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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00001795 ID=TCONS_00001795|Name=TCONS_00001795|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3572bp
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GTTCAGTTAAGATACAAAAGCATGATTTGCATAACCTGATTGCAACATTG
ACTATAGCTTGTAGATAGAGTTATTTTCTCAGAAAAAATCTGTCAAAGCT
TACAATTATTAGTGATTAAAACCTAGGTACTTTAAACACGCTAACTACTT
CATTTTTGTTTGCcgttttttctaatttccaaAATCTTGCTAGAATGCAA
AAAGTTCTCTATTTTTTTAGAAACCTGTGTATTATTTACACGCTGAAGCA
AAATCTCTCATGGACTTTGTGTTCGTAAACTTTCAAtcagataaatattt
ttgtaaattcttattcaaaatcttattttaatttttgggacGATTTCTTT
ATTTTAGATGTAATTTTTTACTATTCTCATTCtgcttttgtaaatatttt
ttctacttaAACGCTTGTNTGACAATTTATCTGCGTTCAGCTAGGAAGTA
ATCTTAAATAAATGATTTAAAAGttctgagaaaaaaataaaagtacatGT
TAACTCATTTCGGTGTCAATAATTTATATGTTTTAGGATAGAGGTGTTTC
ATTGTTATATCATGGCATCGGTGCACTTGCTGTATTTGGTGGAGGTGTCA
TTTATTGCTGGATACAAACCTACATGACCAACTGCATGCTGAAACTAGCT
CTCAATACCAGACGACTATTTTGGATTAGAGCTACACTATCTACCCTTGC
TACcatctttttattttcattcctgaTTACTATTTATTATGCTAGCAAAG
ATTTTGCTAAACGTCCTGATTCTGAGAAAAATATGACCAAATGGAATCCA
CATGATCCTGGTTTCAAGCTACATGTCATCAGCTCATCATGCGAGTGGCT
CCTGGGgacatgtttgtttttgtattttctatcATTCACAAAGGAATTCA
ACAAAATGAAAGTTGGGTTAAGAGTTCAACGGCATTTGAATTCTGCTGCT
CCTTTCTTGGCAAGCACTACTAGCTCACAAGATTCTATGTACGCCTAACG
GTTTTGTTGTACATAGTTTTGCATTTTTCTGTCTGTTGACAGAAATTCCG
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CTATAGCTTGTAGATAGAGTTATTTTCTCAGAAAAAATCTGTCAAAGCTT
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ATTTTTGTTTGCcgttttttctaatttccaaAATCTTGCTAGAATGCAAA
AAGTTCTCTATTTTTTTAGAAACCTGTGTATTATTTACACGCTGAAGCAA
AATCTCTCATGGACTTTGTGTTCGTAAACTTTCAAtcagataaatatttt
tgtaaattcttattcaaaatcttattttaatttttgggacGATTTCTTTA
TTTTAGATGTAATTTTTTACTATTCTCATTCtgcttttgtaaatattttt
tctacttaAACGCTTGTGAATTTTCCACCATTACACATTTTACACCgatt
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TGAAATTGAATTTAAGAACTTAGTCCTGTGTTTCCTGGCTTGATAGTGAA
TGATTTTCTaattagaaatttgaaaaaaaaactcaaaaattgtttttcga
tAAGTTTCTCTTATAACTAACTGATTTCCGTTCtcattttcattcattca
tagagaaagaaaacgaaatagaaaatacaaaatttacaGGGTTTAGAAAT
ATACGTGATGTGTGATGTATTTTGAAGAAACAAGATTAAAGTCAAGAACA
AAGATGGTAGGATGTCGAGAATTGTTTTGCCGTTTGGGCGTGATGCCATT
GTTGTTTTCATTGTGTTCCATTGTCACTTTTATTATCACGTACAGCGTTG
CCGTAGCTGATGGCCATGTGTACCCTTTCCTTCCCGCCATCAGTGATACA
GGTGGTATCAAACCCGAGAGCAACATCTTTGGATTTTGTCTGAGCGCTTG
