TCONS_00001923 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00001923
Unique Name	TCONS_00001923
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1131

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000012:200770..211870-

transcript sequence

>TCONS_00001923 ID=TCONS_00001923|Name=TCONS_00001923|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1131bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000012:200770..211870-

Legend: exon

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>TCONS_00001923 ID=TCONS_00001923|Name=TCONS_00001923|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=11101bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:200770..211870- (Clytia hemisphaerica)
CAAGGGTAACTTTTTTATGAGTACCGTACCTCTAGATCAACAACATGGAC
ATTAGATTGCTCACCTAGAAGATGGAAGACTATCGAAAGCACTTCTAAGC
TATTCCAAGTAAGTACTGTATACTGTTGTTGTTTATCTGAAAGTAATACC
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CCCAGCCAAGAAAAAGCGCGCCAAATATTTAGCAAAGGGCGGCAGCGATG
AAGGCGGAATATTTACGCGCCTATAACCGTGGTCATTTAAAAAGTATCCG
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TTCTAAATTCACCTGCTTCATCGTCATTTTATGAAGACAACTTACTTTAG
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ACTTTAGTTCTCAGGTTTTTAAACTTTTTTATTTGTGTTTCAATTCTGTT
TAATTTATTTACCCTGGGAAACTTCCATTGTAGTTTTAAAAATTAAAAAC
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ATGCAAGTGAAATTTTTCAAATCTGCGGACCTAGACGGGGGTTCGTTTAT
TATCAGTTAGGGTTAGGGTTGGAGCTCGAGAGTCACAATATAAAGCCGAA
GGCCTTCTTAGGGGCATTCGTACCCTGTGACTTAATTAACTTAGGATCCC
GTAGCTAGGGATCCTTGTATCCTTGTAGGGGCACCGGTAGGGTTGGGAGC
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AAACGCCACATAGAAGATCTTTCAAATTCAGTATGTGAATTATAGAGCAG
TAAAAAATACAACTTTTCTATTTTTCCTTTTTTTTGCAAAAGTTCTAGGA
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GGCACTATCGTAAAGCTAGAATCGCTTCGCGTACTCTTAGCTTGAGAAAA
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CTCAGGCGCTCTGCGAGAGTTCTCGGCTCAATCCTCGGACCTCGCTAAAA
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TTATAGTTTTGATTCCCATTGAAGAATAATATTCTGGTTTTCATGTTATT
AGATGCTGTTTTAGAGCTTTAGAGCTACACTGAGAGACGATGCATCCTGG
AGTATGATATCGTTTGCCAACCACATTATCTAAGGGTCTTATCTGTTTCA
TCTTCCTTTTAAGAGCTCTGAACCTAGAGTTCAACTTCTAGATGAATATC
ATTCTGCCACAGTCATGTGCTAAAGCACATTGTGAAGCACATTTTTATTC
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GGGAGAACGCGACGGTGTGTCTACTGAATATTACTCCAGCCATTACAGAA
