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XLOC_000992 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_000992
Unique NameXLOC_000992
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000012:200770..211870-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_000992 ID=XLOC_000992|Name=XLOC_000992|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11101bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:200770..211870- (Clytia hemisphaerica)
CAAGGGTAACTTTTTTATGAGTACCGTACCTCTAGATCAACAACATGGAC ATTAGATTGCTCACCTAGAAGATGGAAGACTATCGAAAGCACTTCTAAGC TATTCCAAGTAAGTACTGTATACTGTTGTTGTTTATCTGAAAGTAATACC AAAAAACACGAAGCCGAACGACCTTACTAACGCATCGGACATAGTGGATG TCCGGTGTCGGATGTGCAATTACAAGAATTATTGTGAGTTGATGGTTTTG GGGAAATCCAGGGAAATCAAAAGGAACGTTTGTTAATTAGACTGACAAGC AAAAGGTCCATAGACCTTTTTTCAAAGAGGCCATCCTGTTGAATAATTAT GTAGTCCAGCAGAAAAACAATGATAAAACCATGCATAATTATTACAATAT GCATGATAACAGTAATTATGCATAGCTCTATCATTGTTTTTATGGCTGGA CTACATAATTATTCAACAGGACGTCCTCTTTGAAAAAAGGTCTATTAAAA GCTTCACACCTTTTTTTATAACTAAAAATAAAAAGCACTCACTTCTGAAT CTTTCTTTGCATTAATTATTGATTTTAAGTATGATAGGTATATTATTCAA ACACGCCTAATCGCAATCGTAAATTTGAAATTACATCGCAACTCTATAAA TAAAATGCTTTAAAAATTTATAATTCGAACCCAATCAAGTTTGAACAAAT GAAGACCATTCAACCCTAGATCTTATTAACATGATATTCAGATGCCAATA AGTTTACTTGTTTCTTCTTTGTCTGTCTGTTTTCACCAACACACAAAAAA CAGAGGTTAGACAACAAGAGCACATGGGAACCACATGGTGAGAGAATTTC CCCAGCCAAGAAAAAGCGCGCCAAATATTTAGCAAAGGGCGGCAGCGATG AAGGCGGAATATTTACGCGCCTATAACCGTGGTCATTTAAAAAGTATCCG 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TAAGACCAAATGATAATTTTATGGAAGAGCCTACAATGCATTGTCATGGT ATAAACAATGGAGAGACTCGACTATTTGTAGAACCAACTCAATCATCACG CACGATCTTTGCTGTCAATCCGTTCACTTTAAACATTGATTTCATTTTGG GCATTCCTGCAAAGCTTGAGGAACCATTTGTGCGTAAAGTCCTTCAGAGT GGTGATGAAATTACAGTCCTTGTTACCAGTAATTCTGCTGAGTATCTGGT CTCTTATAACATTAACAAATGCACTGAACTGAAAAGTCTCAAGGAGCTTT CAGCTTTGGTGGTACTTAGAAACTTTTCAATGGATGACATATTGCAGTAT AATATTCCAAAATTATTGAAAACCTATTTAGAGAATAATATTTTTTACCT CTGATTATGAAATGTTTTATTAACGTTTGTTTGTCTGTTTCATTCTACTG TTCTGTGTGTTTTAATGTTTATTTTTCATGTTGTTTTTTATTTTTCCATT ATCTGTGCGTTGTATCTGTTCTTCTTTTTCAACTAGTGTGTACCGAATTA GACTTATCCTTTATTTTTTATTTAGATTGAACAGATAATGATGAATTGCT TCCCTTATTAAAAGTTTTCCAAATAATTTTTATGGATAAATACATAAGAT TTTAAAATCTACTTTTGTATCGTTTCAGCTAAACTAGAGAAATAATTTTC