TTCATTCCTCGGATTCGTCTCAGTTGTCATTCGATATTATCAATATCGAT
TCGTATCGGAAAATAACGAGGAACATCGACCACGATTGGTGTGCGTCAAT
AAGATCGCATTGGTGATAGGTATTGTGTCCACCGGTGGTGCTCTCCTTGT
TGCAGCTTTTCAGGATCGTGGTGTATCGTTGAACATGCATATCGTTGGTG
CGTTGGCTGTGTTTGGTTTTGGTGTGTTATACTGTTTTATACAGACTTAT
CTCTCCTTCAAGATGTTCGCTTGTGGAATGAACTCAAAAAGAATATGCTT
GATACGTTTAACGATCGCTTTCTTTTCGCTTCTCTTTTTTATTGGAAATC
AAGTTTTCGGTAACCTCGCTGGTCAAGCTCGGGACAGGGACCCACCGACA
CAAAAATCACACGACCGGCCGCATTGGTATCCGGAGGACGCTGGTTTTAA
ATATAACGTCCTCGGTAATGCATCAGAATGGTTAATGGCGCTGTCGTTTT
TTGTGTACTTTTTGACATTCATTCCTGAGTTTAATAAAGTGAAGATGAGT
TTTAGTGTGAAGAGTGACGATTATAGCATGTTGTTACCCTTTCAACAAAG
CGGTGAATCCAAAGACGGGGGTCATGATGATGACGATGAAATGATTACTG
CTTAGGTTATAATTCTTCGACTAAACCATCTTTCGTATTGGTTAATCGAT
TTCTGTTTAAAGAATTTTCATGATCTTCTTGAACAAAAATTGAACATTCG
ACATTTCAATGACATGGGTTTTCTAATTGTATTCGGAAATCTCAGTTTTC
CGTCAAATTGATGAAACTCGTGCAACTTATGGTAACTAAGCTATGTTAGA
AAAAATGTGGATATGTTTTATTTCAACTCTGCGATCAACATTTTTCTTAG
TTTTGCGATAACGAAAACCGAAAACTTATAATATCATAACAACGATGATG
ATACAATTTTATCAACGATGCCAAAAAcgatattaagaacaagttgtgAA
CATTTTATAGCTTCactgactctaaaacacccaatttcttagcaAATCGC
CCAGAAACACACACCAAATGGGGAAGATAAGatcattttaagaacatctt
aaaactcaaaaagtttattcaaaggcttaaaaatcttgaattctaaaaaa
aaaaacggataGCTATCGAGGGTAGAGACTTCGGTTCGCCTTCAACTTGC
GTACCTGATACTTTTTACTTTCACGGGGGTTTATAATCTAAGAAACCTGT
ATACTGTATATTTAATTATAGGgaatattttgagaattttattttttcat
tgtaCGCAAATAGAATGTACTTTTCTTTCTACCTTAGATTCTagcttttt
attttcattttagattttgaattatttttaaattgaaacattgatTGGTT
CTGTGATTTAATTCATTTTGTC Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00001795-protein >TCONS_00001795-protein ID=TCONS_00001795-protein|Name=TCONS_00001795-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=296bp
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TFIPEFNKVKMSFSVKSDDYSMLLPFQQSGESKDGGHDDDDEMITA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000012:646855..652284+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00001795 ID=TCONS_00001795|Name=TCONS_00001795|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5430bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:646855..652284+ (Clytia hemisphaerica)
AACAAAATGAAAGTTGGGTTAAGAGTTCAACGGCATTTGAATTCTGCTGC
TCCTTTCTTGGCAAGCACTACTAGCTCACAAGATTCTATGTACGCCTAAC
GGTTTTGTTGTACATAGTTTTGCATTTTTCTGTCTGTTGACAGAAATTCC
GTTCAGTTAAGATACAAAAGCATGATTTGCATAACCTGATTGCAACATTG