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TGACGTCACAAAACACATTAAATATGAGATTTCTCAAACTTCAATCAGTT
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AAAAATGTGTGTAACGCAAGATGGTAGCTGAGCTGTTATTCTCAAATTTT
GCCAGGGGGTTGATTCCAGTATGAAAGAGGGATTTTGTGCAGTTTTAAGA
CAAAAAATCTTATTGTCTTTTGAAAAAGTAGTTGATGATACATCGTGGTT
TTAATTTTGTGTTTAAAATTTCATTTTCATCTATGATTGAGTGGGAAAAT
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AATTGAGGAATCCCTACAGTGACTTTTTAACAAAAATAATTCTGACGTCA
ATTATTCAAAAATCATGTGATGTAAATTTTCGAATTTTGGAAGGCATGGC
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CAGGTAAGAAACGGTNCATGGCACTTTCTACGAAAAAGTTAGTAAAATTT
GATTTTTTAAATAGTCAATGCGCAGGTAAAAAACGGAGGTCTCCCGCGAG
AAGTGGATATAAAATGTTGTCCCGTAAGTTTGGATATGCCCATGATTGTT
TTGAAATCAAAGTATTCATTATTTGGTCTTTTAAAGCGCGTCATTTCGTC
CTTAAATTTGTAAATACAGCATTATTTTCTTTTCCTTTCTTATGCACTGA
TGATACATTTGACACTCTCAATTTGACGTTTTACTGCTTAATAAATTCCT
GTTTTCGCTTAAATTGAAATCGGCTTCAAACTTCCAGAAGAAACTCTCAT
AATTGACAGTTTACTGTTTACAAGCTAATTTTATGGTGAAGACTTCAAGT
CATATTCTCACATTCAATTTGAACCATAGAAAGGTATTTACGAGAAATCT
TCCAGCTAATCGATATACTCCCGTGGTTGATGAAAACTAATTCGAATTCC
CCGTAAAAATAAAGTTAGAGAGCATCAGCAATACCATCTTTATCATCCTA
AGGGCTTTTGATGCGCAATCTAAACCGGCGTTTGTGACAACGGGAACCAT
CTAGATCATACTAATTAAGTTTTTTCCGGCTCAAAACTTTGTAGACTGGG
GACTTTAAGATTTCCTATTAGGATAAAATTTTGTGCACCTTGGTTCTTTT
GGTCCTTTTAATCCCTTTTTGCCTCTTTTAACATTTCTGAAGGTTTTTTG
GATTAGTTTTCAGCCCTCGAATTTCAGGTCAGCATTATGCAGTGCAGACC
TAAAAGCCAACCAAAGAATGTGTATGATTGGCAGTTCATTGCCGACCATA
ATCATCAATTCTTTTGGCAGCAGACCATAAGTGATAATTGAAAAAAAAAC
ATTGCTGTAGTCTTTAAACAACTTTGCCAACCTATAATGAAGCTCAGATC
GGCATTGCCGATCTAAAAACAAGTCTAGGTTGGCAGAATTTTCACGATTT
GCTTCTACTTGAAATTCAAGGGCTGAGTTTTAGCCTCAAAACAATTGACA
CAAGTTAACTAATGATGAGGCAGTGCAGAGAGGTGGTTCTCTTGTAAATT
AGACTTTAACTCTAATGTAGGTACTGAAAGAAAATGCAAGGTTTGAACAC
AAATATCCAGGCATTCAAAGACAGCCCATTATTTTCAACATTTTTACCCA
AGTCTACCAAAGATCAGAGTCAAAATTATGGTCAAGATAAGAAGACAGAA
CATTATAATGCATCATCTTGTTTGCCACTCGATGCTTCATTTGAATTTGA
TCAATTTTTCAATACCCACGTGTTCACTTCTGGACTGACGGACAATGGTA
AAACTTTGGCCATCTTTGAACAAGATGATAAAGGAAATTTAAACATGCAT
AAATATTGCTATCATAAAGGCCAGATTGNTTAACATTTCTGAAGGTTTTT
TGGATTAGTTTTCAGCCCTCGAATTTCAGGTCAGCATTATGCAGTGCAGA
CCTAAAAGCCAACCAAAGAATGTGTATGATTGGCAGTTCATTGCCGACCA
TAATCATCAATTCTTTTGGCAGCAGACCATAAGTGATAATTGAAAAAAAA
ACATTGCTGTAGTCTTTAAACAACTTTGCCAACCTATAATGAAGCTCAGA
