGTTAGAATTATGGCCGATTTTTACAACTCTAATCAAAGTTTttcctact ctcgggtacctaataaatgGGGTGATTGGATGGGTGGAGAAACTTTAAAA ACTTAATCTCCTggtttgaagatttttgaaaaaaaggccAATACAGACAA AAGAGAAAactctcaaaaatattttcctaaaTATTCATAAGTGAGGGGGG GGGAtcggaataagaatgtcctgagtggaaagtttttgaaaaattaatta gtgggAAGACGCATGTTAATTAGCTGCACAGAACTTTGTTTCAAGTCAAC GTTCATCTTTACGTTTTATGGACATCATGGACGCTAGATGAACGTTCAAA CAACGTTGTAGTAGGATGATCGAttgtaaaatttacaaaacacCGTAACT TGACTCGTCCGTTATTTTAAGTTCATTGGttatttattcttttaaaaatc atcTGATAGCGTCTCATTCcactaatttaaaaaaataccacTCGACCTCC CGTGTGACGAACGCTTAAAATTGCTGCTCTGTACAACTTCAGTAAACTCT CGCCCTAATTCGATAGCTTCAATAATTCGAGCTTATCCTCAGTTACTTGG AAAAACCTTCGTGGAATGTCTTCTACAATTACAATTTCTAtgtactttaa tcggattaaatttcgcgaaatctTTTGGATTAAAATTCCCGAGTCAGggg tttcaaaaatttcgcgtggatttaatttcgcgaatgagtcTGAAAAACAG CTGAAAATGGCATTTTTGGGCACAAATAGAGAGTTTTGACTAGTTCCTCA ATCCAAAATGTAATGTTaaatatttcgcgtggatttaatttcgcgagtca gtaATCTCACACGTTTTCACGAGTCTTAATTTCGCGAAagtggcaaaaat tcgcgaaaacgcgaaatttaatctcgcaaaaattaatccgattaaagtac ttcaaataattttgattctccTTTGGGGCTCGAATTAGCGAAAGTGTGCG CGTTGTTTAAACTGGGTGGTGCTGTCAATTTTTCGTCAGGGTGTGCAATT CACcttaatttcaaaacattaaatGAGAAGTTTAAGCTTTCATGCCATAG TGATTAGCCATTGTAATAAATTCAAAAGTACATTCAAAATTATATTCTTT CCAAACAAAATTGACTACTTCAAAAACACTTTTAGACAGCAAATATTTTT GTGACTGAAATGCTATTACATGATTACTGTAAATTGCGTTCTCCTTTTGT AATCATTACCAATTTGCCATTCTTATCTTTTTTTGGTCAGGTAACTTTGT CGCATCTTTTAATACCAAACCAAAcattaatattttcaaagattttgagc tCAATTGAAGGaaacttattcaaaattttctatttctatcaATCTGAGTC TAAGAATACAGCAAAAATTTGCTGTCGGTCAAATCCAAACTAACGCCTTT TGAAATTCCCCTGAAAACTACGAGGACATTATTGTGAAAATCTAGTTCAA AACCCAGAACTTTCATTTTAATCGTATCGAATTTCGAGTCAAAAAATCGC AAGATCCCTTGATCATTTCTGAAGTTGGAGTTTCGAAGAATTTAGTGTGA GTTTAATTTTCACAAATGAGTCTGTAAGTGGTTTTAAAAGCGGTTATTTT TAGCCCCATACAATTATCTAGAGCAGTTTGCATCAAaaatgttttgagtg tattgatttcaaaagtcaactgtcactgttgaatttattttgcgaaaaaa tgttttttttgtgcCTAAACGTTTGAAAGGGAAACAATGGATAGGGACAA cgaatattttttattaaaactttgaaaacctcTCCTGGATAAACCAGTCA ACAACCAGTATGCATGGTTGCAATTTTATCCCTCAATTTGGTCCCCGCGG AATGTTATCCCTAAAAATACGTTTATGTAAATCGCCAAAACTTCTCAATT AAGTCGCACCCTACGCTGCGAAGCACTGCGAGGAAATTAACCGAGTTCGG TAAAACCATTTGAACGATTTTGTAGTTGATGAAGGAAATACATTTCTGTG AAGTTACGGTAAATGGTCACGTGATAGAATTAATGCTGCTTTTTCTTCCG ACATCTCATAAGATAGGTCACTTCCCGTTGAataagagaaagattcgaat ctTGGTGAAAATTCCACACACTGGGTTTGTAAGTCAAATAGTGCCGTGTG CCTGGCCCCGCTATCTCTGAGACGAAATCATTAAAAAACGATCCTTTTAT CTAAAAGTCTTTGAATCGGAATATTTCCGAGGTTGGAGGTCGAAGAATTT CTTGAAATACTTAACTGAGCTATTCGGCAATTTATGCGGTTCATGGCGTC ATTTTGAAATCAGAAAAATAATGTTAAAAGCCTTCAGATTTTTTAGTCTT TTTTTCGCTGTCAAAATGACGTCATTGATCTCATGAAAAGTAACGTTTGT TGTGCTAATTTGGTCAGGAATGGAATATCGAAAGTTAAACGGCTACAGTA CAGTGATGAAAAGTAAAGATAAGGGTGTAAAAATAATGACTTGCGAAATT TCCATATTCAAGTATTAGTTCATCGAGAAAATGACGGTGGCATTTCTGCT TTTCCTTTCCTTTGTCTCAGTCTAAGAATGTTCACTAGCGATCGAAATGC TTCGTTTTTGGAGAGCTCGAGTAGCCTCTCAGGGCGGATAGGATAGAGtg cctttatatttttttttataatttttttttgtatttttttgtcataattt tcTCGGAAAATATAAC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000023:505583..509198 Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00002925 ID=TCONS_00002925|Name=TCONS_00002925|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3616bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023:505583..509198 (Clytia hemisphaerica) GTTATATTTTCCGAgaaaattatgacaaaaaaatacaaaaaaaaattata
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AAAATACCGTCCGANN
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature Name | Unique Name | Species | Type |
TCONS_00002925-exon-sc0000023-1491911889:505583..509198 | TCONS_00002925-exon-sc0000023-1491911889:505583..509198 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002925-exon-sc0000023-1510915933:505583..509198 | TCONS_00002925-exon-sc0000023-1510915933:505583..509198 | Clytia hemisphaerica | exon |
TCONS_00002925-exon-sc0000023-1575043694:505583..509198 | TCONS_00002925-exon-sc0000023-1575043694:505583..509198 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
sc0000023 | supercontig | sc0000023:505583..509198 . |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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