ACTATAGCTTGTAGATAGAGTTATTTTCTCAGAAAAAATCTGTCAAAGCT
TACAATTATTAGTGATTAAAACCTAGGTACTTTAAACACGCTAACTACTT
CATTTTTGTTTGCcgttttttctaatttccaaAATCTTGCTAGAATGCAA
AAAGTTCTCTATTTTTTTAGAAACCTGTGTATTATTTACACGCTGAAGCA
AAATCTCTCATGGACTTTGTGTTCGTAAACTTTCAAtcagataaatattt
ttgtaaattcttattcaaaatcttattttaatttttgggacGATTTCTTT
ATTTTAGATGTAATTTTTTACTATTCTCATTCtgcttttgtaaatatttt
ttctacttaAACGCTTGTNTGACAATTTATCTGCGTTCAGCTAGGAAGTA
ATCTTAAATAAATGATTTAAAAGttctgagaaaaaaataaaagtacatGT
TAACTCATTTCGGTGTCAATAATTTATATGTTTTAGGATAGAGGTGTTTC
ATTGTTATATCATGGCATCGGTGCACTTGCTGTATTTGGTGGAGGTGTCA
TTTATTGCTGGATACAAACCTACATGACCAACTGCATGCTGAAACTAGCT
CTCAATACCAGACGACTATTTTGGATTAGAGCTACACTATCTACCCTTGC
TACcatctttttattttcattcctgaTTACTATTTATTATGCTAGCAAAG
ATTTTGCTAAACGTCCTGATTCTGAGAAAAATATGACCAAATGGAATCCA
CATGATCCTGGTTTCAAGCTACATGTCATCAGCTCATCATGCGAGTGGCT
CCTGGGgacatgtttgtttttgtattttctatcATTCACAAAGGAATTCA
ACAAAATGAAAGTTGGGTTAAGAGTTCAACGGCATTTGAATTCTGCTGCT
CCTTTCTTGGCAAGCACTACTAGCTCACAAGATTCTATGTACGCCTAACG
GTTTTGTTGTACATAGTTTTGCATTTTTCTGTCTGTTGACAGAAATTCCG
TTCAGTTAAGATACAAAAGCATGATTTGCATAACCTGATTGCAACATTGA
CTATAGCTTGTAGATAGAGTTATTTTCTCAGAAAAAATCTGTCAAAGCTT
ACAATTATTAGTGATTAAAACCTAGGTACTTTAAACACGCTAACTACTTC
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AAGTTCTCTATTTTTTTAGAAACCTGTGTATTATTTACACGCTGAAGCAA
AATCTCTCATGGACTTTGTGTTCGTAAACTTTCAAtcagataaatatttt
tgtaaattcttattcaaaatcttattttaatttttgggacGATTTCTTTA
TTTTAGATGTAATTTTTTACTATTCTCATTCtgcttttgtaaatattttt
tctacttaAACGCTTGTGAATTTTCCACCATTACACATTTTACACCgatt
ttttgtagattttttaactgatttagcaaaatttattaattattattatG
TGAAATTGAATTTAAGAACTTAGTCCTGTGTTTCCTGGCTTGATAGTGAA
TGATTTTCTaattagaaatttgaaaaaaaaactcaaaaattgtttttcga
tAAGTTTCTCTTATAACTAACTGATTTCCGTTCtcattttcattcattca
tagagaaagaaaacgaaatagaaaatacaaaatttacaGGGTTTAGAAAT
ATACGTGATGTGTGATGGTAAGTCGATAATTCTTTTTGAAGTGCTCTGAC
AATTTTTATTTGCTATGTTAGGTCACTGAAAGTGAAAATACCCTGAAAAT
AACAACACAATTTTTCTAAGGTTTTTAGATCGTCAATACAATCTTTTTTA
tcagaataattttataagaacaatgaggcttaaattgaaatttctaaaag
tagttaaaaacaagataaaacttAATCCGAAAATTGATTATCCCATTAAA
AGTAGTTAAAAACGGTTAAAATTAGGTATAAAGCCTAAAATGTCTCAATT
TTGTCCTAAAGTAAGAACAAGGACAATtgaagaacaattcaaggcatgaa
accaaaacaaaattaaaacaacGGAACCTCCACAAAATTTAACGGGCTCT
TATTAAAAAGAGTGAATGTGGCATCTGCATTCGCGAAAGGGCTTCATTTC
CATGTAAAACATTAATAATTTATCACATCAAAAAAAGTATTGTCTCCATC
TTGAAGAGAATTTTATGATTAATAATCAACTAATTGGGTATTACAGAGAA
GTTCTTTCTCTTTCTACACGCCCAAGTATCGATTTCTTATTCCTTACTTT