TCGGCATTGCCGATCTAAAAACAAGTCTAGGTTGGCAGAATTTTCACGAT
TTGCTTCTACTTGAAATTCAAGGGCTGAGTTTTAGCCTCAAAACAATTGA
CACAAGTTAACTAATGATGAGGCAGTGCAGAGAGGTGGTTCTCTTGTAAA
TTAGACTTTAACTCTAATGTAGGTACTGAAAGAAAATGCAAGGTTTGAAC
ACAAATATCCAGGCATTCAAAGACAGCCCATTATTTTCAACATTTTTACC
CAAGTCTACCAAAGATCAGAGTCAAAATTATGGTCAAGATAAGAAGACAG
AACATTATAATGCATCATCTTGTTTGCCACTCGATGCTTCATTTGAATTT
GATCAATTTTTCAATACCCACGTGTTCACTTCTGGACTGATGGACAATGG
TAAAACTTTGGCCATCTTTGAACAAGATGATAAAGGAAATTTAAACATGC
ATAAATATTGCTATCATAAAGGCCAGATTCAAAGTCTTCATTCCAGACAC
TTTAACACATGGTTGATTCGAGATTATGATTATCTTGTCAGTTATGATGG
CTTATTTGTTGTAATGTTTAATTCTGAAGAACTTGCACATGAAAGAGACC
ATCGAAGGAGACGAAAACGTGGCTATGGCCTGGGAGAGAAAGTTTACATT
TCTTTGCTAGTTTATGACCATGATTTTGAAAATGGTCGAAGTGCAATGGG
GAAATTTTTCCCGAATTCCTTTGTACTTACCATGTCTGACAAGGATGATT
CATTGTTTTGGAAATATAAACATGGATATGCTATTGGGGTTGATGGCACC
ATAATTGTCTCCTCATGGGGCGTGACTAGAGACACTTTAGATGAACAAGA
TACGGGTGGGACTGCTTTATATTTGAATTATTTCAAAGTTCAACAAACAA
GCTCTAAAATTGCTGTCAAACATTGTGGTTTTACAGATTTGAGTGGTGCG
TTGACTGGCAAACCGTTACCAACAGCTTTCAACGATCCTGAACANGAAAG
AGACCATCGAAGGAGACGAAAACGTGGCTATGGCCTGGGAGAGAAAGTTT
ACATTTCTTTGCTAGTTTATGACCATGATTTTGAAAATGGTCGAAGTGCA
ATGGGGAAATTTTTCCCTAATTCCTTTGTACTTACCATGTCTGACAAGGA
TGATTCATTGTTTTGGAAATATAAACATGGATATGCTATTGGCGTTGATG
GCACCATAATTGTCTCCTCGTGGGGCGTGACTAGAGACACTTTAGATGAA
CAAGATACGGGTGGGACTGCTTTATATTTGAATTATTTCAAAGTTCAACA
AACAAGCTCTAAAATTGCTGTCAAACATTGTGGTTGTACAGATTTGAGTG
GTGCGTTGACTGGCAAACCGTTACCAACAGCTTTCAACGATCCTGCTATT
GTATGCAACCAAAACATTACTAAAGTCTTCTTTTTGAGTCATAATATGGT
TTACAACGTGATGACGCACTCAATGAGTACATTATCCGAACAAGCTTTCC
AACATAATGTATGGGTTATTCATAGACGGTACGGTGAAATACTGATAACC
ATAGACAGGCCAACTTTCTCGCTACTCAATGTCAAAATATTCAAAGAGAA
CGACAAAGGCGAGTATGATCTAGTAAACAAATTCAAAACAAGTCGAATTA
TAAGACCAAATGATAATTTTATGGAAGAGCCTACAATGCATTGTCATGGT
ATAAACAATGGAGAGACTCGACTATTTGTAGAACCAACTCAATCATCACG
CACGATCTTTGCTGTCAATCCGTTCACTTTAAACATTGATTTCATTTTGG
GCATTCCTGCAAAGCTTGAGGAACCATTTGTGCGTAAAGTCCTTCAGAGT
GGTGATGAAATTACAGTCCTTGTTACCAGTAATTCTGCTGAGTATCTGGT
CTCTTATAACATTAACAAATGCACTGAACTGAAAAGTCTCAAGGAGCTTT
CAGCTTTGGTGGTACTTAGAAACTTTTCAATGGATGACATATTGCAGTAT
AATATTCCAAAATTATTGAAAACCTATTTAGAGAATAATATTTTTTACCT
CTGATTATGAAATGTTTTATTAACGTTTGTTTGTCTGTTTCATTCTACTG
TTCTGTGTGTTTTAATGTTTATTTTTCATGTTGTTTTTTATTTTTCCATT
ATCTGTGCGTTGTATCTGTTCTTCTTTTTCAACTAGTGTGTACCGAATTA
GACTTATCCTTTATTTTTTATTTAGATTGAACAGATAATGATGAATTGCT