TAAAAAAATGTTGCGTTTGGCTCAGAAATCATCTGTCCTTGGACAAGCAG CCAAAATGTTGGCACAACAAGAACGATATATGTCCAAAGCTGTCGTCTTC AACATGGGTGGTGCTATGTTGCCGGCAATGTCACCAGTTTTGCAAAAGTT TGCACGTGACCACAAAATGTCCGAAGCTGAATTGACCAACAAATTATTCA AAGAAGGAGATAAAGGTACCAATTCTATTAGTTTGAGATAAACACTAAAC TGCTTTCAATATCAATTCATTGATATTAAAATAACTTGAAACGACTTTCA ACTTTTTATTTTGGGTAAAGAAAGTCTCGTTTTTTTCTCATATTGGGAAC ATTTTGTTCAGCGAAGAGTCGCCACAATAATAAACTCCCTTGATTTGACT CAATTTCGCCGATGCTAGTTACCTTTCTTTTTTGTCCTTCATAGAATGTA ACCCCCCTGGCTCTTAGGGGGGGGGGCTAGAACCTAAAGTTCTGGCTGGG GGCTCTTTTTCCCTAAGATCAGGGGGGCTACTTACTCAGGGGGGGGGGCT AGAACCTAAAGTTCTGGCTGGGGGCTCTTTTTCCCTAAGATCAGGGGGGC TACTTACTCAGGGGGGGGGCTATTTATTTAGGTCTGTTGACTGGGGGCTA TTTATTTAGGTCTGTTGACTGGGGGCTAACCTAACAACTTTTTCCAAGAA CTAATGTAATTTCATTGCATTTCATTTCATCGGTACAAAAGGTCTCATTA TTTGTAAAACGTTGATATTCATTGACTTCTTAAAATTTGTTTGAAGTTTA ACTTATTAAAATTTGTTTTAATTCTTACAACTACAAGTGAAAATGCATCT TGATAGTCTGACTTATGATCATTGAAAAAGTTTTTTATACGTCCTAATCT AGTAAGGATAGCAAGGACTTGACATTCGCTTTTGATTGATTTTTTGATTA TTCCTTTCTTCTCTTTCTTCTGTTTTTCTTTCTTTTTCAAAACGATGAGA TGCTGCCTTGAATTTAACTAAAGTGCTCTAGCCAATGAGCTACATCCTAT TAAGATGGCTGGAATCGAACCTGCTACCTCCTTAGCTAGTTCAAGACTTT TATCTCATTAACTTATTTTCTTGTTGTTCTTTATAAGTTCTGATAGGTTA GTTCTTTAACTTTTATTTTTCTAGTTTATTTTGCTAGCTTTTTAATAAGC TTTTTGATAGTTCTAGTTTTTAAATTCTGGAGAGTTCAGATTTTTAAGCA TAAATTAATTTTTTTTTTGTATTTTGGTAGGGGGGCTGTCTATTTCGAAT TTTGGTGGGGGCTAAATCTCAGGGGGGGCTGAACCTTCAGGGGGGCTTCA ACCCCTCTGCACTCGATGTCCTTGTTCCGATACACTGTTATGTTATTCGA GTTATGTTTATTTCGCAAAGGTTGATCATTTCTCACATGACCTAAAATGT GGAAACGTTCCCGACGTTCCATTTCTCGATTTTAGTATACCATATAAGTG GTAATTGGTAGTCCGCTTTTGATGAACTTCACTTTTTAATTTCATTCATA GGACTAATGGAAAAAGTCGAACCCGCTTTATTATCGAGACACGGCAGTGA AGATGCCAACCTTGCATACGTTGTTTCCGCTATTCAAAGTATCCGTGGTG AAGGCTTAAAGACCGGTTTGGTTGCATCCGCACCTGGATTGAACACTGAC CTATTCCCAGTCAGCAATGCTTTATTTGACGCTGTAAGTTAATATTCTTT CTTTTGCGAACTCAGATTTGGGTTAAAAATGTAACAGACAGAAACATCCA CATTTTATAGAGTTCTGAGAGGGTCCGCTAAATTCGGTTAGGCGACGATA GCTTTTTAGATTTCAGTAATTGCCTTGGATTTTATTTGGACTCTTTCCGA ACTATGAGCTCTTTCTAGGGAAGGGCAGTGTAATGATAGTTTGGTTACAA TCAATGAATGAATTCTATTTTTGATAGTTAATTTGAATGAAATTAGAAAA CATGCTTTACCAGGTTTTTTGAATTTATTTACACCTCTGATTAAAACATA AAACATTACTTTATTTTCCCACTTTTCCACCGTCAAGGTATCAGCCAACT TGAAAGGTGATTTGATGGACAAATTGAAAGTTGACTCCAGTGAAGTCATT