CAGTATTTTGAAGAAACAAGATTAAAGTCAAGAACAAAGATGGTAGGATG
TCGAGAATTGTTTTGCCGTTTGGGCGTGATGCCATTGTTGTTTTCATTGT
GTTCCATTGTCACTTTTATTATCACGTACAGCGTTGCCGTAGCTGATGGC
CATGTGTACCCTTTCCTTCCCGCCATCAGTGATACAGGTATGCTTAAGAG
GATCAATTTGCGTGATTTACGCGAATTTCGCCAAATATTTTAGATCTAAA
TTTTGGCCAATAGaaaccccttggaaaatgaaaaaaaattgtgtcaAAAT
AGGACCGATTCGTCAAATTTTGTCCACACGAAAACTTTAGGTTCTCAACT
CACGAAAAAAAAGTCCATGCGAAAAtcaatccacttaaggtaataaTACT
ACAGTAACCTCTTCGATGCACGATACATTTATAACCTGTAGTTTGATGGT
AAAGTGATAGTCTAACTTAAATTCTGAGGCTTTTGCCCCTTAGTGTTAAA
GTTGTTGGTTATTAAAGTTGAAATTCACttatcaaaaagttaaaaagttt
caCGTATAAAGGAGTATTAAGTCAgacatttttaacagttttttttaatt
atgtaaaaatcttttaaaaactcATAAAAGGGGGTGTAGAGTTTTAATAT
GAAATAGTCCTGACTCAATGATTTGATAGTTTTGATACGTTTTCTGCCGA
GAGTGTACTTGTTGTGGAGGGGTCAAAATACCGGTAGTCCTTAAAAgagc
aataacttttgatacggaaacttttgcttttttattgcattttttaaaTC
TACGTGAAATTTTGCGTCGATTGATATACAATTTGAAGGCATTTGAGGCA
AAATTCAGAAGCCTCTGAAAGCCAAACTTACCCTGAAATTCCAAGcagtc
aatttttcaattccTGAATAAGTGCTCGGCAGTGAACGTGTTAAGTTAAT
AAACGATCAAATgtgctttttattttactttcagGTGGTATCAAACCCGA
GAGCAACATCTTTGGATTTTGTCTGAGCGCTTGTTCATTCCTCGGATTCG
TCTCAGTTGTCATTCGATATTATCAATATCGATTCGTATCGGAAAATAAC
GAGGAACATCGACCACGATTGGTGTGCGTCAATAAGATCGCATTGGTGAT
AGGTATTGTGTCCACCGGTGGTGCTCTCCTTGTTGCAGCTTTTCAGGTaa
ttttccataatttttgTGGAATCGGATTAGAGCTAAAATATCGCGAGATC
AAGAATTTCTTAAGTTACTACATTCTTGATACTAACTTTAATTTTGAACA
TTCTCCACAGCCGAAGAGCtttgagttttaactctgagttttaacattag
acttaacaCTTAGGACCTTAGCATATCAgaatctcaggatctaaaagcta
aaaaatgttccaataaggctggcTATAttgcctggaagccacttaacccc
tctcGAATCGAAAAACCCAATCAAACAAAGTGaaagtactgaaactgcaa
ttcttgcccgacctttaaattctgaaaaacgttaaagtacccaaaattgc
caaataTATTTCGGCGATGATGGTAGATTTGCAGACTTAAGTTAAACTCT
ATGTAAACGTTTGCATGTCGCTGGATCGATAAAGACcagtttattcaaag
taattttGATTGGATTTTCAGGATCGTGGTGTATCGTTGAACATGCATAT
CGTTGGTGCGTTGGCTGTGTTTGGTTTTGGTGTGTTATACTGTTTTATAC
AGACTTATCTCTCCTTCAAGATGTTCGCTTGTGGAATGAACTCAAAAAGA
ATATGCTTGATACGTTTAACGATCGCTTTCTTTTCGCTTCTCTTTTTTAT
TGGAAATCAAGTTTTCGGTAACCTCGCTGGTCAAGCTCGGGACAGGGACC
CACCGACACAAAAATCACACGACCGGCCGCATTGGTATCCGGAGGACGCT
GGTTTTAAATATAACGTCCTCGGTAATGCATCAGAATGGTTAATGGCGCT
GTCGTTTTTTGTGTACTTTTTGACATTCATTCCTGAGTTTAATAAAGTGA
AGATGAGTTTTAGTGTGAAGAGTGACGATTATAGCATGTTGTTACCCTTT
CAACAAAGCGGTGAATCCAAAGACGGGGGTCATGATGATGACGATGAAAT
GATTACTGCTTAGGTTATAATTCTTCGACTAAACCATCTTTCGTATTGGT
TAATCGATTTCTGTTTAAAGAATTTTCATGATCTTCTTGAACAAAAATTG