TCCCTTATTAAAAGTTTTCCAAATAATTTTTATGGATAAATACATAAGAT
TTTAAAATCTACTTTTGTATCGTTTCAGCTAAACTAGAGAAATAATTTTC
TAAAAAAATGTTGCGTTTGGCTCAGAAATCATCTGTCCTTGGACAAGCAG
CCAAAATGTTGGCACAACAAGAACGATATATGTCCAAAGCTGTCGTCTTC
AACATGGGTGGTGCTATGTTGCCGGCAATGTCACCAGTTTTGCAAAAGTT
TGCACGTGACCACAAAATGTCCGAAGCTGAATTGACCAACAAATTATTCA
AAGAAGGAGATAAAGGTACCAATTCTATTAGTTTGAGATAAACACTAAAC
TGCTTTCAATATCAATTCATTGATATTAAAATAACTTGAAACGACTTTCA
ACTTTTTATTTTGGGTAAAGAAAGTCTCGTTTTTTTCTCATATTGGGAAC
ATTTTGTTCAGCGAAGAGTCGCCACAATAATAAACTCCCTTGATTTGACT
CAATTTCGCCGATGCTAGTTACCTTTCTTTTTTGTCCTTCATAGAATGTA
ACCCCCCTGGCTCTTAGGGGGGGGGGCTAGAACCTAAAGTTCTGGCTGGG
GGCTCTTTTTCCCTAAGATCAGGGGGGCTACTTACTCAGGGGGGGGGGCT
AGAACCTAAAGTTCTGGCTGGGGGCTCTTTTTCCCTAAGATCAGGGGGGC
TACTTACTCAGGGGGGGGGCTATTTATTTAGGTCTGTTGACTGGGGGCTA
TTTATTTAGGTCTGTTGACTGGGGGCTAACCTAACAACTTTTTCCAAGAA
CTAATGTAATTTCATTGCATTTCATTTCATCGGTACAAAAGGTCTCATTA
TTTGTAAAACGTTGATATTCATTGACTTCTTAAAATTTGTTTGAAGTTTA
ACTTATTAAAATTTGTTTTAATTCTTACAACTACAAGTGAAAATGCATCT
TGATAGTCTGACTTATGATCATTGAAAAAGTTTTTTATACGTCCTAATCT
AGTAAGGATAGCAAGGACTTGACATTCGCTTTTGATTGATTTTTTGATTA
TTCCTTTCTTCTCTTTCTTCTGTTTTTCTTTCTTTTTCAAAACGATGAGA
TGCTGCCTTGAATTTAACTAAAGTGCTCTAGCCAATGAGCTACATCCTAT
TAAGATGGCTGGAATCGAACCTGCTACCTCCTTAGCTAGTTCAAGACTTT
TATCTCATTAACTTATTTTCTTGTTGTTCTTTATAAGTTCTGATAGGTTA
GTTCTTTAACTTTTATTTTTCTAGTTTATTTTGCTAGCTTTTTAATAAGC
TTTTTGATAGTTCTAGTTTTTAAATTCTGGAGAGTTCAGATTTTTAAGCA
TAAATTAATTTTTTTTTTGTATTTTGGTAGGGGGGCTGTCTATTTCGAAT
TTTGGTGGGGGCTAAATCTCAGGGGGGGCTGAACCTTCAGGGGGGCTTCA
ACCCCTCTGCACTCGATGTCCTTGTTCCGATACACTGTTATGTTATTCGA
GTTATGTTTATTTCGCAAAGGTTGATCATTTCTCACATGACCTAAAATGT
GGAAACGTTCCCGACGTTCCATTTCTCGATTTTAGTATACCATATAAGTG
GTAATTGGTAGTCCGCTTTTGATGAACTTCACTTTTTAATTTCATTCATA
GGACTAATGGAAAAAGTCGAACCCGCTTTATTATCGAGACACGGCAGTGA
AGATGCCAACCTTGCATACGTTGTTTCCGCTATTCAAAGTATCCGTGGTG
AAGGCTTAAAGACCGGTTTGGTTGCATCCGCACCTGGATTGAACACTGAC
CTATTCCCAGTCAGCAATGCTTTATTTGACGCTGTAAGTTAATATTCTTT
CTTTTGCGAACTCAGATTTGGGTTAAAAATGTAACAGACAGAAACATCCA
CATTTTATAGAGTTCTGAGAGGGTCCGCTAAATTCGGTTAGGCGACGATA
GCTTTTTAGATTTCAGTAATTGCCTTGGATTTTATTTGGACTCTTTCCGA
ACTATGAGCTCTTTCTAGGGAAGGGCAGTGTAATGATAGTTTGGTTACAA
TCAATGAATGAATTCTATTTTTGATAGTTAATTTGAATGAAATTAGAAAA
CATGCTTTACCAGGTTTTTTGAATTTATTTACACCTCTGATTAAAACATA
AAACATTACTTTATTTTCCCACTTTTCCACCGTCAAGGTATCAGCCAACT
TGAAAGGTGATTTGATGGACAAATTGAAAGTTGACTCCAGTGAAGTCATT
