TCONS_00001667 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00001667
Unique NameTCONS_00001667
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4244

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00001667 ID=TCONS_00001667|Name=TCONS_00001667|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4244bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000011:416724..445854-

Legend: exon
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>TCONS_00001667 ID=TCONS_00001667|Name=TCONS_00001667|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=29131bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011:416724..445854- (Clytia hemisphaerica)
CATTCTTATCCTGAATCACTGAAGGTTTAACTATAATATACTTTTGTTAT CTGTATCTTTTTTCCCTTGAAGAATACAAACGAACTCTGTACCGGTTCGG AGACTAAGACCATGTTCGCACGTGACGTTTCCGTTTTGCTCTGAAGTGAA ATGAAGCCATTCTATTGGTTAGAAGTGACGTAAAACTTGAATGTAACCAA TAGAATGGCTTCTTTTTGTTTCGAAGCGAAACGGAACCGTAGCGTGCGAG CGTGATCTAACTAGGTGCCCATCATTGGTTTCGATTCGTTTGACATTGTC CTAACCAAACCATGATTTTCCGCTACTTAAAAGGATGATCAGATGGTTTG AGATATTCAGATTACAGAAACCTTATGTGGTCCTCAGTAAAACCTCAAAG TATTTTTGTGTAACAATTTTCCCAAATCGAGATATTGATATTTGAAAAAT TTTTGAAAATAGGCTCTTACACGGTTCTTACGTTGAAATTCTATTGTTTT CATCCTAAAAGCCAAAAACTTATAACTCGTAACTTAAAATATCTCGACAC AAATAATTTTGAGATTTTGCTCAGGACAATAGAAGGATCCCACATGTCAA ATATTACAAACAATCCGATTATCCCTTTAAATTTCCCGTTTATCTTGATT TCTAAGAATTGGTCAAATATCATACTTACCATGCTTACCTTTTTTCCTTC AAAGTCACCAAGGAAATCAAACAGGATTTTCCCAGGAAGGGGTTTTTTTT AATGACTGAAAGCTTTTATATCTTGTCGATTATATATGGGCACTTGAAAT AGGTAATTATCTGGCGCAATCTTCAATCAGATCAAATGGCGAGAATCTTT AGACATACATTTTTTGAAGATTAAGTCACAAATCCTTGTAGTCAATACTA AATTCTTTGTTTCCTGCTTTTAAAACATGAAAAATGCTTTACACAGATTA 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This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000011supercontigsc0000011:416724..445854 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 4.53842 1.16548 2.02357e-06 0.121757 1.77838 1.88217 0.899513 1.26043 0.163472 0 0.157147 3.30901e-09 2.28016 5.45477 1.60015e-10 1.3604e-05 1.42453 0.495993 1.06841e-06 1.06077e-08 2.26622e-07 0 4.031e-06 0 8.36375e-10 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00001667 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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