AACATTCGACATTTCAATGACATGGGTTTTCTAATTGTATTCGGAAATCT
CAGTTTTCCGTCAAATTGATGAAACTCGTGCAACTTATGGTAACTAAGCT
ATGTTAGAAAAAATGTGGATATGTTTTATTTCAACTCTGCGATCAACATT
TTTCTTAGTTTTGCGATAACGAAAACCGAAAACTTATAATATCATAACAA
CGATGATGATACAATTTTATCAACGATGCCAAAAAcgatattaagaacaa
gttgtgAACATTTTATAGCTTCactgactctaaaacacccaatttcttag
caAATCGCCCAGAAACACACACCAAATGGGGAAGATAAGatcattttaag
aacatcttaaaactcaaaaagtttattcaaaggcttaaaaatcttgaatt
ctaaaaaaaaaaacggataGCTATCGAGGGTAGAGACTTCGGTTCGCCTT
CAACTTGCGTACCTGATACTTTTTACTTTCACGGGGGTTTATAATCTAAG
AAACCTGTATACTGTATATTTAATTATAGGgaatattttgagaattttat
tttttcattgtaCGCAAATAGAATGTACTTTTCTTTCTACCTTAGATTCT
agctttttattttcattttagattttgaattatttttaaattgaaacatt
gatTGGTTCTGTGATTTAATTCATTTTGTC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000012:646855..652284+ >TCONS_00001795 ID=TCONS_00001795|Name=TCONS_00001795|organism=Clytia hemisphaerica|type=CDS|length=3564bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000012:646855..652284+ (Clytia hemisphaerica)
ATGTATTTTGAAGAAACAAGATTAAAGTCAAGAACAAAGATGGTAGGATG
TCGAGAATTGTTTTGCCGTTTGGGCGTGATGCCATTGTTGTTTTCATTGT
GTTCCATTGTCACTTTTATTATCACGTACAGCGTTGCCGTAGCTGATGGC
CATGTGTACCCTTTCCTTCCCGCCATCAGTGATACAGGTGGTATCAAACC
CGAGAGCAACATCTTTGGATTTTGTCTGAGCGCTTGTTCATTCCTCGGAT
TCGTCTCAGTTGTCATTCGATATTATCAATATCGATTCGTATCGGAAAAT
AACGAGGAACATCGACCACGATTGGTGTGCGTCAATAAGATCGCATTGGT
GATAGGTATTGTGTCCACCGGTGGTGCTCTCCTTGTTGCAGCTTTTCAGG
ATCGTGGTGTATCGTTGAACATGCATATCGTTGGTGCGTTGGCTGTGTTT
GGTTTTGGTGTGTTATACTGTTTTATACAGACTTATCTCTCCTTCAAGAT
GTTCGCTTGTGGAATGAACTCAAAAAGAATATGCTTGATACGTTTAACGA
TCGCTTTCTTTTCGCTTCTCTTTTTTATTGGAAATCAAGTTTTCGGTAAC
CTCGCTGGTCAAGCTCGGGACAGGGACCCACCGACACAAAAATCACACGA
CCGGCCGCATTGGTATCCGGAGGACGCTGGTTTTAAATATAACGTCCTCG
GTAATGCATCAGAATGGTTAATGGCGCTGTCGTTTTTTGTGTACTTTTTG
ACATTCATTCCTGAGTTTAATAAAGTGAAGATGAGTTTTAGTGTGAAGAG
TGACGATTATAGCATGTTGTTACCCTTTCAACAAAGCGGTGAATCCAAAG
ACGGGGGTCATGATGATGACGATGAAATGATTACTGCTTAGATGTATTTT
GAAGAAACAAGATTAAAGTCAAGAACAAAGATGGTAGGATGTCGAGAATT
GTTTTGCCGTTTGGGCGTGATGCCATTGTTGTTTTCATTGTGTTCCATTG
TCACTTTTATTATCACGTACAGCGTTGCCGTAGCTGATGGCCATGTGTAC
CCTTTCCTTCCCGCCATCAGTGATACAGGTGGTATCAAACCCGAGAGCAA
CATCTTTGGATTTTGTCTGAGCGCTTGTTCATTCCTCGGATTCGTCTCAG
TTGTCATTCGATATTATCAATATCGATTCGTATCGGAAAATAACGAGGAA
CATCGACCACGATTGGTGTGCGTCAATAAGATCGCATTGGTGATAGGTAT
TGTGTCCACCGGTGGTGCTCTCCTTGTTGCAGCTTTTCAGGATCGTGGTG