TACTTAGATAACGTCGATGCTAACTTGAAAGCTGCTCAAGGAATGGGAAT
GACGACCGTCAAGGTAAACAGATTAACATACGCGCCTTTTTATTAGGCTG
GACTGTTCTTATTTTTTTGAAATTTTCAGGCGCAAATGTGTTTACGATGT
TCTTAATACGCTTAGTTTCTTTACTTAAAACTTGAAATGGGTTTAAAATC
TGTTAAATTCAGTACTTTTAAGTTATTTCTGAAATCTGAGGCTTAGGGTT
GTTCTTGATTTACACTTGATTTGGCCAATTTTTAGCCTCGTGTTCTTATA
AAAGAACATCTAAAGTTTCTTTTAAGGTGGTTTGATGACAAGTATGCCTG
TTAGAACTGCACTACTTTAGGCGTATAAACTTTCGCGAGCAGAAACTTTC
GCGATTTTCGCGAATTTTGGCCCTTTTCGCGAAAGTAAATGTCTTTAAAA
ATTGTAGGAAGGGCCATTCGCAAAAATTTATGCTCGCGAAAAATTCTTAA
CAAAATAGAAAATCTGTAAAACTTCAAACTTTGAATAAAATGTAACTTTT
ATGGCACTTTTTAGCCTGCTAAAAGACTAATAAGTCAAAGAACAAATGTT
TCAAGCCAATCCAAGAAGTATTTGTCCCTCTAAGCCATTTTTTCATCTGA
AAATTCTAAATTTTACGTCTTGATTTGCGAAAGTTTCGTTTCAAGAAATT
TCGCGATTTTTCGTCCTCGCGAAAGTTTGTACGCCTAAAGTAGTTTTTTA
ATCTCCTGGCACATGGTCGAGAATTTGAAAGAAATGTCCTTTTTGAATTT
AATGAGCAGCTCTCCACCGTATGAAGAGAAATGAATATTCATTCTACTAT
TCAGTCTAACATAATTTTGTTATAAGTTCTCGTCATAAGTGAGTTCTTGC
CAAAATTAACTTTTTTATAATTTTCCAAATTAACCCCTCATCTTTTTCCA
AAACACTCATTTTTTTAGGCAAGACGAAACTTATTTATCCTATCATTCGC
CAACATAAATTAGAAATTGCCAAAAATACCAAAATTAGTTCACTTAAGTT
ACTTGTTTCGCATTTTGCTACAAGCTAGAGAGGGGGTCGCCTTTTTAAAC
CATGTATATTCTTCGATTTGCAGGTTGAAGATGTCGAAGCTGCCCTGCAC
GAATTAGAAGCACATCTTCAAGTTCCATTAAGAGAATTCGTTCCAGGTTT
CTCATGGATTTACTACGATGGCGCCAACAGTCCACACAAATCAACCAAAG
AGAACCTTCTCTACTATTTCTTAGTCATCTACATTTTCATGGTCGCTGGT
CACATGACCTGTAAACACGTTCTCAAAATCGACGGTACTTTCCAACATTA
AAGAAATTATTAATAATTTTATAATTTTTTTTTCCTTTTAAAATTTAGAC
CAAAACTTTACCACCTGTACGTCATAGAACTTTTGAATAAAAAGTTTTTG
TGAAAGAAATTCCCCCAAAAAAATACAAATGTATGTACATATTTGATAAA
CATTTATTTGTCGAATTTTTTTTAATTTGGTTCGCCTTTTCAAGAGAAGA
CACGCTTTGGTACATTTTGGTCAACTGAAAAAATCCGATCCAAAAAATGA
A

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_000992	XLOC_000992	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000012	supercontig	sc0000012:200770..211870 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
250.251	267.498	290.023	381.718	337.424	304.471	259.27	353.599	118.28	98.1011	163.323	172.443	143.641	192.591	134.656	122.327	255.116	244.562	87.3368	69.9285	312.385	287.073	211.241	206.971	570.85	550.043	238.345	232.262	156.128	123.878

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00001923 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00001923 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00001923 (transcript) - C. hemisphaerica