TACTTAGATAACGTCGATGCTAACTTGAAAGCTGCTCAAGGAATGGGAAT GACGACCGTCAAGGTAAACAGATTAACATACGCGCCTTTTTATTAGGCTG GACTGTTCTTATTTTTTTGAAATTTTCAGGCGCAAATGTGTTTACGATGT TCTTAATACGCTTAGTTTCTTTACTTAAAACTTGAAATGGGTTTAAAATC TGTTAAATTCAGTACTTTTAAGTTATTTCTGAAATCTGAGGCTTAGGGTT GTTCTTGATTTACACTTGATTTGGCCAATTTTTAGCCTCGTGTTCTTATA AAAGAACATCTAAAGTTTCTTTTAAGGTGGTTTGATGACAAGTATGCCTG TTAGAACTGCACTACTTTAGGCGTATAAACTTTCGCGAGCAGAAACTTTC GCGATTTTCGCGAATTTTGGCCCTTTTCGCGAAAGTAAATGTCTTTAAAA ATTGTAGGAAGGGCCATTCGCAAAAATTTATGCTCGCGAAAAATTCTTAA CAAAATAGAAAATCTGTAAAACTTCAAACTTTGAATAAAATGTAACTTTT ATGGCACTTTTTAGCCTGCTAAAAGACTAATAAGTCAAAGAACAAATGTT TCAAGCCAATCCAAGAAGTATTTGTCCCTCTAAGCCATTTTTTCATCTGA AAATTCTAAATTTTACGTCTTGATTTGCGAAAGTTTCGTTTCAAGAAATT TCGCGATTTTTCGTCCTCGCGAAAGTTTGTACGCCTAAAGTAGTTTTTTA ATCTCCTGGCACATGGTCGAGAATTTGAAAGAAATGTCCTTTTTGAATTT AATGAGCAGCTCTCCACCGTATGAAGAGAAATGAATATTCATTCTACTAT TCAGTCTAACATAATTTTGTTATAAGTTCTCGTCATAAGTGAGTTCTTGC CAAAATTAACTTTTTTATAATTTTCCAAATTAACCCCTCATCTTTTTCCA AAACACTCATTTTTTTAGGCAAGACGAAACTTATTTATCCTATCATTCGC CAACATAAATTAGAAATTGCCAAAAATACCAAAATTAGTTCACTTAAGTT ACTTGTTTCGCATTTTGCTACAAGCTAGAGAGGGGGTCGCCTTTTTAAAC CATGTATATTCTTCGATTTGCAGGTTGAAGATGTCGAAGCTGCCCTGCAC GAATTAGAAGCACATCTTCAAGTTCCATTAAGAGAATTCGTTCCAGGTTT CTCATGGATTTACTACGATGGCGCCAACAGTCCACACAAATCAACCAAAG AGAACCTTCTCTACTATTTCTTAGTCATCTACATTTTCATGGTCGCTGGT CACATGACCTGTAAACACGTTCTCAAAATCGACGGTACTTTCCAACATTA AAGAAATTATTAATAATTTTATAATTTTTTTTTCCTTTTAAAATTTAGAC CAAAACTTTACCACCTGTACGTCATAGAACTTTTGAATAAAAAGTTTTTG TGAAAGAAATTCCCCCAAAAAAATACAAATGTATGTACATATTTGATAAA CATTTATTTGTCGAATTTTTTTTAATTTGGTTCGCCTTTTCAAGAGAAGA CACGCTTTGGTACATTTTGGTCAACTGAAAAAATCCGATCCAAAAAATGA A
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001923TCONS_00001923Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00001922TCONS_00001922Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00001922-proteinTCONS_00001922-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000012supercontigsc0000012:200770..211870 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
591.1 593.91 686.34 662.25 459.08 358.14 465.51 487.78 601.33 553.55 616.45 681 567.54 575.83 565.26 633.12 910.6 965.82 345.05 327.08 804.29 812.38 505.63 512.28 633.49 638.12 564.97 560.47 421.54 370.44