TATCGTTGAACATGCATATCGTTGGTGCGTTGGCTGTGTTTGGTTTTGGT
GTGTTATACTGTTTTATACAGACTTATCTCTCCTTCAAGATGTTCGCTTG
TGGAATGAACTCAAAAAGAATATGCTTGATACGTTTAACGATCGCTTTCT
TTTCGCTTCTCTTTTTTATTGGAAATCAAGTTTTCGGTAACCTCGCTGGT
CAAGCTCGGGACAGGGACCCACCGACACAAAAATCACACGACCGGCCGCA
TTGGTATCCGGAGGACGCTGGTTTTAAATATAACGTCCTCGGTAATGCAT
CAGAATGGTTAATGGCGCTGTCGTTTTTTGTGTACTTTTTGACATTCATT
CCTGAGTTTAATAAAGTGAAGATGAGTTTTAGTGTGAAGAGTGACGATTA
TAGCATGTTGTTACCCTTTCAACAAAGCGGTGAATCCAAAGACGGGGGTC
ATGATGATGACGATGAAATGATTACTGCTTAGATGTATTTTGAAGAAACA
AGATTAAAGTCAAGAACAAAGATGGTAGGATGTCGAGAATTGTTTTGCCG
TTTGGGCGTGATGCCATTGTTGTTTTCATTGTGTTCCATTGTCACTTTTA
TTATCACGTACAGCGTTGCCGTAGCTGATGGCCATGTGTACCCTTTCCTT
CCCGCCATCAGTGATACAGGTGGTATCAAACCCGAGAGCAACATCTTTGG
ATTTTGTCTGAGCGCTTGTTCATTCCTCGGATTCGTCTCAGTTGTCATTC
GATATTATCAATATCGATTCGTATCGGAAAATAACGAGGAACATCGACCA
CGATTGGTGTGCGTCAATAAGATCGCATTGGTGATAGGTATTGTGTCCAC
CGGTGGTGCTCTCCTTGTTGCAGCTTTTCAGGATCGTGGTGTATCGTTGA
ACATGCATATCGTTGGTGCGTTGGCTGTGTTTGGTTTTGGTGTGTTATAC
TGTTTTATACAGACTTATCTCTCCTTCAAGATGTTCGCTTGTGGAATGAA
CTCAAAAAGAATATGCTTGATACGTTTAACGATCGCTTTCTTTTCGCTTC
TCTTTTTTATTGGAAATCAAGTTTTCGGTAACCTCGCTGGTCAAGCTCGG
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GGAGGACGCTGGTTTTAAATATAACGTCCTCGGTAATGCATCAGAATGGT
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AATAAAGTGAAGATGAGTTTTAGTGTGAAGAGTGACGATTATAGCATGTT
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GATGCCATTGTTGTTTTCATTGTGTTCCATTGTCACTTTTATTATCACGT
ACAGCGTTGCCGTAGCTGATGGCCATGTGTACCCTTTCCTTCCCGCCATC
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GAGCGCTTGTTCATTCCTCGGATTCGTCTCAGTTGTCATTCGATATTATC
AATATCGATTCGTATCGGAAAATAACGAGGAACATCGACCACGATTGGTG
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TCGTTGGTGCGTTGGCTGTGTTTGGTTTTGGTGTGTTATACTGTTTTATA
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TGTCGTTTTTTGTGTACTTTTTGACATTCATTCCTGAGTTTAATAAAGTG
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TCAACAAAGCGGTGAATCCAAAGACGGGGGTCATGATGATGACGATGAAA
TGATTACTGCTTAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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|---|
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| TCONS_00001795-exon-sc0000012-1491911889:649358..649541 | TCONS_00001795-exon-sc0000012-1491911889:649358..649541 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001795-exon-sc0000012-1510915933:649358..649541 | TCONS_00001795-exon-sc0000012-1510915933:649358..649541 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001795-exon-sc0000012-1575043694:649358..649541 | TCONS_00001795-exon-sc0000012-1575043694:649358..649541 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00001795-exon-sc0000012-1575043694:650339..650550 | TCONS_00001795-exon-sc0000012-1575043694:650339..650550 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001795-exon-sc0000012-1491911889:651026..652284 | TCONS_00001795-exon-sc0000012-1491911889:651026..652284 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001795-exon-sc0000012-1510915933:651026..652284 | TCONS_00001795-exon-sc0000012-1510915933:651026..652284 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00001795-exon-sc0000012-1575043694:651026..652284 | TCONS_00001795-exon-sc0000012-1575043694:651026..652284 | Clytia hemisphaerica | exon |
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000012 | supercontig | sc0000012:646855..652284 + |
Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
| Term | Definition |
|---|
| IPR019402 | Frag1/DRAM/Sfk1 |
Blast
BLAST of TCONS_00001795 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: DRAM1 (DNA damage-regulated autophagy modulator protein 1 OS=Homo sapiens GN=DRAM1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 125.561 bits (314), Expect = 2.684e-31 Identity = 87/244 (35.66%), Postives = 125/244 (51.23%), Query Frame = 1
Query: 1984 LGVMPLLFSLCSIVTFIITYSVAVADGHVYPFLPAISDTGGIKPESNIFGFCLSACSFLGFVSVVIRYYQYRFVSENNEEHRPRLVCVNKIALVIGIVSTGGALLVAAFQDRGVSLNMHIVGALAVFGFGVLYCFIQTYLSFKMFAC-GMNSKRICLIRLTIAFFSLLFFIGNQVFGNLAGQARDRDPPTQKSHDRPHWYPEDAGFKYNVLGNASEWLMALSFFVYFLTFIPEFNKVKMSFSVK 2712
+ +P L S FII+Y VAV GHV PFLP ISDTG PES IFGF ++ +FLG ++ Y +Y+ V + N+ N ++LV+G+V G +VA FQ+ V + +H GAL F GV+Y +Q+ +S+K +C NS C IR+ I+ S I V +L S + W P + + Y+V+ EW +A F YFLTFI +F V + S +
Sbjct: 8 MAFVPFLLVTWSSAAFIISYVVAVLSGHVNPFLPYISDTGTTPPESGIFGFMINFSAFLGAATM---YTRYKIVQKQNQTCYFSTPVFNLVSLVLGLVGCFGMGIVANFQELAVPV-VHDGGALLAFVCGVVYTLLQSIISYK--SCPQWNSLSTCHIRMVISAVSCAAVIPMIVCASLI------------SITKLEWNPREKDYVYHVVSAICEWTVAFGFIFYFLTFIQDFQSVTLRISTE 233
The following BLAST results are available for this feature:
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